logo

Genes within 1Mb (chr1:29844959:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 8.35e-01 0.0177 0.0853 0.12 B L1
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 8.32e-01 0.0216 0.102 0.12 B L1
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0207 0.0802 0.12 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -878626 sc-eQTL 1.77e-02 0.191 0.0801 0.12 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0328 0.0635 0.12 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 5.08e-01 0.0493 0.0744 0.12 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 4.40e-01 0.0681 0.0881 0.12 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0109 0.0812 0.12 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0234 0.113 0.12 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 1.00e+00 3.4e-05 0.0637 0.12 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 5.26e-01 0.0486 0.0766 0.12 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00493 0.0686 0.12 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 9.44e-01 0.00573 0.0822 0.12 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 8.68e-01 0.0148 0.0889 0.12 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0735 0.119 0.12 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 5.69e-01 0.0413 0.0724 0.12 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 9.84e-02 0.122 0.0735 0.12 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 8.63e-01 0.0149 0.0866 0.12 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 1.34e-01 0.163 0.108 0.12 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 5.45e-01 0.0725 0.12 0.124 DC L1
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0985 0.132 0.124 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 8.45e-01 -0.023 0.118 0.124 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0673 0.0759 0.124 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 1.89e-01 -0.158 0.12 0.124 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 3.35e-01 0.0816 0.0846 0.12 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 3.89e-01 -0.107 0.125 0.12 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0301 0.0954 0.12 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 9.09e-01 0.00754 0.0658 0.12 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 5.17e-01 0.0677 0.104 0.12 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0362 0.0949 0.12 NK L1
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 4.45e-02 -0.25 0.124 0.12 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 5.41e-01 -0.052 0.085 0.12 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 4.82e-02 0.205 0.103 0.12 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0829 0.117 0.12 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0372 0.108 0.12 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 4.00e-01 0.0765 0.0908 0.12 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 5.97e-02 0.202 0.107 0.12 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0289 0.0978 0.12 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 2.21e-02 0.167 0.0725 0.12 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 2.39e-01 -0.141 0.12 0.12 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00328 0.125 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00534 0.153 0.117 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00355 0.137 0.117 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0996 0.136 0.117 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -878626 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00334 0.125 0.117 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 3.45e-01 0.0824 0.087 0.117 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0403 0.141 0.117 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 5.32e-01 0.0779 0.124 0.117 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 3.10e-01 -0.113 0.111 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 6.66e-01 -0.056 0.13 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00073 0.102 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -878626 sc-eQTL 7.65e-01 0.0342 0.114 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 1.34e-01 0.105 0.0697 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 3.21e-02 0.21 0.0973 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0341 0.11 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 4.66e-02 0.235 0.117 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 4.11e-01 -0.11 0.134 0.121 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 9.63e-01 0.00521 0.113 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -878626 sc-eQTL 9.60e-01 0.00543 0.107 0.121 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 9.16e-01 0.0101 0.0952 0.121 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 6.84e-02 0.198 0.108 0.121 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 3.36e-01 -0.123 0.127 0.121 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 5.25e-01 0.0633 0.0995 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 8.96e-01 0.0172 0.131 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0185 0.0934 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -878626 sc-eQTL 7.17e-03 0.259 0.0953 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 9.91e-01 0.000763 0.0647 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0263 0.085 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 9.30e-01 0.00927 0.105 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 8.26e-01 0.0245 0.111 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 1.99e-01 0.166 0.129 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 7.16e-01 0.0415 0.114 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -878626 sc-eQTL 2.47e-01 0.119 0.102 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 4.92e-01 0.0479 0.0696 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 6.91e-01 0.0404 0.101 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 6.74e-02 0.2 0.109 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 8.33e-02 -0.217 0.124 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 3.51e-01 0.119 0.127 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0358 0.126 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 3.89e-02 0.234 0.113 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0757 0.124 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 8.06e-01 0.027 0.11 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00876 0.0837 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0517 0.12 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0342 0.0637 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 8.17e-01 0.0183 0.0789 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 7.36e-01 0.0271 0.0801 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 7.59e-01 0.0283 0.092 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 4.38e-01 0.0761 0.0979 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 9.40e-02 -0.221 0.131 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 3.33e-02 0.157 0.0733 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 6.17e-01 0.0385 0.0768 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 6.66e-01 0.0421 0.0975 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 6.63e-01 0.0474 0.109 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 1.15e-01 0.192 0.122 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 2.02e-01 0.172 0.134 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 3.08e-01 -0.103 0.1 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 7.09e-01 0.0393 0.105 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0821 0.123 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 1.65e-01 -0.168 0.121 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 8.79e-01 0.0162 0.106 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 4.87e-01 0.0869 0.125 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 9.78e-01 0.00257 0.0952 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 7.45e-01 0.0376 0.116 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0962 0.121 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 4.64e-02 0.227 0.113 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 5.06e-01 0.0737 0.111 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0673 0.122 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 7.93e-01 -0.022 0.0836 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 8.51e-01 -0.016 0.0855 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 2.88e-01 0.113 0.106 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 4.82e-01 0.0818 0.116 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 5.26e-01 0.0858 0.135 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0151 0.134 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 4.32e-01 0.0799 0.101 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 8.44e-01 0.0259 0.131 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00241 0.122 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 8.22e-01 0.0277 0.123 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 3.90e-01 -0.109 0.126 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 2.41e-01 -0.156 0.133 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 9.23e-01 0.0129 0.133 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00578 0.126 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0772 0.131 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 2.11e-01 0.148 0.118 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 5.05e-01 0.0796 0.119 0.121 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 9.09e-02 0.226 0.133 0.121 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 9.29e-01 0.0101 0.113 0.121 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 4.05e-01 0.0907 0.109 0.121 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0698 0.121 0.121 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00828 0.125 0.121 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 9.53e-01 0.00785 0.134 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 1.43e-02 -0.324 0.131 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0297 0.117 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 1.87e-01 0.161 0.122 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0435 0.123 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 2.73e-01 0.133 0.121 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 7.20e-01 0.0347 0.0967 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0873 0.132 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0791 0.0916 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 3.52e-02 0.224 0.105 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 3.25e-01 -0.131 0.133 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 1.82e-01 -0.147 0.11 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 4.29e-02 -0.262 0.129 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 1.83e-02 -0.306 0.129 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0203 0.123 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 4.22e-01 0.0932 0.116 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 8.32e-01 0.0262 0.123 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 4.75e-01 0.0853 0.119 0.126 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0917 0.108 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0651 0.134 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0971 0.104 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 4.55e-01 0.0894 0.12 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0275 0.127 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 6.86e-01 0.0477 0.118 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 3.40e-01 0.162 0.17 0.093 PB L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 2.98e-01 -0.16 0.153 0.093 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 8.96e-01 0.0227 0.172 0.093 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -878626 sc-eQTL 2.50e-01 0.178 0.154 0.093 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 2.77e-01 -0.12 0.11 0.093 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 1.98e-01 0.195 0.15 0.093 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 8.58e-01 0.0289 0.161 0.093 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 3.72e-03 0.315 0.107 0.122 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0521 0.112 0.122 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 3.45e-01 -0.108 0.114 0.122 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0464 0.0873 0.122 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0377 0.122 0.122 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 4.23e-01 0.0899 0.112 0.122 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0636 0.116 0.12 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 7.92e-01 0.037 0.14 0.12 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00665 0.0976 0.12 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 6.73e-01 0.0501 0.119 0.12 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 2.68e-01 -0.134 0.121 0.12 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 5.37e-01 0.0747 0.121 0.12 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 3.36e-01 0.122 0.126 0.127 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 6.11e-01 0.0723 0.142 0.127 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0225 0.12 0.127 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0695 0.087 0.127 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0859 0.118 0.127 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 6.87e-01 -0.042 0.104 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0193 0.129 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 7.83e-01 -0.026 0.0942 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 9.98e-01 0.000203 0.0717 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 6.90e-01 0.045 0.113 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0178 0.098 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0172 0.129 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 6.68e-01 0.0509 0.119 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0116 0.0744 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 6.58e-01 0.0492 0.111 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 8.05e-01 0.0382 0.154 0.145 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 1.22e-01 0.237 0.153 0.145 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 2.51e-01 0.155 0.134 0.145 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 2.85e-01 0.166 0.155 0.145 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0767 0.143 0.145 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0636 0.139 0.145 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 9.56e-03 0.312 0.119 0.122 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 1.62e-01 -0.179 0.128 0.122 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 3.51e-01 -0.117 0.125 0.122 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0556 0.0892 0.122 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 2.45e-01 -0.141 0.121 0.122 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 4.03e-01 0.102 0.122 0.124 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 3.26e-01 -0.129 0.131 0.124 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 5.29e-01 -0.083 0.132 0.124 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 2.75e-01 -0.101 0.0923 0.124 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 5.09e-01 0.0775 0.117 0.124 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0425 0.138 0.138 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 1.14e-01 -0.224 0.141 0.138 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 9.84e-01 0.00267 0.135 0.138 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0714 0.108 0.138 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 1.45e-01 -0.174 0.119 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0115 0.102 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0652 0.126 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0608 0.0905 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -878626 sc-eQTL 7.43e-01 0.0366 0.112 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 4.43e-01 0.0539 0.0701 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 4.83e-03 0.26 0.0912 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 7.82e-01 -0.028 0.101 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 4.68e-01 0.0679 0.0935 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 5.05e-01 0.0815 0.122 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 7.56e-01 0.0278 0.0894 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -878626 sc-eQTL 6.09e-03 0.24 0.0867 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 8.31e-01 0.0132 0.0621 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0183 0.0802 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 5.21e-01 0.0612 0.0952 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000808 0.0921 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0315 0.123 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0246 0.0915 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0159 0.0649 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 3.56e-01 0.0967 0.104 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 4.84e-02 0.218 0.11 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 3.38e-01 -0.121 0.126 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0945 0.128 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0747 0.0811 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00909 0.117 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 663059 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0476 0.0927 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 614017 sc-eQTL 2.54e-01 -0.146 0.128 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 957868 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0676 0.087 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -912815 sc-eQTL 5.86e-02 0.199 0.105 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -873545 sc-eQTL 3.74e-01 -0.108 0.122 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -886734 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0581 0.105 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000162510 MATN1 -878626 eQTL 0.0486 0.0608 0.0308 0.0 0.0 0.11

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina