logo

Genes within 1Mb (chr1:29875427:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0785 0.0662 0.25 B L1
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0973 0.0788 0.25 B L1
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00559 0.0624 0.25 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -848158 sc-eQTL 1.05e-01 -0.102 0.0628 0.25 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0626 0.0493 0.25 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0573 0.0578 0.25 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0443 0.0685 0.25 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0724 0.0631 0.25 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 5.33e-01 0.055 0.0881 0.25 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0137 0.0496 0.25 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 3.07e-02 -0.129 0.0591 0.25 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0498 0.0534 0.25 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 4.71e-02 0.127 0.0635 0.25 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0509 0.0696 0.25 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00362 0.0935 0.25 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 9.08e-01 0.00655 0.0568 0.25 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0939 0.0576 0.25 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 4.80e-01 0.048 0.0679 0.25 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 1.68e-01 -0.118 0.085 0.25 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0359 0.0976 0.241 DC L1
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00167 0.108 0.241 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 5.14e-01 0.0627 0.0959 0.241 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 4.26e-03 -0.176 0.0608 0.241 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 1.27e-01 -0.149 0.0976 0.241 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0457 0.0654 0.25 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0939 0.0961 0.25 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 1.93e-01 0.0958 0.0734 0.25 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 5.27e-02 -0.0982 0.0504 0.25 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 3.10e-01 -0.082 0.0806 0.25 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 5.13e-01 0.05 0.0764 0.247 NK L1
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 3.94e-01 0.0858 0.1 0.247 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 4.80e-01 0.0484 0.0685 0.247 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 1.62e-03 -0.261 0.0818 0.247 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 4.67e-01 0.0685 0.094 0.247 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 1.64e-01 -0.121 0.0865 0.247 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 8.92e-01 0.00976 0.0718 0.25 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 7.42e-01 0.028 0.0852 0.25 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 1.59e-01 0.109 0.0769 0.25 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 1.13e-02 -0.146 0.0571 0.25 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 2.47e-01 0.11 0.0946 0.25 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0861 0.0987 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 2.83e-02 0.252 0.114 0.26 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0409 0.104 0.26 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 5.57e-02 0.196 0.102 0.26 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -848158 sc-eQTL 9.60e-01 0.00476 0.0946 0.26 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0386 0.0659 0.26 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 7.87e-01 0.0288 0.107 0.26 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 7.87e-01 0.0255 0.0942 0.26 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 3.63e-01 0.0799 0.0876 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0467 0.102 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00453 0.0809 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -848158 sc-eQTL 8.68e-01 0.015 0.0902 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 6.47e-01 0.0254 0.0553 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0728 0.0775 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00442 0.0869 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0314 0.0917 0.252 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 1.11e-01 -0.165 0.103 0.252 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0423 0.0876 0.252 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -848158 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0781 0.0831 0.252 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0619 0.0737 0.252 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 8.84e-01 0.0123 0.0844 0.252 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 4.13e-01 0.081 0.0987 0.252 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 9.83e-03 -0.201 0.0773 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0438 0.103 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 4.83e-01 0.0517 0.0736 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -848158 sc-eQTL 8.73e-02 -0.13 0.0759 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0686 0.0508 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0524 0.067 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0211 0.0828 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 2.48e-01 0.102 0.0882 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 9.71e-01 0.00376 0.103 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00624 0.0906 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -848158 sc-eQTL 9.53e-01 0.0048 0.0817 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0547 0.0553 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 2.33e-01 0.0963 0.0805 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 8.59e-01 0.0155 0.0872 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 3.03e-01 0.1 0.097 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 8.33e-01 0.0207 0.0985 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 7.34e-02 -0.175 0.0972 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 1.84e-01 -0.117 0.0879 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 2.36e-01 0.114 0.0963 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 5.89e-02 0.161 0.0845 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0624 0.0652 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 2.27e-01 0.113 0.0937 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 3.50e-01 0.0466 0.0497 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 5.08e-02 -0.12 0.0611 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0513 0.0624 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 8.56e-02 0.123 0.0713 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0554 0.0771 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 7.40e-01 0.0346 0.104 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0345 0.0583 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 6.52e-03 -0.163 0.0595 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0386 0.0767 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 6.23e-01 0.0421 0.0855 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0054 0.0953 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 5.62e-01 -0.061 0.105 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 7.65e-01 0.0235 0.0784 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0862 0.0817 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 3.49e-01 0.0898 0.0957 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00655 0.0945 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 8.01e-01 -0.021 0.0831 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 4.08e-01 0.0811 0.0978 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 7.87e-01 0.0202 0.0745 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 6.42e-02 -0.167 0.0897 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 1.43e-01 0.139 0.0946 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0192 0.0894 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0112 0.0869 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00494 0.0956 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 9.41e-01 0.00486 0.0657 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0834 0.0669 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0688 0.0837 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0646 0.0912 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0625 0.107 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 7.39e-01 0.0355 0.106 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0893 0.08 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 1.26e-01 -0.159 0.103 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0178 0.0961 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 2.33e-01 0.116 0.0968 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 2.23e-01 0.119 0.097 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0878 0.103 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 9.52e-01 0.00615 0.103 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 1.38e-01 0.144 0.0968 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 1.50e-01 0.145 0.101 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0458 0.0914 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 2.80e-01 0.103 0.0952 0.249 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 5.64e-01 0.0619 0.107 0.249 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 7.80e-01 0.0252 0.0903 0.249 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 8.22e-02 -0.151 0.0865 0.249 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 6.40e-02 0.179 0.0963 0.249 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 5.52e-01 0.0596 0.1 0.249 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 2.29e-01 0.13 0.107 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 1.40e-01 0.157 0.106 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 4.43e-01 0.0723 0.094 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 2.17e-02 -0.224 0.0969 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 2.25e-01 0.12 0.0982 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 7.51e-02 -0.172 0.0964 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 6.91e-01 0.0312 0.0784 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 7.56e-01 0.0332 0.107 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 5.15e-01 0.0485 0.0743 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 1.85e-03 -0.266 0.0844 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 8.75e-01 0.0171 0.108 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 8.01e-01 0.0225 0.0893 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 4.83e-01 0.0726 0.103 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 1.58e-01 0.146 0.103 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 5.38e-01 0.0601 0.0973 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 1.19e-03 -0.295 0.0897 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 4.57e-01 0.073 0.0979 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0558 0.0947 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 6.49e-01 0.0402 0.0882 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 7.08e-01 0.041 0.109 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 7.53e-01 0.0266 0.0845 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 2.36e-03 -0.293 0.0952 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 2.38e-01 -0.122 0.103 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 2.45e-01 -0.112 0.0957 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 7.63e-01 0.038 0.126 0.237 PB L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 8.19e-01 0.026 0.113 0.237 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 8.15e-01 0.0298 0.127 0.237 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -848158 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0557 0.114 0.237 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0671 0.0814 0.237 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0256 0.112 0.237 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 4.70e-01 0.086 0.119 0.237 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 9.78e-01 0.00239 0.0871 0.252 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 6.73e-01 0.0376 0.089 0.252 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0904 0.252 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0742 0.0693 0.252 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 4.28e-01 -0.077 0.097 0.252 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0685 0.0892 0.252 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0681 0.0899 0.25 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 3.07e-01 -0.111 0.108 0.25 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 6.84e-01 0.0308 0.0756 0.25 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 2.04e-01 -0.117 0.0916 0.25 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 3.31e-01 -0.091 0.0935 0.25 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0338 0.0935 0.25 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 1.15e-01 -0.162 0.102 0.234 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 7.22e-01 0.0411 0.115 0.234 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 4.44e-01 0.0743 0.0969 0.234 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 7.50e-02 -0.125 0.07 0.234 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 3.55e-02 -0.201 0.0948 0.234 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0234 0.0811 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 5.25e-01 0.0638 0.1 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 1.97e-01 0.0945 0.0731 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0783 0.0555 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0142 0.0877 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 7.11e-01 0.0284 0.0764 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 1.21e-01 -0.156 0.1 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 8.18e-01 0.0213 0.0925 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0164 0.058 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 5.46e-01 0.0524 0.0865 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 9.58e-01 0.00667 0.125 0.261 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 7.62e-01 -0.038 0.125 0.261 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 4.46e-01 0.0835 0.109 0.261 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 2.02e-02 -0.291 0.124 0.261 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0407 0.116 0.261 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 2.89e-01 -0.12 0.112 0.261 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 7.97e-01 0.0255 0.0989 0.247 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 1.88e-01 0.138 0.105 0.247 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 4.51e-01 0.0772 0.102 0.247 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 6.32e-01 -0.035 0.0729 0.247 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 5.16e-01 0.0644 0.099 0.247 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0562 0.0994 0.249 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 2.35e-01 -0.127 0.107 0.249 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 6.39e-02 0.199 0.107 0.249 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0477 0.0756 0.249 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00789 0.0959 0.249 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 2.92e-01 0.127 0.12 0.223 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0541 0.124 0.223 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 2.39e-02 0.266 0.116 0.223 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 7.84e-03 -0.249 0.0924 0.223 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 5.18e-01 0.0677 0.105 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 6.46e-01 0.0376 0.0818 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 3.07e-01 -0.103 0.101 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 7.08e-01 0.0272 0.0724 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -848158 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0443 0.0893 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 8.65e-01 -0.00955 0.0562 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0534 0.0742 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0353 0.0809 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 8.94e-02 -0.124 0.0725 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00687 0.0952 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 6.45e-01 0.0322 0.0698 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -848158 sc-eQTL 7.99e-02 -0.12 0.0683 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0632 0.0483 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 8.45e-01 0.0123 0.0626 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0158 0.0743 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0466 0.0715 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 2.70e-01 -0.106 0.0954 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 3.71e-01 0.0636 0.0709 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 2.11e-01 -0.063 0.0503 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0218 0.0813 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 9.95e-01 0.000552 0.0876 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0306 0.0998 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 7.00e-02 0.183 0.1 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 2.01e-01 -0.082 0.064 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0703 0.0923 0.246 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 693527 sc-eQTL 8.54e-01 0.0138 0.0748 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 644485 sc-eQTL 4.62e-01 0.0759 0.103 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 988336 sc-eQTL 4.31e-01 0.0554 0.0702 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -882347 sc-eQTL 9.95e-04 -0.277 0.0829 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -843077 sc-eQTL 9.29e-01 0.00875 0.0982 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -856266 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0514 0.0847 0.248 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 \N -882347 2.76e-07 1.34e-07 5.82e-08 2.05e-07 9.79e-08 9.91e-08 1.6e-07 5.43e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.57e-07 9.19e-08 1.59e-07 7.37e-08 6.25e-08 7.5e-08 4.12e-08 1.44e-07 7.12e-08 4.8e-08 1.25e-07 1.24e-07 1.5e-07 2.87e-08 1.63e-07 1.25e-07 1.07e-07 1.01e-07 1.23e-07 9.88e-08 1.06e-07 3.55e-08 3.59e-08 8.56e-08 4.92e-08 3.05e-08 5.51e-08 8.61e-08 6.58e-08 5.24e-08 6.28e-08 1.46e-07 5.08e-08 1.1e-08 3.29e-08 1.87e-08 1.15e-07 1.96e-09 4.98e-08