logo

Genes within 1Mb (chr1:30126249:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0262 0.075 0.182 B L1
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 5.70e-01 0.0508 0.0893 0.182 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 1.03e-01 0.111 0.0675 0.182 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -597336 sc-eQTL 1.04e-01 -0.116 0.071 0.182 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 5.33e-02 -0.108 0.0554 0.182 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0593 0.0654 0.182 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 9.87e-01 0.00124 0.0776 0.182 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0606 0.0718 0.182 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 1.27e-01 -0.153 0.0996 0.182 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 2.66e-01 0.0682 0.0611 0.182 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 8.48e-01 -0.013 0.0679 0.182 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0534 0.0607 0.182 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 5.41e-01 0.0445 0.0727 0.182 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 7.82e-02 -0.14 0.0793 0.182 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 2.60e-01 -0.121 0.107 0.182 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0161 0.0684 0.182 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 7.60e-01 0.0203 0.0664 0.182 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0682 0.0777 0.182 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 3.88e-01 0.0846 0.0977 0.182 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 2.13e-01 -0.133 0.106 0.18 DC L1
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0342 0.118 0.18 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 4.33e-03 -0.268 0.0929 0.18 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 6.56e-01 0.0302 0.0677 0.18 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 7.45e-01 0.0349 0.107 0.18 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0215 0.0747 0.182 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 2.36e-01 -0.13 0.11 0.182 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 3.00e-01 0.0654 0.0629 0.182 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0442 0.0579 0.182 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -782509 sc-eQTL 4.93e-01 0.0765 0.111 0.182 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 4.10e-01 0.076 0.092 0.182 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 8.19e-01 0.0194 0.0848 0.182 NK L1
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0631 0.112 0.182 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 5.54e-01 0.0477 0.0806 0.182 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0495 0.0928 0.182 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0451 0.104 0.182 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0356 0.0963 0.182 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 1.29e-01 -0.123 0.0805 0.182 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 2.79e-01 0.104 0.0957 0.182 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 8.94e-01 0.0107 0.0797 0.182 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0212 0.0653 0.182 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 1.55e-01 0.152 0.106 0.182 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0748 0.111 0.182 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 2.88e-01 0.139 0.131 0.176 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 2.55e-01 -0.134 0.117 0.176 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 2.83e-01 -0.132 0.122 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -597336 sc-eQTL 2.67e-01 -0.119 0.107 0.176 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 8.71e-01 0.0122 0.0747 0.176 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0877 0.12 0.176 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 1.11e-01 0.17 0.106 0.176 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 1.80e-01 -0.131 0.0972 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 3.00e-01 0.118 0.114 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0333 0.0963 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -597336 sc-eQTL 9.69e-03 -0.258 0.0987 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0437 0.0615 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0217 0.0864 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 3.47e-01 0.091 0.0965 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 6.49e-01 0.046 0.101 0.183 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0484 0.114 0.183 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0334 0.0956 0.183 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -597336 sc-eQTL 7.40e-01 0.0304 0.0915 0.183 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 6.20e-02 -0.151 0.0804 0.183 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 6.34e-01 0.0442 0.0927 0.183 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 8.67e-01 0.0182 0.109 0.183 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 3.18e-01 0.0867 0.0866 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 1.75e-01 0.155 0.114 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 8.01e-02 0.145 0.0827 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -597336 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0315 0.0845 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0239 0.0564 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 5.09e-01 -0.049 0.0741 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 5.91e-01 0.0492 0.0915 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0705 0.0975 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 8.21e-01 0.0258 0.114 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 7.14e-01 0.0344 0.0939 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -597336 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0366 0.0901 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 8.68e-01 0.0102 0.0612 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 8.40e-01 -0.018 0.0891 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 5.91e-01 0.0518 0.0962 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 9.02e-01 0.0139 0.113 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 6.64e-01 0.05 0.115 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 3.58e-01 -0.106 0.115 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 5.63e-01 0.0596 0.103 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 6.31e-01 0.0541 0.113 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 5.60e-01 0.058 0.0993 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0677 0.0754 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 6.28e-02 -0.202 0.108 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 2.42e-01 0.0777 0.0663 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 7.85e-01 0.0194 0.0712 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0463 0.0722 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 4.03e-01 0.0695 0.0829 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0843 0.0886 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0434 0.12 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 5.28e-02 0.162 0.0832 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 4.47e-01 -0.053 0.0695 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 1.66e-01 -0.122 0.0879 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 9.84e-01 0.00194 0.0984 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0353 0.108 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 5.55e-01 0.0703 0.119 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 6.46e-01 0.0422 0.0918 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 7.62e-01 0.0282 0.0929 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0372 0.109 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 2.43e-01 0.125 0.107 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 1.20e-01 -0.147 0.0941 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0462 0.111 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 7.80e-01 -0.026 0.093 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0467 0.103 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 4.88e-01 0.0751 0.108 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 6.32e-01 0.0488 0.102 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0881 0.0996 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 2.45e-01 -0.128 0.109 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 7.44e-01 0.0263 0.0805 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 5.63e-01 0.0447 0.0771 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 1.23e-01 -0.148 0.0957 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 6.60e-02 0.192 0.104 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 7.14e-01 0.0433 0.118 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0666 0.117 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00568 0.11 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 1.05e-01 0.186 0.114 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0951 0.106 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 3.10e-01 0.109 0.107 0.185 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 3.30e-01 0.107 0.109 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 3.43e-01 0.11 0.115 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0813 0.116 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 3.40e-01 0.104 0.109 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 7.36e-01 0.0384 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00358 0.103 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0198 0.109 0.182 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 1.53e-02 0.294 0.12 0.182 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0342 0.105 0.182 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 9.65e-01 0.00437 0.0991 0.182 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 2.82e-01 0.119 0.11 0.182 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0323 0.114 0.182 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0652 0.118 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 9.21e-01 0.0116 0.117 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 1.89e-01 -0.143 0.108 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 5.87e-01 0.0584 0.107 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 1.01e-01 -0.177 0.107 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 6.62e-02 0.195 0.105 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 5.31e-01 0.0547 0.0871 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0242 0.119 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 7.37e-01 0.0303 0.09 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0319 0.096 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0385 0.12 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 9.59e-01 0.00508 0.0992 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0314 0.114 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 8.18e-01 0.0264 0.115 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0564 0.107 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 4.48e-01 0.0774 0.102 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 7.45e-01 0.0353 0.108 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 5.65e-01 0.0603 0.105 0.18 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00911 0.0963 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 3.65e-01 -0.108 0.119 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 2.06e-01 0.122 0.0961 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0199 0.106 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 8.05e-01 0.0278 0.113 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0649 0.105 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 3.06e-01 0.136 0.132 0.185 PB L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 9.65e-02 0.198 0.118 0.185 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0446 0.13 0.185 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -597336 sc-eQTL 3.20e-01 -0.12 0.12 0.185 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0755 0.0861 0.185 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0311 0.118 0.185 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 3.47e-01 0.118 0.125 0.185 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 6.51e-01 0.0433 0.0955 0.176 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0725 0.0975 0.176 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0768 0.106 0.176 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 1.07e-01 -0.123 0.0758 0.176 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 2.83e-01 0.114 0.106 0.176 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 8.02e-01 0.0246 0.098 0.176 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 9.83e-01 0.00224 0.103 0.182 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 9.18e-01 0.0128 0.124 0.182 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0308 0.0921 0.182 