logo

Genes within 1Mb (chr1:29582518:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 7.03e-01 0.0247 0.0646 0.47 B L1
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0583 0.0769 0.47 B L1
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 1.66e-01 0.0814 0.0585 0.47 B L1
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00297 0.0608 0.47 B L1
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 7.44e-01 0.0293 0.0894 0.47 B L1
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 2.27e-01 0.0745 0.0615 0.47 B L1
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0577 0.0606 0.47 B L1
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 4.60e-03 -0.26 0.0906 0.47 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 5.78e-02 0.116 0.0606 0.47 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 6.08e-01 0.0438 0.0851 0.47 CD4T L1
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 3.92e-02 -0.0913 0.044 0.47 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 7.71e-01 0.014 0.0479 0.47 CD4T L1
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 7.80e-01 0.0203 0.0726 0.47 CD4T L1
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 8.60e-01 0.00889 0.0504 0.47 CD4T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 1.89e-01 0.0707 0.0536 0.47 CD4T L1
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0632 0.0907 0.47 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 2.52e-02 0.149 0.0663 0.47 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0841 0.0897 0.47 CD8T L1
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 2.37e-02 -0.125 0.0551 0.47 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 5.40e-01 0.0335 0.0546 0.47 CD8T L1
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 3.40e-01 -0.08 0.0837 0.47 CD8T L1
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0508 0.0606 0.47 CD8T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 4.54e-01 0.0494 0.0659 0.47 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 4.11e-01 0.0766 0.0929 0.475 DC L1
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 5.60e-02 0.196 0.102 0.475 DC L1
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 6.05e-01 0.0474 0.0914 0.475 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 1.92e-01 -0.119 0.0911 0.475 DC L1
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 2.29e-01 0.118 0.098 0.475 DC L1
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 1.21e-01 0.157 0.101 0.475 DC L1
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 8.09e-01 0.0177 0.0732 0.475 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 8.44e-01 0.0124 0.0629 0.47 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 5.01e-02 -0.181 0.0917 0.47 Mono L1
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0803 0.0625 0.47 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00589 0.0708 0.47 Mono L1
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0696 0.0782 0.47 Mono L1
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 6.65e-01 0.0303 0.0699 0.47 Mono L1
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0266 0.0693 0.47 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 3.89e-01 0.0621 0.0718 0.468 NK L1
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 1.25e-02 -0.235 0.0933 0.468 NK L1
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 8.40e-01 0.0111 0.0548 0.468 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0161 0.0645 0.468 NK L1
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 1.39e-01 -0.127 0.0857 0.468 NK L1
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0194 0.0637 0.468 NK L1
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 2.05e-01 0.0953 0.075 0.468 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 7.56e-01 0.0215 0.0691 0.47 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 8.33e-01 0.0173 0.082 0.47 Other_T L1
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 5.81e-01 0.0412 0.0745 0.47 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0403 0.0743 0.47 Other_T L1
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 1.07e-01 -0.15 0.0928 0.47 Other_T L1
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0632 0.0712 0.47 Other_T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 8.23e-02 0.128 0.0733 0.47 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 2.74e-01 0.125 0.114 0.485 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 2.68e-01 0.113 0.102 0.485 B_Activated L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 9.21e-01 0.0104 0.105 0.485 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 7.49e-01 0.0326 0.101 0.485 B_Activated L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 4.09e-01 0.0912 0.11 0.485 B_Activated L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 6.31e-01 0.0533 0.111 0.485 B_Activated L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 9.64e-01 0.00521 0.115 0.485 B_Activated L2
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00939 0.0887 0.485 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 1.65e-01 -0.116 0.0831 0.47 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 3.83e-01 -0.085 0.0971 0.47 B_Intermediate L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 8.37e-01 0.0175 0.0851 0.47 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 8.01e-02 -0.134 0.0763 0.47 B_Intermediate L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 5.44e-01 0.0621 0.102 0.47 B_Intermediate L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 1.14e-01 0.116 0.0732 0.47 B_Intermediate L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 9.06e-01 -0.01 0.0852 0.47 B_Intermediate L2
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0931 0.0937 0.47 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0169 0.0844 0.468 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0553 0.0952 0.468 B_Memory L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 9.05e-01 0.0105 0.0885 0.468 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0193 0.0806 0.468 B_Memory L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0557 0.0917 0.468 B_Memory L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 1.15e-01 0.132 0.0832 0.468 B_Memory L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 1.39e-01 -0.134 0.0904 0.468 B_Memory L2
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 9.20e-01 0.00881 0.088 0.468 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 9.48e-01 0.00486 0.0744 0.47 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0249 0.0979 0.47 B_Naive1 L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 6.62e-01 0.0349 0.0797 0.47 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 4.07e-01 0.0579 0.0697 0.47 B_Naive1 L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00567 0.0905 0.47 B_Naive1 L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 2.77e-01 0.0733 0.0672 0.47 B_Naive1 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 8.17e-01 0.0191 0.0827 0.47 B_Naive1 L2
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 4.62e-02 -0.194 0.0966 0.47 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0196 0.0825 0.468 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 7.95e-01 -0.025 0.0962 0.468 B_Naive2 L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 3.45e-02 0.191 0.0897 0.468 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0667 0.0843 0.468 B_Naive2 L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 8.22e-01 0.0223 0.0987 0.468 B_Naive2 L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 3.47e-01 0.0896 0.095 0.468 B_Naive2 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0149 0.0929 0.468 B_Naive2 L2
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0613 0.096 0.468 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00163 0.0914 0.473 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 7.86e-01 0.0252 0.0926 0.473 CD4_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 4.22e-01 0.0751 0.0933 0.473 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00139 0.0921 0.473 CD4_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0276 0.0977 0.473 CD4_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00466 0.092 0.473 CD4_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0617 0.085 0.473 CD4_CTL L2
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 4.86e-01 0.0535 0.0767 0.473 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 1.74e-01 0.0857 0.0628 0.47 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 1.91e-01 0.119 0.0904 0.47 CD4_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 1.02e-01 -0.086 0.0524 0.47 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0109 0.0481 0.47 CD4_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 1.14e-01 0.126 0.0795 0.47 CD4_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00657 0.0516 0.47 CD4_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 8.11e-02 0.0965 0.055 0.47 CD4_Naive L2
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 9.03e-01 0.0118 0.0964 0.47 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 1.06e-02 0.185 0.0717 0.47 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0973 0.0979 0.47 CD4_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 6.48e-01 0.0264 0.0578 0.47 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 2.33e-01 0.0657 0.0549 0.47 CD4_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0759 0.0839 0.47 CD4_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 1.15e-01 0.096 0.0607 0.47 CD4_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0489 0.072 0.47 CD4_TCM L2
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 9.44e-01 0.00697 0.0992 0.47 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 2.88e-01 0.0948 0.0891 0.47 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 5.84e-01 0.0539 0.0984 0.47 CD4_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 9.04e-02 -0.135 0.0795 0.47 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0978 0.0732 0.47 CD4_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0837 0.0943 0.47 CD4_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 7.57e-01 0.0227 0.0733 0.47 CD4_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 1.91e-01 0.112 0.0851 0.47 CD4_TEM L2
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0245 0.0895 0.47 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00576 0.081 0.47 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0634 0.0954 0.47 CD8_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0707 0.0776 0.47 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 2.67e-01 0.0807 0.0725 0.47 CD8_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 9.25e-01 0.00851 0.0905 0.47 CD8_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 6.09e-01 0.0425 0.0829 0.47 CD8_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 2.06e-01 0.108 0.0852 0.47 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 1.96e-02 0.191 0.0812 0.47 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 6.99e-01 -0.035 0.0904 0.47 CD8_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 1.25e-01 -0.103 0.0666 0.47 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0143 0.0621 0.47 CD8_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 1.25e-01 -0.14 0.0909 0.47 CD8_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0868 0.0644 0.47 CD8_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0327 0.0668 0.47 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 1.07e-03 0.316 0.0952 0.47 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 2.55e-01 -0.111 0.0969 0.47 CD8_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0381 0.0854 0.47 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 7.10e-01 0.0273 0.0734 0.47 CD8_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0316 0.0996 0.47 CD8_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 5.71e-01 0.0483 0.085 0.47 CD8_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 1.31e-01 0.138 0.0906 0.47 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00712 0.0938 0.473 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0091 0.099 0.473 CD8_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 8.22e-01 -0.021 0.0929 0.473 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 6.79e-01 0.0409 0.0988 0.473 CD8_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0652 0.102 0.473 CD8_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0326 0.088 0.473 CD8_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 4.05e-01 0.0828 0.0992 0.473 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 3.95e-01 0.0768 0.09 0.474 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0261 0.101 0.474 MAIT L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 4.55e-01 0.0633 0.0846 0.474 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0369 0.0852 0.474 MAIT L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 2.75e-01 -0.11 0.1 0.474 MAIT L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 7.40e-01 -0.032 0.0961 0.474 MAIT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 8.74e-01 0.0145 0.0908 0.474 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 3.25e-01 0.0997 0.101 0.471 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0278 0.101 0.471 NK_CD56bright L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 1.75e-01 0.128 0.0943 0.471 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0293 0.0886 0.471 NK_CD56bright L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 6.83e-01 0.0427 0.104 0.471 NK_CD56bright L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 1.15e-01 0.147 0.0927 0.471 NK_CD56bright L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 2.76e-02 0.222 0.0998 0.471 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 4.73e-01 0.0533 0.074 0.468 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0975 0.101 0.468 NK_CD56dim L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 8.23e-01 0.0155 0.0694 0.468 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 6.69e-01 0.0301 0.0703 0.468 NK_CD56dim L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 6.01e-02 -0.183 0.0969 0.468 NK_CD56dim L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0339 0.0781 0.468 NK_CD56dim L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 2.94e-01 0.0908 0.0862 0.468 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0631 0.0969 0.463 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 1.96e-02 -0.226 0.096 0.463 NK_HLA L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 4.13e-02 -0.203 0.0989 0.463 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 9.90e-01 0.00109 0.0914 0.463 NK_HLA L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 1.92e-03 -0.323 0.103 0.463 NK_HLA L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 8.83e-02 -0.165 0.0962 0.463 NK_HLA L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 6.87e-02 0.185 0.101 0.463 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0494 0.08 0.468 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 9.88e-02 -0.163 0.0985 0.468 NK_cytokine L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 5.78e-01 0.0423 0.0759 0.468 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 8.19e-01 0.0175 0.0767 0.468 NK_cytokine L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0326 0.0931 0.468 NK_cytokine L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 6.60e-01 0.0318 0.0723 0.468 NK_cytokine L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0988 0.0875 0.468 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 8.89e-01 0.0193 0.138 0.474 PB L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 1.14e-01 -0.195 0.123 0.474 PB L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00178 0.116 0.474 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 1.51e-01 0.2 0.138 0.474 PB L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 9.32e-02 0.238 0.14 0.474 PB L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 3.04e-01 0.147 0.143 0.474 PB L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 4.95e-01 0.0807 0.118 0.474 PB L2
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 2.35e-02 -0.304 0.132 0.474 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0618 0.0812 0.47 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0688 0.083 0.47 Pro_T L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0659 0.0911 0.47 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00767 0.0847 0.47 Pro_T L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0662 0.1 0.47 Pro_T L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0197 0.0886 0.47 Pro_T L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 2.51e-01 0.0961 0.0835 0.47 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 9.90e-01 0.00106 0.0873 0.47 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 9.67e-01 0.00438 0.105 0.47 Treg L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0148 0.0866 0.47 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 6.16e-02 0.137 0.0727 0.47 Treg L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 9.25e-01 0.00921 0.0971 0.47 Treg L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 1.62e-01 0.101 0.0719 0.47 Treg L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 7.18e-01 0.0352 0.0974 0.47 Treg L2
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 8.57e-03 -0.249 0.0939 0.47 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 9.12e-01 0.0106 0.096 0.478 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 1.45e-01 0.157 0.107 0.478 cDC L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 8.98e-01 0.0128 0.0991 0.478 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 1.91e-01 -0.119 0.0903 0.478 cDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 1.15e-01 0.169 0.107 0.478 cDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 1.89e-01 0.129 0.0979 0.478 cDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0465 0.0918 0.478 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 4.43e-01 -0.06 0.0781 0.47 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 3.10e-02 -0.208 0.0956 0.47 cMono_IL1B L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 8.12e-02 -0.128 0.0732 0.47 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 4.34e-01 0.0553 0.0706 0.47 cMono_IL1B L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 1.10e-01 -0.137 0.0855 0.47 cMono_IL1B L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 2.38e-01 0.0916 0.0773 0.47 cMono_IL1B L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0865 0.0731 0.47 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 2.43e-01 0.0848 0.0724 0.47 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 9.15e-01 0.0102 0.0957 0.47 cMono_S100A L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 5.69e-01 0.0518 0.0909 0.47 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0333 0.0878 0.47 cMono_S100A L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0712 0.0923 0.47 cMono_S100A L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 9.46e-01 0.00604 0.0898 0.47 cMono_S100A L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 3.81e-01 0.0854 0.0974 0.47 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 6.82e-02 0.208 0.113 0.467 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 1.29e-01 0.173 0.113 0.467 gdT L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 1.39e-02 0.264 0.106 0.467 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 3.71e-01 0.0894 0.0997 0.467 gdT L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 8.34e-01 0.0228 0.108 0.467 gdT L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 1.43e-01 -0.147 0.1 0.467 gdT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 9.48e-01 0.00725 0.112 0.467 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 5.27e-01 0.0571 0.0902 0.469 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 9.77e-01 0.00281 0.0958 0.469 intMono L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0468 0.0857 0.469 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0325 0.0934 0.469 intMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 2.85e-02 0.209 0.0947 0.469 intMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 8.10e-01 0.0226 0.0938 0.469 intMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 1.92e-01 -0.131 0.0998 0.469 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 4.08e-01 0.0761 0.0918 0.471 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 4.90e-01 0.0685 0.0991 0.471 ncMono L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 1.87e-01 0.121 0.0912 0.471 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 6.55e-01 0.0444 0.0993 0.471 ncMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 6.85e-01 0.0413 0.102 0.471 ncMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 2.01e-01 -0.106 0.083 0.471 ncMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0102 0.0941 0.471 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 6.50e-01 0.0507 0.112 0.46 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 7.09e-01 -0.043 0.115 0.46 pDC L2
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0155 0.112 0.46 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 2.80e-01 -0.118 0.109 0.46 pDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0845 0.114 0.46 pDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 2.99e-01 0.11 0.105 0.46 pDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0546 0.0872 0.46 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0358 0.0765 0.47 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 7.19e-01 -0.034 0.0944 0.47 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 9.16e-01 0.00799 0.0759 0.47 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0697 0.0676 0.47 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 7.47e-01 0.0293 0.0907 0.47 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 4.69e-02 0.131 0.0654 0.47 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0886 0.0789 0.47 B_Memory LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 2.77e-01 -0.103 0.0941 0.47 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 9.75e-01 0.00216 0.0695 0.47 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0324 0.0906 0.47 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 2.73e-01 0.0819 0.0745 0.47 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0133 0.0665 0.47 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0278 0.0936 0.47 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 1.50e-01 0.0953 0.0661 0.47 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 7.90e-01 0.0209 0.0782 0.47 B_Naive LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 939290 sc-eQTL 6.42e-02 -0.179 0.0964 0.47 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0109 0.0696 0.47 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 1.38e-01 -0.138 0.0926 0.47 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 1.25e-01 -0.106 0.0692 0.47 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 7.81e-01 0.0192 0.0691 0.47 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 1.19e-01 -0.123 0.0784 0.47 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 2.76e-01 0.083 0.0761 0.47 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00912 0.074 0.47 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 6.14e-01 0.0411 0.0814 0.466 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 9.26e-01 0.00864 0.0928 0.466 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0432 0.0818 0.466 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0122 0.0941 0.466 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 1.42e-01 0.135 0.0919 0.466 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 1.34e-01 -0.132 0.0875 0.466 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0842 0.0949 0.466 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 400618 sc-eQTL 5.15e-01 0.0457 0.07 0.468 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 351576 sc-eQTL 8.21e-03 -0.253 0.0949 0.468 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 939433 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00358 0.0564 0.468 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 695427 sc-eQTL 9.87e-01 0.00107 0.0658 0.468 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 913786 sc-eQTL 5.08e-02 -0.174 0.0886 0.468 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 999386 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0258 0.067 0.468 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 845897 sc-eQTL 5.83e-01 0.0413 0.0751 0.468 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116350 SRSF4 400618 eQTL 0.0115 0.0256 0.0101 0.0 0.0 0.395

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000188060 \N 990318 2.64e-07 1.11e-07 3.54e-08 1.78e-07 9.01e-08 9.61e-08 1.42e-07 5.2e-08 1.41e-07 4.57e-08 1.56e-07 8.14e-08 1.33e-07 6.38e-08 5.84e-08 7.17e-08 3.94e-08 1.18e-07 5.21e-08 4.21e-08 1.05e-07 1.26e-07 1.32e-07 4.05e-08 1.33e-07 1.16e-07 1.11e-07 9.32e-08 1.05e-07 1.12e-07 9.73e-08 3.94e-08 3.28e-08 8.65e-08 8.98e-08 3.77e-08 5.03e-08 9.22e-08 7.47e-08 3e-08 4.57e-08 1.35e-07 4.52e-08 2.63e-08 6.38e-08 1.66e-08 1.22e-07 3.92e-09 4.85e-08