logo

Genes within 1Mb (chr1:30383711:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0393 0.0981 0.201 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 4.35e-01 0.0614 0.0784 0.201 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0344 0.0659 0.201 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -339874 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00561 0.0693 0.201 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0155 0.0543 0.201 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 9.98e-01 0.000125 0.0636 0.201 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0362 0.0752 0.201 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0967 0.0831 0.201 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0392 0.0651 0.201 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 4.40e-01 0.0448 0.0579 0.201 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 1.66e-01 -0.089 0.064 0.201 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 1.07e-01 -0.0924 0.0571 0.201 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 1.57e-01 0.0974 0.0685 0.201 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 1.80e-01 -0.147 0.109 0.201 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 9.41e-01 0.00546 0.073 0.201 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 1.66e-01 0.0889 0.064 0.201 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 6.93e-01 0.0247 0.0624 0.201 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0251 0.0732 0.201 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 9.73e-01 0.00311 0.092 0.201 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0606 0.0973 0.203 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0255 0.115 0.203 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 2.46e-01 -0.105 0.0901 0.203 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 8.97e-01 0.00838 0.0645 0.203 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 8.47e-01 0.0198 0.102 0.203 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 2.68e-01 0.0835 0.0753 0.201 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 4.28e-02 0.189 0.0927 0.201 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 7.05e-01 0.0228 0.06 0.201 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 6.01e-01 0.0289 0.0551 0.201 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -525047 sc-eQTL 2.32e-01 -0.127 0.106 0.201 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 3.37e-01 0.0841 0.0874 0.201 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 2.57e-01 -0.119 0.105 0.202 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 6.68e-01 0.0308 0.0718 0.202 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 4.45e-01 0.0576 0.0752 0.202 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 3.02e-01 0.0894 0.0865 0.202 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0838 0.0973 0.202 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 7.14e-01 -0.033 0.0899 0.202 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0296 0.0794 0.201 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 9.88e-01 0.00127 0.0849 0.201 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 1.76e-01 0.103 0.076 0.201 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 8.67e-01 0.0105 0.0626 0.201 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 2.73e-02 -0.225 0.101 0.201 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0583 0.107 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 2.12e-01 -0.165 0.132 0.184 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0435 0.133 0.184 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 2.82e-01 -0.133 0.124 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -339874 sc-eQTL 6.36e-01 0.0513 0.108 0.184 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 6.18e-01 0.0377 0.0755 0.184 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 2.61e-01 -0.137 0.122 0.184 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 3.83e-03 -0.309 0.105 0.184 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0257 0.121 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 3.24e-01 0.0994 0.101 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0894 0.0949 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -339874 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0133 0.0989 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 8.44e-01 0.0119 0.0607 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 2.26e-01 -0.103 0.0849 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 8.92e-01 0.0129 0.0954 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 8.70e-01 0.0188 0.115 0.2 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 9.12e-02 0.178 0.105 0.2 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00279 0.092 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -339874 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0527 0.088 0.2 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0583 0.0779 0.2 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0242 0.0893 0.2 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0953 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 7.10e-01 0.0397 0.107 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 3.60e-01 0.0842 0.0919 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0179 0.0812 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -339874 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00616 0.0824 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 7.85e-01 0.015 0.055 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0726 0.0721 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 8.49e-01 0.0171 0.0893 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00333 0.114 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0883 0.0939 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 2.65e-01 0.103 0.0918 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -339874 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0287 0.0884 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 4.26e-01 0.0478 0.0599 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 7.66e-01 0.026 0.0874 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0866 0.0942 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 6.11e-01 -0.057 0.112 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 6.25e-01 0.0538 0.11 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 7.58e-01 0.0333 0.108 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 1.18e-01 -0.15 0.0956 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 3.18e-01 0.105 0.105 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0242 0.0929 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0664 0.0869 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 2.64e-01 -0.086 0.0769 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 7.81e-01 0.0172 0.0616 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 1.14e-01 -0.104 0.0656 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 4.54e-02 -0.133 0.0663 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 1.79e-01 0.103 0.0766 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0102 0.11 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 8.51e-01 0.0167 0.0887 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 6.48e-01 0.0359 0.0785 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0331 0.0651 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 8.53e-01 0.0153 0.0826 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 7.84e-01 0.0253 0.092 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0124 0.111 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 4.08e-01 0.0878 0.106 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 6.99e-01 0.0342 0.0884 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 4.03e-01 0.0748 0.0893 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0897 0.104 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 4.06e-02 -0.21 0.102 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 2.60e-01 -0.136 0.12 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00619 0.0926 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 2.82e-02 0.196 0.0889 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 1.53e-01 0.142 0.0991 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 1.49e-01 -0.151 0.104 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 8.08e-01 -0.024 0.0984 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 9.42e-01 0.00805 0.11 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 9.97e-01 0.0003 0.0946 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 9.00e-01 0.00957 0.0761 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 3.66e-01 0.066 0.0728 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0268 0.091 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 4.82e-01 0.0697 0.099 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 3.14e-01 -0.125 0.123 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 1.19e-01 -0.176 0.113 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 7.57e-02 0.189 0.106 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00735 0.112 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 6.10e-01 0.0527 0.103 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0279 0.104 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 1.51e-01 -0.164 0.113 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0011 0.109 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 6.30e-01 0.054 0.112 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0244 0.105 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 9.14e-01 0.0118 0.109 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 2.44e-01 -0.115 0.0984 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 2.81e-01 -0.126 0.117 0.199 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 9.79e-01 0.00278 0.104 0.199 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 5.70e-01 0.0566 0.0995 0.199 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 7.96e-01 0.0243 0.0939 0.199 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 2.96e-01 -0.109 0.104 0.199 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00569 0.108 0.199 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 1.27e-01 -0.182 0.119 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0351 0.101 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 2.88e-01 0.113 0.106 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 3.66e-01 0.0948 0.105 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0244 0.105 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0229 0.104 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 8.98e-01 0.0142 0.111 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 5.85e-01 0.0448 0.0818 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 8.71e-01 0.0137 0.084 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 4.01e-01 0.0753 0.0894 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0522 0.112 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 1.41e-01 -0.136 0.0921 0.203 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0549 0.117 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0734 0.104 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 4.89e-01 0.0703 0.101 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 1.64e-01 0.135 0.0965 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 5.80e-01 0.0571 0.103 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0308 0.0997 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 2.57e-01 -0.124 0.109 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 8.99e-01 0.0108 0.0852 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 7.50e-01 0.0293 0.0921 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 8.00e-01 0.0258 0.101 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 3.14e-01 -0.108 0.107 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0452 0.0999 0.203 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 1.99e-01 -0.17 0.131 0.196 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 2.16e-01 0.189 0.152 0.196 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 1.78e-01 -0.179 0.132 0.196 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -339874 sc-eQTL 2.23e-01 -0.151 0.123 0.196 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 1.67e-01 -0.122 0.088 0.196 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 6.26e-01 0.0593 0.121 0.196 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0794 0.129 0.196 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00711 0.087 0.198 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 8.51e-01 0.0208 0.11 0.198 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0339 0.103 0.198 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 5.00e-01 0.0498 0.0738 0.198 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 5.36e-02 -0.199 0.102 0.198 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0351 0.0949 0.198 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0661 0.115 0.201 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 2.99e-01 -0.115 0.111 0.201 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 9.81e-01 0.00211 0.0888 0.201 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0732 0.102 0.201 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0174 0.104 0.201 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0147 0.103 0.201 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0339 0.114 0.207 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 8.34e-01 -0.026 0.123 0.207 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0931 0.106 0.207 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0351 0.0743 0.207 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0349 0.101 0.207 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 4.78e-01 0.0641 0.0902 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 6.09e-01 0.0516 0.101 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 9.51e-01 0.00417 0.0682 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0351 0.0598 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -525047 sc-eQTL 7.59e-02 -0.2 0.112 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 1.27e-01 0.144 0.0936 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 2.55e-01 0.108 0.0948 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 7.72e-03 0.297 0.111 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 7.69e-01 0.0239 0.0812 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 4.82e-01 0.0439 0.0624 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -525047 sc-eQTL 1.72e-01 -0.147 0.107 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0634 0.0931 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 4.47e-01 -0.105 0.137 0.2 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 5.54e-01 0.0699 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 2.27e-01 0.147 0.121 0.2 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 3.19e-01 0.132 0.132 0.2 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 7.84e-03 -0.321 0.119 0.2 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 5.93e-01 0.0632 0.118 0.2 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 6.02e-01 0.0549 0.105 0.207 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 9.49e-01 0.00716 0.113 0.207 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 1.63e-01 0.133 0.0953 0.207 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 8.03e-02 0.131 0.0746 0.207 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -525047 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0188 0.103 0.207 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 2.76e-01 0.111 0.102 0.207 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0462 0.0988 0.199 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 6.73e-01 0.0445 0.105 0.199 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0327 0.0861 0.199 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 8.49e-01 0.0149 0.0782 0.199 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -525047 sc-eQTL 2.20e-01 -0.108 0.0874 0.199 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0657 0.099 0.199 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 2.19e-01 -0.14 0.114 0.212 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 4.08e-01 -0.104 0.125 0.212 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0277 0.104 0.212 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 3.04e-01 0.0995 0.0965 0.212 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0283 0.107 0.212 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0412 0.115 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 2.54e-01 0.109 0.0954 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0308 0.0848 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -339874 sc-eQTL 7.07e-01 0.0364 0.0967 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0328 0.0607 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0846 0.0802 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 3.55e-01 -0.081 0.0874 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 9.14e-01 0.0113 0.104 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 9.65e-01 0.00357 0.0823 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0178 0.0778 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -339874 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00497 0.075 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 4.91e-01 0.0364 0.0527 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000161 0.0682 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0248 0.0809 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 2.84e-01 0.0923 0.0859 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 3.41e-02 0.206 0.0965 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 7.47e-01 0.02 0.0622 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00401 0.0547 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -525047 sc-eQTL 8.53e-02 -0.192 0.111 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 3.88e-01 0.0761 0.0879 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0122 0.0946 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 9.03e-01 0.0127 0.103 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 3.46e-01 0.0799 0.0846 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 2.01e-01 0.0867 0.0675 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -525047 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0408 0.099 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 5.59e-01 0.057 0.0975 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -913077 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0893 0.105 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -913271 sc-eQTL 5.74e-01 0.0406 0.0719 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -682280 sc-eQTL 5.86e-01 0.0429 0.0788 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -374063 sc-eQTL 2.51e-01 0.101 0.0879 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -334793 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0753 0.102 0.203 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -347982 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0668 0.0876 0.203 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121769 FABP3 -993139 pQTL 1.32e-02 -0.0518 0.0209 0.0 0.0 0.198

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina