Genes within 1Mb (chr1:29872073:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 4.28e-01 0.0595 0.075 0.184 B L1
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 2.59e-02 0.198 0.0884 0.184 B L1
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 1.56e-01 -0.1 0.0703 0.184 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -851512 sc-eQTL 2.24e-01 0.0868 0.0712 0.184 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 8.20e-01 0.0127 0.0559 0.184 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 2.74e-01 0.0717 0.0654 0.184 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 1.60e-01 0.109 0.0772 0.184 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0109 0.0716 0.184 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 1.79e-01 0.134 0.0992 0.184 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 8.09e-02 -0.0978 0.0557 0.184 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0124 0.0676 0.184 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 6.33e-01 0.0289 0.0604 0.184 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 3.60e-02 -0.151 0.0717 0.184 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 1.17e-01 -0.123 0.0782 0.184 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0115 0.105 0.184 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0344 0.0641 0.184 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00562 0.0654 0.184 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 2.49e-01 0.0884 0.0764 0.184 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 2.36e-01 0.114 0.096 0.184 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 5.57e-02 0.208 0.108 0.178 DC L1
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 1.94e-01 0.156 0.12 0.178 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 4.74e-01 -0.077 0.107 0.178 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 1.37e-01 0.103 0.069 0.178 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 4.05e-01 0.0915 0.11 0.178 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0147 0.0731 0.184 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0644 0.108 0.184 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0729 0.0822 0.184 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 2.09e-01 0.0714 0.0566 0.184 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 4.84e-01 0.0632 0.0901 0.184 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 2.64e-01 -0.092 0.0822 0.185 NK L1
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 1.91e-01 0.142 0.108 0.185 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0814 0.0736 0.185 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 4.46e-01 0.0688 0.0901 0.185 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 9.97e-01 0.000441 0.101 0.185 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 2.22e-01 0.114 0.0933 0.185 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00378 0.081 0.184 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 7.74e-01 0.0276 0.096 0.184 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 2.59e-02 -0.193 0.0861 0.184 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 9.63e-01 0.00301 0.0653 0.184 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 3.33e-01 0.104 0.107 0.184 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 2.08e-01 0.14 0.111 0.184 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0909 0.135 0.168 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 8.86e-01 0.0175 0.122 0.168 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 3.67e-01 -0.109 0.12 0.168 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -851512 sc-eQTL 3.63e-01 0.101 0.11 0.168 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 7.92e-01 0.0204 0.0772 0.168 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 2.57e-02 -0.277 0.123 0.168 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0578 0.11 0.168 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0234 0.102 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 7.02e-01 0.0457 0.12 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 8.12e-01 0.0224 0.0944 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -851512 sc-eQTL 8.37e-01 0.0217 0.105 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 9.34e-01 0.00535 0.0646 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0154 0.0907 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 3.34e-01 0.098 0.101 0.182 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 7.34e-01 0.0347 0.102 0.183 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 6.74e-01 0.0485 0.115 0.183 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 2.19e-02 -0.222 0.0962 0.183 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -851512 sc-eQTL 9.81e-01 0.00225 0.0925 0.183 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 1.71e-01 0.112 0.0816 0.183 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0373 0.0938 0.183 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 5.09e-03 0.305 0.108 0.183 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 1.39e-01 0.13 0.0877 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 4.76e-01 0.0828 0.116 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 1.87e-01 -0.109 0.0824 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -851512 sc-eQTL 2.41e-01 0.101 0.0855 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00696 0.0573 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 2.05e-01 0.0953 0.075 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 7.14e-01 0.0342 0.093 0.184 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 2.58e-01 0.111 0.0981 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 6.07e-02 0.215 0.114 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0606 0.101 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -851512 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0487 0.0907 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000206 0.0617 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0489 0.0897 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00598 0.097 0.185 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 4.74e-01 0.0813 0.113 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 7.69e-01 0.0337 0.115 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0209 0.114 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0269 0.103 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 2.68e-03 0.335 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0416 0.0995 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 7.03e-01 0.0281 0.0738 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 5.33e-01 0.0663 0.106 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0482 0.0562 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 7.89e-01 0.0186 0.0696 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00367 0.0706 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 4.05e-02 -0.166 0.0803 0.184 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0648 0.0872 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 2.49e-02 0.262 0.116 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 6.36e-02 -0.122 0.0655 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 5.20e-01 0.044 0.0684 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 7.05e-01 0.0329 0.0868 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 6.58e-02 -0.177 0.0959 0.184 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 3.14e-01 -0.109 0.108 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 6.65e-01 0.0516 0.119 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 1.25e-01 -0.136 0.0882 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0585 0.0926 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 7.10e-01 0.0404 0.108 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 5.88e-01 0.0579 0.107 0.184 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0806 0.0941 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 1.28e-01 -0.169 0.11 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 1.79e-01 -0.114 0.0842 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 5.53e-01 0.0609 0.103 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 6.26e-01 0.0526 0.108 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 4.15e-01 0.0828 0.101 0.184 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 2.47e-01 -0.115 0.0987 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0417 0.109 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 9.69e-01 0.00287 0.0748 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 2.29e-01 0.092 0.0762 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 1.46e-01 0.139 0.095 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 3.47e-01 0.0977 0.104 0.184 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0946 0.12 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 2.38e-01 0.141 0.119 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0127 0.0905 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 6.19e-01 0.0583 0.117 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 7.38e-02 0.193 0.108 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 1.62e-01 -0.153 0.109 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 2.43e-01 0.126 0.108 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 1.91e-01 0.149 0.113 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 6.38e-02 -0.21 0.113 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0825 0.108 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0905 0.112 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 1.93e-01 0.132 0.101 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0724 0.106 0.184 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 2.96e-01 -0.125 0.119 0.184 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0728 0.1 0.184 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0876 0.0968 0.184 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 4.92e-01 0.0742 0.108 0.184 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 7.59e-01 0.0341 0.111 0.184 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 6.46e-01 0.0546 0.119 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0231 0.118 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0954 0.104 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 4.65e-01 0.0792 0.108 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 6.80e-01 0.0449 0.109 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 9.42e-02 -0.179 0.106 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 8.59e-01 0.0151 0.0848 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 6.12e-01 0.0585 0.115 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 1.24e-01 -0.124 0.08 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 6.13e-01 0.0473 0.0933 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 5.29e-01 0.0738 0.117 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 7.95e-01 0.0251 0.0965 0.183 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 6.97e-01 0.0443 0.114 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0871 0.114 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0467 0.107 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 5.26e-01 0.0644 0.101 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0674 0.108 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 3.90e-01 0.0896 0.104 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 3.21e-02 -0.203 0.0942 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 9.62e-02 0.196 0.117 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0243 0.0912 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0245 0.105 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 5.95e-01 0.0593 0.111 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 1.71e-01 0.142 0.103 0.183 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 3.20e-01 -0.128 0.128 0.211 PB L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 2.33e-01 0.138 0.115 0.211 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0651 0.13 0.211 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -851512 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0672 0.117 0.211 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0188 0.0834 0.211 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 3.44e-01 0.108 0.114 0.211 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 9.30e-01 0.0107 0.122 0.211 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 3.27e-01 -0.096 0.0978 0.176 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 1.07e-02 0.254 0.0986 0.176 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 2.81e-02 -0.223 0.101 0.176 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0121 0.0782 0.176 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 7.81e-01 0.0304 0.109 0.176 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 5.51e-01 0.06 0.1 0.176 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0186 0.103 0.184 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 3.96e-01 -0.105 0.124 0.184 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 8.48e-02 -0.149 0.0859 0.184 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0149 0.105 0.184 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 3.53e-01 0.0996 0.107 0.184 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 3.75e-01 0.095 0.107 0.184 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 5.43e-01 0.0703 0.115 0.178 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 3.96e-01 0.11 0.13 0.178 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00439 0.109 0.178 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 1.84e-02 0.186 0.0783 0.178 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0481 0.108 0.178 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0447 0.09 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0311 0.111 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0843 0.0812 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 7.06e-01 0.0234 0.062 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 5.14e-01 0.0637 0.0973 0.184 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 3.19e-01 0.0852 0.0852 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 6.09e-01 0.0576 0.113 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0389 0.103 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 9.49e-02 0.108 0.0644 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 7.18e-01 -0.035 0.0967 0.184 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 4.17e-01 0.118 0.144 0.176 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 1.97e-01 0.186 0.143 0.176 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 1.23e-01 -0.194 0.125 0.176 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 4.30e-01 0.115 0.145 0.176 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0489 0.134 0.176 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00378 0.13 0.176 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 7.98e-02 -0.187 0.106 0.189 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 3.66e-01 0.103 0.113 0.189 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0105 0.111 0.189 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 1.47e-01 0.114 0.0784 0.189 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0329 0.107 0.189 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 5.51e-02 -0.21 0.109 0.179 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 5.34e-01 0.0736 0.118 0.179 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 7.48e-01 0.0381 0.119 0.179 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 4.79e-01 0.0591 0.0833 0.179 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 1.76e-01 0.143 0.105 0.179 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 1.13e-01 0.213 0.134 0.167 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 2.78e-01 0.151 0.138 0.167 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 3.53e-01 -0.123 0.132 0.167 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 9.72e-01 0.00366 0.106 0.167 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 6.39e-01 -0.055 0.117 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 6.61e-01 0.0405 0.0923 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 2.77e-01 0.124 0.114 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 1.65e-01 -0.113 0.0814 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -851512 sc-eQTL 1.35e-01 0.15 0.1 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 5.71e-01 0.036 0.0634 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0799 0.0837 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 1.15e-01 0.144 0.0909 0.184 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 1.18e-01 0.129 0.0821 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 7.92e-02 0.189 0.107 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 1.59e-01 -0.111 0.0786 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -851512 sc-eQTL 5.46e-01 0.0471 0.0778 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00546 0.0548 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 2.36e-01 0.0839 0.0706 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 5.26e-01 0.0534 0.084 0.184 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 6.49e-01 0.0365 0.08 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0264 0.107 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0748 0.0794 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 2.43e-01 0.0658 0.0563 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 7.26e-01 0.0319 0.0909 0.184 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 2.20e-02 -0.222 0.0963 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 7.41e-01 0.0368 0.111 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 8.01e-01 0.0285 0.113 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 1.95e-01 0.0925 0.0712 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 7.79e-01 0.029 0.103 0.185 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 690173 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0714 0.0808 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 641131 sc-eQTL 2.95e-01 0.117 0.111 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 984982 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0791 0.0758 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -885701 sc-eQTL 5.05e-01 0.0614 0.092 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -846431 sc-eQTL 7.54e-01 0.0334 0.106 0.183 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -859620 sc-eQTL 2.58e-01 0.104 0.0914 0.183 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000159023 EPB41 984982 eQTL 0.0055 0.0652 0.0234 0.00339 0.0 0.186
ENSG00000162510 MATN1 -851512 eQTL 0.021 -0.058 0.0251 0.0 0.0 0.186


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000159023 EPB41 984982 2.74e-07 1.3e-07 5.14e-08 1.83e-07 9.79e-08 9.91e-08 1.61e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.54e-07 9.19e-08 1.52e-07 7.13e-08 6.18e-08 7.36e-08 3.93e-08 1.27e-07 6.07e-08 4.21e-08 1.21e-07 1.27e-07 1.44e-07 2.93e-08 1.5e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.16e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.1e-08 3.96e-08 8.11e-08 5.99e-08 3.05e-08 5.29e-08 8.71e-08 6.71e-08 4.47e-08 5.03e-08 1.46e-07 5.22e-08 1.34e-08 3.42e-08 1.86e-08 1.19e-07 1.89e-09 5e-08