logo

Genes within 1Mb (chr1:29873239:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0656 0.0664 0.246 B L1
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 2.84e-01 -0.085 0.079 0.246 B L1
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00839 0.0626 0.246 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -850346 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0896 0.063 0.246 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0609 0.0494 0.246 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 4.19e-01 -0.047 0.058 0.246 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0472 0.0687 0.246 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 2.68e-01 -0.07 0.063 0.246 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 4.90e-01 0.0608 0.0879 0.246 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0183 0.0496 0.246 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 5.45e-02 -0.114 0.0592 0.246 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0533 0.0533 0.246 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 4.39e-02 0.128 0.0634 0.246 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0505 0.0697 0.246 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0294 0.0935 0.246 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00415 0.0569 0.246 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.10e-01 -0.0924 0.0577 0.246 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 5.29e-01 0.0429 0.0679 0.246 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 1.67e-01 -0.118 0.0851 0.246 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 8.48e-01 0.0188 0.0983 0.236 DC L1
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00134 0.109 0.236 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 5.99e-01 0.0508 0.0966 0.236 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 3.51e-03 -0.181 0.0612 0.236 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 1.71e-01 -0.135 0.0984 0.236 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 6.39e-01 -0.031 0.0658 0.246 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 2.18e-01 -0.119 0.0966 0.246 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 1.85e-01 0.0982 0.0738 0.246 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 4.52e-02 -0.102 0.0507 0.246 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0878 0.081 0.246 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 3.98e-01 0.0647 0.0764 0.242 NK L1
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 5.39e-01 0.062 0.101 0.242 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 5.05e-01 0.0457 0.0685 0.242 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.73e-03 -0.26 0.0818 0.242 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 5.35e-01 0.0585 0.0941 0.242 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 1.91e-01 -0.114 0.0866 0.242 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 9.33e-01 0.00605 0.0721 0.246 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 8.81e-01 0.0128 0.0855 0.246 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 1.03e-01 0.126 0.0771 0.246 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.17e-02 -0.146 0.0573 0.246 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 1.85e-01 0.126 0.0949 0.246 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0679 0.0992 0.246 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 2.75e-02 0.253 0.114 0.255 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0218 0.104 0.255 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 7.62e-02 0.182 0.102 0.255 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -850346 sc-eQTL 9.56e-01 0.00522 0.0945 0.255 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0282 0.0659 0.255 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 9.44e-01 0.0075 0.106 0.255 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 6.78e-01 0.0392 0.0941 0.255 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 3.93e-01 0.0751 0.0877 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0467 0.102 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 9.71e-01 0.00298 0.0809 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -850346 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00409 0.0902 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 5.94e-01 0.0296 0.0554 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0749 0.0776 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 9.21e-01 0.00865 0.087 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0462 0.092 0.248 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 1.06e-01 -0.168 0.103 0.248 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0356 0.0879 0.248 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -850346 sc-eQTL 2.12e-01 -0.104 0.0832 0.248 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0637 0.0739 0.248 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 9.19e-01 0.00858 0.0847 0.248 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 3.66e-01 0.0898 0.099 0.248 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 2.78e-02 -0.172 0.0778 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0396 0.103 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 6.03e-01 0.0385 0.0738 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -850346 sc-eQTL 1.36e-01 -0.114 0.0762 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0681 0.0509 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0416 0.0671 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0237 0.083 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 1.95e-01 0.115 0.0882 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00382 0.103 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 9.29e-01 0.00803 0.0907 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -850346 sc-eQTL 6.95e-01 0.032 0.0817 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0562 0.0554 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 1.54e-01 0.115 0.0805 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 8.57e-01 0.0157 0.0873 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 3.31e-01 0.0947 0.0972 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 7.41e-01 0.0327 0.0987 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 7.78e-02 -0.173 0.0974 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.65e-01 -0.123 0.0881 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 2.63e-01 0.108 0.0965 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 5.76e-02 0.162 0.0847 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0565 0.0652 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 2.17e-01 0.116 0.0936 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 4.16e-01 0.0405 0.0497 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 9.85e-02 -0.102 0.0612 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0549 0.0624 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 6.87e-02 0.13 0.0713 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0495 0.0771 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 5.96e-01 0.0552 0.104 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0373 0.0583 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.68e-02 -0.144 0.0597 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0379 0.0767 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 4.89e-01 0.0592 0.0854 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 9.97e-01 0.000358 0.0952 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0678 0.105 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 7.71e-01 0.0228 0.0783 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0657 0.0817 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 3.87e-01 0.0829 0.0956 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 9.35e-01 0.00772 0.0944 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0252 0.0833 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 5.55e-01 0.0581 0.0981 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 9.51e-01 0.00459 0.0747 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 8.27e-02 -0.157 0.0901 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 1.12e-01 0.151 0.0948 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 8.41e-01 -0.018 0.0897 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0143 0.0872 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0186 0.0959 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00474 0.0659 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0749 0.0672 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 3.79e-01 -0.074 0.084 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0598 0.0915 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0589 0.107 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 7.29e-01 0.0368 0.106 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 2.05e-01 -0.101 0.0799 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.53e-01 -0.148 0.103 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0102 0.0961 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 2.48e-01 0.112 0.0968 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 2.34e-01 0.116 0.0971 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0614 0.103 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0183 0.103 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.93e-01 0.127 0.097 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 1.82e-01 0.135 0.101 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0393 0.0915 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 2.46e-01 0.111 0.0955 0.245 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 7.37e-01 0.0361 0.108 0.245 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 6.54e-01 0.0407 0.0905 0.245 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 6.85e-02 -0.159 0.0867 0.245 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 4.89e-02 0.191 0.0965 0.245 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 4.45e-01 0.0767 0.1 0.245 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 1.64e-01 0.15 0.107 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 2.07e-01 0.135 0.107 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 4.25e-01 0.0752 0.0941 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 2.54e-02 -0.218 0.097 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 1.84e-01 0.131 0.0983 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 8.64e-02 -0.166 0.0965 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 6.46e-01 0.0362 0.0785 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 7.13e-01 0.0393 0.107 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 5.89e-01 0.0403 0.0745 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 2.10e-03 -0.263 0.0846 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00534 0.108 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 7.51e-01 0.0284 0.0894 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 4.46e-01 0.0791 0.103 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 2.68e-01 0.115 0.104 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 6.49e-01 0.0445 0.0976 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 9.03e-04 -0.303 0.0898 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 4.72e-01 0.0707 0.0981 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0649 0.0949 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 5.04e-01 0.0589 0.0881 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 8.73e-01 0.0175 0.109 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 6.92e-01 0.0335 0.0844 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.75e-03 -0.301 0.0951 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 3.05e-01 -0.106 0.103 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 2.65e-01 -0.107 0.0957 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 6.52e-01 0.0568 0.126 0.233 PB L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 7.20e-01 0.0408 0.113 0.233 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 8.07e-01 0.0311 0.127 0.233 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -850346 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0357 0.114 0.233 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0678 0.0815 0.233 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0247 0.112 0.233 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 5.03e-01 0.0799 0.119 0.233 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 9.10e-01 0.00991 0.0872 0.248 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 6.88e-01 0.0358 0.0891 0.248 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 2.53e-01 0.104 0.0905 0.248 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0609 0.0694 0.248 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 4.53e-01 -0.073 0.0971 0.248 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0594 0.0893 0.248 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 4.57e-01 -0.067 0.0899 0.246 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 4.50e-01 -0.082 0.108 0.246 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 7.57e-01 0.0234 0.0755 0.246 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 2.52e-01 -0.105 0.0916 0.246 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0872 0.0934 0.246 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0308 0.0935 0.246 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 1.49e-01 -0.149 0.102 0.232 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 7.44e-01 0.0379 0.116 0.232 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 3.80e-01 0.0856 0.0973 0.232 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 7.88e-02 -0.124 0.0704 0.232 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 3.72e-02 -0.2 0.0952 0.232 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000882 0.0815 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 7.68e-01 0.0297 0.101 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 1.59e-01 0.104 0.0734 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.33e-01 -0.0843 0.0558 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0302 0.0882 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 6.82e-01 0.0316 0.0768 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 1.79e-01 -0.136 0.101 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 8.33e-01 0.0197 0.093 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0172 0.0583 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 4.67e-01 0.0634 0.0869 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000208 0.126 0.258 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0381 0.125 0.258 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 4.16e-01 0.0892 0.109 0.258 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 2.83e-02 -0.275 0.124 0.258 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0389 0.117 0.258 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 3.08e-01 -0.115 0.113 0.258 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 7.93e-01 0.0262 0.0998 0.242 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 1.99e-01 0.136 0.105 0.242 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 6.27e-01 0.0501 0.103 0.242 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0384 0.0735 0.242 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 5.81e-01 0.0553 0.0999 0.242 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0649 0.0999 0.244 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 2.10e-01 -0.135 0.107 0.244 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 6.55e-02 0.199 0.107 0.244 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 6.74e-01 -0.032 0.076 0.244 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 9.00e-01 0.0121 0.0964 0.244 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 2.27e-01 0.147 0.121 0.22 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0649 0.125 0.22 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 2.82e-02 0.26 0.117 0.22 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 7.34e-03 -0.253 0.093 0.22 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 4.82e-01 0.0741 0.105 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 7.25e-01 0.0289 0.0819 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0933 0.101 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 6.69e-01 0.0311 0.0725 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -850346 sc-eQTL 4.61e-01 -0.066 0.0894 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00757 0.0563 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0593 0.0743 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0259 0.0811 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 1.69e-01 -0.1 0.0728 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0111 0.0954 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 6.77e-01 0.0291 0.0699 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -850346 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0992 0.0686 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0629 0.0484 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 6.28e-01 0.0305 0.0627 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0205 0.0745 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 6.77e-01 -0.03 0.0719 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 1.90e-01 -0.126 0.0958 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 3.19e-01 0.0713 0.0713 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0666 0.0505 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0281 0.0817 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 9.50e-01 0.0056 0.0883 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0396 0.101 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 9.51e-02 0.17 0.101 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0771 0.0645 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0722 0.0931 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 691339 sc-eQTL 7.42e-01 0.0247 0.0749 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 642297 sc-eQTL 5.59e-01 0.0603 0.103 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 986148 sc-eQTL 4.67e-01 0.0511 0.0702 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -884535 sc-eQTL 9.76e-04 -0.278 0.083 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -845265 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00521 0.0983 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -858454 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0492 0.0847 0.244 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 \N -884535 2.74e-07 1.35e-07 4.08e-08 1.83e-07 9.16e-08 9.76e-08 1.49e-07 5.2e-08 1.44e-07 4.74e-08 1.55e-07 9e-08 1.45e-07 7.13e-08 6.02e-08 7.3e-08 3.87e-08 1.26e-07 5.75e-08 4.23e-08 1.04e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.68e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.08e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.66e-08 3.61e-08 8.44e-08 5.99e-08 3.95e-08 5.04e-08 9.3e-08 7.23e-08 3.98e-08 3.92e-08 1.33e-07 4.7e-08 1.18e-08 5.7e-08 1.89e-08 1.19e-07 3.81e-09 4.81e-08