logo

Genes within 1Mb (chr1:30379166:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 6.62e-01 0.049 0.112 0.118 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 6.24e-01 0.0439 0.0896 0.118 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 9.95e-01 0.00046 0.0752 0.118 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -344419 sc-eQTL 2.22e-01 0.0965 0.0788 0.118 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00372 0.0619 0.118 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 8.15e-01 0.017 0.0725 0.118 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 1.98e-01 -0.11 0.0855 0.118 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 6.87e-01 0.0388 0.0962 0.118 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 4.97e-01 0.0511 0.0751 0.118 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0699 0.0668 0.118 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 7.04e-01 0.0283 0.0741 0.118 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0409 0.0663 0.118 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0931 0.0792 0.118 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 5.09e-01 0.0834 0.126 0.118 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0516 0.084 0.118 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 5.12e-01 0.0486 0.0739 0.118 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0553 0.0718 0.118 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0321 0.0842 0.118 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0813 0.106 0.118 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 4.22e-01 0.0963 0.12 0.113 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 7.12e-01 0.0525 0.142 0.113 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0826 0.111 0.113 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0589 0.0793 0.113 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00998 0.126 0.113 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 7.68e-01 0.026 0.0877 0.118 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 1.64e-01 -0.151 0.108 0.118 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 2.84e-01 0.0748 0.0695 0.118 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0374 0.0641 0.118 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -529592 sc-eQTL 1.15e-02 0.31 0.121 0.118 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0435 0.102 0.118 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 3.95e-02 0.251 0.121 0.116 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 6.51e-01 0.0379 0.0837 0.116 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 3.86e-01 0.0762 0.0877 0.116 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 2.61e-01 -0.114 0.101 0.116 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 8.27e-01 0.0248 0.114 0.116 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 2.92e-01 -0.111 0.105 0.116 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 7.73e-01 0.0266 0.0918 0.118 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 8.01e-01 0.0247 0.0981 0.118 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 7.95e-01 0.023 0.0882 0.118 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 6.10e-01 0.037 0.0723 0.118 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0228 0.118 0.118 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 6.51e-01 0.0559 0.123 0.118 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 9.49e-02 0.237 0.141 0.125 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 3.48e-01 0.135 0.143 0.125 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 4.49e-01 0.101 0.133 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -344419 sc-eQTL 1.20e-01 0.181 0.116 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 9.47e-01 0.00546 0.0814 0.125 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 3.34e-02 0.278 0.13 0.125 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 9.45e-02 0.194 0.115 0.125 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0553 0.14 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 9.53e-01 0.0068 0.116 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 8.46e-01 0.0213 0.11 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -344419 sc-eQTL 4.18e-01 0.0925 0.114 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0535 0.07 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 6.10e-01 0.0502 0.0983 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 4.69e-01 0.0798 0.11 0.118 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 5.81e-01 0.0748 0.135 0.116 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 7.37e-01 -0.042 0.125 0.116 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 1.31e-01 0.164 0.108 0.116 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -344419 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0221 0.104 0.116 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 2.83e-01 0.0989 0.0918 0.116 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 1.15e-01 0.166 0.105 0.116 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 5.55e-01 0.0729 0.123 0.116 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 9.96e-01 0.000642 0.122 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0529 0.105 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 4.84e-01 0.065 0.0927 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -344419 sc-eQTL 2.88e-01 0.1 0.0939 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 8.75e-01 -0.00995 0.0629 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 7.73e-01 0.0239 0.0826 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 4.95e-02 -0.2 0.101 0.118 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 2.31e-01 -0.157 0.13 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 3.17e-01 -0.108 0.108 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 1.43e-02 -0.257 0.104 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -344419 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0423 0.101 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 8.89e-02 -0.117 0.0684 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 9.39e-01 0.0077 0.1 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0405 0.108 0.118 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 1.63e-01 0.179 0.128 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0969 0.126 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0639 0.124 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 6.57e-01 -0.049 0.11 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 6.67e-01 -0.052 0.121 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 2.04e-01 -0.135 0.106 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0138 0.101 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 1.52e-01 0.128 0.089 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0863 0.0712 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 9.16e-01 0.00805 0.0765 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0317 0.0776 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 1.07e-01 -0.144 0.0886 0.118 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 7.89e-01 0.0341 0.127 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 7.13e-01 0.0378 0.102 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0517 0.0906 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 9.42e-01 0.00548 0.0753 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0582 0.0954 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 9.26e-02 0.178 0.106 0.118 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 9.01e-01 0.0157 0.127 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000546 0.121 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0156 0.101 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0707 0.102 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 2.76e-01 -0.13 0.119 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 4.04e-01 -0.098 0.117 0.118 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 8.81e-01 0.0207 0.138 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0689 0.106 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 9.99e-01 0.000183 0.103 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 2.36e-01 -0.135 0.113 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 3.82e-01 0.105 0.119 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 8.41e-01 0.0225 0.112 0.118 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 9.35e-01 0.0102 0.126 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 6.80e-01 0.0448 0.108 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 3.72e-01 0.0778 0.087 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0279 0.0835 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0283 0.104 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 5.47e-02 -0.217 0.113 0.118 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0327 0.137 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 7.93e-01 0.0331 0.126 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0368 0.118 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0202 0.124 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0792 0.115 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 4.82e-01 0.0816 0.116 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 8.01e-01 0.0341 0.135 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 2.94e-01 -0.136 0.129 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 7.15e-01 0.0484 0.133 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 3.91e-01 -0.107 0.124 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 9.02e-01 -0.016 0.129 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 7.31e-01 0.0403 0.117 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0312 0.133 0.119 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 5.95e-01 0.0626 0.118 0.119 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0362 0.113 0.119 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00319 0.106 0.119 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 2.46e-01 -0.138 0.118 0.119 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 5.75e-01 0.0686 0.122 0.119 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 8.43e-01 -0.027 0.136 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 2.00e-01 0.148 0.115 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0556 0.121 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0222 0.119 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 9.34e-01 -0.01 0.12 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 3.55e-01 -0.109 0.118 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 2.89e-01 0.137 0.128 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 7.67e-01 0.0282 0.0953 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 1.39e-01 0.145 0.0972 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 2.97e-01 -0.109 0.104 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 3.39e-02 0.276 0.129 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 1.63e-01 -0.15 0.107 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 3.96e-01 0.123 0.145 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 8.03e-01 0.0324 0.13 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 6.30e-01 -0.061 0.126 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 1.88e-01 -0.159 0.12 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 9.37e-01 0.0102 0.128 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 2.66e-01 -0.138 0.124 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 2.36e-01 0.15 0.126 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 8.49e-01 0.0187 0.0984 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 2.19e-01 0.131 0.106 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 2.19e-01 -0.144 0.117 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 4.04e-01 -0.104 0.124 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0725 0.115 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 7.29e-01 0.0526 0.151 0.119 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 9.77e-02 0.29 0.173 0.119 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 1.65e-01 -0.211 0.151 0.119 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -344419 sc-eQTL 3.14e-01 0.143 0.142 0.119 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 1.49e-01 0.146 0.101 0.119 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 2.38e-01 0.164 0.138 0.119 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 2.41e-01 0.174 0.147 0.119 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 4.08e-01 0.082 0.0989 0.12 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 3.84e-01 0.109 0.125 0.12 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 6.64e-01 0.051 0.117 0.12 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 4.26e-01 0.0669 0.084 0.12 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0201 0.118 0.12 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 8.15e-01 0.0253 0.108 0.12 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 6.51e-01 0.0589 0.13 0.118 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 1.20e-01 -0.196 0.125 0.118 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00869 0.101 0.118 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 1.71e-01 0.158 0.115 0.118 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 5.58e-01 0.0689 0.118 0.118 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0696 0.117 0.118 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 6.62e-01 0.0609 0.139 0.11 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0301 0.151 0.11 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 1.37e-01 -0.192 0.129 0.11 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 9.45e-01 0.00631 0.0908 0.11 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0295 0.123 0.11 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 6.75e-01 0.0453 0.108 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 4.02e-01 -0.101 0.12 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0452 0.0816 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0407 0.0716 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -529592 sc-eQTL 1.60e-02 0.323 0.133 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 4.14e-02 -0.229 0.112 0.118 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 4.85e-01 0.0781 0.112 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 2.76e-01 -0.144 0.132 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 9.34e-01 0.00794 0.0955 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0711 0.0733 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -529592 sc-eQTL 5.92e-01 0.068 0.127 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 8.31e-01 0.0234 0.11 0.118 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 6.92e-01 0.0633 0.16 0.13 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 7.93e-01 -0.036 0.137 0.13 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0389 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 1.43e-01 -0.225 0.153 0.13 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 7.34e-02 0.253 0.14 0.13 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 9.87e-02 -0.226 0.136 0.13 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 2.66e-01 0.147 0.131 0.107 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00151 0.142 0.107 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 5.33e-01 0.075 0.12 0.107 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 2.18e-01 -0.116 0.0939 0.107 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -529592 sc-eQTL 3.26e-01 0.127 0.129 0.107 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 3.44e-02 -0.27 0.127 0.107 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 2.23e-01 0.141 0.115 0.118 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 1.94e-01 -0.16 0.123 0.118 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 6.27e-02 0.187 0.0997 0.118 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00114 0.0913 0.118 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -529592 sc-eQTL 2.36e-02 0.231 0.101 0.118 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 4.59e-01 0.0858 0.116 0.118 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 3.67e-02 0.283 0.134 0.121 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 6.46e-01 0.0688 0.15 0.121 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 8.31e-01 0.0265 0.124 0.121 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 2.82e-01 -0.124 0.115 0.121 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 2.71e-01 -0.141 0.127 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 6.88e-01 0.0533 0.132 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 4.76e-01 0.0787 0.11 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 4.95e-01 0.0667 0.0976 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -344419 sc-eQTL 1.29e-01 0.169 0.111 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0442 0.0699 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 4.06e-01 0.0769 0.0924 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 1.50e-01 0.145 0.1 0.118 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0133 0.119 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0855 0.0937 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0668 0.0887 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -344419 sc-eQTL 3.23e-01 0.0845 0.0854 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0475 0.0601 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 6.11e-01 0.0396 0.0777 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 3.72e-02 -0.192 0.0915 0.118 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0422 0.1 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 1.21e-01 -0.176 0.113 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00846 0.0724 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 2.58e-01 -0.072 0.0634 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -529592 sc-eQTL 4.53e-02 0.259 0.129 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 2.41e-01 -0.12 0.102 0.118 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 1.94e-01 0.143 0.11 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 3.40e-01 -0.115 0.121 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 3.08e-02 0.213 0.0979 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0719 0.0791 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -529592 sc-eQTL 9.31e-02 0.194 0.115 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0199 0.114 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -917622 sc-eQTL 5.16e-02 0.238 0.122 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -917816 sc-eQTL 9.46e-01 0.00572 0.084 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -686825 sc-eQTL 1.60e-01 0.129 0.0915 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -378608 sc-eQTL 2.63e-01 -0.115 0.102 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 sc-eQTL 7.10e-01 0.0441 0.119 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -352527 sc-eQTL 2.46e-01 -0.119 0.102 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000121769 FABP3 -997684 pQTL 4.52e-02 0.0534 0.0266 0.0 0.0 0.108
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -339338 eQTL 4.53e-02 0.0391 0.0195 0.0 0.0 0.109

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina