Genes within 1Mb (chr1:29835056:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 9.16e-01 0.00751 0.0707 0.201 B L1
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 1.48e-01 0.122 0.0838 0.201 B L1
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 4.26e-02 -0.134 0.0659 0.201 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -888529 sc-eQTL 6.72e-01 0.0285 0.0673 0.201 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00218 0.0527 0.201 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 8.58e-01 0.011 0.0618 0.201 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0109 0.0731 0.201 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0569 0.067 0.201 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 3.18e-01 0.0933 0.0933 0.201 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0103 0.0526 0.201 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 2.91e-01 -0.067 0.0632 0.201 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0298 0.0567 0.201 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 6.20e-02 -0.126 0.0674 0.201 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0748 0.0748 0.201 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0429 0.1 0.201 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 8.44e-01 0.0121 0.0611 0.201 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0734 0.0621 0.201 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 5.77e-01 0.0407 0.073 0.201 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 5.53e-01 0.0545 0.0917 0.201 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 1.04e-02 0.26 0.1 0.205 DC L1
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 4.52e-03 0.317 0.11 0.205 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 7.72e-01 -0.029 0.1 0.205 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 9.77e-01 0.00189 0.0648 0.205 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00118 0.103 0.205 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 4.10e-01 0.0578 0.07 0.201 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0455 0.103 0.201 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 7.52e-01 -0.025 0.0789 0.201 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 7.62e-01 0.0165 0.0545 0.201 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 2.43e-01 -0.101 0.0862 0.201 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0789 0.0781 0.202 NK L1
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 4.04e-01 0.0859 0.103 0.202 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0913 0.0699 0.202 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0269 0.0857 0.202 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 6.58e-01 0.0426 0.0963 0.202 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0249 0.0889 0.202 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00241 0.0779 0.201 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 8.11e-01 0.0222 0.0924 0.201 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 9.56e-01 0.00465 0.0838 0.201 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0831 0.0626 0.201 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 1.05e-01 0.167 0.102 0.201 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 7.82e-01 0.0297 0.107 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 2.72e-02 -0.276 0.124 0.189 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0242 0.113 0.189 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 3.00e-01 0.116 0.112 0.189 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -888529 sc-eQTL 2.42e-01 0.12 0.102 0.189 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 9.15e-01 0.00765 0.0717 0.189 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 1.19e-01 -0.18 0.115 0.189 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 9.43e-01 0.00732 0.102 0.189 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 5.25e-01 0.0604 0.0948 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 5.85e-01 0.0605 0.111 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0476 0.0873 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -888529 sc-eQTL 4.56e-01 0.0728 0.0973 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 9.05e-01 0.00715 0.0598 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0164 0.0839 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 9.23e-01 0.00907 0.0939 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 9.40e-01 0.00729 0.096 0.203 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00792 0.108 0.203 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 2.39e-01 -0.108 0.0914 0.203 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -888529 sc-eQTL 3.37e-02 -0.184 0.0861 0.203 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 6.22e-01 0.038 0.0771 0.203 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0846 0.0881 0.203 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 1.22e-01 0.16 0.103 0.203 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 1.85e-01 0.111 0.0832 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 5.79e-01 0.0611 0.11 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 5.22e-02 -0.152 0.0777 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -888529 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00897 0.0813 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0127 0.0543 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 9.43e-01 0.00509 0.0714 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0149 0.0881 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 9.82e-01 0.00213 0.093 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 6.09e-01 0.0555 0.108 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0647 0.0951 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -888529 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0868 0.0856 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0151 0.0583 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0278 0.0849 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0675 0.0916 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 7.86e-01 0.029 0.107 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 6.59e-01 0.0479 0.108 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0254 0.108 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0302 0.097 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 6.56e-01 0.0474 0.106 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 8.65e-01 0.0159 0.0937 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 8.87e-01 0.00976 0.0689 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 6.54e-01 0.0445 0.0991 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00555 0.0525 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0371 0.0649 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0138 0.066 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 1.75e-02 -0.179 0.0748 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 8.87e-02 -0.139 0.0812 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 3.64e-01 0.1 0.11 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0101 0.0618 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0415 0.064 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0735 0.0811 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 1.29e-01 -0.137 0.09 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0772 0.101 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0232 0.112 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0981 0.0832 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0149 0.0872 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0681 0.102 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 2.17e-01 -0.124 0.1 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 1.24e-01 -0.139 0.0902 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0667 0.107 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0135 0.0813 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0502 0.0987 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 8.55e-01 0.019 0.104 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 5.27e-01 0.0617 0.0975 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 2.50e-01 -0.109 0.0947 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0488 0.104 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 1.54e-01 0.102 0.0715 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 5.52e-01 0.0437 0.0734 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 9.52e-02 0.153 0.091 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 3.89e-01 -0.086 0.0996 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0712 0.116 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 4.68e-01 0.0836 0.115 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0682 0.087 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0414 0.113 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 8.19e-01 0.0239 0.104 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 1.32e-01 -0.159 0.105 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 9.42e-02 0.173 0.103 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 4.89e-01 0.0758 0.109 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 4.01e-02 -0.224 0.108 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 9.95e-02 -0.171 0.103 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 3.47e-01 -0.101 0.107 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 5.45e-01 0.0591 0.0974 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0164 0.101 0.201 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0261 0.114 0.201 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 6.97e-01 0.0374 0.0959 0.201 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 2.44e-01 -0.108 0.0923 0.201 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 4.72e-01 0.0743 0.103 0.201 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0337 0.106 0.201 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 2.79e-01 -0.123 0.113 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 2.00e-01 0.145 0.113 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 8.05e-01 0.0246 0.0995 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 6.05e-01 0.0537 0.104 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 7.66e-01 0.031 0.104 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 6.06e-02 -0.192 0.102 0.198 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 8.97e-01 0.0105 0.0809 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 7.76e-01 0.0314 0.11 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0661 0.0766 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0114 0.089 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 2.54e-01 0.127 0.111 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0596 0.0919 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 9.46e-01 0.00738 0.108 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 2.42e-01 -0.127 0.108 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 5.53e-02 -0.195 0.101 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0521 0.0964 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 6.56e-02 -0.188 0.102 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0484 0.0991 0.196 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 7.26e-02 -0.162 0.0899 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 6.01e-01 0.0587 0.112 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 8.95e-01 0.0114 0.0868 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 2.38e-01 -0.118 0.0997 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 3.99e-01 0.0895 0.106 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 6.27e-01 -0.048 0.0986 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 9.44e-01 0.00845 0.121 0.226 PB L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 3.29e-01 0.106 0.108 0.226 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 3.86e-01 0.106 0.122 0.226 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -888529 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000794 0.11 0.226 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 1.96e-01 0.101 0.0779 0.226 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0246 0.107 0.226 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 6.82e-01 0.0469 0.114 0.226 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 1.32e-01 -0.139 0.0921 0.193 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 1.74e-01 0.129 0.0942 0.193 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0742 0.0963 0.193 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 6.04e-01 0.0383 0.0739 0.193 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 3.17e-01 0.103 0.103 0.193 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 6.38e-01 0.0447 0.0949 0.193 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 7.62e-02 -0.172 0.0965 0.201 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 8.51e-01 -0.022 0.117 0.201 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0291 0.0816 0.201 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 2.25e-01 -0.12 0.0989 0.201 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 6.85e-01 0.0411 0.101 0.201 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 1.60e-01 0.142 0.101 0.201 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 4.85e-01 0.0743 0.106 0.207 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 6.57e-02 0.219 0.118 0.207 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 3.00e-01 0.104 0.1 0.207 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 8.10e-01 0.0177 0.0732 0.207 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0574 0.0993 0.207 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 2.97e-01 0.0899 0.086 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 1.90e-01 0.139 0.106 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00292 0.078 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 9.73e-01 0.00203 0.0593 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 2.43e-01 -0.109 0.093 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 8.83e-01 0.0121 0.0823 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 1.71e-01 -0.149 0.108 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 9.62e-01 0.00469 0.0996 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 4.18e-01 0.0507 0.0624 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 2.88e-01 -0.099 0.093 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 8.58e-01 0.0246 0.138 0.191 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 2.63e-02 0.302 0.135 0.191 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0921 0.12 0.191 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 2.58e-01 -0.157 0.138 0.191 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 7.91e-01 0.0339 0.128 0.191 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0225 0.124 0.191 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 2.84e-01 -0.11 0.102 0.204 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 8.90e-01 -0.015 0.109 0.204 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 7.43e-01 0.0348 0.106 0.204 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0483 0.0755 0.204 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 6.86e-02 -0.187 0.102 0.204 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0852 0.103 0.201 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 5.17e-01 0.0723 0.111 0.201 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0896 0.112 0.201 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0522 0.0785 0.201 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 3.01e-01 0.103 0.0993 0.201 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 8.49e-02 0.226 0.13 0.186 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 1.34e-02 0.332 0.133 0.186 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0444 0.129 0.186 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 9.60e-01 0.00518 0.103 0.186 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0237 0.114 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 9.20e-01 0.00869 0.0864 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 2.89e-01 0.113 0.106 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0588 0.0764 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -888529 sc-eQTL 1.83e-01 0.126 0.094 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 9.36e-01 0.00475 0.0593 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0754 0.0783 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 4.65e-01 0.0625 0.0854 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 4.81e-01 0.0551 0.0781 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 5.16e-01 0.0662 0.102 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 4.13e-02 -0.152 0.074 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -888529 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0343 0.0737 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0228 0.0519 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 7.09e-01 0.025 0.067 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0599 0.0795 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 1.62e-01 0.107 0.0765 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00498 0.103 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00268 0.0763 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 6.92e-01 0.0215 0.0542 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 2.04e-01 -0.111 0.0869 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0826 0.0913 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 8.63e-01 -0.018 0.104 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 8.55e-01 0.0194 0.106 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0181 0.0671 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0612 0.0965 0.203 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 653156 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0209 0.0769 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 604114 sc-eQTL 8.89e-01 0.0148 0.106 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 947965 sc-eQTL 1.74e-01 -0.098 0.0719 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -922718 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0294 0.0875 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 sc-eQTL 5.24e-01 0.0644 0.101 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -896637 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0647 0.087 0.2 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000159023 EPB41 947965 eQTL 0.00353 0.0621 0.0212 0.0044 0.00122 0.231
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -883448 eQTL 1.68e-02 -0.035 0.0146 0.00117 0.0 0.231


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116353 \N 604114 4.89e-07 2.4e-07 8.51e-08 2.43e-07 1.05e-07 1.25e-07 3.33e-07 8.17e-08 2.66e-07 1.46e-07 2.84e-07 2.09e-07 3.77e-07 8.42e-08 9.2e-08 1.46e-07 9.3e-08 2.9e-07 9.71e-08 7.49e-08 1.52e-07 2.3e-07 2.2e-07 5.11e-08 3.27e-07 2.29e-07 1.74e-07 1.52e-07 1.98e-07 1.89e-07 1.71e-07 5.24e-08 4.87e-08 1.24e-07 9.25e-08 5.51e-08 6.39e-08 5.25e-08 4.74e-08 8.61e-08 3.17e-08 2.19e-07 3.46e-08 1.43e-08 5.4e-08 1.05e-08 9.1e-08 0.0 4.66e-08
ENSG00000159023 EPB41 947965 2.76e-07 1.3e-07 5.35e-08 1.81e-07 9.24e-08 9.9e-08 1.6e-07 5.43e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.52e-07 1.01e-07 1.53e-07 7.13e-08 5.91e-08 7.23e-08 4.12e-08 1.4e-07 6.07e-08 4.31e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.93e-08 1.55e-07 1.23e-07 1.13e-07 9.74e-08 1.23e-07 1.07e-07 1.02e-07 3.65e-08 3.66e-08 8.72e-08 7.02e-08 3.14e-08 5.31e-08 8.93e-08 6.59e-08 3.8e-08 5.45e-08 1.33e-07 5.21e-08 2.33e-08 4.92e-08 1.84e-08 1.18e-07 3.8e-09 5.04e-08