logo

Genes within 1Mb (chr1:29852375:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 2.12e-01 0.0957 0.0764 0.175 B L1
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 3.71e-03 0.263 0.0895 0.175 B L1
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 8.85e-02 -0.122 0.0716 0.175 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -871210 sc-eQTL 4.47e-01 0.0555 0.0728 0.175 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 5.20e-01 0.0368 0.0571 0.175 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 9.91e-01 0.00078 0.0669 0.175 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 1.87e-01 0.105 0.0789 0.175 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0211 0.0729 0.175 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 3.65e-01 0.0921 0.101 0.175 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 6.12e-02 -0.107 0.0567 0.175 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00637 0.0689 0.175 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 8.40e-01 0.0125 0.0616 0.175 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0966 0.0735 0.175 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0937 0.0808 0.175 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 1.21e-01 0.168 0.108 0.175 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0575 0.0659 0.175 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 8.62e-01 0.0117 0.0674 0.175 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 2.26e-01 0.0956 0.0787 0.175 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 4.47e-01 0.0755 0.0991 0.175 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 6.88e-02 0.204 0.111 0.171 DC L1
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 4.16e-02 0.251 0.123 0.171 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0145 0.11 0.171 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 2.19e-01 0.0875 0.0711 0.171 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 1.99e-01 0.145 0.112 0.171 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 6.65e-01 0.0326 0.0752 0.175 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 1.75e-01 -0.15 0.11 0.175 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0858 0.0845 0.175 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 3.42e-01 0.0556 0.0583 0.175 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 7.79e-01 0.0261 0.0928 0.175 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0779 0.0839 0.176 NK L1
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 2.99e-01 0.115 0.11 0.176 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 3.67e-02 -0.157 0.0746 0.176 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 9.00e-02 0.156 0.0914 0.176 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 4.79e-01 0.0733 0.103 0.176 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 6.09e-01 0.0489 0.0955 0.176 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 4.08e-01 0.0684 0.0825 0.175 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0387 0.0979 0.175 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 9.88e-02 -0.146 0.0883 0.175 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 1.33e-01 0.0999 0.0663 0.175 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 3.00e-01 0.113 0.109 0.175 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 5.25e-01 0.0724 0.114 0.175 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 1.61e-01 -0.187 0.133 0.163 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 2.83e-01 0.129 0.12 0.163 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 8.65e-02 -0.204 0.118 0.163 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -871210 sc-eQTL 3.28e-01 0.107 0.109 0.163 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0111 0.0763 0.163 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 1.83e-02 -0.289 0.121 0.163 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0409 0.109 0.163 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0331 0.103 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 2.80e-01 0.13 0.12 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0491 0.0948 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -871210 sc-eQTL 5.91e-01 -0.057 0.106 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 9.01e-01 0.00809 0.065 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 8.61e-01 -0.016 0.0912 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 4.47e-01 0.0776 0.102 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 4.20e-01 0.084 0.104 0.177 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 8.84e-01 0.0172 0.118 0.177 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 1.84e-01 -0.132 0.099 0.177 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -871210 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0624 0.0944 0.177 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 3.06e-01 0.0857 0.0835 0.177 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 1.11e-01 -0.153 0.0952 0.177 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 1.30e-02 0.277 0.111 0.177 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 5.21e-02 0.175 0.0896 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 3.41e-01 0.113 0.119 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 1.27e-01 -0.129 0.0843 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -871210 sc-eQTL 2.46e-01 0.102 0.0877 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 8.34e-01 0.0123 0.0588 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 4.68e-01 0.0561 0.0771 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 4.65e-01 0.0697 0.0952 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 3.05e-01 0.104 0.101 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 5.46e-03 0.326 0.116 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 3.24e-01 -0.102 0.104 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -871210 sc-eQTL 2.79e-01 -0.101 0.0934 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 9.21e-01 0.00628 0.0636 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0617 0.0926 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 5.73e-01 0.0565 0.1 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0639 0.119 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.12 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 9.04e-01 0.0144 0.12 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0887 0.108 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 7.65e-02 0.208 0.117 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0409 0.104 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 7.57e-01 0.0233 0.0753 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0175 0.108 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0869 0.0571 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 8.61e-01 0.0125 0.071 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 6.02e-01 0.0376 0.072 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 1.40e-01 -0.122 0.0823 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0821 0.0889 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 4.03e-03 0.342 0.118 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 1.30e-01 -0.102 0.067 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 4.85e-01 0.0489 0.0698 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0515 0.0886 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 7.60e-02 -0.175 0.098 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0413 0.111 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 6.70e-01 0.0524 0.123 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 7.14e-02 -0.165 0.091 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 5.83e-01 0.0526 0.0958 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0552 0.112 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 6.09e-01 0.0566 0.11 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0407 0.0966 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0597 0.114 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 3.27e-02 -0.184 0.0858 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 2.02e-01 0.134 0.105 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 9.66e-01 0.00476 0.111 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 1.87e-01 0.137 0.104 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 2.00e-01 -0.132 0.103 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 7.23e-01 0.0402 0.113 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 8.78e-01 0.012 0.078 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 1.18e-01 0.124 0.0793 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 1.28e-01 0.151 0.099 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 8.44e-01 0.0213 0.108 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0472 0.126 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 1.19e-01 0.195 0.125 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 9.78e-01 0.00257 0.0949 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 8.93e-01 0.0166 0.123 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 5.08e-02 0.221 0.113 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 3.13e-01 -0.116 0.115 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 1.97e-01 0.144 0.111 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 1.40e-02 0.287 0.116 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 1.50e-01 -0.169 0.117 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0949 0.111 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 9.82e-01 0.0026 0.115 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00402 0.104 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 5.78e-01 0.0605 0.109 0.175 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 1.45e-01 -0.178 0.121 0.175 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0639 0.103 0.175 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0129 0.0992 0.175 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 5.88e-01 0.0599 0.11 0.175 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0144 0.114 0.175 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 9.44e-01 0.00865 0.124 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0333 0.123 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 7.86e-02 -0.19 0.107 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 3.88e-01 0.0973 0.112 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 9.27e-01 0.0105 0.113 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 2.29e-01 -0.134 0.111 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 9.62e-01 0.00418 0.087 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 8.55e-01 0.0217 0.118 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 1.74e-01 -0.112 0.0822 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 1.82e-01 0.128 0.0954 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 4.06e-01 0.0997 0.12 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0542 0.0989 0.175 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 5.05e-01 0.0782 0.117 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0252 0.118 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 6.66e-02 -0.202 0.109 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 1.28e-01 0.159 0.104 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 1.38e-01 -0.164 0.11 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 9.60e-01 0.00537 0.107 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 7.17e-02 -0.174 0.0963 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 6.22e-02 0.224 0.119 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 4.10e-02 -0.189 0.0921 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 5.47e-01 0.0645 0.107 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 9.65e-02 0.188 0.113 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 2.52e-01 0.121 0.105 0.175 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 3.65e-01 -0.112 0.123 0.219 PB L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 2.89e-01 0.118 0.111 0.219 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0528 0.125 0.219 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -871210 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0189 0.112 0.219 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 3.38e-01 0.0768 0.0798 0.219 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 3.43e-01 0.104 0.109 0.219 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0176 0.117 0.219 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0168 0.102 0.165 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 1.70e-01 0.143 0.104 0.165 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 1.83e-01 -0.141 0.106 0.165 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 7.61e-02 0.144 0.0809 0.165 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0107 0.114 0.165 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 5.27e-01 0.0663 0.105 0.165 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 6.84e-01 -0.043 0.106 0.175 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 2.52e-01 -0.146 0.127 0.175 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0891 0.0884 0.175 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0419 0.108 0.175 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 5.02e-01 0.0738 0.11 0.175 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 6.00e-01 0.0575 0.11 0.175 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 3.29e-01 0.115 0.118 0.173 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 3.52e-01 0.124 0.133 0.173 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 7.43e-01 0.0367 0.112 0.173 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 2.42e-02 0.183 0.0803 0.173 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0025 0.111 0.173 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 7.58e-01 0.0286 0.0928 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 3.35e-01 -0.111 0.114 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 1.19e-01 -0.131 0.0834 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00204 0.0639 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 6.43e-01 0.0466 0.1 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 2.04e-01 0.111 0.0869 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0524 0.115 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 7.42e-01 0.0348 0.105 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 3.01e-01 0.0684 0.066 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 4.30e-01 -0.078 0.0986 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0443 0.154 0.155 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 3.90e-01 0.132 0.153 0.155 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 7.76e-02 -0.237 0.133 0.155 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 1.19e-01 0.241 0.154 0.155 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0202 0.143 0.155 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0789 0.139 0.155 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 6.42e-03 -0.296 0.107 0.182 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 7.79e-01 0.0326 0.116 0.182 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 2.50e-01 -0.13 0.113 0.182 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 2.89e-01 0.0855 0.0804 0.182 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0337 0.11 0.182 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 1.06e-01 -0.182 0.112 0.172 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 3.07e-01 0.124 0.121 0.172 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 9.82e-01 0.00278 0.122 0.172 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 4.95e-01 0.0586 0.0856 0.172 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 2.91e-01 0.115 0.108 0.172 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 2.80e-01 0.146 0.135 0.167 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 6.29e-02 0.258 0.138 0.167 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0837 0.133 0.167 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 4.33e-01 0.0833 0.106 0.167 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 7.68e-01 0.0347 0.117 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00294 0.0937 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 8.48e-02 0.199 0.115 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 2.13e-01 -0.103 0.0826 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -871210 sc-eQTL 7.07e-01 0.0385 0.102 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 5.62e-01 0.0373 0.0642 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 1.26e-01 -0.13 0.0846 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 1.35e-01 0.138 0.0922 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 3.73e-02 0.176 0.084 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 1.35e-02 0.272 0.109 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 8.33e-02 -0.14 0.0805 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -871210 sc-eQTL 5.74e-01 0.045 0.0799 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 8.32e-01 0.012 0.0563 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 7.01e-01 0.028 0.0727 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 3.27e-01 0.0846 0.0862 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 2.16e-01 0.102 0.0821 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 1.31e-01 -0.166 0.11 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0747 0.0817 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 5.70e-01 0.033 0.058 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 8.31e-01 0.02 0.0935 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 2.59e-02 -0.221 0.0986 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 7.59e-01 0.0349 0.114 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 9.58e-01 0.00608 0.115 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 1.71e-01 0.1 0.0728 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00775 0.105 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 670475 sc-eQTL 5.55e-01 -0.049 0.0828 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 621433 sc-eQTL 4.35e-01 0.0892 0.114 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 965284 sc-eQTL 4.28e-02 -0.157 0.0771 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -905399 sc-eQTL 1.24e-01 0.145 0.0937 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 sc-eQTL 3.35e-01 0.105 0.109 0.175 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -879318 sc-eQTL 8.68e-01 0.0156 0.0938 0.175 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000159023 EPB41 965284 eQTL 0.0502 0.0455 0.0232 0.00108 0.0 0.185
ENSG00000162510 MATN1 -871210 eQTL 0.00827 -0.0656 0.0248 0.0 0.0 0.185
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -866129 eQTL 1.12e-02 -0.0404 0.0159 0.0 0.0 0.185

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina