logo

Genes within 1Mb (chr1:29876429:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0684 0.074 0.192 B L1
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0681 0.0882 0.192 B L1
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 8.29e-01 0.0151 0.0697 0.192 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -847156 sc-eQTL 5.96e-02 -0.133 0.07 0.192 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0727 0.0551 0.192 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0886 0.0645 0.192 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0854 0.0764 0.192 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0644 0.0704 0.192 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 2.81e-01 0.106 0.098 0.192 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0126 0.0554 0.192 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 8.42e-03 -0.174 0.0656 0.192 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0395 0.0596 0.192 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 5.80e-01 0.0396 0.0714 0.192 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0896 0.0775 0.192 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0443 0.104 0.192 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 9.95e-01 0.000437 0.0634 0.192 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 9.11e-02 -0.109 0.0642 0.192 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0408 0.0757 0.192 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 6.91e-02 -0.173 0.0945 0.192 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 2.69e-01 -0.121 0.109 0.185 DC L1
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0197 0.121 0.185 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 6.63e-01 0.0471 0.108 0.185 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 6.96e-03 -0.187 0.0685 0.185 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 2.01e-02 -0.255 0.109 0.185 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 8.02e-01 0.0186 0.0738 0.192 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 3.39e-01 -0.104 0.108 0.192 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 5.58e-01 0.0487 0.083 0.192 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0869 0.057 0.192 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 1.05e-01 -0.147 0.0904 0.192 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 2.79e-01 0.0916 0.0844 0.189 NK L1
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 3.71e-01 0.0998 0.111 0.189 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 5.01e-01 0.0511 0.0758 0.189 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 3.03e-03 -0.272 0.0908 0.189 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 6.77e-01 0.0435 0.104 0.189 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 1.84e-01 -0.128 0.0958 0.189 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 8.58e-01 0.0144 0.0807 0.192 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0478 0.0957 0.192 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 6.70e-01 0.037 0.0868 0.192 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 7.25e-04 -0.218 0.0634 0.192 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 3.41e-01 0.102 0.106 0.192 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 3.26e-01 -0.109 0.111 0.192 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.03e-01 0.135 0.131 0.194 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 1.75e-01 -0.16 0.117 0.194 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 1.68e-01 0.16 0.116 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -847156 sc-eQTL 4.42e-01 0.0825 0.107 0.194 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 9.52e-01 0.00453 0.0748 0.194 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 5.96e-01 0.064 0.121 0.194 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0308 0.107 0.194 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.87e-01 0.0844 0.0975 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0146 0.114 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 5.77e-01 0.0502 0.0898 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -847156 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0118 0.1 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 8.15e-01 0.0144 0.0615 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 1.35e-01 -0.129 0.0859 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 8.77e-01 -0.015 0.0966 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0365 0.102 0.194 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 2.52e-01 -0.131 0.115 0.194 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00882 0.0971 0.194 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -847156 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0892 0.0921 0.194 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0869 0.0816 0.194 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0712 0.0935 0.194 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 8.69e-01 0.0181 0.11 0.194 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 1.89e-01 -0.116 0.088 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.67e-01 0.0501 0.116 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 7.17e-01 0.0301 0.0829 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -847156 sc-eQTL 4.40e-02 -0.173 0.0852 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0727 0.0573 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 1.03e-01 -0.123 0.075 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0864 0.0931 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.94e-01 0.084 0.0983 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0117 0.115 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0235 0.101 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -847156 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00713 0.0909 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0361 0.0617 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 6.43e-01 0.0417 0.0899 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 7.25e-01 0.0342 0.0971 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 2.29e-01 0.132 0.109 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.43e-01 0.0516 0.111 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 9.69e-02 -0.183 0.11 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0794 0.0996 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0159 0.109 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 5.08e-01 0.0637 0.0962 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0887 0.0722 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 2.00e-01 0.133 0.104 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 3.51e-01 0.0515 0.0551 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.69e-02 -0.162 0.0674 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0367 0.0693 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 6.91e-01 0.0317 0.0796 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0857 0.0853 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 7.86e-01 0.0313 0.115 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0426 0.0646 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 9.34e-04 -0.219 0.0653 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00639 0.0851 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 6.84e-01 0.0386 0.0947 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 4.93e-01 0.0734 0.107 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 2.86e-01 -0.126 0.118 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 4.97e-01 0.0598 0.088 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.64e-01 -0.128 0.0916 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 5.53e-01 0.064 0.108 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 5.59e-02 -0.202 0.105 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0722 0.0943 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000747 0.111 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 7.09e-01 0.0316 0.0846 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.26e-01 -0.157 0.102 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 2.43e-01 0.126 0.108 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0225 0.102 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.00e-01 -0.101 0.0974 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0148 0.107 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 9.78e-01 0.00206 0.0738 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.50e-01 -0.108 0.0751 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 2.47e-01 -0.109 0.0939 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 4.46e-02 -0.205 0.102 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 7.61e-01 -0.036 0.118 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.44e-01 0.0543 0.117 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0451 0.0886 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.06e-01 -0.185 0.114 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 1.49e-01 -0.153 0.106 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 9.08e-01 0.0124 0.107 0.19 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.01e-01 0.112 0.108 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 3.66e-01 -0.104 0.114 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00572 0.114 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.21e-02 0.27 0.107 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 3.31e-01 0.11 0.112 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 7.62e-01 -0.031 0.102 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.10e-01 0.109 0.107 0.19 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.15e-01 0.0604 0.12 0.19 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0583 0.101 0.19 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.09e-01 -0.156 0.0969 0.19 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 1.42e-01 0.159 0.108 0.19 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00651 0.112 0.19 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 1.52e-01 0.172 0.12 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 1.61e-02 0.286 0.118 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 3.39e-01 0.101 0.105 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.48e-02 -0.266 0.108 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 6.03e-01 0.0574 0.11 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 1.02e-02 -0.277 0.107 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.26e-01 0.0856 0.0869 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.81e-01 0.0488 0.119 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 4.75e-01 0.0591 0.0825 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 3.12e-03 -0.281 0.0939 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 6.11e-01 0.0612 0.12 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 5.84e-01 0.0544 0.0991 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 7.89e-01 0.0311 0.116 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 9.32e-02 0.195 0.116 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0196 0.109 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 5.73e-02 -0.196 0.102 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 8.34e-02 0.19 0.109 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0792 0.106 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 7.66e-01 0.0292 0.0979 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0608 0.121 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 7.29e-01 0.0325 0.0937 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 5.63e-03 -0.297 0.106 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 7.54e-02 -0.203 0.114 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 3.76e-02 -0.221 0.105 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 5.32e-01 0.0886 0.141 0.189 PB L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 4.88e-01 0.0885 0.127 0.189 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 6.64e-01 0.0623 0.143 0.189 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -847156 sc-eQTL 6.27e-01 0.0627 0.129 0.189 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 6.33e-01 -0.044 0.0919 0.189 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 3.96e-01 -0.107 0.125 0.189 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 8.50e-01 0.0254 0.134 0.189 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 6.79e-01 0.0408 0.0986 0.193 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0499 0.101 0.193 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 1.10e-01 0.164 0.102 0.193 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.65e-01 -0.109 0.0783 0.193 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00485 0.11 0.193 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 7.09e-02 -0.182 0.1 0.193 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0923 0.101 0.192 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0147 0.122 0.192 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 4.57e-01 0.0632 0.0848 0.192 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.44e-01 -0.151 0.103 0.192 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 1.57e-01 -0.149 0.105 0.192 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 2.32e-01 -0.125 0.105 0.192 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 3.44e-01 -0.112 0.118 0.173 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0459 0.133 0.173 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 3.97e-01 0.0949 0.112 0.173 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.01e-01 -0.133 0.0809 0.173 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 1.74e-02 -0.261 0.109 0.173 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 2.32e-01 0.108 0.0904 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 3.71e-01 0.1 0.112 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 4.82e-01 0.0577 0.0819 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 3.13e-01 -0.063 0.0623 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0607 0.098 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0424 0.0863 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.87e-02 -0.207 0.113 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0768 0.104 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 9.84e-01 0.00128 0.0655 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 8.91e-01 0.0135 0.0977 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 4.87e-01 -0.1 0.144 0.191 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0831 0.144 0.191 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 7.41e-01 0.0418 0.126 0.191 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 9.00e-03 -0.376 0.142 0.191 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0728 0.134 0.191 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000638 0.13 0.191 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 6.25e-01 0.0554 0.113 0.187 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 7.28e-01 0.0417 0.12 0.187 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 6.42e-01 0.0545 0.117 0.187 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0889 0.0831 0.187 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0277 0.113 0.187 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0457 0.11 0.188 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 2.17e-01 -0.146 0.118 0.188 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 5.10e-02 0.231 0.118 0.188 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 4.74e-01 -0.06 0.0836 0.188 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0616 0.106 0.188 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0101 0.137 0.167 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.66e-01 0.0608 0.141 0.167 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 1.59e-01 0.188 0.133 0.167 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 4.98e-02 -0.209 0.106 0.167 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 4.84e-01 -0.083 0.118 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 6.35e-01 0.043 0.0906 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0971 0.112 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 5.97e-01 0.0424 0.0802 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -847156 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0306 0.099 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0165 0.0622 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 1.34e-01 -0.123 0.0818 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0811 0.0895 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 1.66e-01 -0.113 0.0813 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 5.48e-01 0.064 0.106 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 7.26e-01 0.0274 0.078 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -847156 sc-eQTL 3.99e-02 -0.158 0.0762 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0753 0.0539 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0329 0.0699 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0657 0.083 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 7.81e-01 0.0224 0.0805 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 2.79e-01 -0.117 0.107 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0062 0.0799 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0424 0.0567 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0696 0.0913 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 8.34e-01 0.0207 0.0989 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 3.15e-01 -0.113 0.112 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 8.24e-02 0.198 0.113 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 1.58e-01 -0.102 0.0721 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 2.57e-01 -0.118 0.104 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 694529 sc-eQTL 5.57e-01 0.0488 0.0828 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 645487 sc-eQTL 6.43e-01 0.0531 0.114 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 989338 sc-eQTL 5.67e-01 0.0446 0.0778 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -881345 sc-eQTL 3.07e-03 -0.277 0.0923 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -842075 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00288 0.109 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -855264 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0542 0.0938 0.19 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 \N -881345 2.74e-07 1.35e-07 4.48e-08 1.89e-07 1.01e-07 9.76e-08 1.53e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.52e-07 9.19e-08 1.59e-07 7.64e-08 6.18e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.27e-07 5.97e-08 4.89e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.44e-07 2.64e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.92e-08 1.09e-07 1.07e-07 1.06e-07 3.6e-08 3.61e-08 8.23e-08 7.36e-08 3.05e-08 5.58e-08 8.93e-08 6.71e-08 3.8e-08 4.39e-08 1.33e-07 5.2e-08 7.61e-09 4.25e-08 1.89e-08 1.19e-07 1.88e-09 4.88e-08