Genes within 1Mb (chr6:139195396:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 1.38e-01 -0.143 0.0959 0.188 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 1.63e-01 -0.103 0.0732 0.188 B L1
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0117 0.0938 0.188 B L1
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 3.78e-02 -0.171 0.082 0.188 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0298 0.0486 0.188 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -96602 sc-eQTL 8.07e-02 -0.208 0.118 0.188 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 1.42e-01 -0.11 0.0747 0.188 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -75966 sc-eQTL 5.45e-02 0.16 0.0828 0.188 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 3.43e-02 -0.224 0.105 0.188 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 7.99e-02 -0.125 0.071 0.188 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 1.80e-01 -0.119 0.0884 0.188 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0809 0.0696 0.188 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 5.15e-02 0.0994 0.0507 0.188 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 1.10e-02 -0.221 0.0861 0.188 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 sc-eQTL 5.53e-02 -0.165 0.0854 0.188 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0584 0.117 0.188 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 4.15e-02 -0.155 0.0756 0.188 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 2.14e-01 -0.104 0.0832 0.188 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 4.21e-01 0.0633 0.0784 0.188 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 3.24e-02 0.0952 0.0442 0.188 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 3.40e-02 -0.179 0.084 0.188 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 sc-eQTL 5.61e-02 -0.196 0.102 0.188 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 3.81e-02 -0.239 0.115 0.194 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 2.06e-02 -0.187 0.0804 0.194 DC L1
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 7.91e-01 0.0253 0.0954 0.194 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 502825 sc-eQTL 4.54e-01 0.0796 0.106 0.194 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0278 0.0939 0.194 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 7.23e-02 0.165 0.0913 0.194 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0898 0.109 0.194 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 502848 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00343 0.111 0.194 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0804 0.085 0.188 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 9.10e-01 0.00667 0.0589 0.188 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0622 0.0776 0.188 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 502825 sc-eQTL 4.79e-01 0.0788 0.111 0.188 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00245 0.0652 0.188 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 4.71e-02 0.168 0.084 0.188 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 6.26e-01 0.0438 0.0896 0.188 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 502848 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0669 0.116 0.188 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 3.72e-02 -0.218 0.104 0.189 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 1.81e-01 -0.124 0.0921 0.189 NK L1
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0929 0.0905 0.189 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 1.51e-01 -0.124 0.086 0.189 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 1.17e-02 0.158 0.0621 0.189 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 4.53e-01 -0.063 0.0837 0.189 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 2.34e-01 -0.145 0.121 0.188 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 2.33e-02 -0.177 0.0776 0.188 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0422 0.088 0.188 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0978 0.0944 0.188 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 7.75e-02 0.109 0.0615 0.188 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0807 0.0724 0.188 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0912 0.146 0.186 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0332 0.128 0.186 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00962 0.14 0.186 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 1.68e-01 -0.201 0.145 0.186 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 3.85e-01 -0.115 0.132 0.186 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -96602 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0762 0.113 0.186 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 1.48e-01 0.206 0.142 0.186 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -75966 sc-eQTL 9.50e-01 0.00893 0.142 0.186 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 9.67e-01 0.00502 0.12 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 2.06e-01 -0.105 0.0827 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 2.12e-01 -0.129 0.103 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 5.16e-01 0.0728 0.112 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 2.95e-01 0.0999 0.0951 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -96602 sc-eQTL 3.68e-01 -0.105 0.117 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 1.47e-01 -0.156 0.107 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -75966 sc-eQTL 1.46e-01 0.169 0.116 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 1.45e-01 -0.177 0.121 0.188 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0759 0.0916 0.188 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 9.74e-01 0.00345 0.105 0.188 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0535 0.114 0.188 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0161 0.0903 0.188 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -96602 sc-eQTL 2.82e-01 -0.124 0.115 0.188 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00598 0.106 0.188 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -75966 sc-eQTL 2.38e-01 0.153 0.13 0.188 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 3.12e-01 -0.116 0.114 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 1.23e-01 -0.124 0.0799 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0463 0.0996 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 1.53e-01 -0.132 0.0918 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 7.11e-01 -0.024 0.0645 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -96602 sc-eQTL 3.44e-01 -0.114 0.121 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0966 0.0876 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -75966 sc-eQTL 4.79e-01 0.0817 0.115 0.188 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0785 0.113 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 6.95e-01 0.0304 0.0774 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 2.84e-01 0.114 0.106 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 2.54e-01 -0.116 0.101 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0789 0.0747 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -96602 sc-eQTL 6.51e-01 0.0537 0.119 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 1.94e-01 -0.157 0.12 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -75966 sc-eQTL 5.98e-01 0.0587 0.111 0.187 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 2.15e-01 -0.146 0.118 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 1.06e-01 -0.164 0.101 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0979 0.119 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 7.96e-02 -0.202 0.115 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 1.30e-01 0.159 0.105 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0295 0.106 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 sc-eQTL 4.89e-02 -0.214 0.108 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 2.29e-02 -0.252 0.11 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0839 0.0692 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0917 0.0863 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0736 0.0766 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 7.57e-01 0.016 0.0516 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 3.95e-03 -0.251 0.086 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 sc-eQTL 3.98e-02 -0.182 0.0878 0.188 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0396 0.109 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 8.22e-03 -0.213 0.0798 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 1.51e-01 -0.125 0.0868 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0752 0.0826 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 2.53e-02 0.142 0.0629 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 1.91e-02 -0.22 0.0934 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 sc-eQTL 1.71e-01 -0.14 0.102 0.188 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 4.03e-02 -0.253 0.122 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0237 0.0842 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0546 0.0961 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 6.72e-01 0.0444 0.105 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 2.10e-01 0.0937 0.0745 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 2.50e-01 -0.113 0.0978 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0413 0.103 0.188 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 3.89e-01 -0.11 0.127 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 2.69e-01 -0.101 0.0908 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 7.75e-01 0.0265 0.0928 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 3.83e-01 0.0866 0.0992 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 2.70e-02 0.177 0.0794 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 9.01e-01 0.0117 0.0936 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 sc-eQTL 2.32e-03 -0.339 0.11 0.188 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0957 0.121 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 2.75e-02 -0.17 0.0766 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 1.17e-01 -0.146 0.093 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00976 0.0938 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 5.38e-01 0.0303 0.0492 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 3.24e-02 -0.212 0.0984 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0755 0.114 0.188 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0487 0.133 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 1.53e-01 -0.134 0.0932 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0102 0.0975 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 2.10e-01 0.127 0.101 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 6.97e-01 0.0393 0.101 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0814 0.104 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 sc-eQTL 7.47e-01 0.0353 0.11 0.188 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0803 0.125 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0432 0.114 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 1.04e-01 -0.19 0.116 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00587 0.122 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 9.64e-01 -0.0042 0.0939 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 9.17e-01 0.0106 0.102 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 sc-eQTL 8.49e-01 0.0222 0.116 0.187 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 4.11e-01 -0.109 0.132 0.188 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 9.09e-02 -0.155 0.0913 0.188 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 2.23e-01 -0.123 0.1 0.188 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0849 0.108 0.188 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0568 0.0797 0.188 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00583 0.0939 0.188 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0708 0.122 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0556 0.104 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0208 0.111 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 8.64e-01 0.0177 0.104 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 9.83e-03 0.245 0.0939 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 1.93e-01 0.133 0.102 0.184 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 1.45e-01 -0.164 0.112 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0443 0.1 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 5.24e-01 -0.062 0.0972 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 3.12e-02 -0.198 0.0912 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 4.42e-02 0.125 0.0618 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0943 0.083 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 3.28e-01 -0.127 0.13 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 8.84e-02 -0.188 0.11 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 1.53e-01 -0.174 0.121 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0867 0.12 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 5.74e-02 0.187 0.0979 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000691 0.106 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 4.52e-03 -0.327 0.114 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 9.36e-02 -0.167 0.0993 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 2.48e-01 -0.115 0.0996 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0372 0.103 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 9.11e-02 0.112 0.066 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0645 0.0867 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 1.94e-01 0.187 0.143 0.2 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 9.84e-02 0.211 0.126 0.2 PB L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 7.39e-01 0.0523 0.157 0.2 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 3.23e-01 0.138 0.139 0.2 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 5.52e-04 0.329 0.0924 0.2 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -96602 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0656 0.142 0.2 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 1.37e-01 -0.159 0.106 0.2 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -75966 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0641 0.144 0.2 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0673 0.127 0.183 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0777 0.101 0.183 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 3.42e-01 0.0954 0.1 0.183 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 9.08e-01 0.0136 0.118 0.183 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 4.25e-02 0.154 0.0755 0.183 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0566 0.0907 0.183 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 2.23e-01 -0.146 0.119 0.188 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0847 0.0815 0.188 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 7.74e-01 0.0285 0.0994 0.188 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 1.44e-01 -0.15 0.102 0.188 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 1.04e-01 0.142 0.0871 0.188 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 9.11e-01 0.0109 0.0978 0.188 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 sc-eQTL 2.28e-01 0.135 0.112 0.188 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 1.13e-01 -0.185 0.116 0.193 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 2.48e-02 -0.187 0.0826 0.193 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 1.19e-01 -0.173 0.11 0.193 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 502825 sc-eQTL 6.72e-01 0.0461 0.109 0.193 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 7.87e-01 0.0339 0.125 0.193 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 8.16e-02 0.178 0.102 0.193 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 9.78e-01 -0.003 0.109 0.193 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 502848 sc-eQTL 7.00e-01 0.0462 0.12 0.193 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0979 0.093 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0133 0.067 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0929 0.0768 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 502825 sc-eQTL 2.09e-01 0.141 0.112 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 5.52e-01 0.0596 0.1 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 1.54e-02 0.203 0.0831 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0257 0.0881 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 502848 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0842 0.117 0.188 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0264 0.107 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 6.50e-01 0.0332 0.0731 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 6.11e-01 -0.046 0.0903 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 502825 sc-eQTL 3.22e-01 -0.113 0.114 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 8.40e-01 0.0218 0.108 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 2.12e-02 0.216 0.093 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 3.52e-01 0.0869 0.0931 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 502848 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00711 0.125 0.188 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 4.62e-01 -0.101 0.137 0.197 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 9.38e-03 -0.337 0.128 0.197 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 8.61e-01 0.023 0.131 0.197 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 4.56e-02 -0.269 0.133 0.197 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 3.36e-02 0.215 0.1 0.197 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0882 0.117 0.197 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 2.79e-01 -0.135 0.124 0.187 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00754 0.0837 0.187 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 7.83e-01 0.0282 0.102 0.187 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 502825 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0622 0.113 0.187 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 9.61e-01 0.0057 0.117 0.187 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 2.83e-02 0.232 0.105 0.187 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 3.44e-01 0.0978 0.103 0.187 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 502848 sc-eQTL 2.07e-01 -0.16 0.126 0.187 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00383 0.115 0.19 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 1.18e-01 -0.107 0.0683 0.19 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 7.52e-01 0.0333 0.105 0.19 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 502825 sc-eQTL 7.44e-01 0.0361 0.111 0.19 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0392 0.0833 0.19 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 2.71e-02 0.221 0.0992 0.19 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 3.54e-01 0.079 0.085 0.19 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 502848 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0358 0.123 0.19 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 3.13e-01 -0.13 0.129 0.186 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 1.31e-01 -0.152 0.0999 0.186 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 5.23e-01 0.0701 0.109 0.186 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 502825 sc-eQTL 7.13e-01 0.0369 0.1 0.186 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0345 0.101 0.186 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0817 0.111 0.186 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 2.36e-01 -0.154 0.13 0.186 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 502848 sc-eQTL 4.40e-02 -0.202 0.0993 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 3.67e-01 -0.103 0.114 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 1.46e-01 -0.115 0.079 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0375 0.102 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0416 0.106 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 4.86e-01 0.051 0.0732 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -96602 sc-eQTL 9.43e-02 -0.203 0.121 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0965 0.103 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -75966 sc-eQTL 2.20e-02 0.273 0.118 0.188 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 1.85e-01 -0.142 0.107 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0794 0.074 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 9.35e-01 0.00814 0.1 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 3.72e-02 -0.177 0.0844 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0708 0.0596 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -96602 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0399 0.125 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 1.59e-01 -0.128 0.0906 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -75966 sc-eQTL 3.88e-01 0.0923 0.107 0.188 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0812 0.0857 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000277 0.064 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0848 0.0768 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 502825 sc-eQTL 7.24e-01 0.0398 0.113 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 5.05e-01 0.0618 0.0926 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 1.72e-02 0.195 0.0813 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000982 0.0903 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 502848 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0847 0.121 0.188 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0108 0.116 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0836 0.0617 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 7.94e-01 0.0259 0.099 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 502825 sc-eQTL 8.88e-01 0.0155 0.11 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0613 0.0684 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 2.61e-02 0.222 0.0992 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 5.10e-01 0.0571 0.0864 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 502848 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0535 0.122 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 421887 sc-eQTL 2.49e-02 -0.242 0.107 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 791865 sc-eQTL 1.57e-01 -0.133 0.0936 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 60316 sc-eQTL 2.48e-01 -0.107 0.0922 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 207135 sc-eQTL 2.14e-01 -0.112 0.09 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 166651 sc-eQTL 3.70e-02 0.121 0.0577 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -179252 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0635 0.0842 0.19 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 791865 eQTL 0.0316 -0.0515 0.0239 0.0 0.0 0.214
ENSG00000112406 HECA 60316 eQTL 3.48e-11 0.0764 0.0114 0.00279 0.00332 0.214
ENSG00000146386 ABRACL 166651 eQTL 0.00018 0.106 0.0282 0.0 0.0 0.214
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 eQTL 0.00819 -0.0586 0.0221 0.0 0.0 0.214


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA 60316 7.81e-06 9.31e-06 1.25e-06 4.37e-06 2.44e-06 4.07e-06 9.75e-06 1.81e-06 7.74e-06 4.75e-06 1.06e-05 4.92e-06 1.21e-05 3.87e-06 2.19e-06 6.09e-06 3.74e-06 6.33e-06 2.63e-06 2.79e-06 4.72e-06 7.99e-06 6.85e-06 3.29e-06 1.23e-05 3.55e-06 4.48e-06 3.27e-06 8.58e-06 7.97e-06 4.57e-06 9.97e-07 1.24e-06 3.12e-06 3.62e-06 2.36e-06 1.72e-06 2.07e-06 2.01e-06 1e-06 9.58e-07 9.72e-06 1.31e-06 1.88e-07 8.32e-07 1.62e-06 1.38e-06 7.32e-07 4.6e-07
ENSG00000146386 ABRACL 166651 2.77e-06 2.49e-06 5.75e-07 1.96e-06 7.88e-07 8.08e-07 2.08e-06 8.52e-07 2.28e-06 1.23e-06 2.52e-06 1.49e-06 3.64e-06 1.39e-06 9.21e-07 1.79e-06 1.58e-06 2.25e-06 1.51e-06 1.39e-06 1.39e-06 3.12e-06 2.7e-06 1.54e-06 3.74e-06 1.07e-06 1.46e-06 1.8e-06 2.66e-06 2.29e-06 1.86e-06 4.53e-07 6.23e-07 1.35e-06 1.54e-06 9.73e-07 8.38e-07 4.48e-07 1.33e-06 4.35e-07 2.08e-07 3.31e-06 5.93e-07 1.87e-07 3.65e-07 3.72e-07 8.59e-07 2.07e-07 1.78e-07
ENSG00000231329 AL031772.1 -44257 9.21e-06 9.99e-06 1.93e-06 6.02e-06 2.38e-06 4.65e-06 1.16e-05 2.23e-06 1e-05 5.36e-06 1.28e-05 5.74e-06 1.62e-05 3.59e-06 3.17e-06 6.6e-06 5.31e-06 8.43e-06 2.99e-06 2.95e-06 6.18e-06 1.02e-05 9.43e-06 3.58e-06 1.57e-05 4.39e-06 5.27e-06 4.66e-06 1.2e-05 1.06e-05 5.93e-06 9.76e-07 1.29e-06 3.63e-06 4.77e-06 2.87e-06 1.79e-06 2.04e-06 1.99e-06 1.2e-06 1.11e-06 1.28e-05 1.39e-06 2.52e-07 9.58e-07 1.75e-06 1.79e-06 6.52e-07 5e-07