logo

Genes within 1Mb (chr1:30130100:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 9.26e-01 0.0109 0.118 0.073 B L1
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 9.17e-01 0.0146 0.14 0.073 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0181 0.107 0.073 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -593485 sc-eQTL 3.76e-01 0.0992 0.112 0.073 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 2.75e-01 0.0958 0.0875 0.073 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 2.38e-01 -0.121 0.103 0.073 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 1.96e-01 -0.157 0.121 0.073 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 2.70e-01 0.123 0.111 0.073 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 6.26e-01 0.0756 0.155 0.073 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 6.12e-01 0.0481 0.0947 0.073 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 4.05e-01 0.0875 0.105 0.073 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 4.73e-02 -0.186 0.093 0.073 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0279 0.112 0.073 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 7.19e-01 0.0435 0.121 0.073 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 2.65e-01 -0.18 0.161 0.073 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 9.32e-01 0.00878 0.103 0.073 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 2.93e-01 0.106 0.1 0.073 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 9.48e-01 0.00762 0.118 0.073 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 4.70e-01 -0.107 0.148 0.073 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0994 0.166 0.074 DC L1
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 5.68e-01 0.104 0.183 0.074 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 3.17e-01 0.148 0.147 0.074 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 5.36e-01 0.0653 0.105 0.074 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 3.50e-01 0.156 0.166 0.074 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 2.72e-01 -0.128 0.117 0.073 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 9.76e-01 0.00509 0.172 0.073 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 4.18e-01 -0.08 0.0986 0.073 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0699 0.0907 0.073 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -778658 sc-eQTL 7.43e-02 -0.311 0.173 0.073 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0673 0.144 0.073 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0456 0.13 0.073 NK L1
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 2.59e-01 0.193 0.17 0.073 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00172 0.124 0.073 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 3.47e-02 0.299 0.141 0.073 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 9.17e-02 0.269 0.159 0.073 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 6.30e-01 0.0712 0.147 0.073 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0462 0.124 0.073 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 4.23e-01 -0.118 0.147 0.073 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 4.67e-01 0.089 0.122 0.073 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0394 0.1 0.073 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 7.46e-01 0.0533 0.164 0.073 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0386 0.171 0.073 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 4.93e-01 -0.14 0.203 0.071 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 4.36e-01 -0.143 0.183 0.071 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 4.43e-01 -0.146 0.19 0.071 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -593485 sc-eQTL 3.35e-01 0.161 0.166 0.071 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 2.20e-02 0.264 0.114 0.071 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 7.25e-01 -0.066 0.187 0.071 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 5.07e-01 -0.11 0.166 0.071 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 4.26e-02 0.307 0.151 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 3.63e-01 0.161 0.177 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 2.86e-01 0.16 0.15 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -593485 sc-eQTL 3.67e-01 0.141 0.156 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 2.05e-02 0.221 0.0947 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 2.63e-02 -0.298 0.133 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 6.65e-02 -0.276 0.149 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0698 0.156 0.073 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 8.07e-01 0.0431 0.176 0.073 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 8.69e-01 0.0243 0.148 0.073 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -593485 sc-eQTL 7.36e-01 0.0476 0.141 0.073 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 4.32e-02 0.252 0.124 0.073 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 3.75e-01 -0.127 0.143 0.073 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0173 0.168 0.073 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 8.99e-01 0.0173 0.136 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 5.18e-01 0.115 0.178 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 2.56e-01 -0.148 0.13 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -593485 sc-eQTL 8.54e-01 0.0242 0.132 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 7.37e-02 0.157 0.0875 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0823 0.116 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 6.25e-01 -0.07 0.143 0.073 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 6.51e-01 -0.07 0.154 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 1.38e-01 -0.267 0.179 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0177 0.149 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -593485 sc-eQTL 6.04e-02 -0.267 0.141 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 6.33e-01 0.0462 0.0968 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0102 0.141 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0268 0.152 0.073 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 3.52e-01 0.156 0.167 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 2.17e-02 0.389 0.168 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 3.31e-02 0.363 0.169 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 3.32e-01 0.148 0.152 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 6.13e-01 0.0844 0.167 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0275 0.147 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 4.75e-01 0.0811 0.113 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 8.39e-01 0.0331 0.163 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 9.35e-01 0.00812 0.0997 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 3.65e-01 0.0969 0.107 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 9.85e-02 -0.179 0.108 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00467 0.125 0.073 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 4.06e-01 0.111 0.133 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 3.57e-01 -0.166 0.18 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 5.50e-01 0.0754 0.126 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 1.85e-01 0.139 0.104 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 5.64e-02 -0.253 0.132 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0657 0.148 0.073 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 6.94e-02 0.3 0.165 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 1.46e-01 0.265 0.182 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 3.65e-01 -0.128 0.141 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0347 0.143 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0455 0.167 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 1.30e-01 -0.249 0.164 0.073 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 6.62e-02 0.266 0.144 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 9.90e-02 -0.281 0.17 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 5.19e-01 0.092 0.142 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 5.83e-01 0.0868 0.158 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 2.82e-01 -0.178 0.165 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 4.98e-01 0.106 0.156 0.073 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 2.34e-01 0.18 0.151 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0512 0.167 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 8.79e-01 0.0186 0.122 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 5.28e-01 0.0739 0.117 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 5.38e-01 0.09 0.146 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 3.59e-01 -0.146 0.159 0.073 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 2.88e-01 0.188 0.177 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000731 0.176 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 3.46e-01 -0.155 0.164 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 5.33e-01 -0.107 0.172 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 2.87e-01 -0.17 0.159 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 3.99e-01 -0.136 0.161 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0802 0.168 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 6.57e-01 0.0788 0.177 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 7.61e-01 0.0544 0.179 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 1.61e-01 0.235 0.167 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 4.00e-02 0.357 0.173 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 5.16e-01 -0.103 0.158 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 3.66e-01 -0.152 0.168 0.074 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 4.79e-01 -0.134 0.189 0.074 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0094 0.163 0.074 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0525 0.154 0.074 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 3.42e-01 0.163 0.171 0.074 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 9.77e-01 0.00518 0.176 0.074 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0305 0.182 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 5.62e-01 0.105 0.181 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 6.86e-02 -0.306 0.167 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0983 0.166 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 2.29e-01 0.201 0.167 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 2.54e-01 -0.188 0.164 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0435 0.131 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 3.96e-01 0.152 0.179 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 4.60e-01 0.1 0.136 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 8.93e-02 0.245 0.144 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 1.09e-01 0.29 0.18 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0792 0.15 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 3.26e-01 -0.17 0.172 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 5.54e-01 -0.103 0.173 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 3.03e-01 0.166 0.161 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 2.20e-01 0.189 0.153 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 6.23e-01 0.0807 0.164 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 9.40e-01 0.0119 0.158 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0535 0.149 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 3.66e-01 0.167 0.184 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0873 0.149 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 3.49e-02 0.345 0.162 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0119 0.174 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 3.41e-01 0.154 0.162 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0717 0.213 0.067 PB L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 5.56e-01 -0.113 0.192 0.067 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 7.85e-01 0.057 0.208 0.067 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -593485 sc-eQTL 3.90e-01 0.167 0.193 0.067 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 9.13e-02 0.233 0.137 0.067 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0037 0.19 0.067 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 6.20e-01 0.1 0.202 0.067 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 4.02e-01 -0.124 0.148 0.072 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 2.63e-01 -0.169 0.151 0.072 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0555 0.165 0.072 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0932 0.118 0.072 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 8.51e-01 0.031 0.165 0.072 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0803 0.152 0.072 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0542 0.158 0.073 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 8.69e-01 0.0314 0.19 0.073 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 9.85e-01 0.00265 0.141 0.073 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 3.57e-01 0.149 0.161 0.073 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 2.54e-01 0.187 0.164 0.073 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0778 0.164 0.073 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 2.12e-01 -0.22 0.176 0.076 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 9.85e-01 0.00381 0.199 0.076 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 2.44e-01 0.202 0.173 0.076 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 4.08e-02 0.248 0.12 0.076 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 6.98e-01 0.0642 0.165 0.076 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 1.61e-01 -0.202 0.143 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 5.43e-01 0.108 0.178 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0816 0.113 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0926 0.0989 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -778658 sc-eQTL 4.72e-01 -0.134 0.187 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 6.24e-01 0.0764 0.156 0.073 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00198 0.133 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 4.82e-01 -0.124 0.176 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 9.38e-01 0.0103 0.132 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 3.03e-01 -0.104 0.101 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -778658 sc-eQTL 4.85e-02 -0.344 0.173 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 2.66e-01 -0.168 0.151 0.073 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 7.15e-01 0.0805 0.22 0.07 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 6.84e-01 0.0896 0.219 0.07 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 4.46e-01 0.156 0.204 0.07 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 4.76e-01 -0.158 0.222 0.07 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 3.18e-01 -0.204 0.204 0.07 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 3.25e-01 -0.195 0.198 0.07 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 3.91e-01 -0.143 0.166 0.073 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0586 0.176 0.073 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 4.19e-03 -0.443 0.153 0.073 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 2.69e-01 -0.135 0.122 0.073 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -778658 sc-eQTL 4.96e-01 -0.114 0.168 0.073 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 3.36e-01 -0.16 0.166 0.073 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0544 0.173 0.07 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 4.88e-01 0.13 0.187 0.07 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 6.78e-01 0.0604 0.145 0.07 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 2.19e-01 -0.162 0.131 0.07 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -778658 sc-eQTL 4.92e-01 0.101 0.147 0.07 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 6.93e-01 -0.066 0.167 0.07 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 8.59e-01 0.0344 0.194 0.073 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 3.79e-01 0.175 0.199 0.073 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 6.11e-01 0.0831 0.163 0.073 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0987 0.152 0.073 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 5.46e-01 0.101 0.168 0.073 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 2.71e-01 0.154 0.14 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 5.26e-01 0.11 0.173 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 3.95e-01 0.115 0.134 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -593485 sc-eQTL 7.03e-02 0.277 0.152 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 2.55e-02 0.214 0.0952 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 5.47e-02 -0.244 0.126 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 1.03e-01 -0.226 0.138 0.073 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0171 0.128 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0505 0.167 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0308 0.125 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -593485 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00758 0.12 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 2.49e-01 0.0976 0.0845 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0366 0.109 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0842 0.13 0.073 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 2.99e-01 -0.133 0.128 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 9.57e-01 -0.0093 0.171 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0444 0.103 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0757 0.0901 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -778658 sc-eQTL 1.04e-01 -0.299 0.183 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 7.71e-01 0.0424 0.145 0.073 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0359 0.154 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 6.06e-01 0.0904 0.175 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 3.93e-01 -0.121 0.141 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 6.77e-01 -0.047 0.113 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -778658 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0516 0.165 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 3.23e-01 -0.16 0.162 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 948200 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0523 0.126 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 899158 sc-eQTL 4.11e-01 0.143 0.173 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -935891 sc-eQTL 4.81e-01 0.0902 0.128 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -627674 sc-eQTL 2.82e-02 0.313 0.141 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -588404 sc-eQTL 1.33e-01 0.248 0.164 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -601593 sc-eQTL 5.89e-01 0.0771 0.142 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162512 SDC3 -778658 eQTL 0.0213 -0.11 0.0477 0.0 0.0 0.0697

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina