logo

Genes within 1Mb (chr1:30105888:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 3.77e-01 -0.061 0.0689 0.222 B L1
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0347 0.0822 0.222 B L1
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 3.25e-01 0.0615 0.0624 0.222 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -617697 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0506 0.0656 0.222 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0208 0.0514 0.222 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 7.17e-01 0.0219 0.0603 0.222 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 4.67e-01 -0.052 0.0713 0.222 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 8.52e-01 0.0126 0.0675 0.222 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0202 0.094 0.222 CD4T L1
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 1.60e-01 0.0807 0.0573 0.222 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 4.15e-01 0.052 0.0637 0.222 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 4.28e-01 0.0453 0.0569 0.222 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0895 0.068 0.222 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 4.26e-01 0.0571 0.0716 0.222 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 8.92e-01 -0.013 0.0961 0.222 CD8T L1
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 9.25e-01 0.00577 0.0614 0.222 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 3.82e-01 0.0521 0.0595 0.222 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 7.98e-01 0.0179 0.0699 0.222 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0058 0.0878 0.222 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0274 0.0973 0.225 DC L1
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0932 0.107 0.225 DC L1
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 4.80e-01 0.0612 0.0865 0.225 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00558 0.0619 0.225 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 1.45e-01 -0.142 0.0973 0.225 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 6.64e-01 0.0299 0.0687 0.222 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0714 0.101 0.222 Mono L1
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 8.17e-01 0.0134 0.0581 0.222 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 2.99e-01 0.0555 0.0533 0.222 Mono L1
ENSG00000162512 SDC3 -802870 sc-eQTL 8.64e-01 0.0176 0.103 0.222 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 1.72e-01 -0.116 0.0844 0.222 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0843 0.0777 0.219 NK L1
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 1.74e-01 -0.139 0.102 0.219 NK L1
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0123 0.0741 0.219 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0691 0.0851 0.219 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 6.58e-03 0.258 0.0941 0.219 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 1.96e-01 -0.114 0.0881 0.219 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 4.39e-01 0.0574 0.0741 0.222 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 7.98e-02 0.154 0.0873 0.222 Other_T L1
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 6.87e-01 0.0295 0.073 0.222 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 9.08e-02 0.101 0.0595 0.222 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0728 0.0979 0.222 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0726 0.102 0.222 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 7.08e-01 0.0441 0.118 0.23 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 9.21e-01 0.0105 0.106 0.23 B_Activated L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 1.35e-01 0.164 0.109 0.23 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -617697 sc-eQTL 2.34e-02 0.217 0.0948 0.23 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 4.38e-02 -0.135 0.0663 0.23 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 1.47e-01 0.157 0.108 0.23 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 2.41e-01 -0.112 0.0955 0.23 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00866 0.0893 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 4.75e-01 0.0744 0.104 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 2.61e-01 0.0989 0.0878 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -617697 sc-eQTL 6.40e-01 0.0429 0.0916 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 5.03e-01 0.0378 0.0562 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0512 0.0789 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 9.51e-02 -0.147 0.0878 0.223 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00688 0.0921 0.224 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0297 0.104 0.224 B_Memory L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 3.45e-01 0.0825 0.0872 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -617697 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0613 0.0835 0.224 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 2.83e-02 0.162 0.0732 0.224 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 8.14e-01 -0.02 0.0848 0.224 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 5.20e-01 0.0639 0.0992 0.224 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 5.58e-02 -0.153 0.0795 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 2.63e-01 -0.118 0.105 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 4.03e-01 0.0644 0.0769 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -617697 sc-eQTL 9.05e-02 -0.132 0.0776 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 9.97e-02 -0.0857 0.0518 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 1.25e-01 0.105 0.0682 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0983 0.0844 0.222 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0916 0.0908 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00521 0.106 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 1.82e-01 -0.117 0.0871 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -617697 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0877 0.0838 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0642 0.0569 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0489 0.083 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0289 0.0897 0.223 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 2.98e-01 0.103 0.0986 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 5.03e-01 0.0671 0.1 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 9.14e-01 0.0109 0.101 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 1.47e-01 0.13 0.0894 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 7.37e-02 0.175 0.0975 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 3.84e-01 0.0755 0.0866 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00961 0.0679 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 5.88e-01 0.0529 0.0976 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 9.53e-02 0.0995 0.0594 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 7.87e-01 0.0174 0.064 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 6.28e-01 0.0315 0.0649 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 3.93e-02 -0.153 0.0739 0.222 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0155 0.0809 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 4.84e-01 0.0764 0.109 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00682 0.0765 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 2.85e-01 0.0678 0.0633 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00134 0.0805 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0154 0.0896 0.222 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0115 0.0988 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0837 0.109 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0181 0.084 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0631 0.0848 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00902 0.0994 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 9.96e-01 0.000466 0.0979 0.222 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 1.01e-01 0.141 0.0856 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00817 0.101 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 9.64e-02 0.14 0.0841 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 8.11e-01 0.0224 0.0938 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 9.08e-01 0.0114 0.0986 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 7.52e-01 0.0294 0.0927 0.222 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0975 0.09 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 9.39e-01 0.00756 0.0992 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0126 0.0727 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 2.70e-01 0.0769 0.0695 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 2.74e-01 0.0952 0.0868 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 9.40e-01 0.00717 0.0947 0.222 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 5.75e-01 0.0606 0.108 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0431 0.107 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0525 0.1 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 6.04e-01 0.0545 0.105 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 4.29e-01 0.0768 0.0969 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 1.32e-02 -0.241 0.0965 0.215 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00611 0.1 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0139 0.106 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 6.48e-01 0.0487 0.106 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 9.37e-01 0.00787 0.1 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 2.56e-01 0.118 0.104 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 6.44e-01 0.0435 0.094 0.221 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 5.03e-02 0.189 0.096 0.223 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 7.58e-01 0.0336 0.109 0.223 MAIT L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 3.82e-01 0.0819 0.0936 0.223 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 1.03e-01 0.144 0.0879 0.223 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0641 0.0984 0.223 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0521 0.101 0.223 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 7.91e-02 -0.195 0.11 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 5.52e-01 0.0657 0.11 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0258 0.103 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 1.79e-01 -0.136 0.101 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 8.93e-01 0.0137 0.102 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0024 0.1 0.22 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0251 0.0804 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 4.46e-02 -0.219 0.108 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 7.24e-01 0.0294 0.083 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0871 0.0883 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 8.56e-02 0.19 0.11 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0896 0.0913 0.218 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 7.54e-01 0.0335 0.106 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 9.43e-01 0.00759 0.107 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0157 0.0994 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 3.14e-01 0.0956 0.0946 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 4.82e-01 0.071 0.101 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 7.79e-02 -0.172 0.0968 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 1.32e-01 -0.134 0.0884 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0104 0.11 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00444 0.0891 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0325 0.0981 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 5.43e-01 0.0634 0.104 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0347 0.0967 0.218 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 3.37e-01 0.132 0.136 0.211 PB L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0867 0.123 0.211 PB L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 4.45e-01 0.102 0.133 0.211 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -617697 sc-eQTL 1.80e-01 -0.167 0.123 0.211 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0628 0.0887 0.211 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 1.43e-01 -0.178 0.121 0.211 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0775 0.129 0.211 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0465 0.0886 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 9.99e-01 0.000161 0.0906 0.22 Pro_T L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 8.44e-01 0.0195 0.0985 0.22 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 5.21e-01 0.0454 0.0706 0.22 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 5.78e-01 0.0551 0.0987 0.22 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 8.93e-02 -0.154 0.0902 0.22 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 3.54e-01 0.0871 0.0938 0.222 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 3.03e-02 -0.244 0.112 0.222 Treg L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 8.93e-01 0.0113 0.0838 0.222 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 8.56e-01 0.0174 0.0959 0.222 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 8.46e-01 0.0191 0.0977 0.222 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 1.02e-01 -0.159 0.097 0.222 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0196 0.103 0.227 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 4.88e-01 -0.08 0.115 0.227 cDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 7.10e-01 0.0375 0.101 0.227 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0595 0.0706 0.227 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 4.46e-02 -0.192 0.095 0.227 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 8.29e-01 0.0182 0.0844 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 8.26e-01 0.023 0.104 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 7.82e-01 0.0184 0.0662 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 4.72e-01 0.0418 0.058 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000162512 SDC3 -802870 sc-eQTL 3.85e-01 0.0951 0.109 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 1.27e-03 -0.291 0.0891 0.222 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 6.87e-01 0.032 0.0792 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 2.61e-01 -0.117 0.104 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0442 0.0781 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 8.21e-01 0.0136 0.0601 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000162512 SDC3 -802870 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0919 0.104 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 3.39e-01 0.0857 0.0895 0.222 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 1.99e-02 -0.293 0.124 0.23 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 8.84e-02 0.214 0.125 0.23 gdT L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 5.46e-01 0.071 0.117 0.23 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 4.78e-01 0.0906 0.127 0.23 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0932 0.117 0.23 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 8.65e-01 0.0194 0.114 0.23 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 6.23e-01 0.0496 0.101 0.22 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 2.89e-01 -0.113 0.107 0.22 intMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 6.86e-01 0.0384 0.0948 0.22 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0474 0.0743 0.22 intMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -802870 sc-eQTL 2.62e-01 0.114 0.102 0.22 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0139 0.101 0.22 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0278 0.0998 0.224 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 7.78e-01 0.0305 0.108 0.224 ncMono L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 4.86e-02 0.164 0.0828 0.224 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 1.81e-01 0.102 0.0756 0.224 ncMono L2
ENSG00000162512 SDC3 -802870 sc-eQTL 2.12e-01 -0.106 0.0848 0.224 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0328 0.0962 0.224 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0388 0.113 0.229 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 2.33e-01 -0.138 0.115 0.229 pDC L2
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 2.50e-01 0.109 0.0945 0.229 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 6.95e-01 0.0346 0.0882 0.229 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 9.75e-01 0.00304 0.0977 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0695 0.082 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 3.83e-01 0.0884 0.101 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 3.98e-02 0.161 0.0779 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -617697 sc-eQTL 3.30e-01 0.0875 0.0895 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 1.65e-01 0.0782 0.0561 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 8.51e-01 -0.014 0.0746 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0548 0.0812 0.222 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 1.86e-01 -0.1 0.0755 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 2.91e-01 -0.104 0.0986 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 9.61e-01 0.0036 0.0742 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -617697 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0892 0.0712 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 7.83e-02 -0.0884 0.0499 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 5.43e-01 0.0395 0.0649 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0566 0.0771 0.222 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 7.05e-01 0.0284 0.075 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0798 0.1 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0302 0.0601 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 6.30e-01 0.0255 0.0529 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -802870 sc-eQTL 7.36e-01 0.0364 0.108 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 1.23e-01 -0.131 0.0847 0.222 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 9.39e-01 0.00696 0.0905 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0441 0.103 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 1.53e-01 0.118 0.0825 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 1.24e-01 0.102 0.066 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162512 SDC3 -802870 sc-eQTL 7.61e-01 0.0295 0.0969 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0198 0.0955 0.22 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 923988 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0516 0.0761 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 874946 sc-eQTL 7.71e-02 -0.185 0.104 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000134644 PUM1 -960103 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00186 0.0775 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -651886 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0437 0.0866 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 sc-eQTL 8.79e-03 0.26 0.0983 0.218 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -625805 sc-eQTL 1.25e-01 -0.132 0.0857 0.218 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 eQTL 3.55e-02 -0.0305 0.0145 0.0 0.0 0.232

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -612616 3.92e-07 1.59e-07 5.72e-08 2.26e-07 9.8e-08 8.63e-08 2.4e-07 5.75e-08 1.66e-07 8.53e-08 1.83e-07 1.31e-07 2.38e-07 8.07e-08 5.69e-08 8.71e-08 4.45e-08 1.8e-07 7.12e-08 5.07e-08 1.25e-07 1.56e-07 1.64e-07 3.58e-08 2.28e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.1e-07 1.37e-07 1.1e-07 1.22e-07 3.06e-08 3.59e-08 9.78e-08 3.97e-08 2.99e-08 5.7e-08 8.61e-08 6.76e-08 3.99e-08 6.07e-08 1.6e-07 5.12e-08 1.24e-08 3.32e-08 1.65e-08 1e-07 1.88e-09 5.04e-08