logo

Genes within 1Mb (chr1:30319406:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 1.32e-01 0.224 0.149 0.079 B L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 5.34e-01 0.0744 0.12 0.079 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 5.04e-02 0.196 0.0995 0.079 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -404179 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0566 0.105 0.079 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 6.58e-01 0.0366 0.0826 0.079 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0162 0.0968 0.079 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0191 0.115 0.079 B L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 7.79e-01 0.036 0.128 0.079 CD4T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 8.92e-01 0.0137 0.1 0.079 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 6.27e-01 0.0434 0.0893 0.079 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 1.02e-01 -0.162 0.0984 0.079 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0957 0.0883 0.079 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 5.82e-01 0.0584 0.106 0.079 CD4T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 2.81e-01 0.179 0.166 0.079 CD8T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0342 0.111 0.079 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 8.94e-01 0.013 0.0977 0.079 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0867 0.0947 0.079 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0725 0.111 0.079 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 3.17e-01 -0.14 0.139 0.079 CD8T L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 1.23e-01 -0.23 0.148 0.081 DC L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 4.25e-03 -0.5 0.173 0.081 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 3.88e-01 -0.12 0.138 0.081 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 3.23e-01 0.0976 0.0985 0.081 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 1.75e-01 -0.211 0.156 0.081 DC L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 8.12e-01 0.0276 0.116 0.079 Mono L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 1.39e-02 0.351 0.141 0.079 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 7.53e-01 0.0289 0.092 0.079 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 4.93e-01 0.058 0.0845 0.079 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -589352 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0434 0.163 0.079 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 1.81e-02 0.316 0.133 0.079 Mono L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 9.48e-01 0.0107 0.162 0.079 NK L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 5.74e-01 0.0622 0.111 0.079 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0223 0.116 0.079 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 4.75e-01 0.0956 0.133 0.079 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 3.17e-01 0.15 0.15 0.079 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 1.44e-01 0.202 0.138 0.079 NK L1
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0869 0.121 0.079 Other_T L1
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 2.99e-01 0.134 0.129 0.079 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 7.19e-01 0.0418 0.116 0.079 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 2.40e-01 -0.112 0.0948 0.079 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00987 0.156 0.079 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0483 0.162 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 8.51e-01 0.0381 0.203 0.077 B_Activated L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 8.01e-01 0.0516 0.205 0.077 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 8.47e-02 -0.327 0.188 0.077 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -404179 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0308 0.166 0.077 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 3.83e-02 0.239 0.114 0.077 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 2.18e-01 -0.23 0.186 0.077 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 9.59e-01 0.00849 0.166 0.077 B_Activated L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 3.62e-01 0.164 0.18 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0576 0.15 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0163 0.142 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -404179 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0118 0.147 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 7.83e-01 0.0249 0.0905 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 2.26e-01 -0.154 0.127 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 9.02e-01 0.0175 0.142 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 4.28e-01 0.138 0.174 0.08 B_Memory L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 3.60e-01 0.147 0.16 0.08 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 2.25e-01 0.169 0.139 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -404179 sc-eQTL 5.97e-02 -0.251 0.133 0.08 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 3.20e-01 0.118 0.118 0.08 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0107 0.136 0.08 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 5.31e-01 0.0995 0.159 0.08 B_Memory L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 2.69e-01 0.179 0.162 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 2.65e-01 0.156 0.14 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 3.15e-03 0.361 0.121 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -404179 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0478 0.125 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 8.10e-01 0.0202 0.0837 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 8.59e-01 0.0196 0.11 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 6.38e-01 0.064 0.136 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00428 0.174 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 4.91e-01 0.0988 0.143 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 5.21e-01 0.0902 0.14 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -404179 sc-eQTL 1.83e-01 -0.179 0.134 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 4.70e-01 0.0662 0.0914 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 9.92e-01 0.00141 0.133 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 3.24e-01 -0.142 0.144 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0509 0.172 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0455 0.169 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 5.02e-01 -0.112 0.166 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 1.79e-01 -0.198 0.147 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0351 0.162 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0605 0.143 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0134 0.133 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 9.85e-01 0.00219 0.118 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 7.49e-01 0.0303 0.0945 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0887 0.101 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0461 0.103 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 1.01e-01 0.193 0.117 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 4.66e-01 0.122 0.168 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 3.85e-01 0.118 0.135 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 7.30e-01 0.0414 0.12 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 6.31e-02 -0.184 0.0986 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 3.29e-01 -0.123 0.126 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 9.71e-01 0.00518 0.14 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 7.72e-01 0.0479 0.165 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 5.21e-01 0.101 0.157 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00433 0.131 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0306 0.133 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 9.33e-01 0.0131 0.155 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 1.66e-02 -0.365 0.151 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0988 0.18 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 9.77e-01 0.00405 0.138 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 4.91e-01 0.0926 0.134 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0152 0.149 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 8.58e-01 0.0279 0.156 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 8.33e-01 0.0311 0.147 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 1.23e-02 0.411 0.163 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 4.75e-01 -0.102 0.142 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0773 0.115 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0535 0.11 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0376 0.137 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 4.35e-01 -0.117 0.149 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 4.17e-01 0.145 0.179 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 2.04e-01 0.208 0.163 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 2.18e-01 0.19 0.154 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0254 0.161 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0137 0.149 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 3.64e-01 -0.137 0.151 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 1.96e-01 -0.229 0.176 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 4.89e-01 0.118 0.17 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0365 0.174 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 9.72e-01 0.00576 0.163 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 2.72e-01 -0.186 0.169 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 8.62e-01 0.0267 0.153 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 2.37e-01 -0.209 0.176 0.08 MAIT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 1.51e-01 0.225 0.156 0.08 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 9.20e-01 0.0152 0.15 0.08 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0443 0.142 0.08 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0181 0.158 0.08 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 1.79e-01 0.218 0.162 0.08 MAIT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 9.75e-01 0.00575 0.18 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0861 0.152 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 2.07e-01 -0.201 0.159 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 3.02e-01 -0.163 0.157 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 8.67e-01 0.0264 0.158 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 4.47e-01 -0.119 0.156 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 3.72e-01 0.152 0.17 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 2.29e-01 0.152 0.126 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 2.72e-01 -0.142 0.129 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 3.05e-01 0.141 0.138 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 7.46e-01 0.0561 0.173 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 5.90e-01 0.077 0.142 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 3.56e-01 0.165 0.178 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 7.27e-01 0.0555 0.159 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 4.01e-01 0.13 0.155 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 3.12e-01 -0.15 0.147 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 4.33e-01 0.123 0.157 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 8.46e-01 0.0297 0.152 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 1.43e-01 -0.244 0.166 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 8.59e-01 0.0232 0.13 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 5.90e-02 0.265 0.14 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 5.64e-01 0.0896 0.155 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 1.41e-01 0.242 0.164 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 7.21e-01 0.0546 0.153 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 1.46e-01 0.306 0.209 0.067 PB L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 5.55e-01 -0.145 0.244 0.067 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 4.33e-01 -0.167 0.212 0.067 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -404179 sc-eQTL 9.80e-01 0.00506 0.198 0.067 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 1.03e-01 -0.23 0.14 0.067 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 3.06e-01 -0.198 0.193 0.067 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 4.49e-01 0.156 0.206 0.067 PB L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0747 0.131 0.08 Pro_T L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 3.36e-01 0.16 0.166 0.08 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 2.28e-01 -0.187 0.155 0.08 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 1.27e-02 -0.276 0.11 0.08 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0979 0.155 0.08 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0313 0.143 0.08 Pro_T L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0632 0.172 0.079 Treg L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 2.65e-02 -0.368 0.165 0.079 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 5.86e-01 0.0726 0.133 0.079 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0565 0.153 0.079 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 4.28e-01 0.123 0.155 0.079 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00854 0.155 0.079 Treg L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 3.51e-01 -0.162 0.174 0.08 cDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 1.85e-02 -0.441 0.186 0.08 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 9.80e-02 -0.267 0.161 0.08 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 2.01e-01 0.145 0.113 0.08 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 6.97e-02 -0.279 0.153 0.08 cDC L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 3.32e-01 0.135 0.139 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 5.69e-01 0.0885 0.155 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 1.39e-01 0.155 0.105 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 8.47e-01 0.0178 0.0922 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -589352 sc-eQTL 4.59e-01 -0.129 0.174 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 3.06e-02 0.312 0.143 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 9.71e-01 0.00529 0.146 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 2.00e-03 0.528 0.169 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0554 0.125 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 1.96e-01 0.124 0.0955 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -589352 sc-eQTL 2.88e-01 -0.176 0.165 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 2.59e-01 0.161 0.143 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 9.71e-01 0.00763 0.209 0.088 gdT L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0164 0.179 0.088 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 7.22e-01 0.0659 0.185 0.088 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 5.01e-01 -0.135 0.201 0.088 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 1.36e-01 -0.276 0.184 0.088 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 3.07e-01 -0.183 0.179 0.088 gdT L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 1.79e-01 -0.217 0.161 0.08 intMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 5.26e-01 -0.11 0.173 0.08 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 4.53e-01 0.11 0.147 0.08 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 3.48e-01 0.108 0.115 0.08 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -589352 sc-eQTL 7.45e-01 0.0516 0.158 0.08 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 2.53e-01 0.179 0.156 0.08 intMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 3.53e-01 -0.143 0.153 0.077 ncMono L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 3.89e-01 0.141 0.163 0.077 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 3.70e-01 -0.12 0.133 0.077 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0518 0.121 0.077 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -589352 sc-eQTL 5.53e-01 0.0807 0.136 0.077 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 4.12e-01 0.126 0.154 0.077 ncMono L2
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 4.54e-01 -0.13 0.173 0.079 pDC L2
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 8.61e-03 -0.496 0.186 0.079 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 4.21e-01 -0.127 0.158 0.079 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 6.99e-01 0.0569 0.147 0.079 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 3.54e-01 -0.151 0.162 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 1.66e-01 0.238 0.171 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 9.31e-01 0.0123 0.143 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 8.05e-01 0.0313 0.127 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -404179 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0618 0.144 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 3.07e-01 0.0926 0.0905 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 2.32e-01 -0.143 0.12 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 5.93e-01 -0.07 0.131 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 5.28e-01 0.0993 0.157 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 3.01e-01 0.129 0.124 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 1.65e-02 0.28 0.116 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -404179 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0812 0.113 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 6.63e-01 0.0347 0.0796 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 5.69e-01 0.0586 0.103 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0194 0.122 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 4.72e-01 0.0953 0.132 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 1.21e-02 0.374 0.148 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 4.18e-01 0.0775 0.0954 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 4.09e-01 0.0694 0.0839 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -589352 sc-eQTL 3.01e-01 -0.177 0.171 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 2.10e-02 0.311 0.134 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 2.31e-01 -0.174 0.145 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 8.30e-01 0.0342 0.159 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 9.48e-01 0.00851 0.131 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 8.71e-01 0.017 0.104 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -589352 sc-eQTL 7.82e-01 0.0423 0.153 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 2.30e-01 0.181 0.15 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000060688 SNRNP40 -977382 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00234 0.163 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000121766 ZCCHC17 -977576 sc-eQTL 4.11e-01 0.0914 0.111 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -746585 sc-eQTL 9.46e-01 0.0082 0.122 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -438368 sc-eQTL 4.72e-01 0.0978 0.136 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -399098 sc-eQTL 3.20e-01 0.156 0.157 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -412287 sc-eQTL 9.22e-02 0.228 0.134 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000134644 \N -746585 2.95e-07 1.33e-07 5.93e-08 1.97e-07 1.03e-07 8.21e-08 1.81e-07 5.56e-08 1.59e-07 7.6e-08 1.59e-07 1.19e-07 1.87e-07 7.95e-08 5.72e-08 7.98e-08 4.18e-08 1.64e-07 6.92e-08 5.04e-08 1.27e-07 1.39e-07 1.58e-07 2.68e-08 1.72e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.06e-07 1.31e-07 1.05e-07 1.06e-07 3.39e-08 3.59e-08 9.76e-08 3.4e-08 3.07e-08 5.58e-08 8.37e-08 6.67e-08 3.82e-08 5.8e-08 1.46e-07 5.12e-08 1.3e-08 3.4e-08 1.65e-08 9.29e-08 1.91e-09 4.8e-08