logo

Genes within 1Mb (chr6:139022755:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 1.26e-01 -0.119 0.0773 0.293 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 9.71e-02 0.0982 0.0589 0.293 B L1
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 1.16e-01 0.0929 0.0588 0.293 B L1
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 8.31e-02 0.131 0.075 0.293 B L1
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 4.81e-01 -0.047 0.0667 0.293 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 4.39e-04 -0.136 0.0381 0.293 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -269243 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0387 0.0961 0.293 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 5.17e-01 0.0392 0.0605 0.293 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -248607 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0269 0.0673 0.293 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 2.23e-01 -0.106 0.0865 0.293 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 7.81e-02 0.102 0.0579 0.293 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 3.76e-01 0.0486 0.0548 0.293 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 1.29e-01 0.11 0.072 0.293 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 3.00e-01 -0.059 0.0568 0.293 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 8.60e-01 0.00739 0.0417 0.293 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 5.81e-02 0.135 0.0707 0.293 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -216898 sc-eQTL 4.54e-01 0.0527 0.0702 0.293 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0595 0.094 0.293 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 6.70e-02 0.113 0.0611 0.293 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0448 0.0627 0.293 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 8.37e-02 0.116 0.0669 0.293 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0172 0.0633 0.293 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 2.33e-01 0.043 0.0359 0.293 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 4.23e-03 0.194 0.0671 0.293 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -216898 sc-eQTL 7.83e-01 0.0229 0.0831 0.293 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0882 0.0964 0.288 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0505 0.0678 0.288 DC L1
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0087 0.0796 0.288 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 330184 sc-eQTL 4.89e-01 0.0613 0.0885 0.288 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0773 0.0782 0.288 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 2.50e-02 0.171 0.0758 0.288 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 9.55e-01 0.00518 0.0911 0.288 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 330207 sc-eQTL 1.74e-01 -0.126 0.0922 0.288 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 5.58e-03 -0.194 0.0691 0.293 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00223 0.0487 0.293 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 9.94e-01 0.000484 0.0642 0.293 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 330184 sc-eQTL 2.43e-01 -0.107 0.0917 0.293 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0712 0.0536 0.293 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 1.66e-03 0.218 0.0685 0.293 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 4.17e-01 0.0602 0.074 0.293 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 330207 sc-eQTL 1.86e-01 -0.126 0.0953 0.293 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 6.55e-01 0.0389 0.087 0.292 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 1.24e-01 0.118 0.0762 0.292 NK L1
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 3.57e-01 0.0599 0.0649 0.292 NK L1
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 6.96e-02 0.136 0.0746 0.292 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0284 0.0716 0.292 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 2.13e-02 0.12 0.0516 0.292 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 6.15e-02 0.13 0.0689 0.292 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0375 0.0995 0.293 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 6.33e-01 0.0307 0.0642 0.293 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0543 0.0792 0.293 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 7.18e-03 0.192 0.0708 0.293 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 1.02e-01 -0.126 0.077 0.293 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 1.05e-02 0.129 0.05 0.293 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 1.71e-01 0.0813 0.0592 0.293 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 4.71e-01 0.0797 0.11 0.291 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0149 0.0969 0.291 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 3.21e-02 -0.107 0.0496 0.291 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 2.66e-01 0.117 0.105 0.291 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0752 0.11 0.291 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0507 0.0997 0.291 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -269243 sc-eQTL 9.13e-02 -0.144 0.0847 0.291 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 2.85e-02 -0.234 0.106 0.291 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -248607 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0164 0.107 0.291 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0658 0.0963 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0508 0.0667 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 4.55e-01 0.0636 0.0849 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 8.63e-01 0.0145 0.0835 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 7.59e-01 0.0277 0.0901 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 3.73e-01 0.0683 0.0765 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -269243 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0792 0.0938 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0122 0.0864 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -248607 sc-eQTL 5.37e-01 0.0579 0.0935 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0643 0.0979 0.293 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 7.66e-02 0.13 0.0731 0.293 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 4.06e-01 0.0764 0.0917 0.293 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 1.18e-01 0.132 0.0842 0.293 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 2.49e-02 -0.205 0.0907 0.293 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 7.53e-02 -0.129 0.0721 0.293 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -269243 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0585 0.0925 0.293 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 3.92e-01 0.0729 0.085 0.293 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -248607 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0677 0.104 0.293 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 2.00e-01 -0.12 0.0935 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 4.91e-02 0.129 0.0654 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 3.67e-01 0.0807 0.0893 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 7.02e-02 0.148 0.0812 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 6.34e-01 0.036 0.0757 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 2.13e-03 -0.161 0.0518 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -269243 sc-eQTL 5.81e-01 0.0548 0.0991 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 3.54e-01 0.0669 0.072 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -248607 sc-eQTL 7.68e-01 0.028 0.0946 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0606 0.0908 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 2.52e-01 0.0713 0.062 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 1.16e-01 0.117 0.0743 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 7.73e-01 0.0247 0.0856 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 2.78e-01 0.0886 0.0814 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 3.86e-02 -0.124 0.0595 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -269243 sc-eQTL 5.57e-01 0.0559 0.0951 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 1.06e-01 0.157 0.0965 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -248607 sc-eQTL 7.37e-01 0.0299 0.0891 0.292 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0467 0.0966 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 1.60e-02 0.2 0.0823 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 9.66e-02 0.169 0.101 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 5.75e-01 0.0547 0.0975 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0493 0.0947 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 8.12e-01 0.0205 0.0863 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 1.16e-01 0.136 0.0862 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -216898 sc-eQTL 3.72e-01 -0.08 0.0893 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0366 0.091 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 1.95e-01 0.0734 0.0565 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 1.86e-01 0.0991 0.0746 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 1.58e-01 0.0997 0.0704 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0153 0.0627 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0275 0.0422 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 1.01e-01 0.117 0.0713 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -216898 sc-eQTL 9.06e-01 0.0086 0.0725 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 8.34e-02 -0.154 0.0883 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 1.21e-01 0.102 0.0658 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 1.95e-01 -0.107 0.0827 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 2.84e-01 0.0761 0.0709 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0727 0.0672 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 1.20e-01 0.0805 0.0516 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 2.90e-02 0.168 0.0762 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -216898 sc-eQTL 3.90e-01 0.0716 0.0832 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0811 0.101 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 3.25e-01 0.068 0.0688 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00653 0.0802 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 6.46e-01 0.0362 0.0787 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0193 0.0858 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 5.40e-01 0.0375 0.0611 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 5.43e-02 0.154 0.0796 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -216898 sc-eQTL 9.21e-01 0.00831 0.0841 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 6.71e-01 0.0447 0.105 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 5.05e-02 0.146 0.0743 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 2.84e-01 -0.1 0.0933 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 3.79e-01 0.0672 0.0763 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 3.67e-02 -0.17 0.081 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 1.94e-03 0.203 0.0647 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 4.30e-02 0.155 0.0763 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -216898 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0213 0.0925 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 1.77e-01 -0.131 0.097 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 2.38e-01 0.0735 0.0621 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0232 0.0749 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 3.95e-01 0.064 0.0751 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0243 0.0754 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 8.17e-01 -0.00918 0.0396 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 9.75e-02 0.132 0.0794 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -216898 sc-eQTL 5.23e-01 0.0585 0.0914 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 4.93e-01 0.0751 0.109 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 1.65e-01 0.107 0.0765 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 4.08e-02 -0.207 0.1 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 1.20e-01 0.124 0.0795 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 8.04e-01 0.0207 0.0832 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0256 0.0829 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 9.77e-01 0.00251 0.0852 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -216898 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0661 0.0898 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 3.17e-01 0.103 0.103 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 1.54e-01 0.133 0.093 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 7.22e-01 -0.038 0.107 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0219 0.0962 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 9.22e-01 0.00976 0.1 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 1.82e-01 0.103 0.0768 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 8.41e-02 0.145 0.0832 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -216898 sc-eQTL 1.29e-01 -0.144 0.0948 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 2.90e-01 -0.113 0.107 0.29 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 7.88e-01 0.02 0.0743 0.29 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 1.26e-01 -0.15 0.0978 0.29 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 4.26e-02 0.165 0.0807 0.29 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 1.38e-02 -0.215 0.0865 0.29 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 1.86e-02 0.151 0.0637 0.29 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 7.64e-01 0.0229 0.0759 0.29 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 4.44e-01 0.077 0.1 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 7.27e-01 0.0299 0.0855 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 1.89e-01 -0.12 0.0911 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 2.39e-01 0.107 0.0907 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 8.12e-01 0.0202 0.0849 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 1.76e-02 -0.185 0.0772 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 5.80e-01 0.0465 0.0839 0.289 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0114 0.094 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 1.59e-01 0.117 0.083 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 1.54e-01 0.107 0.0744 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 8.73e-02 0.138 0.0803 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 9.66e-01 0.00329 0.0766 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 2.12e-02 0.119 0.0512 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 3.05e-02 0.149 0.0684 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 7.61e-01 0.0333 0.109 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 1.38e-01 0.138 0.0926 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 6.30e-02 0.153 0.082 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 2.16e-01 0.126 0.102 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 2.67e-02 -0.222 0.0996 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 5.27e-01 0.0525 0.0829 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 1.12e-01 0.141 0.088 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 6.22e-01 0.0484 0.098 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 3.08e-01 0.0862 0.0843 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 6.30e-01 -0.038 0.0787 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 2.69e-01 0.0934 0.0842 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0239 0.0872 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 1.66e-02 0.134 0.0554 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 8.90e-02 0.124 0.0729 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 5.50e-01 0.0694 0.116 0.3 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 7.70e-01 0.0301 0.103 0.3 PB L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 1.91e-02 0.182 0.0766 0.3 PB L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 7.49e-01 0.0405 0.126 0.3 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 1.11e-01 -0.178 0.111 0.3 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 1.16e-01 0.123 0.0776 0.3 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -269243 sc-eQTL 6.30e-01 0.0553 0.114 0.3 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 9.97e-01 0.000279 0.0863 0.3 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -248607 sc-eQTL 3.54e-01 -0.107 0.115 0.3 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 5.05e-02 -0.203 0.103 0.296 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0336 0.0828 0.296 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0075 0.0766 0.296 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 7.59e-03 0.217 0.0805 0.296 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 1.77e-01 0.13 0.096 0.296 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 2.12e-01 0.0776 0.0619 0.296 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 2.57e-02 0.164 0.0732 0.296 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0615 0.097 0.293 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 3.59e-01 0.0609 0.0662 0.293 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 5.51e-01 0.0622 0.104 0.293 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 4.12e-01 0.0662 0.0805 0.293 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0454 0.0834 0.293 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 6.28e-01 0.0345 0.0711 0.293 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 1.22e-01 0.122 0.0789 0.293 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -216898 sc-eQTL 4.18e-01 0.0735 0.0906 0.293 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 1.18e-02 -0.245 0.0962 0.283 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0663 0.0701 0.283 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 8.30e-01 0.0201 0.0931 0.283 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 330184 sc-eQTL 7.33e-01 0.0311 0.0911 0.283 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 1.49e-01 -0.151 0.104 0.283 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 8.35e-02 0.148 0.0852 0.283 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 7.24e-01 0.0323 0.0911 0.283 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 330207 sc-eQTL 2.73e-01 -0.11 0.1 0.283 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 2.32e-02 -0.174 0.076 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0415 0.0552 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0571 0.0634 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 330184 sc-eQTL 5.19e-01 0.0597 0.0925 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 5.29e-01 0.052 0.0825 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 7.79e-04 0.231 0.0677 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 5.86e-01 0.0396 0.0726 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 330207 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0679 0.0968 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00948 0.0886 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 1.53e-01 0.0865 0.0603 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 8.54e-01 