logo

Genes within 1Mb (chr1:29558305:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0821 0.109 0.075 B L1
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 4.67e-01 0.0944 0.13 0.075 B L1
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 5.70e-01 0.0564 0.099 0.075 B L1
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 2.37e-01 0.121 0.102 0.075 B L1
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 7.49e-01 0.0482 0.151 0.075 B L1
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 5.43e-03 -0.287 0.102 0.075 B L1
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 4.86e-01 0.0714 0.102 0.075 B L1
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 6.48e-01 0.0711 0.156 0.075 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 2.84e-01 -0.111 0.103 0.075 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0295 0.144 0.075 CD4T L1
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0447 0.0749 0.075 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0128 0.0809 0.075 CD4T L1
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 3.05e-01 -0.126 0.122 0.075 CD4T L1
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0843 0.0847 0.075 CD4T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0741 0.0906 0.075 CD4T L1
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 9.60e-01 0.00764 0.153 0.075 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 3.37e-01 -0.109 0.113 0.075 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 8.36e-01 0.0315 0.152 0.075 CD8T L1
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0092 0.0943 0.075 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0621 0.0924 0.075 CD8T L1
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 3.60e-01 0.13 0.142 0.075 CD8T L1
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 3.41e-01 0.0978 0.102 0.075 CD8T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0656 0.111 0.075 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 1.53e-01 0.218 0.152 0.077 DC L1
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 3.99e-02 0.345 0.167 0.077 DC L1
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 7.39e-01 0.05 0.15 0.077 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 4.53e-02 0.299 0.149 0.077 DC L1
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 6.71e-01 0.0686 0.161 0.077 DC L1
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 5.73e-01 0.0941 0.167 0.077 DC L1
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 2.25e-01 -0.145 0.12 0.077 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0382 0.11 0.075 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 7.66e-01 0.0482 0.162 0.075 Mono L1
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 4.24e-01 0.0878 0.11 0.075 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 6.53e-01 0.0557 0.124 0.075 Mono L1
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 3.87e-01 0.118 0.137 0.075 Mono L1
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 1.53e-01 0.174 0.122 0.075 Mono L1
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 2.67e-01 0.135 0.121 0.075 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 3.54e-01 -0.111 0.12 0.075 NK L1
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 2.52e-01 0.181 0.158 0.075 NK L1
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 2.98e-01 0.0952 0.0912 0.075 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 7.10e-01 0.0401 0.108 0.075 NK L1
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 3.34e-01 0.139 0.143 0.075 NK L1
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 8.11e-01 0.0254 0.106 0.075 NK L1
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0728 0.125 0.075 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0232 0.117 0.075 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 4.83e-01 0.0971 0.138 0.075 Other_T L1
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 7.45e-01 -0.041 0.126 0.075 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 7.02e-01 0.0479 0.125 0.075 Other_T L1
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0383 0.157 0.075 Other_T L1
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0698 0.12 0.075 Other_T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 3.37e-01 0.12 0.124 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 1.81e-02 -0.47 0.197 0.071 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 3.63e-01 0.164 0.18 0.071 B_Activated L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 4.17e-02 0.373 0.182 0.071 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0363 0.178 0.071 B_Activated L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0481 0.194 0.071 B_Activated L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0379 0.195 0.071 B_Activated L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 4.41e-01 -0.156 0.202 0.071 B_Activated L2
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 3.74e-01 0.139 0.155 0.071 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0843 0.144 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 7.21e-01 0.0601 0.168 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 6.95e-01 0.0576 0.147 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 8.20e-01 0.0301 0.133 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 2.00e-01 -0.226 0.176 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0731 0.127 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 3.92e-01 -0.126 0.147 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 7.51e-02 -0.288 0.161 0.073 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 4.25e-01 0.12 0.151 0.075 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 1.76e-01 -0.23 0.17 0.075 B_Memory L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 3.17e-01 0.158 0.158 0.075 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 5.98e-01 0.076 0.144 0.075 B_Memory L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 1.02e-01 0.267 0.163 0.075 B_Memory L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 6.70e-01 0.0637 0.149 0.075 B_Memory L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 3.73e-03 0.467 0.159 0.075 B_Memory L2
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 4.82e-02 0.31 0.156 0.075 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0801 0.128 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 6.76e-01 0.0707 0.169 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 7.05e-01 0.0521 0.138 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00446 0.121 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 2.94e-02 0.339 0.155 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 2.97e-02 -0.252 0.115 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 4.47e-01 -0.109 0.143 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 1.42e-01 0.247 0.168 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 9.78e-01 0.00406 0.144 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0657 0.168 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 2.59e-02 -0.351 0.156 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 7.24e-01 0.0521 0.147 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 8.35e-02 -0.298 0.171 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 1.75e-01 -0.225 0.165 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 4.14e-01 0.132 0.162 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 3.73e-01 0.149 0.167 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 1.96e-01 -0.203 0.156 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00936 0.159 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0724 0.16 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0253 0.158 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 3.20e-01 0.167 0.167 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 6.50e-01 0.0718 0.158 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 4.29e-01 0.116 0.146 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 8.16e-02 -0.229 0.131 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 3.24e-01 -0.105 0.106 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 8.99e-01 0.0193 0.153 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 6.02e-02 -0.166 0.088 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0401 0.081 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 9.36e-02 -0.225 0.134 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 1.61e-01 -0.122 0.0865 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 1.27e-01 -0.142 0.0929 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0227 0.162 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000903 0.126 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0695 0.17 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 1.71e-01 0.137 0.0996 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 6.24e-01 0.0467 0.0952 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 2.15e-01 -0.18 0.145 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0968 0.105 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 6.07e-01 0.0641 0.125 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 3.96e-01 0.146 0.171 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 5.48e-02 -0.294 0.152 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0449 0.169 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 6.89e-03 0.369 0.135 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0585 0.126 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 7.12e-01 0.0599 0.162 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 1.49e-01 0.182 0.125 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0411 0.147 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 6.85e-01 0.0626 0.154 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0543 0.136 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 6.18e-01 0.0801 0.16 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 8.25e-01 0.0289 0.131 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0339 0.122 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 4.79e-01 0.108 0.152 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 9.82e-02 0.23 0.138 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 3.64e-01 -0.13 0.143 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 2.74e-01 -0.154 0.141 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0969 0.155 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 3.81e-01 -0.101 0.115 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0457 0.107 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 9.17e-01 0.0164 0.157 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 3.02e-01 0.115 0.111 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 9.63e-01 0.00529 0.115 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 9.70e-01 0.00623 0.163 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 7.40e-01 0.0538 0.162 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 9.68e-01 0.00575 0.142 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0914 0.122 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 8.07e-01 0.0407 0.166 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 7.57e-02 -0.251 0.141 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0465 0.152 0.081 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 9.22e-02 -0.265 0.156 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00574 0.166 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 2.65e-01 0.174 0.156 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 3.09e-01 -0.169 0.166 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 3.34e-01 0.166 0.172 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 3.39e-01 0.141 0.148 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0887 0.167 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 6.88e-01 0.0616 0.153 0.076 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 8.17e-01 -0.04 0.172 0.076 MAIT L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0779 0.144 0.076 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 9.98e-01 0.000301 0.145 0.076 MAIT L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 8.82e-01 0.0254 0.171 0.076 MAIT L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 4.32e-01 -0.129 0.163 0.076 MAIT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 4.18e-01 0.125 0.154 0.076 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 2.87e-01 -0.179 0.168 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 1.08e-01 -0.268 0.166 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 2.43e-01 -0.184 0.157 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 2.39e-01 0.173 0.147 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 7.08e-01 0.0652 0.174 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 5.15e-01 0.101 0.155 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 4.57e-01 -0.125 0.168 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 4.01e-01 -0.104 0.123 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 6.84e-01 0.0684 0.168 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 2.45e-01 0.134 0.115 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0654 0.117 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 3.91e-01 0.139 0.162 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 9.14e-01 0.0141 0.13 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 3.37e-01 -0.138 0.143 0.073 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 8.59e-01 0.0286 0.161 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 5.48e-02 0.31 0.161 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 1.07e-01 0.268 0.165 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 9.52e-01 0.0091 0.152 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0187 0.175 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 9.57e-02 0.268 0.16 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 2.09e-01 -0.214 0.17 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0892 0.138 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 1.63e-01 0.238 0.17 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 7.63e-01 0.0395 0.131 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 3.95e-01 0.112 0.132 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 3.79e-01 0.141 0.16 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 3.48e-01 0.117 0.124 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 3.81e-01 0.132 0.151 0.073 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 9.34e-01 0.0214 0.258 0.056 PB L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 7.17e-01 0.0845 0.232 0.056 PB L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 1.20e-03 0.691 0.208 0.056 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 7.14e-01 0.0959 0.261 0.056 PB L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0644 0.266 0.056 PB L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 3.08e-01 -0.274 0.267 0.056 PB L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 1.74e-01 -0.301 0.22 0.056 PB L2
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 6.35e-01 -0.121 0.254 0.056 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 1.73e-01 0.185 0.135 0.076 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 3.47e-01 0.13 0.138 0.076 Pro_T L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 5.62e-01 0.0884 0.152 0.076 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 2.89e-01 -0.15 0.141 0.076 Pro_T L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 9.82e-01 0.00379 0.168 0.076 Pro_T L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 1.96e-01 0.191 0.147 0.076 Pro_T L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 6.06e-01 0.0722 0.14 0.076 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0329 0.147 0.075 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0791 0.177 0.075 Treg L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 2.30e-01 0.175 0.146 0.075 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 9.44e-01 0.00871 0.124 0.075 Treg L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 2.99e-01 0.17 0.163 0.075 Treg L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 1.03e-01 -0.198 0.121 0.075 Treg L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 9.54e-01 0.00949 0.164 0.075 Treg L2
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 8.78e-01 0.0248 0.161 0.075 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 2.95e-01 0.172 0.164 0.078 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 2.56e-01 0.21 0.184 0.078 cDC L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 8.64e-01 0.0291 0.17 0.078 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 7.60e-02 0.275 0.154 0.078 cDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 9.33e-01 0.0154 0.184 0.078 cDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 1.10e-01 0.269 0.167 0.078 cDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 7.08e-01 -0.059 0.157 0.078 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 6.15e-01 0.0675 0.134 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 3.89e-01 0.143 0.166 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 2.43e-01 0.148 0.126 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 4.04e-01 -0.101 0.121 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 1.55e-01 0.21 0.147 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 9.55e-01 0.00747 0.133 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 4.18e-01 0.102 0.126 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 6.55e-01 0.057 0.127 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0643 0.168 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 3.64e-01 -0.145 0.159 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 3.95e-02 0.316 0.152 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 6.22e-01 0.0799 0.162 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 2.75e-02 0.346 0.156 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 6.98e-01 0.0665 0.171 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 1.80e-01 -0.248 0.184 0.091 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0356 0.184 0.091 gdT L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 5.17e-01 -0.114 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 1.19e-01 0.252 0.16 0.091 gdT L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0965 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 3.66e-01 0.147 0.163 0.091 gdT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 8.70e-01 0.0297 0.181 0.091 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0354 0.158 0.073 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 4.27e-01 -0.134 0.168 0.073 intMono L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0565 0.15 0.073 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 1.82e-01 -0.218 0.163 0.073 intMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 8.91e-01 0.023 0.168 0.073 intMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 5.82e-01 0.0905 0.164 0.073 intMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 1.37e-01 0.261 0.175 0.073 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 3.90e-02 -0.312 0.15 0.079 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00445 0.163 0.079 ncMono L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0601 0.151 0.079 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 3.48e-01 -0.154 0.163 0.079 ncMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 4.95e-01 -0.115 0.167 0.079 ncMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 8.63e-02 0.235 0.136 0.079 ncMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 1.04e-01 0.252 0.154 0.079 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 3.02e-01 0.185 0.179 0.076 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0107 0.184 0.076 pDC L2
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0696 0.179 0.076 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 1.41e-01 0.258 0.174 0.076 pDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0777 0.183 0.076 pDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0463 0.17 0.076 pDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0125 0.14 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0892 0.133 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000213 0.164 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 1.06e-01 0.213 0.131 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 2.13e-01 0.147 0.117 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00594 0.158 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 9.95e-01 0.000722 0.115 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 2.60e-01 0.155 0.137 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0726 0.164 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0238 0.12 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 7.36e-01 0.0528 0.156 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 3.69e-01 -0.116 0.129 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 5.61e-01 0.0666 0.115 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 5.32e-01 0.101 0.161 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 5.23e-03 -0.317 0.112 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00678 0.135 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 915077 sc-eQTL 1.82e-01 0.223 0.167 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 6.55e-01 0.0533 0.119 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 8.94e-01 0.0212 0.16 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 3.22e-01 0.118 0.119 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 3.56e-01 0.109 0.118 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 1.65e-01 0.187 0.135 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 3.11e-01 0.132 0.13 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 5.61e-01 0.0738 0.127 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 1.25e-01 -0.214 0.139 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 7.60e-01 0.0488 0.16 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 8.31e-01 -0.03 0.141 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 1.97e-01 -0.209 0.161 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 9.35e-01 0.013 0.159 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 1.69e-02 0.36 0.149 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 1.09e-02 0.414 0.161 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 376405 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0825 0.118 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 327363 sc-eQTL 9.82e-02 0.268 0.161 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 915220 sc-eQTL 1.49e-01 0.137 0.0943 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 671214 sc-eQTL 9.58e-01 0.00581 0.111 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 889573 sc-eQTL 2.94e-01 0.158 0.15 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 975173 sc-eQTL 9.63e-01 0.00521 0.113 0.073 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 821684 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0358 0.126 0.073 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116353 MECR 327363 eQTL 0.0491 -0.0675 0.0343 0.00122 0.0 0.078

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120656 \N 915220 2.69e-07 1.3e-07 4.69e-08 1.82e-07 9.16e-08 9.8e-08 1.49e-07 5.4e-08 1.44e-07 4.74e-08 1.62e-07 8.36e-08 1.41e-07 6.56e-08 5.99e-08 7.3e-08 4.17e-08 1.26e-07 5.82e-08 4e-08 1.19e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.49e-08 1.37e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.57e-08 1.12e-07 1.07e-07 9.7e-08 3.26e-08 3.66e-08 8.55e-08 8.38e-08 3.95e-08 5.31e-08 9.23e-08 6.54e-08 3.8e-08 4.39e-08 1.33e-07 5.22e-08 1.12e-08 4.67e-08 1.99e-08 1.22e-07 3.81e-09 5.04e-08