logo

Genes within 1Mb (chr1:29778955:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 4.25e-01 0.0592 0.074 0.171 B L1
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 2.43e-03 0.265 0.0864 0.171 B L1
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0705 0.0696 0.171 B L1
ENSG00000162510 MATN1 -944630 sc-eQTL 8.56e-01 0.0128 0.0706 0.171 B L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 8.83e-01 0.00814 0.0553 0.171 B L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 1.09e-01 -0.104 0.0644 0.171 B L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0361 0.0766 0.171 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 2.88e-01 0.0741 0.0696 0.171 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 5.44e-01 0.059 0.0972 0.171 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 4.21e-01 0.0441 0.0547 0.171 CD4T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 8.61e-01 0.0116 0.066 0.171 CD4T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 8.97e-01 0.00764 0.059 0.171 CD4T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 9.60e-01 0.00357 0.0707 0.171 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 4.77e-01 0.0543 0.0763 0.171 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 8.12e-01 0.0244 0.102 0.171 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 8.23e-01 0.0139 0.0623 0.171 CD8T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 5.64e-01 0.0367 0.0635 0.171 CD8T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0814 0.0743 0.171 CD8T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 7.68e-02 0.165 0.0929 0.171 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0547 0.101 0.176 DC L1
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0507 0.112 0.176 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0478 0.0995 0.176 DC L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 6.56e-01 0.0286 0.0643 0.176 DC L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 4.12e-01 0.0835 0.102 0.176 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0523 0.0727 0.171 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0268 0.107 0.171 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0599 0.0818 0.171 Mono L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 9.00e-02 0.0957 0.0562 0.171 Mono L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0289 0.0898 0.171 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0651 0.0798 0.172 NK L1
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 8.51e-01 0.0197 0.105 0.172 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 4.10e-01 -0.059 0.0715 0.172 NK L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 3.09e-01 0.089 0.0873 0.172 NK L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 7.72e-01 0.0285 0.0983 0.172 NK L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 9.97e-01 0.000347 0.0908 0.172 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 9.33e-01 0.00659 0.0777 0.171 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 4.90e-01 0.0636 0.092 0.171 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0175 0.0835 0.171 Other_T L1
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0782 0.0625 0.171 Other_T L1
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 2.89e-01 0.109 0.102 0.171 Other_T L1
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00469 0.107 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 3.52e-02 -0.268 0.126 0.158 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 7.63e-01 0.0347 0.115 0.158 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 5.32e-01 0.071 0.114 0.158 B_Activated L2
ENSG00000162510 MATN1 -944630 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0303 0.104 0.158 B_Activated L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 9.00e-01 0.00914 0.0729 0.158 B_Activated L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0306 0.118 0.158 B_Activated L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 7.63e-01 0.0314 0.104 0.158 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0075 0.0976 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 1.86e-01 0.151 0.113 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0293 0.0898 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000162510 MATN1 -944630 sc-eQTL 2.59e-01 0.113 0.0999 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0299 0.0615 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0924 0.0861 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 9.74e-01 0.00314 0.0966 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 4.96e-01 0.0678 0.0995 0.17 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 3.01e-01 0.116 0.112 0.17 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 7.44e-01 0.0311 0.0951 0.17 B_Memory L2
ENSG00000162510 MATN1 -944630 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0737 0.0902 0.17 B_Memory L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0269 0.0801 0.17 B_Memory L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00553 0.0916 0.17 B_Memory L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 3.37e-01 0.103 0.107 0.17 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 1.59e-01 0.121 0.086 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 7.72e-02 0.2 0.113 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 1.49e-01 -0.117 0.0807 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000162510 MATN1 -944630 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0118 0.0841 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 6.70e-01 0.0239 0.0561 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0886 0.0735 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 6.33e-01 0.0435 0.0911 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 7.28e-01 0.0335 0.096 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 5.71e-02 0.212 0.111 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 6.23e-01 0.0483 0.0982 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000162510 MATN1 -944630 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0642 0.0885 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 5.65e-01 0.0347 0.0601 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0462 0.0876 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0271 0.0946 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 5.52e-02 -0.201 0.104 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 8.75e-01 0.0168 0.107 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 9.45e-01 0.00735 0.106 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 4.12e-01 0.0786 0.0956 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 4.12e-01 0.0859 0.105 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 5.78e-01 0.0515 0.0924 0.17 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 2.38e-01 0.0848 0.0717 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0024 0.103 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 7.12e-01 0.0203 0.0548 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 6.36e-01 0.0321 0.0678 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0116 0.0689 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0361 0.0791 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 8.17e-01 0.0198 0.0854 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 1.01e-01 0.189 0.114 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 4.37e-01 0.0503 0.0645 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 7.62e-01 0.0203 0.067 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 6.55e-01 -0.038 0.085 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0769 0.0945 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 9.92e-01 0.000991 0.104 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0378 0.114 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0376 0.0854 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 3.72e-01 0.0797 0.0891 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 3.25e-01 -0.103 0.104 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 2.21e-01 -0.126 0.103 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00103 0.0906 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 3.71e-01 0.0954 0.106 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 5.41e-01 0.0497 0.0811 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 2.29e-01 0.119 0.0982 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0438 0.104 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 1.76e-02 0.23 0.0961 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 5.12e-01 0.0615 0.0936 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 8.76e-01 0.0161 0.103 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 5.18e-01 0.0457 0.0707 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 2.10e-01 0.0907 0.0721 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 2.10e-01 -0.113 0.09 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 3.89e-01 0.0847 0.0982 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 2.92e-01 0.118 0.112 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 5.03e-01 0.0748 0.111 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00759 0.0843 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 3.68e-01 0.0983 0.109 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 6.20e-01 0.0501 0.101 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 6.74e-01 -0.043 0.102 0.171 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 2.09e-01 -0.136 0.108 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 1.71e-01 0.156 0.114 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 6.78e-01 0.0474 0.114 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 8.71e-01 0.0176 0.108 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 7.39e-01 0.0374 0.112 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 9.78e-02 -0.168 0.101 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0516 0.102 0.171 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 4.55e-01 0.0853 0.114 0.171 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0645 0.0961 0.171 MAIT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0124 0.0929 0.171 MAIT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0541 0.103 0.171 MAIT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 5.18e-01 -0.069 0.107 0.171 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0975 0.113 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0858 0.112 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 9.76e-01 0.003 0.0988 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 2.40e-02 0.231 0.102 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 1.79e-01 -0.139 0.103 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 3.23e-01 -0.101 0.102 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0472 0.0829 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 8.22e-01 0.0255 0.113 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 7.48e-01 0.0253 0.0787 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 3.66e-01 0.0825 0.0912 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 3.40e-01 0.109 0.114 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 7.29e-01 0.0327 0.0944 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0622 0.11 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0788 0.11 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 3.04e-02 -0.223 0.102 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 4.41e-01 0.0756 0.098 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 2.17e-01 -0.129 0.104 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0504 0.101 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 2.57e-01 -0.105 0.0929 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 6.21e-01 0.0571 0.115 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 7.44e-02 -0.159 0.0885 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 8.38e-01 -0.021 0.103 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 6.47e-01 0.05 0.109 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 1.37e-01 -0.15 0.101 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0439 0.119 0.211 PB L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 3.47e-01 0.101 0.106 0.211 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0216 0.12 0.211 PB L2
ENSG00000162510 MATN1 -944630 sc-eQTL 7.97e-01 0.0278 0.108 0.211 PB L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 2.69e-01 0.0851 0.0766 0.211 PB L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 9.19e-01 0.0108 0.105 0.211 PB L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 6.08e-01 0.0576 0.112 0.211 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0993 0.0929 0.17 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0339 0.0951 0.17 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 4.86e-01 0.0675 0.0968 0.17 Pro_T L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 7.57e-01 0.023 0.0743 0.17 Pro_T L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 8.81e-01 0.0156 0.104 0.17 Pro_T L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 5.07e-01 0.0634 0.0954 0.17 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 1.68e-01 -0.137 0.099 0.171 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 1.29e-01 0.182 0.119 0.171 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 5.37e-01 0.0516 0.0834 0.171 Treg L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 9.86e-01 0.00183 0.102 0.171 Treg L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 8.86e-01 0.0148 0.103 0.171 Treg L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 7.47e-03 0.274 0.102 0.171 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0875 0.107 0.18 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0974 0.121 0.18 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0227 0.102 0.18 cDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 4.22e-01 0.0595 0.074 0.18 cDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 4.81e-01 0.071 0.101 0.18 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0519 0.0898 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 8.92e-01 0.0152 0.111 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0854 0.081 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 2.26e-01 0.0748 0.0616 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0207 0.0972 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0864 0.0835 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 5.44e-01 -0.067 0.11 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 9.11e-01 0.0114 0.101 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 1.33e-01 0.0953 0.0632 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0813 0.0947 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 3.11e-01 -0.141 0.139 0.152 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 3.17e-01 0.139 0.138 0.152 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 1.19e-01 -0.19 0.121 0.152 gdT L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 6.79e-01 0.0582 0.14 0.152 gdT L2
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 3.89e-01 -0.112 0.129 0.152 gdT L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0794 0.125 0.152 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 2.65e-01 -0.116 0.104 0.176 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0406 0.111 0.176 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0677 0.108 0.176 intMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0391 0.077 0.176 intMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 1.82e-01 -0.139 0.104 0.176 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0562 0.104 0.179 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0106 0.112 0.179 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 2.07e-01 0.141 0.112 0.179 ncMono L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0829 0.0787 0.179 ncMono L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 8.97e-01 -0.013 0.1 0.179 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0123 0.131 0.158 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 7.04e-01 0.0515 0.135 0.158 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 4.31e-01 -0.101 0.128 0.158 pDC L2
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 7.57e-01 0.0319 0.103 0.158 pDC L2
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 3.23e-01 0.112 0.113 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00593 0.0896 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 2.90e-02 0.241 0.109 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000165 0.0793 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -944630 sc-eQTL 7.34e-01 0.0333 0.0979 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00191 0.0615 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0845 0.0812 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 4.57e-01 0.066 0.0886 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 2.60e-01 0.0918 0.0812 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 5.43e-03 0.293 0.104 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0836 0.0776 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162510 MATN1 -944630 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0172 0.0767 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 7.03e-01 0.0206 0.054 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0551 0.0697 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0369 0.0829 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0102 0.0797 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0164 0.107 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0658 0.079 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 9.24e-02 0.0943 0.0558 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0362 0.0904 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0929 0.0935 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0315 0.107 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 6.11e-01 0.0551 0.108 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 7.71e-01 -0.02 0.0687 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 3.58e-01 -0.091 0.0987 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 597055 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0384 0.0788 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 548013 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0128 0.109 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 891864 sc-eQTL 1.58e-01 -0.104 0.0737 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162511 LAPTM5 -978819 sc-eQTL 5.35e-01 0.0557 0.0896 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 sc-eQTL 5.95e-01 0.0551 0.103 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000287510 AL137857.1 -952738 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0325 0.0893 0.172 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000186056 MATN1-AS1 -939549 eQTL 6.58e-04 -0.0526 0.0154 0.00495 0.00127 0.191

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina