Genes within 1Mb (chr6:139059796:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.92e-03 -0.358 0.114 0.126 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 4.72e-01 0.064 0.0889 0.126 B L1
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 4.31e-01 0.0699 0.0887 0.126 B L1
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 3.39e-01 0.109 0.113 0.126 B L1
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 4.61e-01 -0.074 0.1 0.126 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 6.35e-01 0.028 0.0588 0.126 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -232202 sc-eQTL 6.94e-01 0.0568 0.144 0.126 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0992 0.0906 0.126 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -211566 sc-eQTL 2.89e-02 0.22 0.0999 0.126 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.26e-03 -0.408 0.125 0.126 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0322 0.086 0.126 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0251 0.081 0.126 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 3.56e-01 0.0985 0.107 0.126 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 4.39e-01 -0.065 0.0838 0.126 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 8.25e-05 0.238 0.0594 0.126 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 1.26e-01 -0.16 0.105 0.126 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -179857 sc-eQTL 1.99e-01 -0.133 0.103 0.126 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.62e-02 -0.336 0.138 0.126 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 7.30e-01 0.0317 0.0919 0.126 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0976 0.0934 0.126 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00452 0.1 0.126 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 2.10e-01 0.118 0.0942 0.126 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 7.31e-08 0.28 0.0502 0.126 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0943 0.102 0.126 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -179857 sc-eQTL 3.22e-01 -0.123 0.124 0.126 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 3.34e-02 -0.294 0.137 0.128 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 4.07e-01 -0.081 0.0975 0.128 DC L1
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 4.67e-01 0.0833 0.114 0.128 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 367225 sc-eQTL 3.16e-01 0.128 0.127 0.128 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0823 0.113 0.128 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 7.02e-02 0.199 0.109 0.128 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00488 0.131 0.128 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 367248 sc-eQTL 1.76e-01 -0.18 0.133 0.128 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 8.61e-04 -0.335 0.0991 0.126 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 2.15e-01 0.0873 0.0701 0.126 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 7.86e-01 0.0253 0.0928 0.126 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 367225 sc-eQTL 3.20e-02 -0.284 0.131 0.126 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 8.42e-01 0.0156 0.0778 0.126 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.91e-02 0.236 0.1 0.126 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 9.72e-01 0.0038 0.107 0.126 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 367248 sc-eQTL 3.55e-01 -0.128 0.138 0.126 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.16e-01 -0.192 0.122 0.127 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0346 0.108 0.127 NK L1
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00855 0.0917 0.127 NK L1
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 4.11e-01 0.0873 0.106 0.127 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0621 0.101 0.127 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 6.52e-08 0.385 0.0687 0.127 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0393 0.0979 0.127 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 2.19e-02 -0.338 0.147 0.126 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0145 0.0958 0.126 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00548 0.118 0.126 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 2.26e-02 0.244 0.106 0.126 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 2.28e-01 -0.139 0.115 0.126 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 3.19e-05 0.309 0.0726 0.126 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 2.20e-01 0.109 0.0883 0.126 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 5.44e-01 -0.101 0.167 0.128 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 7.56e-01 0.0456 0.146 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 8.11e-01 0.0182 0.076 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 4.03e-01 0.133 0.159 0.128 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 8.13e-01 0.0395 0.166 0.128 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 8.86e-01 0.0217 0.151 0.128 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -232202 sc-eQTL 3.19e-01 -0.129 0.129 0.128 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 4.41e-01 0.125 0.162 0.128 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -211566 sc-eQTL 8.30e-02 0.28 0.161 0.128 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 2.61e-01 -0.16 0.142 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0286 0.0986 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 4.42e-01 0.0965 0.125 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 1.83e-01 -0.164 0.123 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 4.91e-01 0.0916 0.133 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.76e-02 0.267 0.112 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -232202 sc-eQTL 7.54e-01 0.0436 0.139 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 3.26e-01 -0.125 0.127 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -211566 sc-eQTL 1.33e-01 0.207 0.138 0.127 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.02e-01 -0.237 0.144 0.127 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 6.87e-01 0.044 0.109 0.127 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 6.74e-01 0.0573 0.136 0.127 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 4.75e-01 0.0897 0.125 0.127 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 9.66e-01 0.00576 0.136 0.127 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 5.47e-01 0.0649 0.107 0.127 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -232202 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0836 0.137 0.127 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 8.84e-01 0.0184 0.126 0.127 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -211566 sc-eQTL 9.97e-01 0.000603 0.155 0.127 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.05e-01 -0.224 0.138 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 1.06e-01 0.157 0.0968 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 2.20e-01 -0.162 0.132 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 7.54e-02 0.214 0.12 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0717 0.112 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 8.95e-01 0.0103 0.0782 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -232202 sc-eQTL 7.55e-01 0.0458 0.146 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0855 0.106 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -211566 sc-eQTL 5.85e-02 0.264 0.139 0.126 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.28e-02 -0.335 0.133 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 9.80e-01 0.00231 0.0925 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 4.57e-02 0.221 0.11 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 8.45e-02 0.219 0.126 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 3.84e-01 0.106 0.121 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0474 0.0894 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -232202 sc-eQTL 9.05e-01 0.0169 0.142 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 7.60e-02 -0.256 0.143 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -211566 sc-eQTL 1.70e-01 0.182 0.132 0.127 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 4.51e-01 -0.107 0.142 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0811 0.123 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 6.47e-01 0.0685 0.149 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 4.22e-01 0.115 0.143 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 7.96e-01 0.0361 0.139 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 8.75e-02 0.216 0.126 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0301 0.127 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -179857 sc-eQTL 1.22e-02 -0.327 0.129 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.64e-04 -0.499 0.13 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0248 0.0838 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0545 0.111 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 3.76e-01 0.0924 0.104 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 5.90e-01 -0.05 0.0926 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 6.39e-03 0.169 0.0613 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 1.01e-01 -0.173 0.105 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -179857 sc-eQTL 8.33e-02 -0.185 0.106 0.126 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 2.93e-01 -0.138 0.131 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0209 0.0975 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 3.16e-01 -0.123 0.122 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 7.32e-01 0.0359 0.105 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0392 0.0994 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 6.68e-06 0.337 0.0728 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0414 0.114 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -179857 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0637 0.123 0.126 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 3.27e-01 -0.146 0.149 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 5.09e-01 0.0672 0.102 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0778 0.118 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 7.82e-01 0.0321 0.116 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 8.35e-01 0.0264 0.127 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 6.94e-04 0.302 0.0878 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 3.44e-01 0.112 0.118 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -179857 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0877 0.124 0.126 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 6.75e-02 -0.276 0.15 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 1.99e-01 0.139 0.108 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 1.14e-01 -0.213 0.134 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 4.84e-01 0.0771 0.11 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 5.83e-01 0.0648 0.118 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 4.07e-09 0.539 0.0878 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 2.76e-01 0.121 0.111 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -179857 sc-eQTL 3.62e-02 -0.278 0.132 0.126 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 8.21e-02 -0.255 0.146 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 9.82e-01 0.00211 0.0941 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0326 0.113 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0452 0.114 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0373 0.114 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.84e-02 0.14 0.059 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 1.31e-01 -0.182 0.12 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -179857 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0893 0.138 0.126 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 3.95e-01 -0.139 0.164 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0977 0.115 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 3.02e-01 0.157 0.152 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 2.15e-01 0.149 0.119 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 1.23e-01 0.192 0.124 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 5.49e-03 0.342 0.122 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 5.72e-01 0.0721 0.127 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -179857 sc-eQTL 3.33e-01 0.13 0.134 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 4.70e-01 -0.107 0.148 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 1.61e-01 0.188 0.134 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 1.25e-01 -0.235 0.153 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 4.37e-01 -0.108 0.138 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0643 0.144 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.96e-03 0.341 0.108 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 3.59e-01 0.111 0.121 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -179857 sc-eQTL 1.76e-01 -0.186 0.137 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.25e-01 -0.244 0.159 0.126 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 6.52e-01 -0.05 0.111 0.126 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0733 0.146 0.126 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 1.15e-01 0.191 0.121 0.126 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 9.31e-02 -0.219 0.13 0.126 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 4.95e-02 0.188 0.0952 0.126 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 7.08e-02 0.204 0.112 0.126 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 9.10e-02 -0.248 0.146 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0902 0.125 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 9.39e-01 0.0102 0.134 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 7.38e-01 0.0445 0.133 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 4.87e-01 0.0864 0.124 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.59e-02 0.274 0.113 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0458 0.123 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0334 0.133 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 6.87e-01 0.0477 0.118 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 2.28e-01 -0.128 0.106 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 6.56e-01 0.0511 0.114 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 1.21e-01 -0.168 0.108 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 9.40e-06 0.319 0.0701 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0965 0.0978 0.127 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0687 0.153 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 3.62e-01 -0.119 0.13 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 3.81e-01 0.102 0.116 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0024 0.143 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 2.00e-01 -0.181 0.141 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 8.87e-03 0.302 0.114 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0535 0.124 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 7.70e-03 -0.362 0.134 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0724 0.118 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 3.83e-01 0.0959 0.11 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 7.74e-02 0.208 0.117 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0558 0.122 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.53e-05 0.332 0.0749 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 6.60e-01 0.0451 0.102 0.127 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0216 0.185 0.111 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 6.84e-01 0.0669 0.164 0.111 PB L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 1.21e-01 -0.193 0.124 0.111 PB L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 5.17e-02 0.388 0.198 0.111 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 5.04e-01 -0.119 0.178 0.111 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.51e-02 0.3 0.122 0.111 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -232202 sc-eQTL 7.51e-01 0.0581 0.182 0.111 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 2.78e-01 -0.149 0.137 0.111 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -211566 sc-eQTL 2.57e-01 0.209 0.183 0.111 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 2.55e-01 -0.177 0.155 0.124 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 1.97e-01 0.16 0.123 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 3.45e-01 0.108 0.114 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 1.28e-02 0.303 0.121 0.124 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0155 0.144 0.124 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.74e-03 0.288 0.0908 0.124 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 7.76e-01 0.0316 0.111 0.124 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.01e-01 -0.233 0.142 0.126 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0815 0.0973 0.126 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 3.55e-01 0.142 0.153 0.126 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0762 0.118 0.126 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 5.41e-01 0.0751 0.123 0.126 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 3.48e-04 0.368 0.101 0.126 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 5.83e-01 0.064 0.117 0.126 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -179857 sc-eQTL 5.14e-01 0.0871 0.133 0.126 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.02e-02 -0.358 0.138 0.134 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 3.76e-01 -0.089 0.1 0.134 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 9.23e-01 0.0129 0.133 0.134 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 367225 sc-eQTL 5.83e-01 0.0716 0.13 0.134 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00334 0.15 0.134 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 2.09e-02 0.282 0.121 0.134 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 4.46e-01 0.0995 0.13 0.134 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 367248 sc-eQTL 2.95e-01 -0.151 0.144 0.134 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 3.67e-02 -0.227 0.108 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 6.48e-01 0.0357 0.0782 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0408 0.0899 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 367225 sc-eQTL 4.20e-01 -0.106 0.131 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 5.60e-01 0.0682 0.117 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.23e-02 0.245 0.097 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0173 0.103 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 367248 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0665 0.137 0.126 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 7.13e-03 -0.34 0.125 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 5.29e-01 0.0548 0.087 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 4.52e-01 0.081 0.107 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 367225 sc-eQTL 1.56e-01 -0.193 0.136 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 1.53e-01 -0.184 0.128 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 2.08e-02 0.258 0.111 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 2.05e-01 0.141 0.111 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 367248 sc-eQTL 2.29e-02 -0.338 0.147 0.126 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 9.79e-01 0.00422 0.161 0.148 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 7.85e-01 -0.042 0.154 0.148 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 8.61e-01 0.0251 0.143 0.148 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 1.25e-01 0.234 0.152 0.148 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 2.76e-01 -0.172 0.158 0.148 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.45e-01 0.173 0.118 0.148 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 9.33e-01 0.0115 0.137 0.148 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 2.11e-02 -0.335 0.144 0.127 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 2.50e-01 0.112 0.0976 0.127 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0377 0.12 0.127 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 367225 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0576 0.132 0.127 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 5.49e-01 0.0818 0.136 0.127 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.31e-01 0.187 0.124 0.127 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 4.48e-01 0.0918 0.121 0.127 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 367248 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0894 0.148 0.127 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.29e-01 -0.211 0.139 0.124 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0427 0.0831 0.124 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 4.98e-01 0.0863 0.127 0.124 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 367225 sc-eQTL 2.40e-01 -0.157 0.133 0.124 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0359 0.101 0.124 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.86e-03 0.374 0.119 0.124 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 1.27e-01 0.157 0.103 0.124 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 367248 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00119 0.149 0.124 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.94e-01 -0.207 0.159 0.13 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0941 0.124 0.13 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 4.15e-01 0.11 0.135 0.13 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 367225 sc-eQTL 1.99e-01 0.159 0.123 0.13 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0382 0.125 0.13 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 7.71e-01 0.0398 0.137 0.13 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 6.74e-01 0.0679 0.161 0.13 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 367248 sc-eQTL 2.35e-01 -0.147 0.124 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 6.23e-02 -0.251 0.134 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 8.75e-01 0.0147 0.0934 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 1.93e-01 0.16 0.123 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0923 0.12 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 8.13e-01 0.0295 0.124 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 7.06e-02 0.155 0.0855 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -232202 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0273 0.143 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0426 0.121 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -211566 sc-eQTL 6.32e-02 0.261 0.14 0.126 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.25e-02 -0.321 0.127 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 1.38e-01 0.133 0.0892 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0654 0.132 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 2.69e-02 0.266 0.119 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 1.00e+00 2.35e-06 0.103 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 5.16e-01 -0.047 0.0722 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -232202 sc-eQTL 8.86e-01 0.0217 0.151 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 1.68e-01 -0.151 0.109 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -211566 sc-eQTL 4.40e-02 0.259 0.128 0.126 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 2.20e-03 -0.307 0.0991 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 3.00e-01 0.0782 0.0753 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 8.97e-01 0.0118 0.0909 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 367225 sc-eQTL 1.27e-01 -0.202 0.132 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0286 0.109 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 1.07e-02 0.246 0.0957 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 7.72e-01 0.0308 0.106 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 367248 sc-eQTL 1.46e-01 -0.207 0.142 0.126 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 7.63e-03 -0.364 0.135 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000492 0.0734 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 7.64e-01 0.0353 0.117 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 367225 sc-eQTL 1.87e-01 -0.172 0.13 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 6.72e-01 0.0345 0.0812 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 5.33e-03 0.329 0.117 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 1.94e-01 0.133 0.102 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 367248 sc-eQTL 7.29e-01 0.05 0.144 0.127 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 sc-eQTL 1.25e-01 -0.195 0.127 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 656265 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0373 0.111 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 952377 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0264 0.0933 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -75284 sc-eQTL 3.36e-01 0.105 0.109 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 71535 sc-eQTL 2.24e-01 -0.129 0.106 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 31051 sc-eQTL 2.24e-08 0.37 0.0637 0.127 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -314852 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0281 0.0991 0.127 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 286287 eQTL 0.000827 -0.0805 0.024 0.0 0.0 0.121
ENSG00000112406 HECA -75284 eQTL 0.00826 0.038 0.0144 0.0 0.0 0.121
ENSG00000146386 ABRACL 31051 eQTL 4.52e-17 0.29 0.0339 0.0 0.0 0.121
ENSG00000226571 AL592429.2 -211566 eQTL 3.49e-02 0.107 0.0506 0.0 0.0 0.121


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA -75284 5.85e-06 8.94e-06 7.17e-07 4.31e-06 1.5e-06 1.56e-06 8.99e-06 1.51e-06 5.38e-06 3.08e-06 8.15e-06 2.82e-06 1.12e-05 3.14e-06 1.45e-06 4.31e-06 3.72e-06 3.78e-06 2.19e-06 2.52e-06 2.55e-06 7.58e-06 4.78e-06 1.93e-06 1.02e-05 2.35e-06 2.91e-06 2.27e-06 6.73e-06 7.66e-06 4.16e-06 5.83e-07 7.8e-07 2.61e-06 2.69e-06 1.61e-06 1.01e-06 9.96e-07 1.34e-06 8.28e-07 5.21e-07 8.42e-06 9.28e-07 1.61e-07 7.68e-07 8.07e-07 9.74e-07 6.71e-07 6.01e-07
ENSG00000146386 ABRACL 31051 1.18e-05 1.38e-05 2.27e-06 8.21e-06 2.36e-06 5.13e-06 1.55e-05 2.22e-06 1.18e-05 5.41e-06 1.45e-05 6.11e-06 2.09e-05 4.15e-06 3.95e-06 6.93e-06 6.79e-06 9.78e-06 3.39e-06 3.24e-06 6.35e-06 1.21e-05 1.02e-05 3.69e-06 2.14e-05 4.72e-06 6.34e-06 5.24e-06 1.41e-05 1.15e-05 8.68e-06 1.06e-06 1.27e-06 3.61e-06 5.48e-06 2.8e-06 1.82e-06 2.09e-06 2.22e-06 1.19e-06 1.03e-06 1.58e-05 1.8e-06 2.07e-07 7.99e-07 1.96e-06 1.48e-06 8.04e-07 4.84e-07
ENSG00000226571 AL592429.2 -211566 1.93e-06 2.43e-06 2.31e-07 1.68e-06 4.55e-07 6.24e-07 1.32e-06 5.78e-07 1.69e-06 7.15e-07 1.84e-06 1.28e-06 3.49e-06 9.33e-07 4.61e-07 9.61e-07 1.01e-06 1.35e-06 7.09e-07 1.11e-06 6.02e-07 2.17e-06 1.55e-06 1.02e-06 2.68e-06 1.1e-06 1e-06 1.35e-06 1.68e-06 1.67e-06 1.71e-06 2.49e-07 3.72e-07 8.91e-07 9e-07 8.58e-07 7.24e-07 3.65e-07 7.27e-07 2.05e-07 2.88e-07 2.73e-06 5.1e-07 2.06e-07 3.82e-07 3.21e-07 2.7e-07 1.69e-07 2.41e-07