logo

Genes within 1Mb (chr1:30173741:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 2.96e-02 -0.216 0.0985 0.1 B L1
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 2.74e-01 -0.13 0.118 0.1 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 7.31e-01 -0.031 0.0901 0.1 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -549844 sc-eQTL 5.42e-01 0.0578 0.0947 0.1 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0746 0.074 0.1 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 3.55e-01 0.0804 0.0868 0.1 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 8.30e-02 0.178 0.102 0.1 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 1.29e-01 -0.143 0.094 0.1 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 9.63e-01 0.00605 0.132 0.1 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0783 0.0804 0.1 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 1.90e-01 -0.117 0.089 0.1 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 5.43e-01 0.0486 0.0798 0.1 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0181 0.0957 0.1 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 2.44e-01 -0.12 0.102 0.1 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 3.66e-01 0.125 0.137 0.1 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 2.45e-01 -0.102 0.0877 0.1 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0954 0.0852 0.1 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 9.31e-01 0.00867 0.1 0.1 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 2.21e-01 0.154 0.125 0.1 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 8.87e-01 -0.02 0.141 0.101 DC L1
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 1.53e-01 0.223 0.155 0.101 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 3.54e-01 -0.116 0.125 0.101 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 5.40e-01 -0.055 0.0896 0.101 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00357 0.142 0.101 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0983 0.0987 0.1 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 6.97e-01 0.0568 0.146 0.1 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0128 0.0836 0.1 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0448 0.0768 0.1 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -735017 sc-eQTL 2.50e-01 -0.17 0.147 0.1 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0175 0.122 0.1 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 3.45e-01 -0.103 0.109 0.099 NK L1
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 2.24e-01 -0.174 0.143 0.099 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0308 0.104 0.099 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 3.73e-01 -0.106 0.119 0.099 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 2.23e-01 0.163 0.134 0.099 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 4.18e-01 0.1 0.124 0.099 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 1.11e-01 0.169 0.105 0.1 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 8.13e-01 0.0298 0.126 0.1 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 9.21e-01 0.0104 0.104 0.1 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 8.14e-03 -0.225 0.0842 0.1 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 7.72e-01 0.0406 0.14 0.1 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0649 0.146 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 3.84e-01 -0.148 0.169 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 1.56e-01 0.216 0.152 0.107 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 3.75e-01 -0.141 0.158 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -549844 sc-eQTL 4.26e-01 0.11 0.139 0.107 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00728 0.0968 0.107 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0337 0.156 0.107 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 4.87e-01 0.0962 0.138 0.107 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 9.50e-01 0.00823 0.131 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 2.02e-02 -0.353 0.151 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 2.71e-01 -0.142 0.129 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -549844 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0712 0.134 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0138 0.0825 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 6.31e-01 0.0557 0.116 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 9.61e-01 0.00635 0.13 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 8.58e-01 -0.024 0.134 0.101 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0166 0.152 0.101 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 2.33e-01 -0.152 0.127 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -549844 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0535 0.122 0.101 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 6.93e-01 0.0427 0.108 0.101 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0166 0.124 0.101 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 7.99e-01 0.0369 0.145 0.101 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 7.85e-02 -0.203 0.115 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0961 0.152 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 6.54e-01 0.0498 0.111 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -549844 sc-eQTL 9.44e-01 0.00795 0.113 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0216 0.0752 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 2.76e-01 0.108 0.0986 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 1.78e-02 0.288 0.12 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 7.72e-02 -0.229 0.129 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 8.34e-01 0.0319 0.152 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 3.36e-01 -0.12 0.125 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -549844 sc-eQTL 9.27e-01 0.011 0.12 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0437 0.0814 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00522 0.119 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 5.44e-01 0.0777 0.128 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0861 0.143 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 2.17e-01 0.18 0.145 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 8.08e-01 0.0355 0.146 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 1.30e-01 -0.197 0.13 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 7.15e-01 0.0521 0.143 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 2.43e-01 -0.147 0.126 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 1.99e-01 -0.125 0.0971 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 7.13e-01 0.0517 0.14 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 9.25e-01 0.0081 0.0858 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0924 0.0917 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 4.37e-01 0.0725 0.0932 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 7.01e-01 0.0412 0.107 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 2.00e-01 -0.148 0.115 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0947 0.156 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 1.27e-01 -0.166 0.109 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 1.12e-01 -0.144 0.0901 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 3.76e-01 0.102 0.115 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 3.44e-01 -0.121 0.128 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0481 0.142 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 4.76e-01 0.112 0.156 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 3.55e-02 -0.253 0.119 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 9.58e-01 0.00649 0.122 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 5.79e-02 -0.27 0.142 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 1.50e-01 0.202 0.14 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 7.79e-01 0.0345 0.123 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 4.15e-01 0.118 0.145 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 3.08e-01 -0.123 0.121 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 3.34e-01 -0.129 0.134 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 4.72e-02 0.279 0.14 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 9.40e-01 0.01 0.132 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0932 0.129 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 6.29e-01 0.0686 0.142 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 1.31e-01 -0.157 0.103 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 7.11e-01 -0.037 0.0997 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0942 0.124 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 6.53e-01 0.0609 0.135 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 1.08e-01 -0.248 0.154 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 4.84e-01 0.107 0.153 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 3.98e-01 0.121 0.143 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 3.91e-01 -0.129 0.15 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 2.58e-01 -0.157 0.139 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 9.67e-02 0.233 0.14 0.102 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 2.02e-01 -0.184 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 7.03e-01 0.0581 0.152 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 6.52e-01 0.0693 0.154 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 2.65e-01 -0.161 0.144 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0122 0.15 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 6.58e-01 -0.06 0.136 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 4.02e-01 0.116 0.138 0.102 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 9.93e-01 -0.0013 0.155 0.102 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 4.43e-01 0.103 0.133 0.102 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 4.34e-02 -0.254 0.125 0.102 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 4.79e-01 0.0995 0.14 0.102 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00173 0.145 0.102 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 6.06e-01 0.0785 0.152 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 5.53e-03 -0.415 0.148 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 7.38e-01 -0.047 0.14 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0144 0.139 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 3.52e-02 0.292 0.138 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 3.74e-01 0.122 0.137 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 3.53e-01 -0.104 0.112 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0855 0.152 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0154 0.116 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 1.45e-01 -0.18 0.123 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 7.57e-01 0.0478 0.154 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 3.31e-01 -0.124 0.127 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 2.98e-01 -0.155 0.149 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 3.27e-02 -0.319 0.148 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 9.77e-01 0.00402 0.14 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 1.64e-02 -0.318 0.131 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 1.66e-01 0.196 0.141 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 7.29e-01 0.0475 0.137 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0133 0.125 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 5.19e-01 0.1 0.155 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 1.13e-01 -0.199 0.125 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 3.14e-01 -0.139 0.138 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 7.43e-01 0.0481 0.146 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 8.21e-02 0.236 0.135 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00937 0.188 0.093 PB L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0392 0.169 0.093 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 4.27e-01 0.146 0.183 0.093 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -549844 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0936 0.171 0.093 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 1.37e-01 -0.181 0.121 0.093 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 1.26e-01 -0.255 0.165 0.093 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 4.82e-01 0.125 0.178 0.093 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 9.47e-01 0.00849 0.126 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 7.55e-02 0.229 0.128 0.102 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0655 0.141 0.102 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 6.56e-02 -0.185 0.1 0.102 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 6.25e-01 0.069 0.141 0.102 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 7.81e-01 0.036 0.13 0.102 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 3.63e-01 -0.122 0.134 0.1 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0778 0.161 0.1 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 3.54e-01 -0.111 0.119 0.1 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0227 0.137 0.1 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0224 0.14 0.1 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 2.30e-01 -0.167 0.139 0.1 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 6.59e-02 -0.275 0.149 0.105 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 3.40e-02 0.355 0.166 0.105 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 9.11e-01 0.0165 0.147 0.105 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0582 0.103 0.105 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0191 0.14 0.105 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0728 0.122 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 5.61e-01 0.0878 0.151 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 9.10e-01 0.0109 0.0957 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0561 0.0839 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -735017 sc-eQTL 3.77e-01 -0.14 0.158 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 6.61e-01 0.058 0.132 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 9.34e-01 0.00942 0.114 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 7.54e-01 0.0473 0.151 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 2.22e-01 0.138 0.113 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0284 0.0868 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -735017 sc-eQTL 9.86e-01 0.00256 0.15 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 8.21e-01 0.0293 0.129 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 1.23e-01 0.28 0.18 0.106 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 8.15e-01 0.0424 0.181 0.106 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 7.68e-01 0.0496 0.168 0.106 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 3.09e-01 -0.186 0.182 0.106 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0882 0.169 0.106 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 1.44e-01 -0.239 0.162 0.106 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0231 0.14 0.102 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 2.90e-01 -0.157 0.148 0.102 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 7.16e-01 -0.048 0.132 0.102 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 9.07e-01 0.012 0.103 0.102 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -735017 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0856 0.141 0.102 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00212 0.14 0.102 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 9.83e-01 0.00312 0.143 0.104 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 6.55e-01 0.0689 0.154 0.104 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 9.80e-01 -0.003 0.12 0.104 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0648 0.109 0.104 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -735017 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0339 0.122 0.104 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 9.80e-01 0.0035 0.138 0.104 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 7.15e-01 0.064 0.175 0.096 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 3.61e-01 -0.165 0.18 0.096 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0629 0.147 0.096 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0536 0.137 0.096 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0611 0.152 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0501 0.12 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 1.95e-01 -0.191 0.147 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 1.79e-02 -0.27 0.113 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -549844 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0353 0.131 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0634 0.082 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 7.51e-01 0.0345 0.109 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0319 0.118 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 7.94e-03 -0.286 0.107 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0592 0.141 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0654 0.106 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -549844 sc-eQTL 7.71e-01 0.0298 0.102 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0436 0.0719 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 2.09e-01 0.117 0.0926 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 2.54e-02 0.246 0.109 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0927 0.109 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 6.84e-01 0.0595 0.146 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 5.40e-01 0.0538 0.0876 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00589 0.077 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -735017 sc-eQTL 3.63e-01 -0.143 0.157 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 5.52e-01 0.0739 0.124 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0485 0.127 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0206 0.145 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 3.78e-01 -0.103 0.116 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0318 0.093 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -735017 sc-eQTL 2.65e-01 -0.151 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 4.48e-01 -0.102 0.134 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 991841 sc-eQTL 3.15e-01 -0.108 0.107 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 942799 sc-eQTL 4.89e-01 -0.102 0.148 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -892250 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0774 0.109 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -584033 sc-eQTL 2.90e-01 -0.129 0.122 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -544763 sc-eQTL 3.89e-01 0.121 0.14 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -557952 sc-eQTL 5.64e-01 0.0701 0.121 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 \N -735017 3.02e-07 1.33e-07 5.93e-08 2.05e-07 1.03e-07 8.33e-08 1.9e-07 5.62e-08 1.59e-07 7.6e-08 1.63e-07 1.19e-07 1.95e-07 7.95e-08 5.69e-08 8.08e-08 4.45e-08 1.64e-07 7.12e-08 5.07e-08 1.22e-07 1.42e-07 1.58e-07 3.07e-08 1.98e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.1e-07 1.31e-07 1.06e-07 1.09e-07 3.39e-08 3.38e-08 8.89e-08 2.97e-08 2.79e-08 5.74e-08 8.68e-08 6.67e-08 3.99e-08 5.94e-08 1.59e-07 5.08e-08 1.11e-08 3.29e-08 1.65e-08 9.96e-08 1.91e-09 4.82e-08