logo

Genes within 1Mb (chr6:139043568:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0662 0.108 0.111 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0647 0.0823 0.111 B L1
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0871 0.082 0.111 B L1
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 4.90e-01 0.0725 0.105 0.111 B L1
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 2.57e-01 -0.105 0.0925 0.111 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 3.04e-02 -0.117 0.0539 0.111 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -248430 sc-eQTL 2.48e-01 -0.154 0.133 0.111 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0311 0.0841 0.111 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -227794 sc-eQTL 1.70e-01 -0.128 0.0931 0.111 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 3.38e-01 -0.116 0.12 0.111 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0636 0.0809 0.111 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00925 0.0764 0.111 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 8.05e-01 0.0248 0.101 0.111 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 3.56e-02 0.166 0.0783 0.111 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 1.15e-04 0.22 0.056 0.111 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0422 0.0991 0.111 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -196085 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0306 0.0977 0.111 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 4.76e-02 -0.259 0.13 0.111 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 2.02e-01 -0.11 0.0857 0.111 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 7.33e-01 0.0299 0.0876 0.111 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 5.13e-01 0.0616 0.094 0.111 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 1.59e-01 0.125 0.0881 0.111 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 6.57e-03 0.136 0.0495 0.111 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0195 0.0956 0.111 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -196085 sc-eQTL 8.23e-01 -0.026 0.116 0.111 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 9.90e-01 0.00173 0.138 0.106 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0479 0.0971 0.106 DC L1
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 6.87e-01 -0.046 0.114 0.106 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 350997 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0474 0.127 0.106 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 2.26e-01 -0.136 0.112 0.106 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 8.98e-03 0.285 0.108 0.106 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 3.56e-01 -0.12 0.13 0.106 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 351020 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0521 0.132 0.106 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0117 0.0947 0.111 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0303 0.0655 0.111 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0325 0.0864 0.111 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 350997 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0156 0.124 0.111 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 4.48e-01 -0.055 0.0723 0.111 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 1.30e-07 0.482 0.0882 0.111 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 4.99e-01 0.0674 0.0996 0.111 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 351020 sc-eQTL 1.42e-01 -0.189 0.128 0.111 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0148 0.116 0.112 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 5.21e-01 -0.066 0.102 0.112 NK L1
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 1.92e-01 -0.113 0.0867 0.112 NK L1
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0675 0.101 0.112 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 2.24e-01 0.116 0.0955 0.112 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 1.55e-04 0.26 0.0676 0.112 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0681 0.0929 0.112 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 8.35e-01 0.0293 0.14 0.111 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0513 0.0905 0.111 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 8.10e-02 -0.195 0.111 0.111 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0199 0.102 0.111 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 7.06e-01 0.0413 0.109 0.111 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00395 0.0715 0.111 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0462 0.0836 0.111 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0785 0.153 0.112 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0539 0.134 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 5.26e-01 0.0442 0.0696 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 2.35e-01 -0.173 0.145 0.112 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 3.05e-01 0.157 0.152 0.112 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 7.58e-01 0.0427 0.138 0.112 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -248430 sc-eQTL 3.67e-01 0.107 0.118 0.112 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 4.40e-01 0.115 0.149 0.112 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -227794 sc-eQTL 3.34e-01 -0.144 0.148 0.112 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 3.20e-01 -0.134 0.135 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0604 0.0933 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 7.05e-02 -0.214 0.118 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 8.63e-01 0.0201 0.117 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00594 0.126 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 3.35e-01 -0.103 0.107 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -248430 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0931 0.131 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 8.57e-01 0.0218 0.121 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -227794 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0425 0.131 0.112 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 8.01e-01 0.0343 0.136 0.11 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0265 0.103 0.11 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00423 0.128 0.11 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 8.26e-02 0.204 0.117 0.11 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 8.09e-01 0.0309 0.128 0.11 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 3.50e-01 0.0945 0.101 0.11 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -248430 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0955 0.129 0.11 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00948 0.119 0.11 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -227794 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0346 0.146 0.11 