logo

Genes within 1Mb (chr1:29861503:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 4.02e-01 0.0644 0.0766 0.179 B L1
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 3.43e-02 0.193 0.0905 0.179 B L1
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0964 0.0719 0.179 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -862082 sc-eQTL 2.71e-01 0.0804 0.0728 0.179 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 9.09e-01 0.00652 0.0572 0.179 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 3.16e-01 0.0672 0.0669 0.179 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 1.01e-01 0.13 0.0788 0.179 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0113 0.0734 0.179 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 2.85e-01 0.109 0.102 0.179 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0902 0.0572 0.179 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0192 0.0693 0.179 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 6.17e-01 0.031 0.062 0.179 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 2.40e-02 -0.167 0.0734 0.179 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 1.20e-01 -0.125 0.0802 0.179 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 9.58e-01 0.00565 0.108 0.179 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0361 0.0657 0.179 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0198 0.067 0.179 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 2.22e-01 0.0959 0.0783 0.179 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 2.81e-01 0.106 0.0985 0.179 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 4.37e-02 0.225 0.111 0.176 DC L1
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 1.77e-01 0.166 0.123 0.176 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0744 0.11 0.176 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 1.34e-01 0.106 0.0706 0.176 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 3.19e-01 0.112 0.112 0.176 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0164 0.0747 0.179 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 4.19e-01 -0.089 0.11 0.179 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0843 0.0839 0.179 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 2.90e-01 0.0614 0.0579 0.179 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 4.05e-01 0.0767 0.092 0.179 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 1.93e-01 -0.11 0.0839 0.18 NK L1
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 2.02e-01 0.141 0.11 0.18 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 3.02e-01 -0.078 0.0753 0.18 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 6.59e-01 0.0407 0.0922 0.18 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0156 0.104 0.18 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 2.53e-01 0.109 0.0954 0.18 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 8.36e-01 0.017 0.0825 0.179 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 8.55e-01 0.0179 0.0978 0.179 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 2.78e-02 -0.194 0.0877 0.179 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00123 0.0666 0.179 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 2.20e-01 0.134 0.109 0.179 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 2.30e-01 0.136 0.113 0.179 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0999 0.14 0.163 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 7.05e-01 0.0476 0.126 0.163 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 2.56e-01 -0.141 0.124 0.163 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -862082 sc-eQTL 3.13e-01 0.115 0.114 0.163 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 5.45e-01 0.0484 0.0797 0.163 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 2.23e-02 -0.293 0.127 0.163 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0306 0.114 0.163 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00532 0.105 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 7.59e-01 0.0374 0.122 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 9.33e-01 0.00812 0.0963 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -862082 sc-eQTL 8.75e-01 0.0169 0.107 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00153 0.0659 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 1.00e+00 -5.56e-05 0.0925 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 3.87e-01 0.0895 0.103 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 6.23e-01 0.0511 0.104 0.181 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 6.73e-01 0.0495 0.117 0.181 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 2.45e-02 -0.222 0.098 0.181 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -862082 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0228 0.0942 0.181 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 2.12e-01 0.104 0.0832 0.181 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0337 0.0956 0.181 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 6.80e-03 0.301 0.11 0.181 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 1.33e-01 0.135 0.0897 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 6.30e-01 0.0571 0.119 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 1.72e-01 -0.115 0.0842 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -862082 sc-eQTL 2.66e-01 0.0976 0.0875 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00821 0.0586 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 2.34e-01 0.0917 0.0767 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 4.08e-01 0.0786 0.095 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 3.70e-01 0.0903 0.101 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 4.25e-02 0.238 0.116 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0485 0.103 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -862082 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0503 0.093 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 9.79e-01 0.00164 0.0632 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0638 0.0919 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00508 0.0994 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 5.14e-01 0.076 0.116 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 6.26e-01 0.0576 0.118 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 6.89e-01 -0.047 0.117 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0592 0.106 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 6.04e-03 0.315 0.114 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0457 0.102 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 7.77e-01 0.0214 0.0755 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 7.16e-01 0.0396 0.109 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0397 0.0575 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 7.73e-01 0.0205 0.0712 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 9.81e-01 0.00176 0.0723 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 3.77e-02 -0.172 0.0822 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0328 0.0893 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 2.29e-02 0.272 0.119 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 1.07e-01 -0.109 0.0671 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 5.88e-01 0.038 0.07 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 7.97e-01 0.0229 0.0888 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 3.97e-02 -0.203 0.098 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 3.11e-01 -0.112 0.111 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 8.21e-01 0.0276 0.122 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 1.57e-01 -0.129 0.0908 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0858 0.0951 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 6.27e-01 0.0542 0.111 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 5.51e-01 0.0655 0.11 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0866 0.0963 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 1.19e-01 -0.177 0.113 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 1.50e-01 -0.125 0.0861 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 6.30e-01 0.0506 0.105 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 5.01e-01 0.0744 0.11 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 3.76e-01 0.0919 0.104 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0912 0.101 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0111 0.111 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 9.57e-01 0.00415 0.0765 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 2.77e-01 0.085 0.078 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 1.43e-01 0.143 0.0971 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 3.54e-01 0.0986 0.106 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0782 0.124 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 1.55e-01 0.175 0.122 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00504 0.093 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 6.27e-01 0.0586 0.12 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 9.31e-02 0.187 0.111 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 2.30e-01 -0.135 0.112 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 2.07e-01 0.139 0.11 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 2.42e-01 0.137 0.116 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 8.55e-02 -0.2 0.116 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 3.51e-01 -0.103 0.11 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 3.83e-01 -0.1 0.115 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 2.36e-01 0.123 0.103 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0375 0.108 0.18 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 3.04e-01 -0.125 0.122 0.18 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 5.20e-01 -0.066 0.102 0.18 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 2.43e-01 -0.116 0.0987 0.18 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 3.17e-01 0.11 0.11 0.18 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 9.03e-01 0.0138 0.114 0.18 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 7.77e-01 0.0345 0.122 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0165 0.121 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 3.67e-01 -0.096 0.106 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 5.54e-01 0.0657 0.111 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00479 0.111 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 1.51e-01 -0.158 0.109 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 9.78e-01 0.00244 0.0867 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 7.25e-01 0.0416 0.118 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 1.44e-01 -0.12 0.0819 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 8.41e-01 0.0192 0.0955 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 5.99e-01 0.063 0.12 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 9.38e-01 0.00763 0.0987 0.179 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 7.42e-01 0.0384 0.117 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0805 0.117 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0316 0.11 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 5.52e-01 0.0618 0.104 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0668 0.11 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 3.12e-01 0.108 0.107 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 2.38e-02 -0.219 0.0963 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 6.86e-02 0.219 0.12 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0293 0.0933 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0401 0.108 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 6.29e-01 0.0551 0.114 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 1.64e-01 0.148 0.106 0.179 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 3.59e-01 -0.118 0.128 0.207 PB L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 3.00e-01 0.12 0.115 0.207 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0425 0.13 0.207 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -862082 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0564 0.117 0.207 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0302 0.0835 0.207 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 3.94e-01 0.0975 0.114 0.207 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 8.71e-01 0.0199 0.122 0.207 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0901 0.0997 0.172 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 7.33e-03 0.272 0.1 0.172 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 3.27e-02 -0.221 0.103 0.172 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00586 0.0797 0.172 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 6.41e-01 0.0519 0.111 0.172 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 3.70e-01 0.0918 