logo

Genes within 1Mb (chr1:29541673:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0706 0.0659 0.261 B L1
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0784 0.0785 0.261 B L1
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0252 0.06 0.261 B L1
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 8.22e-01 0.014 0.0621 0.261 B L1
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 1.20e-01 0.142 0.0908 0.261 B L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00455 0.068 0.261 B L1
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 3.27e-01 0.0618 0.0629 0.261 B L1
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 2.28e-02 -0.141 0.0613 0.261 B L1
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 1.06e-01 -0.152 0.0938 0.261 B L1
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0292 0.0622 0.261 CD4T L1
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 6.65e-01 0.0376 0.0866 0.261 CD4T L1
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0178 0.0452 0.261 CD4T L1
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0299 0.0487 0.261 CD4T L1
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 9.68e-01 0.00296 0.0738 0.261 CD4T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 5.50e-01 0.0423 0.0707 0.261 CD4T L1
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 7.81e-01 0.0143 0.0512 0.261 CD4T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0156 0.0547 0.261 CD4T L1
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0974 0.0922 0.261 CD4T L1
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 8.64e-01 0.0118 0.0688 0.261 CD8T L1
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00284 0.0922 0.261 CD8T L1
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 5.07e-01 -0.038 0.0571 0.261 CD8T L1
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 4.77e-01 0.0399 0.056 0.261 CD8T L1
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 1.80e-01 0.115 0.0856 0.261 CD8T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00372 0.0735 0.261 CD8T L1
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 1.78e-02 0.147 0.0614 0.261 CD8T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0345 0.0676 0.261 CD8T L1
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 8.39e-01 0.0191 0.094 0.255 DC L1
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 4.94e-01 0.071 0.104 0.255 DC L1
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 5.82e-01 0.0509 0.0924 0.255 DC L1
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 1.13e-01 0.146 0.0919 0.255 DC L1
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 2.34e-02 0.224 0.0981 0.255 DC L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 3.53e-01 0.0911 0.0978 0.255 DC L1
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0183 0.103 0.255 DC L1
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 9.12e-01 0.00814 0.0739 0.255 DC L1
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 2.73e-01 0.0725 0.0659 0.261 Mono L1
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 5.33e-01 0.0607 0.0971 0.261 Mono L1
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0835 0.0657 0.261 Mono L1
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 2.56e-01 0.0844 0.0741 0.261 Mono L1
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 5.90e-01 0.0444 0.0822 0.261 Mono L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 7.36e-01 0.0242 0.0717 0.261 Mono L1
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0428 0.0734 0.261 Mono L1
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0157 0.0728 0.261 Mono L1
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0282 0.073 0.262 NK L1
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0882 0.0959 0.262 NK L1
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 3.99e-01 0.0468 0.0555 0.262 NK L1
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 6.44e-01 0.0303 0.0654 0.262 NK L1
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0204 0.0873 0.262 NK L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 2.79e-01 0.0973 0.0896 0.262 NK L1
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 6.55e-01 0.0289 0.0646 0.262 NK L1
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0918 0.0761 0.262 NK L1
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0512 0.0704 0.261 Other_T L1
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0346 0.0835 0.261 Other_T L1
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 5.72e-01 -0.043 0.076 0.261 Other_T L1
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 9.92e-01 0.000793 0.0758 0.261 Other_T L1
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 7.24e-01 0.0337 0.0951 0.261 Other_T L1
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0317 0.075 0.261 Other_T L1
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 7.94e-01 -0.019 0.0727 0.261 Other_T L1
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00736 0.0752 0.261 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 8.64e-01 0.0199 0.116 0.268 B_Activated L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000338 0.104 0.268 B_Activated L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 3.54e-01 0.099 0.106 0.268 B_Activated L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0104 0.103 0.268 B_Activated L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 4.25e-02 -0.227 0.111 0.268 B_Activated L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 2.07e-01 -0.143 0.113 0.268 B_Activated L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 6.28e-01 0.0548 0.113 0.268 B_Activated L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 3.96e-02 0.24 0.116 0.268 B_Activated L2
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 9.16e-01 0.00951 0.0903 0.268 B_Activated L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0314 0.0879 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 6.94e-01 0.0403 0.102 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 3.85e-01 -0.078 0.0895 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 6.99e-01 0.0314 0.0809 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0521 0.108 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 6.81e-01 0.0419 0.102 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0301 0.0775 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 1.08e-01 -0.144 0.0892 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0158 0.0989 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00825 0.0908 0.259 B_Memory L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0274 0.102 0.259 B_Memory L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 1.55e-01 -0.135 0.0947 0.259 B_Memory L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0764 0.0865 0.259 B_Memory L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0114 0.0987 0.259 B_Memory L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 9.23e-01 0.00938 0.0968 0.259 B_Memory L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 1.54e-01 0.128 0.0896 0.259 B_Memory L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 9.48e-01 0.00642 0.0978 0.259 B_Memory L2
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0106 0.0947 0.259 B_Memory L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0367 0.0764 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0491 0.1 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0326 0.0819 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0525 0.0716 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 1.33e-01 0.14 0.0925 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 9.82e-01 0.00211 0.0923 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 7.44e-01 0.0226 0.0692 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 6.89e-03 -0.228 0.0835 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 2.15e-01 -0.124 0.0998 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0562 0.087 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0686 0.101 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0589 0.0957 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0755 0.089 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 4.02e-01 0.0874 0.104 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000806 0.0902 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 8.95e-01 0.0132 0.1 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 9.82e-01 0.00227 0.098 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0358 0.101 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 5.78e-01 0.0524 0.094 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 5.74e-01 0.0536 0.0953 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 1.45e-01 0.14 0.0957 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0446 0.0948 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0808 0.1 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0349 0.0976 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00666 0.0948 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 1.83e-01 0.117 0.0872 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0417 0.0791 0.261 CD4_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0485 0.0641 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 6.38e-01 0.0434 0.0923 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0459 0.0535 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 6.54e-01 -0.022 0.0489 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0373 0.0813 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 2.12e-01 0.103 0.0819 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 6.14e-01 0.0265 0.0525 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0517 0.0563 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0236 0.0981 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 5.70e-01 -0.043 0.0755 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 5.77e-02 -0.193 0.101 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 6.69e-01 0.0257 0.06 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0699 0.0569 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 6.47e-01 0.04 0.0872 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0303 0.0887 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 9.16e-01 0.00665 0.0633 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 7.00e-01 0.0288 0.0747 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 7.36e-02 -0.183 0.102 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 7.22e-01 0.0337 0.0945 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 5.91e-01 0.0561 0.104 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0608 0.0846 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 3.02e-01 0.0802 0.0776 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 2.95e-01 0.105 0.0997 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 1.38e-01 -0.153 0.102 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 2.67e-01 0.0861 0.0773 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 6.74e-01 -0.038 0.0903 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00122 0.0948 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 4.65e-01 0.0611 0.0834 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0154 0.0984 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0414 0.0801 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0143 0.0749 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 1.67e-01 0.129 0.0929 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0539 0.0911 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 8.90e-01 0.0119 0.0855 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 3.29e-01 0.0861 0.088 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 9.51e-01 0.00528 0.0864 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0401 0.0949 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 1.07e-01 -0.113 0.0699 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 8.77e-01 0.0102 0.0653 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 3.67e-01 0.0867 0.0959 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0221 0.0964 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 2.28e-02 0.154 0.0671 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 2.26e-01 -0.085 0.07 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 1.24e-01 0.158 0.102 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0222 0.102 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 9.34e-01 0.00741 0.0897 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 2.41e-01 0.0904 0.0769 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 1.90e-01 -0.137 0.104 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 3.89e-01 0.0923 0.107 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0138 0.0894 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 8.03e-01 0.024 0.0957 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 2.72e-01 0.106 0.0965 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 7.52e-01 0.0323 0.102 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 8.42e-01 0.0191 0.0958 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 2.26e-01 -0.123 0.102 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 3.55e-01 0.0978 0.105 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 4.60e-01 0.0764 0.103 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 8.19e-02 -0.158 0.0901 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0587 0.102 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0782 0.0935 0.26 MAIT L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 8.92e-01 0.0143 0.105 0.26 MAIT L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 1.40e-01 -0.13 0.0876 0.26 MAIT L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0993 0.0883 0.26 MAIT L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 3.90e-01 0.0897 0.104 0.26 MAIT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00721 0.104 0.26 MAIT L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0433 0.0999 0.26 MAIT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00611 0.0944 0.26 MAIT L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 4.49e-01 0.0779 0.103 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0133 0.102 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0928 0.0959 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 4.85e-01 0.0628 0.0898 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 5.79e-01 0.0589 0.106 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 2.42e-01 -0.121 0.104 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 2.53e-01 0.108 0.0943 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 4.74e-01 0.0735 0.102 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0623 0.0745 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0798 0.101 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 1.87e-01 0.0922 0.0696 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0122 0.0708 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00637 0.0983 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 7.64e-01 0.0293 0.0976 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 9.31e-01 0.00684 0.0787 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 3.44e-02 -0.183 0.0861 0.263 NK_CD56dim L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0205 0.102 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 8.69e-01 0.0169 0.103 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 7.55e-02 -0.187 0.105 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 2.54e-01 0.11 0.0961 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 2.59e-01 -0.125 0.111 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 4.10e-01 0.0926 0.112 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 9.99e-01 0.000137 0.102 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 3.00e-01 -0.112 0.107 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 9.21e-01 0.00821 0.0827 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0489 0.102 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 8.04e-02 0.137 0.0778 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 2.17e-01 0.0977 0.0789 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 1.11e-01 -0.153 0.0955 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 3.84e-01 0.0822 0.0942 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0522 0.0746 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 7.64e-01 0.0273 0.0906 0.263 NK_cytokine L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 3.30e-01 0.118 0.12 0.281 PB L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0682 0.109 0.281 PB L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 7.33e-01 0.0348 0.102 0.281 PB L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 2.68e-01 0.135 0.122 0.281 PB L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 3.06e-01 0.128 0.124 0.281 PB L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 5.74e-01 0.0665 0.118 0.281 PB L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00549 0.126 0.281 PB L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 3.81e-02 -0.214 0.102 0.281 PB L2
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 3.61e-01 -0.109 0.118 0.281 PB L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 3.78e-01 0.077 0.0871 0.259 Pro_T L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000987 0.0892 0.259 Pro_T L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0591 0.0977 0.259 Pro_T L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 3.22e-02 -0.194 0.0898 0.259 Pro_T L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 5.22e-01 0.0691 0.108 0.259 Pro_T L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0976 0.0921 0.259 Pro_T L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0142 0.0951 0.259 Pro_T L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 9.90e-01 0.00118 0.0899 0.259 Pro_T L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 4.04e-01 0.0757 0.0905 0.261 Treg L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 6.17e-01 0.0546 0.109 0.261 Treg L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 9.90e-01 0.00117 0.0899 0.261 Treg L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 1.00e-01 0.125 0.0756 0.261 Treg L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 5.13e-01 0.066 0.101 0.261 Treg L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0971 0.105 0.261 Treg L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 1.56e-01 -0.106 0.0746 0.261 Treg L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 2.03e-01 0.129 0.101 0.261 Treg L2
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 6.26e-02 -0.184 0.0983 0.261 Treg L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 6.36e-01 0.0476 0.101 0.249 cDC L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00789 0.113 0.249 cDC L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0858 0.104 0.249 cDC L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 2.12e-01 0.119 0.0947 0.249 cDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 6.08e-01 0.0579 0.112 0.249 cDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 4.28e-03 0.315 0.109 0.249 cDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 8.92e-01 0.014 0.103 0.249 cDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 3.73e-01 0.0859 0.0961 0.249 cDC L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 4.13e-01 0.0659 0.0804 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 8.77e-01 0.0154 0.0995 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0129 0.0759 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 3.75e-01 0.0646 0.0727 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 7.07e-02 0.16 0.0879 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0425 0.0778 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0168 0.0798 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 1.29e-01 -0.115 0.0751 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 1.44e-01 0.112 0.0767 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 6.84e-01 0.0414 0.102 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 1.83e-01 -0.128 0.0962 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 1.32e-01 0.14 0.0927 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0663 0.098 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 2.82e-01 0.102 0.0941 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 1.85e-01 -0.126 0.095 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 5.69e-01 0.059 0.103 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00254 0.131 0.261 gdT L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 4.40e-01 0.101 0.13 0.261 gdT L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 2.83e-01 0.133 0.124 0.261 gdT L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 8.78e-02 0.195 0.113 0.261 gdT L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 3.91e-01 -0.106 0.123 0.261 gdT L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 6.33e-01 0.0564 0.118 0.261 gdT L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 1.13e-01 -0.182 0.114 0.261 gdT L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0585 0.128 0.261 gdT L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 2.72e-01 0.107 0.0974 0.256 intMono L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 9.71e-01 0.00378 0.104 0.256 intMono L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 2.69e-01 -0.102 0.0925 0.256 intMono L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0506 0.101 0.256 intMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0108 0.104 0.256 intMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 1.78e-01 -0.141 0.104 0.256 intMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0266 0.101 0.256 intMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 7.13e-01 0.0399 0.108 0.256 intMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 5.53e-01 0.0577 0.0969 0.253 ncMono L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 4.09e-01 0.0863 0.104 0.253 ncMono L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0425 0.0966 0.253 ncMono L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0288 0.105 0.253 ncMono L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0218 0.107 0.253 ncMono L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 9.73e-01 0.00344 0.1 0.253 ncMono L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0956 0.0876 0.253 ncMono L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 2.30e-01 -0.119 0.0989 0.253 ncMono L2
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 9.57e-01 -0.006 0.111 0.243 pDC L2
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 9.60e-01 0.00568 0.114 0.243 pDC L2
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 6.34e-01 0.0529 0.111 0.243 pDC L2
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 6.63e-01 0.0474 0.109 0.243 pDC L2
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 2.10e-01 0.142 0.113 0.243 pDC L2
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 6.65e-01 0.046 0.106 0.243 pDC L2
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 1.75e-01 -0.142 0.104 0.243 pDC L2
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0448 0.0867 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 9.02e-01 0.00999 0.0809 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 7.45e-01 0.0325 0.0998 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 8.58e-02 -0.138 0.0797 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 7.94e-01 0.0187 0.0716 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0625 0.0958 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 9.74e-01 0.00296 0.09 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 2.77e-01 0.0758 0.0696 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 3.33e-01 -0.081 0.0835 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 9.37e-01 0.00794 0.0998 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0959 0.0715 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0579 0.0936 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0311 0.0771 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0171 0.0686 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 4.94e-02 0.189 0.0958 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 9.12e-01 0.00921 0.083 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 5.85e-01 0.0375 0.0685 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 1.52e-02 -0.195 0.0797 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000229388 LINC01715 898445 sc-eQTL 1.86e-01 -0.133 0.0999 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 3.36e-01 0.0692 0.0718 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 4.97e-01 0.0654 0.0961 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0943 0.0717 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 1.49e-01 0.103 0.0711 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 1.41e-01 0.12 0.0812 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 7.56e-01 0.023 0.0738 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0448 0.0788 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0111 0.0765 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 3.66e-01 0.0793 0.0876 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 3.89e-01 0.0862 0.0999 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 2.52e-01 -0.101 0.088 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00687 0.101 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00471 0.0995 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0919 0.103 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0331 0.0948 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 8.61e-01 -0.018 0.103 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000116350 SRSF4 359773 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0598 0.0714 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000116353 MECR 310731 sc-eQTL 4.41e-01 -0.076 0.0985 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120656 TAF12 898588 sc-eQTL 1.85e-01 0.0763 0.0573 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000159023 EPB41 654582 sc-eQTL 7.03e-01 0.0256 0.0672 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000162419 GMEB1 872941 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0567 0.0913 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000180098 TRNAU1AP 988588 sc-eQTL 1.79e-01 0.123 0.0909 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197989 SNHG12 958541 sc-eQTL 8.87e-01 0.00973 0.0685 0.263 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198492 YTHDF2 805052 sc-eQTL 9.88e-02 -0.126 0.0763 0.263 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000116353 MECR 310731 eQTL 0.0515 -0.0428 0.022 0.00111 0.0 0.252
ENSG00000120656 TAF12 898588 eQTL 0.0248 -0.0208 0.00927 0.00153 0.0 0.252

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000060656 \N 305157 1.24e-06 9.07e-07 3.45e-07 5.11e-07 3.09e-07 4.63e-07 1.18e-06 3.65e-07 1.29e-06 4.15e-07 1.35e-06 5.98e-07 1.75e-06 2.67e-07 4.48e-07 8.28e-07 7.74e-07 5.99e-07 6.62e-07 6.8e-07 4.77e-07 1.22e-06 8.6e-07 6.51e-07 1.94e-06 4.27e-07 7.31e-07 6.89e-07 1.23e-06 1.11e-06 5.79e-07 1.54e-07 2.43e-07 6.8e-07 4.2e-07 4.5e-07 4.82e-07 1.46e-07 2.95e-07 2.42e-07 2.59e-07 1.43e-06 5.49e-08 2.63e-08 1.45e-07 1e-07 2.21e-07 7.81e-08 1.13e-07
ENSG00000162419 \N 872941 2.76e-07 1.27e-07 5.03e-08 1.81e-07 9.79e-08 9.91e-08 1.6e-07 5.43e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.52e-07 1.05e-07 1.53e-07 7.13e-08 6.12e-08 7.23e-08 4.01e-08 1.44e-07 6.07e-08 4.21e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.64e-08 1.55e-07 1.22e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.23e-07 1.05e-07 1.02e-07 3.68e-08 3.89e-08 8.56e-08 6.34e-08 3.28e-08 5.31e-08 8.93e-08 6.59e-08 3.8e-08 5.45e-08 1.4e-07 5.2e-08 1.76e-08 4.7e-08 1.86e-08 1.21e-07 3.79e-09 5.02e-08