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 7.19e-01 -0.038 0.105 0.182 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 3.39e-01 -0.103 0.107 0.182 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 2.02e-02 0.248 0.106 0.182 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 1.28e-01 -0.173 0.113 0.183 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 2.51e-01 -0.146 0.127 0.183 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0551 0.111 0.183 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 4.08e-01 0.0647 0.078 0.183 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0732 0.106 0.183 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0428 0.0914 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0711 0.113 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 9.73e-01 -0.0024 0.0717 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 9.58e-01 0.0033 0.0629 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -782509 sc-eQTL 7.81e-01 0.033 0.119 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 3.58e-01 0.0909 0.0987 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 7.19e-01 0.0315 0.0874 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 1.22e-01 -0.178 0.115 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 5.80e-03 0.236 0.0848 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0126 0.0663 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -782509 sc-eQTL 7.55e-01 0.0357 0.115 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 7.49e-01 0.0316 0.0989 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0647 0.142 0.188 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 2.26e-01 -0.172 0.141 0.188 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 4.13e-01 0.108 0.132 0.188 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00201 0.143 0.188 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 6.99e-01 0.0512 0.132 0.188 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0657 0.128 0.188 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0117 0.106 0.184 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0148 0.113 0.184 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0632 0.0999 0.184 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 9.14e-01 0.00848 0.0784 0.184 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -782509 sc-eQTL 7.38e-01 0.036 0.107 0.184 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 5.83e-01 0.0585 0.106 0.184 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 7.26e-01 -0.038 0.108 0.183 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0296 0.117 0.183 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0698 0.0905 0.183 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0924 0.082 0.183 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -782509 sc-eQTL 3.46e-01 0.087 0.092 0.183 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 1.51e-01 0.149 0.104 0.183 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 4.56e-01 -0.1 0.134 0.172 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 9.32e-01 0.0118 0.138 0.172 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0529 0.113 0.172 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0738 0.105 0.172 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 4.01e-01 0.0979 0.116 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0886 0.0897 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 5.52e-01 0.0661 0.111 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0725 0.086 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -597336 sc-eQTL 1.52e-03 -0.308 0.096 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 4.40e-02 -0.124 0.0612 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0529 0.0816 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 8.11e-01 0.0213 0.089 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 7.44e-01 0.0266 0.0814 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 3.96e-01 0.0901 0.106 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 4.78e-02 0.157 0.079 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -597336 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0714 0.0766 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0028 0.054 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0378 0.0698 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 5.37e-01 0.0512 0.0828 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00458 0.0818 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 6.21e-02 -0.204 0.109 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 1.98e-01 0.0845 0.0654 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00709 0.0577 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -782509 sc-eQTL 8.31e-01 0.0251 0.118 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 5.23e-01 0.0594 0.0929 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0515 0.0966 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 9.77e-01 0.00312 0.11 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 1.84e-01 -0.118 0.0882 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0571 0.0707 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -782509 sc-eQTL 6.51e-01 0.0468 0.103 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 2.12e-01 0.127 0.102 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 944349 sc-eQTL 6.44e-01 0.0383 0.0828 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 895307 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0514 0.114 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -939742 sc-eQTL 5.04e-01 0.0564 0.0842 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -631525 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0233 0.0942 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -592255 sc-eQTL 9.73e-01 0.00374 0.109 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -605444 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0479 0.0937 0.183 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116353 MECR 895307 eQTL 0.0431 -0.0514 0.0254 0.00135 0.0 0.183

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162512 \N -782509 3.07e-07 1.01e-07 3.44e-08 1.78e-07 9.91e-08 9.71e-08 1.42e-07 5.21e-08 1.42e-07 4.23e-08 1.63e-07 8.02e-08 1.26e-07 6.21e-08 4.84e-08 7.89e-08 4.94e-08 1.1e-07 5.22e-08 3.89e-08 1.05e-07 1.33e-07 1.29e-07 4.98e-08 1.31e-07 1.13e-07 1.1e-07 8.71e-08 9.97e-08 1.1e-07 9.58e-08 3.84e-08 2.74e-08 8.3e-08 9.15e-08 3.93e-08 4.78e-08 9.13e-08 8.42e-08 3.59e-08 3.27e-08 1.37e-07 5.08e-08 2.76e-08 9.21e-08 1.72e-08 1.26e-07 4.04e-09 4.77e-08