Genes within 1Mb (chr1:29800925:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 2.09e-01 0.0941 0.0747 0.169 B L1
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 9.24e-03 0.231 0.0879 0.169 B L1
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0256 0.0705 0.169 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -922660 sc-eQTL 3.89e-01 0.0615 0.0712 0.169 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0366 0.0558 0.169 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0842 0.0652 0.169 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 4.24e-01 -0.062 0.0774 0.169 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 3.93e-01 0.0599 0.0699 0.169 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 4.88e-01 0.0676 0.0975 0.169 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 4.38e-01 0.0427 0.0549 0.169 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 9.06e-01 0.00781 0.0662 0.169 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000666 0.0592 0.169 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0082 0.0709 0.169 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 1.24e-01 0.119 0.0773 0.169 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0172 0.104 0.169 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 7.65e-01 0.019 0.0634 0.169 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 4.72e-01 0.0466 0.0646 0.169 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0318 0.0758 0.169 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 1.51e-02 0.23 0.0939 0.169 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0264 0.102 0.176 DC L1
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 7.68e-01 0.0332 0.113 0.176 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 8.19e-01 -0.023 0.1 0.176 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 8.33e-01 0.0137 0.0648 0.176 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 4.71e-01 0.074 0.102 0.176 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0952 0.0737 0.169 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 8.87e-01 0.0155 0.109 0.169 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0405 0.0832 0.169 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 1.38e-01 0.0852 0.0572 0.169 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 8.58e-01 0.0163 0.0912 0.169 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 5.97e-01 -0.043 0.0812 0.17 NK L1
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 3.07e-01 0.109 0.107 0.17 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 3.36e-01 -0.07 0.0726 0.17 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 6.02e-01 0.0464 0.0889 0.17 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 9.90e-01 0.00122 0.0999 0.17 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0929 0.0921 0.17 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 4.11e-01 0.0649 0.0787 0.169 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 3.37e-01 0.0897 0.0933 0.169 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 9.76e-01 0.00253 0.0848 0.169 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0362 0.0636 0.169 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 4.51e-01 0.0785 0.104 0.169 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 7.26e-01 0.0381 0.108 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 7.42e-02 -0.225 0.125 0.156 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 5.28e-01 0.0717 0.113 0.156 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 6.55e-01 0.0502 0.112 0.156 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -922660 sc-eQTL 8.81e-01 0.0155 0.103 0.156 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0111 0.072 0.156 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0958 0.116 0.156 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 6.73e-01 0.0435 0.103 0.156 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0164 0.0986 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 2.94e-01 0.121 0.115 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0244 0.0908 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -922660 sc-eQTL 6.79e-02 0.184 0.1 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0627 0.062 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 2.20e-01 -0.107 0.0869 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0307 0.0976 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 8.28e-01 0.0219 0.101 0.168 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 1.58e-01 0.161 0.113 0.168 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 7.71e-01 0.0281 0.0962 0.168 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -922660 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0662 0.0913 0.168 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0256 0.081 0.168 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 5.69e-01 0.0529 0.0927 0.168 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 6.34e-01 0.0518 0.109 0.168 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 1.23e-01 0.135 0.0869 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 1.62e-01 0.161 0.114 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0477 0.082 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -922660 sc-eQTL 6.10e-01 0.0434 0.0851 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0115 0.0568 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0601 0.0746 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 9.92e-01 0.000964 0.0922 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 5.65e-01 0.0557 0.0967 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 6.38e-02 0.209 0.112 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 5.10e-01 0.0653 0.099 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -922660 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0213 0.0894 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 4.60e-01 0.0449 0.0606 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0399 0.0883 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0411 0.0954 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 1.20e-01 -0.167 0.107 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 6.72e-01 0.0462 0.109 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 9.22e-01 0.0106 0.108 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 6.43e-01 0.0453 0.0977 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 3.76e-01 0.0947 0.107 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0314 0.0943 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 3.70e-01 0.0646 0.072 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0249 0.104 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 9.18e-01 0.00568 0.055 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 7.40e-01 0.0226 0.068 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0294 0.069 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0443 0.0792 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 9.63e-01 0.00395 0.0854 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 9.91e-02 0.189 0.114 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 3.74e-01 0.0575 0.0645 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 6.07e-01 0.0345 0.0669 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0154 0.085 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0552 0.0946 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 7.42e-01 0.0345 0.105 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 9.95e-01 0.000691 0.116 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0827 0.0861 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 1.77e-01 0.122 0.0897 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 3.19e-01 -0.105 0.105 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 1.85e-01 -0.137 0.103 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 7.94e-01 0.0243 0.0927 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 3.64e-01 0.0993 0.109 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 4.84e-01 0.0582 0.083 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 3.53e-01 0.0938 0.101 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0226 0.106 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 2.98e-02 0.216 0.0986 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 3.27e-01 0.0934 0.095 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0104 0.105 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 2.84e-01 0.0771 0.0718 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 5.33e-02 0.142 0.0729 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0407 0.0918 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 2.32e-01 0.12 0.0997 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 1.62e-01 0.16 0.114 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00337 0.113 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00234 0.0858 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 4.96e-01 0.0757 0.111 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 9.82e-01 0.00229 0.103 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0866 0.104 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 1.05e-01 -0.178 0.109 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 3.10e-01 0.117 0.116 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 4.46e-01 0.0882 0.116 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0218 0.11 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 8.44e-01 0.0225 0.114 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 9.45e-02 -0.172 0.102 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0248 0.103 0.171 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 3.84e-01 0.101 0.115 0.171 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0381 0.0972 0.171 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 7.28e-01 0.0326 0.0939 0.171 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0439 0.105 0.171 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0289 0.108 0.171 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0848 0.114 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00753 0.113 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 7.19e-01 0.036 0.0999 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 5.15e-02 0.202 0.103 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 1.60e-01 -0.147 0.104 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 8.31e-02 -0.178 0.102 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00189 0.0848 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 2.97e-01 0.12 0.115 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00804 0.0805 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 6.36e-01 0.0442 0.0933 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 3.48e-01 0.11 0.117 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 4.75e-01 -0.069 0.0964 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0699 0.112 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 2.25e-01 -0.136 0.112 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 1.96e-01 -0.136 0.105 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 6.64e-01 0.0433 0.0996 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 8.89e-02 -0.18 0.105 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 1.86e-01 -0.135 0.102 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 1.16e-01 -0.149 0.0944 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 4.47e-01 0.0895 0.117 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 1.09e-01 -0.146 0.0903 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0803 0.105 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 8.86e-01 0.0159 0.111 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 3.17e-02 -0.221 0.102 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0343 0.12 0.207 PB L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0314 0.108 0.207 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 9.78e-01 0.00339 0.122 0.207 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -922660 sc-eQTL 6.65e-01 0.0474 0.109 0.207 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 4.79e-01 0.0554 0.078 0.207 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0403 0.107 0.207 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 4.34e-01 0.0892 0.114 0.207 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0311 0.0946 0.165 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0656 0.0966 0.165 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 7.98e-01 0.0252 0.0985 0.165 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 3.31e-01 0.0734 0.0753 0.165 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 8.20e-01 0.0241 0.106 0.165 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 8.04e-01 0.0241 0.097 0.165 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0771 0.1 0.169 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 1.39e-01 0.179 0.12 0.169 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 4.41e-01 0.0651 0.0843 0.169 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0118 0.103 0.169 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 7.68e-01 0.031 0.105 0.169 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 1.49e-02 0.253 0.103 0.169 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0296 0.107 0.183 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 8.41e-01 0.0241 0.12 0.183 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 8.20e-01 0.023 0.101 0.183 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 7.17e-01 0.0266 0.0735 0.183 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 6.65e-01 0.0432 0.0997 0.183 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 1.82e-01 -0.121 0.0908 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 5.25e-01 0.0718 0.113 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0828 0.0823 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 5.81e-01 0.0347 0.0627 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 7.94e-01 0.0258 0.0987 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0847 0.0846 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0451 0.112 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 7.50e-01 0.0328 0.103 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 2.21e-01 0.0787 0.0641 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0804 0.0958 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0582 0.142 0.152 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 1.41e-01 0.207 0.14 0.152 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 4.93e-01 -0.085 0.124 0.152 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 4.34e-01 0.112 0.142 0.152 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0854 0.131 0.152 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00429 0.128 0.152 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 6.50e-02 -0.195 0.105 0.173 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0337 0.113 0.173 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 9.53e-01 0.00647 0.11 0.173 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0421 0.0782 0.173 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 2.96e-01 -0.111 0.106 0.173 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0469 0.104 0.176 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 8.83e-01 0.0166 0.112 0.176 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 4.48e-01 0.0855 0.112 0.176 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0872 0.079 0.176 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 7.23e-01 0.0356 0.1 0.176 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 9.91e-01 0.00147 0.129 0.164 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 8.27e-01 0.0292 0.133 0.164 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0985 0.127 0.164 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 4.73e-01 0.0727 0.101 0.164 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 6.24e-01 0.055 0.112 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00226 0.0902 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 2.40e-02 0.25 0.11 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 9.70e-01 0.00302 0.0799 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -922660 sc-eQTL 3.75e-01 0.0875 0.0984 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0169 0.0619 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0622 0.0818 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 5.57e-01 0.0525 0.0892 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 1.29e-01 0.124 0.0815 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 1.60e-02 0.256 0.105 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0401 0.0783 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -922660 sc-eQTL 6.65e-01 0.0335 0.0773 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 9.84e-01 0.00111 0.0544 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0339 0.0702 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0616 0.0834 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0571 0.0808 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 7.48e-01 0.0348 0.108 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0401 0.0803 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 2.09e-01 0.0715 0.0568 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 9.58e-01 0.00483 0.0918 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 2.15e-01 -0.117 0.0946 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0354 0.108 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 5.07e-01 0.0728 0.11 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00914 0.0696 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0284 0.1 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 619025 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0129 0.0806 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 569983 sc-eQTL 6.26e-01 0.0542 0.111 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 913834 sc-eQTL 1.14e-01 -0.119 0.0752 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -956849 sc-eQTL 9.15e-01 0.00978 0.0916 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 sc-eQTL 8.38e-01 0.0216 0.106 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -930768 sc-eQTL 1.71e-01 -0.125 0.0908 0.17 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -917579 eQTL 8.19e-04 -0.0515 0.0153 0.00424 0.00108 0.201


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina