logo

Genes within 1Mb (chr1:29810112:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 4.08e-01 0.0584 0.0705 0.186 B L1
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 1.13e-01 0.133 0.0836 0.186 B L1
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 1.21e-01 -0.103 0.066 0.186 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -913473 sc-eQTL 4.26e-01 0.0535 0.0671 0.186 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0263 0.0526 0.186 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00637 0.0617 0.186 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 9.62e-01 0.00349 0.073 0.186 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0292 0.0672 0.186 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 2.97e-01 0.0975 0.0933 0.186 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 9.58e-01 0.00275 0.0527 0.186 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0198 0.0635 0.186 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0147 0.0568 0.186 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 9.41e-02 -0.114 0.0676 0.186 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 5.47e-01 -0.045 0.0745 0.186 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0552 0.0999 0.186 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 7.05e-01 0.0231 0.0608 0.186 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0215 0.062 0.186 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 2.43e-01 0.0848 0.0725 0.186 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 2.10e-01 0.114 0.091 0.186 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 1.31e-02 0.25 0.0998 0.189 DC L1
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 1.25e-02 0.277 0.11 0.189 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0615 0.0995 0.189 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 2.53e-01 0.0736 0.0642 0.189 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 5.38e-01 0.0628 0.102 0.189 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 8.36e-01 0.0146 0.0704 0.186 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0673 0.103 0.186 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0466 0.0791 0.186 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 6.84e-01 0.0223 0.0547 0.186 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0451 0.0868 0.186 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0483 0.0778 0.187 NK L1
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 2.43e-01 0.12 0.102 0.187 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 1.87e-01 -0.092 0.0695 0.187 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 8.80e-01 0.0128 0.0853 0.187 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 3.26e-01 0.0942 0.0956 0.187 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00152 0.0885 0.187 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 7.19e-01 0.0282 0.0782 0.186 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 6.09e-01 0.0475 0.0928 0.186 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 9.55e-01 0.00477 0.0842 0.186 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0552 0.0631 0.186 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 4.43e-02 0.207 0.102 0.186 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 3.80e-01 0.0946 0.108 0.186 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 2.75e-02 -0.273 0.123 0.173 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 7.85e-01 0.0305 0.112 0.173 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 4.73e-01 0.0796 0.111 0.173 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -913473 sc-eQTL 4.41e-01 0.0784 0.102 0.173 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 9.34e-01 0.00587 0.071 0.173 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 2.96e-02 -0.248 0.113 0.173 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 6.87e-01 0.041 0.101 0.173 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 5.54e-01 0.0561 0.0947 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 9.24e-01 0.0106 0.111 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 8.68e-01 0.0145 0.0873 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -913473 sc-eQTL 2.51e-01 0.112 0.0971 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 8.81e-01 0.00897 0.0598 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0393 0.0838 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 7.62e-01 0.0284 0.0938 0.185 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 5.06e-01 0.0637 0.0957 0.188 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00815 0.108 0.188 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 4.78e-01 -0.065 0.0913 0.188 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -913473 sc-eQTL 6.19e-02 -0.162 0.0862 0.188 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.84e-01 0.0211 0.077 0.188 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0851 0.0879 0.188 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 6.49e-02 0.19 0.102 0.188 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 1.01e-01 0.136 0.0826 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 4.73e-01 0.0786 0.109 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 3.53e-02 -0.164 0.0772 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -913473 sc-eQTL 9.05e-01 0.00969 0.0809 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0154 0.054 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 9.99e-01 -4.79e-05 0.071 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0105 0.0877 0.186 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 6.09e-01 0.0478 0.0932 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 2.02e-01 0.139 0.108 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00741 0.0955 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -913473 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0567 0.086 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 9.97e-01 0.000206 0.0585 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0407 0.0851 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0566 0.0919 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0307 0.108 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 4.68e-01 0.0798 0.11 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 8.28e-01 0.0238 0.109 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0222 0.0986 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 1.20e-01 0.167 0.107 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 5.48e-01 0.0572 0.0951 0.182 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 5.68e-01 0.0394 0.0689 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 4.95e-01 0.0678 0.0991 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00669 0.0526 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 9.74e-01 0.00211 0.0651 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 7.92e-01 0.0174 0.066 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 1.88e-02 -0.177 0.0749 0.186 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 1.89e-01 -0.107 0.0811 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 2.79e-01 0.119 0.109 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 5.63e-01 0.0356 0.0615 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.48e-01 0.0205 0.0638 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 1.58e-01 -0.114 0.0806 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 2.53e-01 -0.103 0.0899 0.186 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0896 0.101 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 8.36e-01 0.0232 0.112 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0714 0.0833 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.99e-01 0.0222 0.0871 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 1.93e-01 -0.133 0.102 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0539 0.1 0.186 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0555 0.0914 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0737 0.108 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00422 0.0821 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 9.09e-01 0.0114 0.0996 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 7.93e-01 0.0275 0.105 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 1.51e-01 0.141 0.098 0.186 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0504 0.095 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0402 0.104 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 2.64e-01 0.0803 0.0716 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 3.38e-01 0.0704 0.0733 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 6.68e-03 0.247 0.0901 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00407 0.0998 0.186 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0315 0.116 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 3.00e-01 0.119 0.114 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 5.41e-01 -0.053 0.0867 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.60e-01 0.0343 0.112 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0102 0.104 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 1.58e-01 -0.148 0.105 0.178 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 4.42e-01 0.0794 0.103 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00452 0.109 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 1.68e-01 -0.15 0.108 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 5.39e-02 -0.198 0.102 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0675 0.107 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 6.22e-01 0.0479 0.097 0.192 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0243 0.102 0.188 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 6.77e-01 -0.048 0.115 0.188 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 8.45e-01 0.0189 0.0968 0.188 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0948 0.0932 0.188 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 4.29e-01 0.0824 0.104 0.188 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0232 0.107 0.188 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0884 0.115 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 5.07e-01 0.0758 0.114 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 7.16e-01 0.0367 0.101 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 4.41e-01 0.0809 0.105 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 9.07e-01 0.0123 0.105 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 1.73e-01 -0.141 0.103 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 6.45e-01 0.0373 0.0807 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 6.09e-01 0.0562 0.11 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0937 0.0763 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.19e-01 0.0321 0.0888 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 1.93e-01 0.145 0.111 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0584 0.0917 0.185 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 7.61e-01 0.0328 0.107 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 7.22e-02 -0.193 0.107 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 5.77e-02 -0.192 0.1 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0496 0.0957 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 1.79e-01 -0.137 0.101 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0497 0.0985 0.183 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 6.91e-02 -0.164 0.0899 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 2.33e-01 0.134 0.112 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 9.75e-01 0.00271 0.0867 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0799 0.0998 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 2.48e-01 0.122 0.106 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0124 0.0986 0.185 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0382 0.118 0.215 PB L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 3.20e-01 0.106 0.106 0.215 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 7.49e-01 0.0385 0.12 0.215 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -913473 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0233 0.108 0.215 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 2.52e-01 0.088 0.0765 0.215 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00229 0.105 0.215 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 3.46e-01 0.106 0.112 0.215 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 2.25e-01 -0.112 0.0918 0.178 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 1.01e-01 0.154 0.0935 0.178 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0494 0.0958 0.178 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.20e-01 0.0263 0.0735 0.178 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 5.56e-01 0.0605 0.103 0.178 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 3.37e-01 0.0907 0.0943 0.178 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 1.57e-01 -0.138 0.0969 0.186 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0551 0.117 0.186 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0259 0.0818 0.186 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 2.55e-01 -0.113 0.0991 0.186 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 3.61e-01 0.0926 0.101 0.186 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 2.05e-01 0.128 0.101 0.186 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 5.70e-01 0.0601 0.106 0.193 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 9.94e-02 0.195 0.118 0.193 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 6.28e-01 0.0486 0.1 0.193 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 4.13e-01 0.0597 0.0727 0.193 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0206 0.0989 0.193 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 7.51e-01 0.0276 0.0867 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 3.72e-01 0.0957 0.107 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 7.12e-01 -0.029 0.0784 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 9.07e-01 0.00698 0.0597 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0367 0.0938 0.186 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 9.84e-01 0.00163 0.0823 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 1.36e-01 -0.162 0.108 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0192 0.0996 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.71e-01 0.0182 0.0625 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0913 0.093 0.186 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0928 0.138 0.179 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 8.06e-03 0.362 0.135 0.179 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 2.61e-01 -0.136 0.121 0.179 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0777 0.139 0.179 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 4.67e-01 0.0937 0.129 0.179 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 8.56e-01 0.0227 0.125 0.179 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 3.37e-01 -0.098 0.102 0.189 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00957 0.108 0.189 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 6.79e-01 0.0438 0.106 0.189 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.71e-01 -0.022 0.0753 0.189 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 5.46e-02 -0.196 0.101 0.189 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 3.25e-01 -0.102 0.103 0.188 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 7.67e-01 0.0331 0.111 0.188 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0113 0.112 0.188 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0259 0.0785 0.188 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 2.59e-01 0.112 0.0992 0.188 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 2.04e-01 0.164 0.128 0.172 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 3.58e-02 0.277 0.131 0.172 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0231 0.127 0.172 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 6.31e-01 0.0486 0.101 0.172 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 9.38e-01 0.00875 0.112 0.172 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 6.80e-01 0.0355 0.0861 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 4.12e-01 0.0872 0.106 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00189 0.0762 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -913473 sc-eQTL 1.30e-01 0.142 0.0936 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00539 0.0591 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 1.98e-01 -0.101 0.0779 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 2.65e-01 0.095 0.085 0.186 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 1.41e-01 0.115 0.0776 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 2.25e-01 0.123 0.101 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 4.77e-02 -0.147 0.0739 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -913473 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00439 0.0736 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0214 0.0518 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 9.20e-01 0.00669 0.0669 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0516 0.0794 0.186 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 3.76e-01 0.0683 0.077 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0372 0.103 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 6.96e-01 -0.03 0.0766 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 7.03e-01 0.0207 0.0544 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0514 0.0875 0.186 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0924 0.0917 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0233 0.105 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 6.00e-01 0.0558 0.106 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 6.91e-01 0.0268 0.0674 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0435 0.097 0.188 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 628212 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00377 0.0765 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 579170 sc-eQTL 5.46e-01 0.0637 0.105 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 923021 sc-eQTL 1.14e-01 -0.113 0.0715 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -947662 sc-eQTL 9.07e-01 0.0102 0.0871 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 sc-eQTL 2.63e-01 0.113 0.1 0.185 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -921581 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0536 0.0866 0.185 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000159023 EPB41 923021 eQTL 0.00679 0.0593 0.0218 0.00312 0.0 0.219
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -908392 eQTL 4.39e-03 -0.0428 0.015 0.00308 0.0 0.219

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000116353 \N 579170 8.43e-07 4.93e-07 1.27e-07 3.77e-07 1.07e-07 2.24e-07 5.54e-07 1.48e-07 4.26e-07 2.43e-07 7.32e-07 4.03e-07 7.36e-07 1.49e-07 2.81e-07 2.55e-07 2.77e-07 3.74e-07 2.6e-07 1.71e-07 2.05e-07 3.87e-07 3.3e-07 1.78e-07 8.09e-07 2.39e-07 3.1e-07 2.71e-07 3.56e-07 5.99e-07 2.73e-07 6.56e-08 4.49e-08 1.49e-07 3.31e-07 1.19e-07 1.13e-07 9.33e-08 6.38e-08 2.8e-08 1.01e-07 5.09e-07 4.12e-08 1.54e-08 1.67e-07 1.29e-08 1.17e-07 2.31e-08 6.36e-08
ENSG00000159023 EPB41 923021 3.02e-07 1.42e-07 6.15e-08 2.09e-07 1.05e-07 8.63e-08 1.99e-07 5.68e-08 1.59e-07 8.53e-08 1.61e-07 1.31e-07 2.05e-07 8e-08 5.62e-08 8.71e-08 4.18e-08 1.72e-07 7.39e-08 5.87e-08 1.22e-07 1.42e-07 1.62e-07 3.42e-08 2.02e-07 1.26e-07 1.22e-07 1.1e-07 1.34e-07 1.1e-07 1.09e-07 3.9e-08 3.29e-08 9.78e-08 3.36e-08 2.68e-08 5.51e-08 8.2e-08 6.41e-08 5.45e-08 6.14e-08 1.52e-07 4.76e-08 1.09e-08 3.48e-08 1.55e-08 8.67e-08 2.07e-09 4.94e-08