Genes within 1Mb (chr6:139211611:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0574 0.111 0.111 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0382 0.0848 0.111 B L1
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 5.12e-01 0.0709 0.108 0.111 B L1
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 1.67e-01 -0.132 0.0951 0.111 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 8.55e-01 0.0103 0.0561 0.111 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -80387 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0299 0.137 0.111 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0764 0.0864 0.111 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -59751 sc-eQTL 5.33e-01 0.0601 0.0962 0.111 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 6.25e-02 -0.23 0.123 0.111 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 1.46e-01 -0.12 0.0826 0.111 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0883 0.103 0.111 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 9.52e-01 0.00492 0.081 0.111 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 1.18e-01 0.0928 0.0591 0.111 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 3.73e-02 -0.21 0.1 0.111 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 sc-eQTL 5.76e-03 -0.274 0.0982 0.111 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 9.84e-01 0.0027 0.135 0.111 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 7.86e-03 -0.234 0.0871 0.111 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0517 0.0968 0.111 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 8.22e-02 0.158 0.0905 0.111 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 3.53e-03 0.15 0.0508 0.111 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 2.77e-02 -0.216 0.0973 0.111 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 sc-eQTL 1.71e-01 -0.164 0.119 0.111 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 4.21e-02 -0.277 0.135 0.113 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 8.87e-02 -0.163 0.0954 0.113 DC L1
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 2.47e-01 -0.13 0.112 0.113 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 519040 sc-eQTL 2.69e-01 0.138 0.125 0.113 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 7.63e-01 0.0334 0.111 0.113 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 1.74e-01 0.147 0.108 0.113 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0465 0.129 0.113 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 519063 sc-eQTL 4.88e-01 -0.091 0.131 0.113 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 2.39e-01 -0.117 0.0995 0.111 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0104 0.0691 0.111 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0481 0.091 0.111 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 519040 sc-eQTL 4.78e-01 0.0926 0.13 0.111 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 4.76e-02 0.151 0.0757 0.111 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 6.50e-03 0.268 0.0977 0.111 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0103 0.105 0.111 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 519063 sc-eQTL 7.10e-01 0.0505 0.136 0.111 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0993 0.119 0.112 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 8.06e-02 -0.184 0.105 0.112 NK L1
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 3.22e-01 -0.102 0.103 0.112 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 4.35e-01 0.0769 0.0983 0.112 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 7.96e-04 0.238 0.0699 0.112 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0724 0.0954 0.112 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0812 0.143 0.111 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0707 0.0923 0.111 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 5.44e-01 0.0629 0.104 0.111 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 7.84e-01 0.0305 0.111 0.111 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 3.65e-01 0.0662 0.0728 0.111 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0517 0.0853 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 4.53e-01 -0.129 0.171 0.099 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0741 0.15 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0581 0.163 0.099 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0583 0.171 0.099 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0704 0.155 0.099 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -80387 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00527 0.132 0.099 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 4.77e-01 0.119 0.166 0.099 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -59751 sc-eQTL 3.77e-01 0.147 0.166 0.099 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0141 0.141 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0949 0.0976 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0887 0.122 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 8.39e-01 0.0268 0.132 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 5.91e-02 0.211 0.111 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -80387 sc-eQTL 1.71e-01 -0.188 0.137 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 1.89e-01 -0.166 0.126 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -59751 sc-eQTL 3.32e-01 0.133 0.137 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0907 0.142 0.11 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 6.27e-01 0.0519 0.107 0.11 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0245 0.123 0.11 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0213 0.133 0.11 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 3.90e-01 0.0904 0.105 0.11 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -80387 sc-eQTL 1.65e-01 0.186 0.133 0.11 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00513 0.123 0.11 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -59751 sc-eQTL 1.64e-01 -0.21 0.151 0.11 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 9.01e-01 0.0164 0.132 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0867 0.0927 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 7.01e-01 0.0442 0.115 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 1.39e-01 -0.158 0.106 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0101 0.0746 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -80387 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0297 0.14 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 1.91e-01 -0.133 0.101 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -59751 sc-eQTL 4.48e-01 0.101 0.133 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 3.47e-01 -0.122 0.129 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 4.20e-01 0.0715 0.0885 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 8.44e-02 0.21 0.121 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 9.46e-01 0.00794 0.116 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 1.96e-01 -0.111 0.0854 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -80387 sc-eQTL 9.18e-01 0.0139 0.136 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0937 0.138 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -59751 sc-eQTL 3.23e-01 0.126 0.127 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 8.19e-01 0.0314 0.137 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 6.07e-01 -0.061 0.118 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 4.34e-01 -0.108 0.138 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0937 0.134 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 4.04e-01 0.102 0.122 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0797 0.123 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 sc-eQTL 3.35e-02 -0.269 0.125 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 6.83e-02 -0.237 0.129 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0736 0.0812 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0536 0.101 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00248 0.0899 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 6.11e-01 0.0308 0.0605 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 3.26e-02 -0.219 0.102 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 sc-eQTL 7.64e-03 -0.275 0.102 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 8.82e-01 -0.019 0.128 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 1.47e-02 -0.23 0.0937 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 4.87e-01 -0.071 0.102 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0389 0.0968 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 3.32e-02 0.158 0.0737 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 3.07e-01 -0.113 0.11 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 sc-eQTL 1.88e-01 -0.157 0.119 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 2.27e-02 -0.328 0.143 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0961 0.0985 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0104 0.113 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 8.18e-01 0.0284 0.123 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 1.79e-01 0.117 0.0872 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 8.65e-02 -0.197 0.114 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 sc-eQTL 1.10e-01 -0.192 0.12 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0909 0.147 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 3.64e-02 -0.219 0.104 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 9.05e-01 0.0128 0.107 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 1.97e-02 0.266 0.113 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 2.80e-04 0.332 0.0898 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 2.78e-01 -0.117 0.108 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 sc-eQTL 6.15e-03 -0.352 0.127 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 3.56e-01 0.131 0.142 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 4.58e-02 -0.181 0.0899 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0662 0.109 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 5.07e-01 0.0729 0.11 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 5.82e-02 0.109 0.0571 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 1.19e-02 -0.291 0.115 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0535 0.133 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 3.01e-01 -0.16 0.154 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0874 0.108 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0602 0.113 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 1.48e-01 0.17 0.117 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 1.33e-01 0.176 0.116 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 2.05e-01 -0.152 0.12 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 sc-eQTL 3.88e-01 0.11 0.127 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0282 0.145 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 2.52e-01 -0.151 0.132 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 1.03e-01 -0.221 0.135 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0232 0.141 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 5.10e-01 0.0718 0.109 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0811 0.118 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 sc-eQTL 3.78e-01 -0.119 0.134 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0145 0.155 0.113 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 3.41e-01 -0.102 0.107 0.113 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 4.53e-01 0.0883 0.118 0.113 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 8.87e-01 0.018 0.127 0.113 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 2.64e-01 -0.104 0.0929 0.113 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 5.72e-01 0.062 0.11 0.113 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 4.61e-01 -0.105 0.142 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00739 0.121 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 3.73e-01 -0.115 0.129 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 1.05e-01 0.195 0.12 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 1.03e-04 0.424 0.107 