Genes within 1Mb (chr6:139077665:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 8.49e-01 0.0172 0.0904 0.197 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0259 0.0689 0.197 B L1
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0555 0.0687 0.197 B L1
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 3.24e-01 0.0866 0.0877 0.197 B L1
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 1.47e-01 -0.112 0.0773 0.197 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0203 0.0456 0.197 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -214333 sc-eQTL 9.93e-01 0.001 0.112 0.197 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 3.86e-01 -0.061 0.0703 0.197 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -193697 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0892 0.078 0.197 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 9.39e-01 0.00758 0.099 0.197 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0399 0.0664 0.197 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0738 0.0625 0.197 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 7.58e-01 0.0254 0.0826 0.197 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 1.02e-01 0.106 0.0645 0.197 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 1.47e-03 0.15 0.0465 0.197 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0607 0.0812 0.197 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -161988 sc-eQTL 8.98e-01 0.0103 0.0802 0.197 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0788 0.109 0.197 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0599 0.0713 0.197 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 3.03e-01 0.075 0.0726 0.197 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 7.42e-01 0.0258 0.0781 0.197 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 5.35e-01 0.0457 0.0734 0.197 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 2.77e-03 0.124 0.041 0.197 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0299 0.0794 0.197 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -161988 sc-eQTL 2.99e-01 -0.1 0.0962 0.197 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 2.09e-01 -0.141 0.112 0.196 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0129 0.0791 0.196 DC L1
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 9.83e-01 0.00197 0.0927 0.196 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 385094 sc-eQTL 3.96e-01 0.0875 0.103 0.196 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 1.49e-01 -0.132 0.0907 0.196 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 3.01e-02 0.193 0.0883 0.196 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 1.31e-01 -0.16 0.105 0.196 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 385117 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0197 0.108 0.196 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 6.39e-01 0.0375 0.0798 0.197 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0143 0.0552 0.197 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 6.54e-01 0.0327 0.0728 0.197 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 385094 sc-eQTL 9.28e-01 0.00945 0.104 0.197 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0315 0.0611 0.197 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 6.91e-06 0.35 0.0758 0.197 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0125 0.0841 0.197 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 385117 sc-eQTL 2.92e-01 -0.114 0.108 0.197 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 9.70e-01 0.00362 0.0962 0.197 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0494 0.0847 0.197 NK L1
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0389 0.0719 0.197 NK L1
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 9.39e-02 -0.139 0.0826 0.197 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 6.32e-01 0.038 0.0792 0.197 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 1.40e-03 0.183 0.0564 0.197 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0658 0.0767 0.197 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 7.86e-01 0.0315 0.116 0.197 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0241 0.0749 0.197 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 4.35e-02 -0.186 0.0915 0.197 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 8.61e-01 0.0147 0.084 0.197 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 5.87e-01 0.0491 0.0902 0.197 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 8.50e-01 0.0112 0.0591 0.197 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0784 0.069 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 2.73e-01 -0.139 0.127 0.199 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 3.54e-01 -0.103 0.111 0.199 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 5.59e-01 0.0339 0.0578 0.199 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 5.22e-02 -0.234 0.12 0.199 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 4.03e-01 0.106 0.127 0.199 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 7.52e-01 0.0363 0.115 0.199 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -214333 sc-eQTL 6.99e-02 0.178 0.0973 0.199 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 2.44e-01 0.144 0.123 0.199 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -193697 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0683 0.123 0.199 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0786 0.112 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 4.80e-01 0.0549 0.0776 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 1.85e-01 -0.131 0.0984 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 9.12e-02 0.164 0.0965 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00494 0.105 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0597 0.0891 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -214333 sc-eQTL 1.70e-01 -0.15 0.109 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0223 0.101 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -193697 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0607 0.109 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 5.55e-01 0.0677 0.115 0.196 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0367 0.0862 0.196 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00756 0.108 0.196 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 2.76e-01 0.108 0.0988 0.196 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 6.88e-01 0.0431 0.107 0.196 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 1.49e-01 0.123 0.0845 0.196 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -214333 sc-eQTL 6.57e-01 0.0482 0.108 0.196 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 4.86e-01 0.0695 0.0995 0.196 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -193697 sc-eQTL 6.77e-01 0.051 0.122 0.196 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 2.84e-01 0.115 0.107 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0181 0.0752 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 8.19e-01 0.0234 0.102 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 6.54e-01 0.0419 0.0932 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 1.95e-01 -0.112 0.086 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0775 0.0601 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -214333 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0149 0.113 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 6.20e-02 -0.153 0.0816 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -193697 sc-eQTL 2.72e-01 -0.119 0.108 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 6.06e-02 -0.194 0.103 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00194 0.0709 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0319 0.0852 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 6.21e-01 0.0483 0.0976 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 2.00e-01 -0.119 0.0928 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0388 0.0685 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -214333 sc-eQTL 7.80e-01 0.0303 0.109 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 9.04e-01 0.0133 0.111 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -193697 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0814 0.102 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 6.68e-01 0.047 0.109 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 3.35e-01 0.0911 0.0943 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 1.89e-01 -0.151 0.115 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00132 0.11 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0193 0.107 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 9.97e-01 0.000389 0.0977 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 1.51e-01 -0.141 0.0977 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -161988 sc-eQTL 1.94e-01 -0.131 0.101 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 6.61e-01 0.0458 0.104 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0616 0.0649 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0202 0.0859 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 4.33e-01 0.0636 0.081 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 4.73e-02 0.142 0.0713 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 5.82e-02 0.0915 0.048 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0458 0.0822 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -161988 sc-eQTL 6.15e-01 0.0419 0.0831 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 7.94e-01 -0.027 0.103 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00354 0.0767 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 5.45e-01 0.0583 0.0961 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 4.95e-01 0.0562 0.0823 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 1.20e-01 0.121 0.0777 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 2.87e-03 0.178 0.0589 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0547 0.0893 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -161988 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0271 0.0966 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0333 0.116 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0188 0.0793 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0717 0.0921 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 4.62e-02 0.18 0.0897 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 3.04e-02 -0.213 0.0976 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 1.36e-02 0.173 0.0693 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0586 0.0923 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -161988 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0681 0.0965 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 8.62e-01 -0.021 0.121 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0966 0.0862 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 3.82e-01 0.0942 0.108 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0682 0.088 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0121 0.0943 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 3.18e-02 0.163 0.0755 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0851 0.0887 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -161988 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0108 0.113 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00465 0.0723 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 6.37e-01 -0.041 0.0868 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 6.31e-01 0.042 0.0872 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 3.52e-01 0.0814 0.0873 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 1.89e-01 0.0603 0.0457 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 2.79e-01 -0.1 0.0925 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -161988 sc-eQTL 1.65e-01 -0.147 0.106 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0378 0.129 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 9.69e-01 0.0035 0.0906 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0391 0.12 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 6.26e-01 0.046 0.0942 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 6.31e-01 0.0471 0.098 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 9.90e-02 0.161 0.097 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 9.40e-01 0.0076 0.1 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -161988 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0459 0.106 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 6.65e-02 -0.213 0.115 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0882 0.106 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 1.20e-01 0.187 0.12 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 6.80e-01 0.045 0.109 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 1.97e-01 0.146 0.113 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 6.50e-01 0.0398 0.0874 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0918 0.0948 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -161988 sc-eQTL 7.38e-01 0.0362 0.108 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 1.42e-01 0.182 0.123 0.199 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 5.31e-01 0.054 0.0859 0.199 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 8.03e-02 -0.198 0.113 0.199 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 1.73e-01 0.128 0.0938 0.199 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 1.27e-01 0.155 0.101 0.199 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0411 0.0745 0.199 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 1.68e-01 -0.121 0.0874 0.199 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 1.53e-01 -0.161 0.112 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 3.57e-01 0.0882 0.0956 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 4.13e-01 -0.084 0.102 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 5.38e-01 0.0628 0.102 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 7.95e-01 0.0247 0.0951 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 4.68e-02 0.174 0.0868 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 7.74e-01 -0.027 0.094 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 2.93e-01 0.109 0.103 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0261 0.0916 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00265 0.0821 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 8.29e-02 -0.154 0.0882 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000632 0.0842 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 1.90e-02 0.133 0.0562 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 1.18e-01 -0.119 0.0756 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 5.80e-01 0.0655 0.118 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00447 0.101 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0728 0.0894 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0828 0.11 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 2.69e-03 0.324 0.107 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 1.42e-01 0.132 0.0893 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 2.49e-01 -0.11 0.0956 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 9.82e-02 -0.175 0.106 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0715 0.0915 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 9.36e-02 0.143 0.0848 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 6.16e-01 -0.046 0.0915 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 8.66e-01 0.016 0.0945 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 9.49e-05 0.234 0.0587 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0258 0.0795 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0735 0.13 0.181 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0213 0.115 0.181 PB L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 2.30e-01 -0.105 0.0874 0.181 PB L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 2.70e-01 -0.156 0.141 0.181 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0844 0.125 0.181 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0385 0.0879 0.181 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -214333 sc-eQTL 9.57e-01 0.00687 0.128 0.181 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 3.30e-01 0.0941 0.0963 0.181 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -193697 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0779 0.13 0.181 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0212 0.118 0.198 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 9.72e-01 0.00334 0.0943 0.198 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0631 0.087 0.198 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0486 0.0931 0.198 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 5.16e-01 0.0713 0.11 0.198 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0135 0.0708 0.198 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0664 0.0842 0.198 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 7.36e-01 0.0375 0.111 0.197 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0251 0.0759 0.197 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0833 0.119 0.197 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0538 0.0922 0.197 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 9.41e-01 0.00708 0.0955 0.197 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 1.33e-03 0.258 0.0794 0.197 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 8.26e-01 0.02 0.0908 0.197 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -161988 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0212 0.104 0.197 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 4.67e-01 0.0847 0.116 0.195 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0274 0.0835 0.195 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 9.38e-01 0.00859 0.111 0.195 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 385094 sc-eQTL 5.74e-01 0.061 0.108 0.195 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0557 0.125 0.195 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 3.20e-01 0.102 0.102 0.195 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 3.01e-01 -0.112 0.108 0.195 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 385117 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0404 0.12 0.195 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 7.67e-01 0.0258 0.0871 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0137 0.0626 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00918 0.072 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 385094 sc-eQTL 7.78e-01 0.0296 0.105 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 9.62e-01 0.00441 0.0936 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 8.90e-04 0.259 0.0767 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 6.16e-01 0.0413 0.0823 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 385117 sc-eQTL 1.24e-01 -0.168 0.109 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0237 0.101 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0484 0.0689 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 9.40e-01 0.00642 0.0852 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 385094 sc-eQTL 7.91e-01 0.0286 0.108 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 6.89e-01 0.0409 0.102 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 8.52e-05 0.343 0.0857 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0533 0.0879 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 385117 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0182 0.118 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 3.62e-01 -0.116 0.127 0.203 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 9.46e-01 0.00822 0.122 0.203 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 3.41e-02 -0.238 0.111 0.203 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 1.68e-01 0.167 0.12 0.203 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 4.19e-01 -0.101 0.125 0.203 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0121 0.0944 0.203 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 3.58e-01 -0.1 0.108 0.203 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 1.45e-01 0.167 0.114 0.198 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 3.51e-01 -0.072 0.077 0.198 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0236 0.0943 0.198 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 385094 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000634 0.104 0.198 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 1.34e-02 -0.264 0.106 0.198 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 2.59e-01 0.111 0.0977 0.198 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0194 0.0952 0.198 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 385117 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0181 0.117 0.198 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0274 0.108 0.201 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 2.22e-01 0.079 0.0645 0.201 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 9.27e-01 0.00913 0.0991 0.201 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 385094 sc-eQTL 3.26e-01 -0.102 0.104 0.201 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 7.68e-01 0.0232 0.0785 0.201 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 3.29e-03 0.275 0.0926 0.201 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 6.10e-01 -0.041 0.0802 0.201 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 385117 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0426 0.116 0.201 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 9.95e-01 0.000847 0.123 0.198 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 7.81e-01 0.0266 0.0954 0.198 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 4.25e-01 0.083 0.104 0.198 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 385094 sc-eQTL 6.97e-01 -0.037 0.0949 0.198 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 1.19e-01 -0.149 0.0954 0.198 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 2.38e-04 0.379 0.101 0.198 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 1.65e-01 -0.171 0.123 0.198 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 385117 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0124 0.0954 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0622 0.108 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 9.13e-01 0.00812 0.0746 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0834 0.0981 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 1.59e-01 0.135 0.0953 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 4.18e-01 0.0806 0.0992 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0235 0.0688 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -214333 sc-eQTL 8.47e-01 0.022 0.114 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 4.60e-01 0.0714 0.0966 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -193697 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0482 0.112 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0158 0.0996 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0238 0.0691 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 6.63e-01 0.0443 0.101 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 5.08e-01 0.0617 0.0931 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 8.50e-02 -0.136 0.0789 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0557 0.0556 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -214333 sc-eQTL 7.38e-01 0.0391 0.117 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 1.61e-01 -0.119 0.0843 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -193697 sc-eQTL 2.47e-01 -0.115 0.0992 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00425 0.0807 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0203 0.0602 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 8.76e-01 0.0113 0.0724 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 385094 sc-eQTL 9.98e-01 0.000225 0.106 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0072 0.0871 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 3.57e-05 0.314 0.0744 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 9.81e-01 0.00207 0.0848 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 385117 sc-eQTL 3.23e-01 -0.112 0.113 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 5.66e-01 0.0624 0.108 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 9.74e-01 0.00186 0.058 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 6.56e-01 0.0413 0.0926 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 385094 sc-eQTL 6.80e-01 0.0425 0.103 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 1.18e-01 -0.1 0.0638 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 8.98e-04 0.308 0.0915 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0194 0.0809 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 385117 sc-eQTL 4.88e-01 -0.079 0.114 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 sc-eQTL 8.01e-01 0.0251 0.0997 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 674134 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0484 0.0864 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 970246 sc-eQTL 9.15e-01 0.00777 0.0729 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -57415 sc-eQTL 5.53e-02 -0.162 0.0843 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 89404 sc-eQTL 6.16e-01 0.0417 0.083 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 48920 sc-eQTL 4.65e-04 0.185 0.0521 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -296983 sc-eQTL 3.14e-01 -0.078 0.0773 0.196 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 eQTL 0.015 -0.0484 0.0198 0.0 0.0 0.206
ENSG00000112406 HECA -57415 eQTL 0.00237 -0.0361 0.0118 0.0 0.0 0.206
ENSG00000135597 REPS1 89404 eQTL 0.0216 0.0484 0.021 0.0 0.0 0.206
ENSG00000146386 ABRACL 48920 eQTL 5.51e-12 0.197 0.0283 0.0 0.0 0.206


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A 304156 1.24e-06 9.82e-07 3e-07 9.36e-07 2.71e-07 4.78e-07 1.34e-06 3.28e-07 1.14e-06 3.82e-07 1.4e-06 5.97e-07 2e-06 2.76e-07 4.48e-07 7.41e-07 8.4e-07 5.45e-07 6.18e-07 6.97e-07 4.77e-07 1.12e-06 9.29e-07 6.02e-07 2.09e-06 3.63e-07 7.27e-07 7.19e-07 1.07e-06 1.22e-06 5.2e-07 2.24e-07 2.33e-07 7.03e-07 5.65e-07 4.75e-07 5.1e-07 1.61e-07 3.73e-07 2.44e-07 2.85e-07 1.59e-06 5.58e-08 1.32e-07 1.88e-07 1.12e-07 2.01e-07 3.66e-08 9.23e-08
ENSG00000112406 HECA -57415 8.31e-06 9.28e-06 9.83e-07 4.07e-06 1.9e-06 3.93e-06 9.48e-06 1.29e-06 5.77e-06 4.19e-06 1.04e-05 4.6e-06 1.15e-05 3.96e-06 1.54e-06 5.65e-06 3.74e-06 5.05e-06 2.24e-06 2.15e-06 4.39e-06 7.57e-06 6.85e-06 2.42e-06 1.27e-05 2.79e-06 4.22e-06 2.87e-06 7.21e-06 7.8e-06 4.13e-06 7.72e-07 6.91e-07 2.86e-06 2.96e-06 2.1e-06 1.39e-06 1.14e-06 1.42e-06 8.74e-07 8.59e-07 1.01e-05 1.3e-06 1.33e-07 7.62e-07 1.02e-06 8.75e-07 7.23e-07 5.81e-07
ENSG00000146386 ABRACL 48920 9.86e-06 9.4e-06 1.23e-06 4.79e-06 2.16e-06 4.28e-06 1.03e-05 1.55e-06 7.35e-06 4.78e-06 1.19e-05 5.16e-06 1.36e-05 3.84e-06 2.2e-06 6.49e-06 4.13e-06 6.63e-06 2.64e-06 2.62e-06 4.94e-06 8.24e-06 7.55e-06 3.08e-06 1.39e-05 3.28e-06 4.63e-06 3.42e-06 8.7e-06 8.46e-06 4.72e-06 9.93e-07 1.02e-06 2.92e-06 3.64e-06 2.18e-06 1.71e-06 1.85e-06 1.6e-06 1.01e-06 1.03e-06 1.23e-05 1.48e-06 1.58e-07 8.14e-07 1.44e-06 1.28e-06 7.67e-07 5.66e-07