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 3.12e-01 0.13 0.128 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0969 0.09 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00878 0.122 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 5.91e-01 0.0603 0.112 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 4.24e-02 -0.209 0.103 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 2.48e-02 -0.162 0.0716 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -248430 sc-eQTL 6.64e-01 -0.059 0.136 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 6.28e-02 -0.183 0.0979 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -227794 sc-eQTL 4.61e-03 -0.364 0.127 0.111 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 2.30e-01 -0.151 0.125 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0193 0.0859 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0769 0.103 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 6.85e-01 0.048 0.118 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0311 0.113 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 7.28e-03 -0.221 0.0817 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -248430 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0512 0.132 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00884 0.134 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -227794 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0404 0.123 0.112 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 5.20e-01 0.0846 0.131 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 3.86e-01 0.0986 0.113 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 8.06e-01 0.0339 0.138 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0505 0.133 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 5.89e-01 0.0697 0.129 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 7.31e-01 0.0404 0.117 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 3.17e-01 -0.118 0.118 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -196085 sc-eQTL 1.42e-01 -0.178 0.121 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 8.33e-01 -0.027 0.128 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0731 0.0796 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 9.78e-01 0.00289 0.105 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 5.61e-01 0.0578 0.0993 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 7.59e-02 0.156 0.0875 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 2.64e-02 0.131 0.0586 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 7.59e-01 -0.031 0.101 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -196085 sc-eQTL 7.80e-01 0.0284 0.102 0.111 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 1.97e-01 -0.16 0.124 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0351 0.0924 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 8.17e-01 0.0269 0.116 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 2.79e-01 0.107 0.0991 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 2.24e-02 0.214 0.093 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 3.99e-03 0.207 0.071 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0144 0.108 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -196085 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0148 0.116 0.111 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0386 0.139 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 1.98e-01 -0.122 0.0945 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0487 0.11 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 2.35e-01 0.129 0.108 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 3.99e-02 -0.241 0.117 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 8.26e-03 0.221 0.0828 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 2.67e-01 -0.123 0.11 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -196085 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0461 0.116 0.111 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 7.60e-02 -0.256 0.144 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 1.88e-01 -0.136 0.103 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 4.67e-01 0.0941 0.129 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0834 0.105 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 6.56e-01 0.0504 0.113 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 7.23e-02 0.164 0.0907 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0861 0.106 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -196085 sc-eQTL 3.45e-01 -0.121 0.127 0.111 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0714 0.136 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0014 0.0869 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00784 0.104 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 6.95e-01 0.0411 0.105 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 5.35e-02 0.202 0.104 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 8.41e-02 0.0951 0.0548 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 2.66e-01 -0.124 0.111 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -196085 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0191 0.128 0.111 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 1.59e-01 -0.224 0.158 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0389 0.112 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 4.37e-01 -0.115 0.148 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 2.82e-01 0.125 0.116 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0335 0.121 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 2.30e-01 0.145 0.12 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 8.12e-01 0.0295 0.124 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -196085 sc-eQTL 1.49e-01 0.189 0.13 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 3.70e-02 -0.289 0.138 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 1.29e-01 -0.192 0.126 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 8.39e-02 0.249 0.143 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 7.65e-01 0.039 0.13 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 2.33e-01 0.162 0.135 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 5.26e-01 0.0665 0.105 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 7.59e-01 0.0349 0.114 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -196085 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0596 0.129 0.114 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 2.53e-01 0.172 0.15 0.113 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 3.65e-01 0.0948 0.104 0.113 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 4.08e-01 -0.115 0.138 0.113 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 2.71e-01 0.126 0.114 0.113 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 4.46e-01 0.094 0.123 0.113 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 9.81e-01 0.00216 0.0907 0.113 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0631 0.107 0.113 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0825 0.136 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 5.78e-01 0.0645 0.116 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 2.00e-01 -0.158 0.123 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 2.72e-01 0.135 0.123 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 7.25e-01 0.0405 0.115 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 2.39e-01 0.125 0.106 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0875 0.113 0.111 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 6.98e-01 0.0488 0.126 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 3.19e-01 -0.111 0.111 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0712 0.1 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 3.14e-01 -0.109 0.108 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 4.91e-01 0.0707 0.102 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 2.71e-03 0.206 0.068 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 2.26e-01 -0.112 0.0923 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 5.17e-01 0.0936 0.144 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00424 0.123 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 2.78e-01 -0.119 0.109 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 9.84e-01 0.00274 0.135 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 1.35e-01 0.199 0.133 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 1.03e-01 0.178 0.109 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 1.20e-01 -0.182 0.116 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 1.63e-01 -0.181 0.13 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 3.17e-01 -0.112 0.112 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 8.51e-01 0.0197 0.105 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 8.80e-01 -0.017 0.112 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 5.47e-01 0.0698 0.116 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 3.12e-04 0.265 0.0723 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0203 0.0974 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 8.99e-01 0.0182 0.142 0.122 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0519 0.126 0.122 PB L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 2.73e-01 -0.105 0.0958 0.122 PB L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0775 0.155 0.122 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 3.57e-01 -0.127 0.137 0.122 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 7.24e-01 0.0341 0.0962 0.122 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -248430 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0575 0.14 0.122 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 4.21e-01 0.0853 0.106 0.122 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -227794 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00385 0.142 0.122 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 4.16e-01 0.117 0.144 0.111 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0189 0.115 0.111 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 2.78e-01 -0.115 0.106 0.111 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0552 0.113 0.111 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 9.90e-01 0.00174 0.134 0.111 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 6.82e-01 0.0353 0.0861 0.111 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0349 0.103 0.111 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 2.21e-01 -0.164 0.134 0.111 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0768 0.0918 0.111 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 7.36e-01 0.0489 0.145 0.111 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0606 0.112 0.111 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0103 0.116 0.111 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 2.42e-03 0.296 0.0965 0.111 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0244 0.11 0.111 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -196085 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0976 0.126 0.111 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 4.33e-01 0.109 0.139 0.105 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0633 0.0994 0.105 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0974 0.132 0.105 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 350997 sc-eQTL 9.00e-01 0.0163 0.129 0.105 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 4.60e-01 -0.11 0.149 0.105 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 1.51e-01 0.175 0.121 0.105 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00218 0.129 0.105 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 351020 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0605 0.142 0.105 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0728 0.103 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0056 0.0743 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0718 0.0853 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 350997 sc-eQTL 6.92e-01 0.0493 0.124 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0364 0.111 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 5.10e-06 0.416 0.0889 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 2.04e-01 0.124 0.0973 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 351020 sc-eQTL 2.57e-01 -0.148 0.13 0.111 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0128 0.12 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00941 0.0818 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 2.88e-01 -0.107 0.101 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 350997 sc-eQTL 8.38e-01 0.0262 0.128 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 6.98e-01 0.0471 0.121 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 3.98e-05 0.425 0.101 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 8.71e-01 0.0169 0.104 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 351020 sc-eQTL 2.22e-01 -0.171 0.14 0.111 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 6.34e-02 -0.296 0.158 0.112 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 4.83e-01 0.107 0.153 0.112 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 5.05e-02 -0.276 0.14 0.112 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 2.29e-01 0.183 0.151 0.112 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 6.17e-01 0.0788 0.157 0.112 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 9.97e-01 0.000435 0.119 0.112 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0179 0.137 0.112 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 6.37e-01 0.0647 0.137 0.113 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0684 0.0918 0.113 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0198 0.112 0.113 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 350997 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00701 0.124 0.113 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 9.11e-03 -0.332 0.126 0.113 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 9.91e-02 0.192 0.116 0.113 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 3.97e-01 0.0962 0.113 0.113 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 351020 sc-eQTL 9.18e-01 0.0144 0.139 0.113 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 8.64e-01 0.022 0.129 0.113 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 7.73e-02 0.135 0.0761 0.113 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 8.22e-01 0.0264 0.118 0.113 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 350997 sc-eQTL 1.75e-01 -0.167 0.123 0.113 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 9.40e-01 0.00706 0.0931 0.113 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 6.96e-04 0.375 0.109 0.113 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0474 0.0951 0.113 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 351020 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0473 0.137 0.113 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 5.64e-01 0.0872 0.151 0.113 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 7.89e-01 0.0315 0.118 0.113 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0406 0.128 0.113 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 350997 sc-eQTL 2.24e-01 -0.142 0.116 0.113 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 2.85e-02 -0.258 0.117 0.113 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 3.56e-04 0.454 0.124 0.113 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 1.83e-01 -0.203 0.151 0.113 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 351020 sc-eQTL 8.28e-01 0.0256 0.118 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 1.66e-01 -0.179 0.129 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0638 0.0895 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 2.69e-01 -0.131 0.118 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 4.95e-01 0.0786 0.115 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 4.73e-01 0.0857 0.119 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0696 0.0825 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -248430 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0272 0.137 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 5.53e-01 0.069 0.116 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -227794 sc-eQTL 4.11e-01 -0.111 0.135 0.111 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0202 0.119 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0742 0.0827 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 8.97e-01 0.0157 0.122 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 4.61e-01 0.0825 0.112 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 8.75e-02 -0.162 0.0946 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 3.97e-03 -0.191 0.0655 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -248430 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0142 0.14 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 1.49e-01 -0.147 0.101 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -227794 sc-eQTL 4.08e-02 -0.243 0.118 0.111 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0364 0.0957 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0116 0.0713 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0801 0.0857 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 350997 sc-eQTL 8.76e-01 0.0195 0.125 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0342 0.103 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 4.64e-07 0.45 0.0864 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 3.69e-01 0.0903 0.1 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 351020 sc-eQTL 1.31e-01 -0.203 0.134 0.111 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00303 0.129 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 9.04e-01 0.00828 0.0687 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 6.78e-01 0.0457 0.11 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 350997 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0728 0.122 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0965 0.0757 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 1.28e-04 0.419 0.107 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 7.31e-01 0.033 0.0958 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 351020 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0329 0.135 0.112 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0207 0.121 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 640037 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0882 0.105 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 936149 sc-eQTL 4.56e-01 -0.066 0.0883 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -91512 sc-eQTL 2.70e-01 -0.114 0.103 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 55307 sc-eQTL 2.45e-01 0.117 0.1 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 14823 sc-eQTL 7.53e-05 0.253 0.0626 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -331080 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0759 0.0938 0.11 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 270059 eQTL 0.000327 -0.0977 0.0271 0.0 0.0 0.105
ENSG00000051620 HEBP2 640037 eQTL 0.0458 -0.0668 0.0334 0.0 0.0 0.105
ENSG00000112406 HECA -91512 eQTL 0.0185 -0.0383 0.0162 0.0 0.0 0.105
ENSG00000135597 REPS1 55307 eQTL 0.026 0.0642 0.0288 0.0 0.0 0.105
ENSG00000146386 ABRACL 14823 eQTL 1e-16 0.324 0.0383 0.0 0.0 0.105

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135540 \N 350997 1.28e-06 1.08e-06 2.52e-07 1.56e-06 3.2e-07 6.43e-07 1.41e-06 3.68e-07 1.52e-06 4.11e-07 1.84e-06 6.02e-07 2.33e-06 2.74e-07 4.4e-07 8.02e-07 8.26e-07 6.5e-07 8.21e-07 6.52e-07 6.56e-07 1.45e-06 9.35e-07 5.58e-07 2.28e-06 3.63e-07 1.02e-06 8.64e-07 1.3e-06 1.25e-06 8.11e-07 3.45e-07 2.57e-07 5.96e-07 8.75e-07 4.63e-07 5.58e-07 2.97e-07 5.18e-07 2.03e-07 3.17e-07 1.43e-06 1.38e-07 5.68e-08 3.7e-07 3.38e-07 2.37e-07 1.96e-07 1.98e-07
ENSG00000135597 REPS1 55307 2.17e-05 2.05e-05 3.08e-06 9.8e-06 3.02e-06 7.99e-06 2.58e-05 3.1e-06 1.67e-05 8.56e-06 2.15e-05 8.63e-06 2.69e-05 6.24e-06 5.36e-06 9.46e-06 8.54e-06 1.41e-05 4.12e-06 4.69e-06 8.33e-06 1.55e-05 1.73e-05 5.48e-06 2.42e-05 5.44e-06 8.36e-06 7.75e-06 1.91e-05 1.38e-05 1.18e-05 1.42e-06 1.79e-06 4.13e-06 7.79e-06 3.76e-06 1.78e-06 2.69e-06 2.84e-06 2.33e-06 1.28e-06 1.89e-05 2.7e-06 2.66e-07 1.97e-06 2.67e-06 3.18e-06 1.3e-06 1.37e-06
ENSG00000146386 ABRACL 14823 3.75e-05 3.3e-05 6.31e-06 1.55e-05 5.98e-06 1.44e-05 4.51e-05 4.55e-06 3.11e-05 1.56e-05 3.78e-05 1.77e-05 4.74e-05 1.4e-05 7.05e-06 1.92e-05 1.77e-05 2.54e-05 7.83e-06 6.75e-06 1.52e-05 3.34e-05 3.24e-05 9.09e-06 4.38e-05 8.02e-06 1.46e-05 1.29e-05 3.23e-05 2.5e-05 2e-05 1.64e-06 2.62e-06 7.05e-06 1.16e-05 5.77e-06 3.17e-06 3.11e-06 4.65e-06 3.35e-06 1.74e-06 3.78e-05 3.58e-06 3.62e-07 2.55e-06 3.9e-06 4.08e-06 1.6e-06 1.5e-06