0.102 0.172 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0484 0.106 0.179 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 2.11e-01 -0.159 0.127 0.179 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 1.51e-01 -0.127 0.0884 0.179 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0304 0.108 0.179 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 3.68e-01 0.0991 0.11 0.179 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 3.27e-01 0.108 0.11 0.179 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 5.66e-01 0.0679 0.118 0.176 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 4.17e-01 0.108 0.132 0.176 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00206 0.112 0.176 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 2.52e-02 0.181 0.0802 0.176 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0365 0.11 0.176 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0453 0.0919 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0246 0.114 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 2.27e-01 -0.1 0.0829 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 8.30e-01 0.0136 0.0633 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 4.88e-01 0.069 0.0994 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 3.26e-01 0.0857 0.087 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 8.01e-01 0.0291 0.115 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0529 0.105 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 1.23e-01 0.102 0.0658 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0211 0.0988 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 3.22e-01 0.147 0.148 0.173 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 1.88e-01 0.195 0.147 0.173 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 1.10e-01 -0.207 0.129 0.173 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 4.07e-01 0.124 0.15 0.173 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0516 0.138 0.173 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 9.66e-01 0.00571 0.134 0.173 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 6.26e-02 -0.203 0.108 0.184 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 4.97e-01 0.0787 0.116 0.184 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00401 0.113 0.184 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 1.73e-01 0.11 0.0801 0.184 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0201 0.109 0.184 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 6.12e-02 -0.209 0.111 0.174 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 4.57e-01 0.0899 0.121 0.174 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 6.23e-01 0.0596 0.121 0.174 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 6.02e-01 0.0445 0.0852 0.174 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 1.02e-01 0.176 0.107 0.174 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 7.84e-02 0.244 0.138 0.164 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 2.48e-01 0.165 0.142 0.164 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 3.94e-01 -0.116 0.136 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 8.68e-01 0.0182 0.109 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0481 0.12 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 5.82e-01 0.0518 0.0941 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 2.43e-01 0.136 0.116 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 1.57e-01 -0.118 0.083 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -862082 sc-eQTL 2.36e-01 0.122 0.103 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 5.39e-01 0.0398 0.0646 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0525 0.0854 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 1.53e-01 0.133 0.0927 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 1.43e-01 0.124 0.0841 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 1.01e-01 0.181 0.11 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 1.91e-01 -0.106 0.0805 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -862082 sc-eQTL 5.93e-01 0.0426 0.0797 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00543 0.0561 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 2.89e-01 0.0769 0.0723 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 3.50e-01 0.0806 0.0859 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 6.78e-01 0.034 0.0817 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0454 0.109 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0902 0.0809 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 2.99e-01 0.0598 0.0575 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 6.55e-01 0.0415 0.0928 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 2.28e-02 -0.226 0.0986 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 8.99e-01 0.0144 0.114 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 6.89e-01 0.0462 0.115 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 2.27e-01 0.0883 0.0729 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 6.27e-01 0.0513 0.105 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 679603 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0878 0.0826 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 630561 sc-eQTL 3.23e-01 0.113 0.114 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 974412 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0751 0.0776 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -896271 sc-eQTL 7.37e-01 0.0317 0.0942 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -857001 sc-eQTL 8.23e-01 0.0243 0.109 0.179 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -870190 sc-eQTL 3.28e-01 0.0917 0.0936 0.179 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000159023 EPB41 974412 eQTL 0.00508 0.0656 0.0234 0.00342 0.0 0.185
ENSG00000162510 MATN1 -862082 eQTL 0.0235 -0.0568 0.025 0.0 0.0 0.185

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000159023 EPB41 974412 2.67e-07 1.3e-07 4.98e-08 1.81e-07 1.01e-07 9.9e-08 1.61e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.55e-07 9.19e-08 1.52e-07 7.13e-08 6.12e-08 7.49e-08 4.09e-08 1.33e-07 5.97e-08 4.21e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.44e-07 2.93e-08 1.5e-07 1.21e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.16e-07 1.07e-07 9.92e-08 2.93e-08 3.66e-08 8.11e-08 6.34e-08 3.2e-08 5.31e-08 8.61e-08 6.37e-08 3.86e-08 5.34e-08 1.36e-07 5.2e-08 1.38e-08 3.83e-08 1.89e-08 1.2e-07 1.88e-09 5.02e-08