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 2.26e-01 0.144 0.119 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 8.20e-01 0.0294 0.129 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 3.81e-01 -0.1 0.114 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0425 0.111 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0614 0.105 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 2.66e-03 0.212 0.0696 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 2.76e-01 -0.103 0.0946 0.112 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0497 0.153 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 6.33e-02 -0.241 0.129 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 2.41e-01 -0.168 0.143 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 4.01e-01 -0.119 0.141 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 3.76e-01 0.103 0.116 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0868 0.124 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 2.01e-02 -0.31 0.132 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 1.82e-02 -0.271 0.114 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0732 0.115 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 4.04e-01 0.0994 0.119 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 3.68e-02 0.16 0.0759 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0101 0.1 0.112 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 1.58e-01 0.257 0.181 0.093 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0122 0.162 0.093 PB L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 4.11e-01 0.163 0.198 0.093 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 7.92e-01 0.0467 0.176 0.093 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 1.07e-02 0.312 0.12 0.093 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -80387 sc-eQTL 6.11e-01 -0.092 0.18 0.093 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 7.06e-01 0.0514 0.136 0.093 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -59751 sc-eQTL 8.64e-01 0.0314 0.182 0.093 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 8.41e-01 0.0298 0.148 0.111 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 9.25e-01 0.0111 0.118 0.111 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 3.93e-01 0.0996 0.116 0.111 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00274 0.137 0.111 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 8.44e-02 0.152 0.0879 0.111 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 3.05e-01 -0.108 0.105 0.111 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 3.57e-01 -0.128 0.138 0.111 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0795 0.0944 0.111 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0223 0.115 0.111 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 8.48e-01 0.0229 0.119 0.111 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 4.41e-01 0.0782 0.101 0.111 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 1.84e-01 -0.15 0.113 0.111 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 sc-eQTL 7.56e-02 0.229 0.128 0.111 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 2.05e-02 -0.314 0.134 0.11 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0719 0.0975 0.11 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 6.16e-01 -0.065 0.129 0.11 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 519040 sc-eQTL 8.42e-01 0.0252 0.127 0.11 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0332 0.146 0.11 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 5.16e-02 0.232 0.118 0.11 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 8.05e-01 0.0314 0.127 0.11 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519063 sc-eQTL 1.23e-01 -0.215 0.139 0.11 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0892 0.108 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0167 0.0777 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 2.33e-01 -0.107 0.0891 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 519040 sc-eQTL 1.52e-01 0.187 0.13 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 2.86e-01 0.124 0.116 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 2.09e-03 0.298 0.0956 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 8.06e-01 0.0252 0.102 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519063 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00143 0.136 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 2.61e-01 -0.139 0.124 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 9.85e-01 0.00163 0.0848 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0357 0.105 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 519040 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0176 0.133 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 6.88e-01 0.0505 0.126 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 2.32e-02 0.247 0.108 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 5.82e-01 0.0597 0.108 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519063 sc-eQTL 6.43e-01 0.0676 0.145 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 2.96e-01 -0.169 0.161 0.118 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 8.42e-01 0.0308 0.154 0.118 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 4.58e-01 0.114 0.153 0.118 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 7.14e-01 0.0584 0.159 0.118 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 6.59e-01 0.0529 0.12 0.118 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0799 0.138 0.118 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0966 0.144 0.113 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 2.11e-01 -0.121 0.0963 0.113 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 7.94e-01 0.0309 0.118 0.113 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 519040 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0609 0.13 0.113 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0147 0.135 0.113 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 1.86e-01 0.162 0.122 0.113 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 7.98e-01 0.0306 0.119 0.113 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519063 sc-eQTL 4.75e-01 -0.104 0.146 0.113 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00158 0.133 0.113 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0648 0.0792 0.113 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 7.48e-01 0.0392 0.122 0.113 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 519040 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0584 0.128 0.113 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 1.39e-01 0.142 0.0958 0.113 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 1.11e-03 0.374 0.113 0.113 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 5.55e-01 0.0582 0.0984 0.113 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519063 sc-eQTL 4.17e-01 0.115 0.142 0.113 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0568 0.159 0.107 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0865 0.123 0.107 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0869 0.134 0.107 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 519040 sc-eQTL 4.13e-01 0.101 0.123 0.107 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 3.90e-01 0.107 0.124 0.107 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 4.11e-01 0.112 0.136 0.107 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 2.74e-01 -0.175 0.159 0.107 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 519063 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0764 0.123 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0988 0.133 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0196 0.0924 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0947 0.119 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0101 0.123 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 3.43e-01 0.0809 0.0851 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -80387 sc-eQTL 5.72e-01 0.08 0.141 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0421 0.12 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -59751 sc-eQTL 7.33e-01 0.0477 0.139 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0491 0.123 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0342 0.0853 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 3.51e-01 0.107 0.115 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 2.60e-01 -0.111 0.0979 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 1.29e-01 -0.104 0.0685 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -80387 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0552 0.144 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 3.44e-01 -0.099 0.104 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -59751 sc-eQTL 2.46e-01 0.143 0.123 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 1.87e-01 -0.132 0.0996 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 8.51e-01 0.014 0.0745 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 4.35e-01 -0.07 0.0895 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 519040 sc-eQTL 2.64e-01 0.146 0.131 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 2.80e-01 0.116 0.108 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 3.92e-03 0.274 0.094 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 8.31e-01 0.0225 0.105 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 519063 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0122 0.141 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0508 0.134 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 1.57e-01 -0.101 0.0711 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 5.52e-01 0.068 0.114 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 519040 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0763 0.127 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 1.67e-01 0.109 0.0787 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 5.92e-03 0.316 0.114 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 5.44e-01 0.0606 0.0996 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 519063 sc-eQTL 5.10e-01 0.0924 0.14 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0715 0.124 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 808080 sc-eQTL 4.32e-02 -0.217 0.107 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 76531 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0828 0.106 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 223350 sc-eQTL 6.81e-01 0.0426 0.103 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 182866 sc-eQTL 1.21e-03 0.214 0.0652 0.112 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -163037 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0866 0.0964 0.112 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 438102 eQTL 0.00205 -0.0818 0.0265 0.0 0.0 0.101
ENSG00000112406 HECA 76531 eQTL 2.57e-05 0.0666 0.0157 0.0 0.0 0.101
ENSG00000135597 REPS1 223350 eQTL 0.561 -0.0164 0.0282 0.00123 0.0 0.101
ENSG00000146386 ABRACL 182866 eQTL 0.0192 0.0905 0.0386 0.0 0.0 0.101
ENSG00000164442 CITED2 -163037 eQTL 0.0607 -0.0705 0.0375 0.00114 0.0 0.101
ENSG00000218565 AL592429.1 -126407 eQTL 0.0266 -0.081 0.0364 0.0 0.0 0.101
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 eQTL 0.0426 -0.0613 0.0302 0.0 0.0 0.101


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA 76531 5.75e-06 6.3e-06 9.56e-07 3.47e-06 1.84e-06 1.71e-06 8.56e-06 1.28e-06 4.7e-06 3.25e-06 8.05e-06 3.14e-06 1.02e-05 2.32e-06 1.01e-06 4.51e-06 3.53e-06 3.77e-06 2.25e-06 2.15e-06 3.08e-06 6.89e-06 5.31e-06 2.32e-06 8.8e-06 2.38e-06 3.16e-06 2.1e-06 6.87e-06 7.58e-06 3.38e-06 5.62e-07 9.28e-07 2.77e-06 2.22e-06 2.1e-06 1.36e-06 8.34e-07 1.32e-06 8.87e-07 9.79e-07 8.22e-06 6.73e-07 1.64e-07 7.38e-07 8.35e-07 9.29e-07 7.01e-07 5.6e-07
ENSG00000231329 AL031772.1 -28042 1.1e-05 1.26e-05 2.5e-06 7.53e-06 2.44e-06 5.83e-06 1.65e-05 2.43e-06 1.18e-05 6e-06 1.6e-05 6.66e-06 2.28e-05 4.48e-06 4.1e-06 8.04e-06 7.66e-06 1.12e-05 4.11e-06 3.93e-06 6.88e-06 1.21e-05 1.24e-05 4.9e-06 2.14e-05 5e-06 7.13e-06 5.29e-06 1.5e-05 1.58e-05 7.73e-06 1.11e-06 1.67e-06 4.4e-06 5.76e-06 3.9e-06 2.05e-06 2.4e-06 3.15e-06 2.1e-06 1.63e-06 1.57e-05 1.63e-06 3.59e-07 1.84e-06 2.32e-06 2.15e-06 1.2e-06 9.67e-07