Genes within 1Mb (chr1:30164550:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 1.24e-01 -0.132 0.0857 0.126 B L1
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 9.71e-01 0.0038 0.103 0.126 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 7.83e-01 0.0215 0.078 0.126 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -559035 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0937 0.0817 0.126 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 8.42e-01 0.0128 0.0642 0.126 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 4.70e-01 0.0544 0.0752 0.126 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 7.36e-01 0.03 0.089 0.126 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0869 0.083 0.126 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0353 0.116 0.126 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 1.60e-01 0.0997 0.0706 0.126 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 1.63e-01 0.11 0.0783 0.126 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 1.36e-02 0.172 0.0693 0.126 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 3.15e-02 0.18 0.0833 0.126 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 2.16e-01 -0.113 0.0911 0.126 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0892 0.122 0.126 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 1.13e-01 0.124 0.0778 0.126 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 1.80e-02 0.179 0.075 0.126 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 6.82e-01 0.0365 0.0891 0.126 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0138 0.112 0.126 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 1.18e-01 -0.19 0.121 0.131 DC L1
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0865 0.134 0.131 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 7.10e-01 0.0402 0.108 0.131 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0852 0.077 0.131 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0689 0.122 0.131 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0221 0.0875 0.126 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0562 0.129 0.126 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 8.10e-01 0.0178 0.0739 0.126 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 4.76e-01 0.0485 0.0679 0.126 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -744208 sc-eQTL 2.11e-01 0.163 0.13 0.126 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 1.12e-01 0.171 0.107 0.126 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0965 0.0987 0.127 NK L1
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 9.93e-01 0.00117 0.13 0.127 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 5.21e-01 0.0604 0.094 0.127 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 5.54e-01 0.0641 0.108 0.127 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0752 0.122 0.127 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 8.27e-01 0.0247 0.112 0.127 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 1.93e-01 -0.12 0.0922 0.126 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 6.77e-01 0.0458 0.11 0.126 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00859 0.0912 0.126 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 7.10e-01 0.0279 0.0747 0.126 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 6.81e-01 0.0503 0.122 0.126 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 1.95e-01 -0.165 0.127 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 1.48e-01 0.218 0.15 0.125 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 2.16e-01 0.168 0.135 0.125 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 2.44e-01 -0.165 0.141 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -559035 sc-eQTL 6.45e-01 -0.057 0.123 0.125 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0237 0.0861 0.125 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 2.27e-02 -0.315 0.137 0.125 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 8.30e-01 0.0265 0.123 0.125 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 7.07e-02 -0.206 0.114 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00511 0.134 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 3.33e-01 -0.109 0.113 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -559035 sc-eQTL 4.56e-02 -0.234 0.116 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 5.63e-01 0.0417 0.0721 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 2.50e-01 0.116 0.101 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 8.33e-01 0.0239 0.113 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 1.32e-01 -0.177 0.117 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 3.79e-02 -0.275 0.132 0.127 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 3.22e-01 -0.111 0.111 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -559035 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0879 0.107 0.127 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0053 0.0947 0.127 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 6.53e-01 0.0488 0.108 0.127 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 1.96e-01 0.164 0.126 0.127 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 3.08e-01 -0.103 0.101 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 6.55e-02 0.243 0.131 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 9.89e-01 0.00138 0.0967 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -559035 sc-eQTL 9.08e-02 -0.166 0.0974 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 4.82e-01 -0.046 0.0654 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 6.48e-01 0.0394 0.086 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 3.21e-02 0.227 0.105 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 2.60e-01 -0.13 0.115 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 1.89e-01 -0.177 0.134 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 5.10e-01 0.0733 0.111 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -559035 sc-eQTL 3.27e-01 0.105 0.107 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 5.61e-01 0.0422 0.0725 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 9.83e-01 0.00225 0.106 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 2.38e-01 -0.135 0.114 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0469 0.126 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 6.30e-01 0.0617 0.128 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 6.30e-01 0.062 0.129 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 1.03e-01 0.186 0.114 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 3.63e-05 0.507 0.12 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 2.13e-01 0.138 0.11 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 1.01e-01 -0.14 0.0849 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 8.45e-01 0.024 0.123 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 3.22e-01 0.0746 0.0751 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 2.79e-01 0.0873 0.0804 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 7.08e-02 0.147 0.0812 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 1.47e-01 0.136 0.0935 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 4.14e-01 0.0831 0.101 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 1.65e-01 -0.19 0.136 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 3.06e-01 0.0983 0.0957 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 2.74e-01 0.0871 0.0794 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 4.66e-02 0.2 0.1 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 1.42e-01 0.165 0.112 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 2.96e-02 -0.271 0.124 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 3.81e-01 0.121 0.138 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 3.03e-01 -0.11 0.106 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 4.71e-01 0.0777 0.108 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 2.05e-01 0.16 0.126 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 7.38e-02 0.221 0.123 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 8.66e-02 -0.185 0.107 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 2.59e-02 -0.282 0.126 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 4.81e-01 0.0748 0.106 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 9.17e-01 0.0123 0.117 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 7.86e-01 0.0336 0.123 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 1.46e-01 0.169 0.116 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 3.47e-01 -0.108 0.114 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 8.90e-01 0.0175 0.126 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 2.03e-01 0.117 0.0919 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 5.67e-02 0.168 0.0876 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0822 0.11 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 5.77e-01 0.0671 0.12 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0351 0.14 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 5.40e-02 0.267 0.138 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 2.57e-01 0.147 0.129 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 7.78e-01 0.0384 0.136 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0563 0.126 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0953 0.127 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 6.17e-01 0.0639 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 9.65e-01 0.00584 0.135 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 5.99e-01 0.0715 0.136 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0576 0.128 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 6.80e-01 0.0547 0.133 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 7.64e-01 -0.036 0.12 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 1.01e-01 -0.197 0.12 0.128 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0545 0.136 0.128 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 6.26e-01 0.0569 0.117 0.128 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 4.26e-01 0.0878 0.11 0.128 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 4.11e-01 0.101 0.123 0.128 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 8.42e-01 0.0252 0.126 0.128 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 2.54e-01 -0.156 0.136 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 2.20e-01 0.166 0.135 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 3.28e-01 -0.123 0.126 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 3.91e-01 0.107 0.124 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 1.44e-02 -0.304 0.123 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 8.70e-01 0.0202 0.123 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0325 0.101 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 9.62e-01 0.00654 0.138 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 7.14e-01 0.0384 0.105 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 5.08e-01 0.0739 0.112 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0467 0.14 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0689 0.115 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0803 0.13 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 2.38e-01 0.155 0.131 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 1.32e-01 0.183 0.121 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 4.10e-01 0.096 0.116 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0846 0.124 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 4.84e-01 0.0839 0.12 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 2.08e-01 -0.14 0.111 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 4.34e-01 -0.108 0.137 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 2.93e-01 0.117 0.111 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 8.33e-01 0.0258 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0492 0.13 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 2.42e-01 0.141 0.12 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 6.59e-01 0.0699 0.158 0.119 PB L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0356 0.142 0.119 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 4.19e-02 0.311 0.151 0.119 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -559035 sc-eQTL 7.13e-01 0.0528 0.144 0.119 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 2.30e-01 -0.123 0.102 0.119 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 2.10e-01 -0.176 0.139 0.119 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 3.63e-01 0.136 0.149 0.119 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0786 0.11 0.126 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 3.59e-01 -0.103 0.112 0.126 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 6.12e-01 0.0621 0.122 0.126 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0884 0.0874 0.126 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0104 0.122 0.126 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0597 0.113 0.126 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 1.14e-01 0.187 0.118 0.126 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 2.70e-01 -0.157 0.142 0.126 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 2.48e-01 0.122 0.105 0.126 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 8.43e-01 0.024 0.121 0.126 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0597 0.123 0.126 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 4.70e-01 0.0889 0.123 0.126 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 3.53e-03 -0.387 0.131 0.127 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00173 0.151 0.127 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 5.63e-01 0.0762 0.132 0.127 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 1.29e-01 0.14 0.0918 0.127 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 1.29e-01 -0.19 0.125 0.127 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 1.48e-01 -0.153 0.105 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0547 0.131 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0281 0.0829 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 2.44e-01 0.0847 0.0725 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -744208 sc-eQTL 2.19e-01 0.168 0.137 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 2.46e-01 0.133 0.114 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 7.63e-01 0.0301 0.0994 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 8.20e-01 0.0299 0.131 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 1.59e-01 0.138 0.0977 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 3.03e-01 0.0778 0.0753 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -744208 sc-eQTL 6.36e-01 0.0617 0.13 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 8.91e-01 0.0154 0.113 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 5.63e-01 0.0955 0.165 0.142 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 1.96e-01 0.212 0.163 0.142 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 2.54e-01 -0.174 0.152 0.142 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0461 0.166 0.142 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0673 0.153 0.142 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 4.64e-01 -0.109 0.148 0.142 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 6.76e-01 0.052 0.124 0.129 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00552 0.132 0.129 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 4.30e-02 -0.235 0.116 0.129 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 5.67e-01 0.0525 0.0915 0.129 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -744208 sc-eQTL 6.25e-01 0.0613 0.125 0.129 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 3.83e-01 0.109 0.124 0.129 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 4.48e-01 0.0968 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0548 0.137 0.127 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 5.61e-01 -0.062 0.107 0.127 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 8.42e-01 0.0193 0.0969 0.127 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -744208 sc-eQTL 8.65e-01 0.0185 0.109 0.127 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 6.79e-01 0.0509 0.123 0.127 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 3.67e-01 0.131 0.145 0.13 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 2.41e-02 -0.334 0.147 0.13 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 5.63e-01 0.0708 0.122 0.13 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 9.62e-02 -0.188 0.112 0.13 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 1.35e-01 0.187 0.125 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 5.12e-02 -0.205 0.105 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0469 0.13 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 1.20e-01 -0.157 0.101 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -559035 sc-eQTL 2.31e-01 -0.138 0.115 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 8.79e-01 0.0111 0.0724 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 8.72e-01 0.0155 0.0958 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 9.78e-01 0.00287 0.104 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 9.94e-02 -0.156 0.0942 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 6.71e-01 0.0527 0.124 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 2.89e-01 0.0985 0.0926 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -559035 sc-eQTL 2.46e-01 -0.104 0.0891 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0349 0.0629 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 3.73e-01 0.0724 0.0811 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 3.80e-01 0.0847 0.0964 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0598 0.0937 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0833 0.125 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 6.54e-01 0.0338 0.0752 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 4.54e-01 0.0495 0.066 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -744208 sc-eQTL 1.53e-01 0.192 0.134 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 2.85e-01 0.114 0.106 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 6.07e-01 0.0589 0.114 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 8.94e-01 0.0173 0.13 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0865 0.105 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 7.62e-01 0.0254 0.0838 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -744208 sc-eQTL 6.83e-01 0.05 0.122 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 5.39e-01 0.0741 0.121 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 982650 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0727 0.0963 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 933608 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0441 0.133 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -901441 sc-eQTL 3.50e-01 0.0918 0.098 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -593224 sc-eQTL 4.73e-01 0.0788 0.11 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0455 0.127 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -567143 sc-eQTL 9.14e-01 0.0117 0.109 0.127 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116353 MECR 933608 eQTL 0.0564 -0.0486 0.0254 0.0012 0.0 0.153
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -553954 eQTL 3.97e-02 -0.035 0.017 0.0 0.0 0.153


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 \N -593224 4.21e-07 1.92e-07 6.99e-08 2.36e-07 1.02e-07 1.08e-07 2.95e-07 7.46e-08 2.26e-07 1.28e-07 2.47e-07 1.91e-07 3.48e-07 8.66e-08 7.98e-08 1.14e-07 8.42e-08 2.66e-07 7.76e-08 8.52e-08 1.34e-07 2.07e-07 1.89e-07 4.81e-08 2.86e-07 1.86e-07 1.39e-07 1.46e-07 1.54e-07 1.81e-07 1.52e-07 4.78e-08 4.76e-08 9.09e-08 7.55e-08 4.86e-08 6.14e-08 6.78e-08 4.75e-08 7.92e-08 4.46e-08 1.79e-07 3.59e-08 1.43e-08 4.91e-08 9.86e-09 9.07e-08 0.0 4.61e-08