logo

Genes within 1Mb (chr1:29853250:CTT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0814 0.0767 0.169 B L1
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0867 0.0914 0.169 B L1
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0361 0.0722 0.169 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -870335 sc-eQTL 6.11e-02 -0.137 0.0726 0.169 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0527 0.0572 0.169 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 9.94e-01 0.000466 0.0671 0.169 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0881 0.0792 0.169 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0102 0.0747 0.169 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 7.63e-01 0.0314 0.104 0.169 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00649 0.0586 0.169 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 1.86e-02 -0.165 0.0696 0.169 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0587 0.063 0.169 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00795 0.0756 0.169 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 1.63e-01 -0.114 0.0815 0.169 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 7.03e-02 -0.198 0.109 0.169 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 5.29e-01 0.0421 0.0667 0.169 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0807 0.0679 0.169 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0349 0.0798 0.169 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 1.96e-02 -0.233 0.099 0.169 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 7.10e-02 -0.211 0.116 0.162 DC L1
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0296 0.129 0.162 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 4.22e-01 0.0924 0.115 0.162 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 3.70e-03 -0.214 0.0728 0.162 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 4.07e-03 -0.335 0.115 0.162 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 7.95e-01 0.0202 0.0775 0.169 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0159 0.114 0.169 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 8.78e-01 0.0134 0.0872 0.169 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0527 0.0601 0.169 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 1.17e-01 -0.15 0.095 0.169 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 6.81e-01 0.0356 0.0865 0.17 NK L1
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 6.70e-01 0.0485 0.114 0.17 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 5.35e-01 0.0481 0.0775 0.17 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 1.30e-02 -0.234 0.0933 0.17 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0215 0.106 0.17 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0909 0.0981 0.17 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0799 0.0839 0.169 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0156 0.0997 0.169 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 8.03e-01 0.0226 0.0904 0.169 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 2.81e-04 -0.243 0.0658 0.169 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 5.57e-01 0.0654 0.111 0.169 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 3.17e-01 -0.116 0.115 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 5.90e-01 0.0745 0.138 0.168 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 4.04e-02 -0.254 0.123 0.168 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 4.35e-02 0.247 0.122 0.168 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -870335 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0197 0.113 0.168 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 4.56e-01 0.0588 0.0788 0.168 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 9.34e-01 0.0106 0.127 0.168 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0831 0.113 0.168 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 2.22e-01 0.125 0.102 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0867 0.12 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 5.71e-01 0.0536 0.0945 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -870335 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0385 0.105 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00293 0.0647 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 9.47e-02 -0.151 0.0902 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 8.29e-01 -0.022 0.102 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0432 0.107 0.168 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0941 0.121 0.168 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0375 0.102 0.168 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -870335 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0487 0.0972 0.168 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0715 0.086 0.168 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0558 0.0986 0.168 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 9.97e-01 0.000456 0.116 0.168 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0915 0.0913 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 6.16e-01 0.0605 0.12 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0577 0.0858 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -870335 sc-eQTL 3.63e-02 -0.186 0.0881 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0507 0.0594 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0593 0.078 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 1.75e-01 -0.131 0.0961 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 3.18e-01 0.102 0.102 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 3.19e-01 -0.118 0.118 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0955 0.104 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -870335 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0803 0.0938 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0266 0.0638 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 1.60e-01 0.131 0.0925 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 4.96e-01 0.0684 0.1 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 2.94e-01 0.121 0.115 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0602 0.117 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 2.22e-01 -0.142 0.116 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0465 0.105 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00861 0.115 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 9.35e-01 0.0083 0.101 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00347 0.0758 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 1.84e-01 0.145 0.108 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 3.71e-01 0.0516 0.0576 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 6.68e-03 -0.192 0.0702 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0807 0.0723 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 8.14e-01 0.0196 0.0833 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 2.56e-01 -0.103 0.09 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0418 0.122 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0584 0.0681 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 1.52e-02 -0.171 0.0698 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 7.17e-01 0.0326 0.0898 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0305 0.1 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 4.18e-01 0.0914 0.113 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 4.00e-01 -0.105 0.124 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 4.02e-01 0.0778 0.0927 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00752 0.097 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 8.72e-01 0.0183 0.113 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 1.24e-01 -0.172 0.111 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0779 0.1 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 3.82e-01 -0.103 0.118 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 6.66e-01 0.0388 0.0898 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 1.15e-01 -0.172 0.108 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 5.86e-01 0.0625 0.114 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0679 0.108 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 1.20e-01 -0.157 0.101 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 1.28e-01 -0.169 0.111 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 8.11e-01 0.0184 0.0766 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0832 0.0782 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0671 0.0977 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 7.33e-03 -0.283 0.105 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0525 0.124 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 7.22e-01 0.0438 0.123 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0264 0.0928 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 8.06e-02 -0.209 0.119 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 8.27e-02 -0.193 0.11 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0318 0.112 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 1.37e-01 0.168 0.113 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 1.86e-01 -0.158 0.119 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00427 0.119 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 2.70e-02 0.249 0.112 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 7.79e-01 0.033 0.118 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 9.23e-01 0.0103 0.106 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 6.30e-01 0.0545 0.113 0.169 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 7.35e-01 -0.043 0.127 0.169 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0841 0.106 0.169 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 2.35e-01 -0.122 0.103 0.169 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 2.75e-01 0.125 0.114 0.169 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0244 0.118 0.169 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 2.41e-01 0.145 0.124 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 6.73e-02 0.225 0.122 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 2.59e-01 0.122 0.108 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 3.40e-02 -0.239 0.112 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 2.55e-01 0.129 0.113 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 5.40e-03 -0.309 0.11 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 6.82e-01 0.0365 0.0888 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 7.18e-01 0.0437 0.121 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 8.36e-01 0.0175 0.0843 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 1.56e-02 -0.235 0.0965 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0615 0.122 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 4.75e-01 0.0723 0.101 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 6.01e-01 0.0613 0.117 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 2.11e-01 0.147 0.117 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 5.57e-01 0.065 0.11 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 3.63e-02 -0.218 0.103 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 1.26e-01 0.17 0.111 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 3.02e-01 -0.111 0.107 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 9.62e-01 0.00476 0.0991 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 3.59e-01 -0.113 0.122 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 4.38e-01 0.0736 0.0947 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 6.63e-03 -0.295 0.107 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 2.35e-01 -0.138 0.115 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 4.84e-02 -0.212 0.107 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 9.16e-01 -0.016 0.152 0.156 PB L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 7.89e-02 0.24 0.135 0.156 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 2.91e-01 0.163 0.153 0.156 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -870335 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00525 0.138 0.156 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 7.17e-01 -0.036 0.0988 0.156 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 3.01e-01 -0.14 0.135 0.156 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0157 0.144 0.156 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0751 0.103 0.17 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 8.28e-01 -0.023 0.105 0.17 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 5.93e-01 0.0575 0.107 0.17 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 1.54e-01 -0.117 0.0819 0.17 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0348 0.115 0.17 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 1.05e-01 -0.171 0.105 0.17 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0509 0.105 0.169 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 3.83e-01 -0.111 0.127 0.169 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 6.71e-01 0.0377 0.0886 0.169 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 8.05e-02 -0.188 0.107 0.169 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 1.76e-01 -0.148 0.109 0.169 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 1.35e-01 -0.163 0.109 0.169 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0889 0.125 0.149 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0772 0.14 0.149 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 2.73e-01 0.129 0.118 0.149 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 7.05e-02 -0.155 0.0851 0.149 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 7.10e-03 -0.311 0.114 0.149 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 2.33e-01 0.115 0.0963 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 3.77e-01 0.106 0.119 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0193 0.0873 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0747 0.0663 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0259 0.105 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0974 0.0926 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 2.52e-01 -0.14 0.122 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0589 0.112 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 9.39e-01 0.00537 0.0705 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0133 0.105 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0827 0.146 0.179 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0621 0.145 0.179 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 9.64e-01 0.0057 0.128 0.179 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 1.06e-03 -0.474 0.142 0.179 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 2.55e-01 -0.155 0.135 0.179 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 8.16e-01 0.0307 0.131 0.179 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 2.94e-01 0.125 0.118 0.164 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000193 0.126 0.164 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 5.54e-01 0.0726 0.123 0.164 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 4.65e-01 -0.064 0.0874 0.164 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 2.01e-01 -0.152 0.118 0.164 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0613 0.113 0.167 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 2.93e-01 -0.128 0.121 0.167 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 1.83e-01 0.162 0.121 0.167 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0639 0.0855 0.167 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 2.65e-01 -0.121 0.108 0.167 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0499 0.147 0.15 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 5.45e-01 0.0915 0.151 0.15 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 2.66e-01 0.16 0.143 0.15 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 5.04e-02 -0.224 0.113 0.15 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 2.86e-01 -0.136 0.127 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 4.87e-01 0.0662 0.0951 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 2.71e-01 -0.129 0.117 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 5.47e-01 0.0507 0.0842 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -870335 sc-eQTL 9.46e-01 0.00701 0.104 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0623 0.0652 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 4.43e-02 -0.173 0.0856 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 1.28e-01 -0.143 0.0937 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0967 0.0841 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 9.70e-01 0.00417 0.11 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0701 0.0805 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -870335 sc-eQTL 2.07e-02 -0.183 0.0786 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0647 0.0558 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 4.86e-01 0.0505 0.0723 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0655 0.0858 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 8.93e-01 0.0115 0.0853 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0575 0.114 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0477 0.0847 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0271 0.0601 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0578 0.0968 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 5.19e-01 0.0652 0.101 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 3.73e-01 -0.102 0.115 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 1.29e-01 0.177 0.116 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0867 0.0738 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 6.23e-02 -0.198 0.106 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 671350 sc-eQTL 9.72e-01 0.00297 0.0846 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 622308 sc-eQTL 8.76e-01 0.0183 0.117 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 966159 sc-eQTL 5.58e-01 0.0466 0.0794 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -904524 sc-eQTL 1.04e-02 -0.245 0.0947 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -865254 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0902 0.111 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -878443 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0203 0.0958 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000162511 \N -904524 1.28e-06 9.74e-07 7.57e-07 1.64e-06 4.89e-07 4.39e-07 1.43e-06 2.88e-07 1.46e-06 6.24e-07 1.81e-06 6.36e-07 2.46e-06 2.68e-07 5.01e-07 1.2e-06 1.07e-06 1.16e-06 5.76e-07 1.16e-06 1.28e-06 1.96e-06 1.65e-06 8.07e-07 2.19e-06 3.71e-07 1.02e-06 1.07e-06 1.25e-06 1.43e-06 7.05e-07 5.87e-07 3.23e-07 1.08e-06 5.38e-07 8.52e-07 8.89e-07 2.38e-07 4.94e-07 3.71e-07 2.29e-07 2.05e-06 5.58e-07 1.27e-08 3.97e-07 3.34e-07 2.6e-07 4.91e-08 1.56e-07