0.0138 0.0749 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 330184 sc-eQTL 6.05e-02 -0.178 0.0941 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 2.75e-02 -0.197 0.0887 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 9.29e-03 0.202 0.0768 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 1.08e-01 0.124 0.0768 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 330207 sc-eQTL 1.31e-01 -0.157 0.103 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 2.01e-02 0.268 0.114 0.294 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 1.86e-02 0.258 0.108 0.294 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 6.68e-01 0.0441 0.103 0.294 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 3.92e-01 0.0944 0.11 0.294 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 3.17e-01 0.114 0.114 0.294 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 9.29e-01 0.00764 0.0858 0.294 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0305 0.0989 0.294 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 5.44e-03 -0.287 0.102 0.289 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 2.40e-01 0.0821 0.0697 0.289 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 5.23e-01 0.0546 0.0854 0.289 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 330184 sc-eQTL 3.29e-02 -0.2 0.0932 0.289 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0838 0.0972 0.289 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 2.67e-03 0.264 0.0869 0.289 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 3.83e-03 0.247 0.0845 0.289 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 330207 sc-eQTL 3.21e-02 -0.226 0.105 0.289 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 2.06e-01 -0.123 0.0969 0.287 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0529 0.0579 0.287 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 8.15e-01 0.0209 0.0889 0.287 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 330184 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0966 0.0932 0.287 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0908 0.0701 0.287 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 3.37e-02 0.179 0.0839 0.287 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 4.71e-01 0.052 0.0719 0.287 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 330207 sc-eQTL 9.10e-01 0.0117 0.104 0.287 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0326 0.11 0.288 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 2.11e-01 -0.107 0.0852 0.288 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0653 0.0931 0.288 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 330184 sc-eQTL 1.65e-01 0.118 0.0847 0.288 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 7.70e-01 0.0253 0.0864 0.288 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 3.82e-01 0.0825 0.0941 0.288 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 1.43e-01 0.162 0.11 0.288 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 330207 sc-eQTL 8.47e-02 -0.147 0.0848 0.288 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0302 0.0928 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 5.04e-01 0.0429 0.0642 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 1.87e-01 0.112 0.0843 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 3.64e-01 0.075 0.0824 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 7.83e-02 -0.15 0.085 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 1.71e-01 -0.0812 0.0591 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -269243 sc-eQTL 1.44e-01 -0.143 0.0977 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0202 0.0833 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -248607 sc-eQTL 5.01e-01 0.0652 0.0968 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 1.53e-01 -0.124 0.0862 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 5.32e-02 0.116 0.0595 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 1.33e-01 0.132 0.0878 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 1.22e-01 0.125 0.0805 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 1.77e-01 0.0931 0.0688 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 9.18e-04 -0.159 0.0472 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -269243 sc-eQTL 8.57e-01 0.0183 0.101 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 3.75e-01 0.0654 0.0735 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -248607 sc-eQTL 9.47e-01 0.00575 0.0866 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 6.17e-02 -0.132 0.0704 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 9.79e-01 0.00142 0.0529 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 5.20e-01 -0.041 0.0636 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 330184 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0335 0.0931 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0876 0.0763 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 7.78e-04 0.226 0.0663 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 4.25e-01 0.0595 0.0745 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 330207 sc-eQTL 1.87e-01 -0.132 0.0995 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 1.92e-03 -0.295 0.0938 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0104 0.0512 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 7.97e-01 0.0211 0.0819 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 330184 sc-eQTL 1.66e-02 -0.217 0.0899 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0495 0.0566 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 1.24e-02 0.206 0.0818 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 7.85e-02 0.126 0.071 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 330207 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0603 0.101 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 sc-eQTL 6.74e-01 0.0381 0.0904 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 619224 sc-eQTL 1.73e-01 0.107 0.0781 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 915336 sc-eQTL 2.56e-01 0.0752 0.066 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -112325 sc-eQTL 4.27e-02 0.156 0.0764 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 34494 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0401 0.0753 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -5990 sc-eQTL 3.62e-03 0.14 0.0477 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -351893 sc-eQTL 5.02e-02 0.137 0.0696 0.289 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 eQTL 0.012 -0.0423 0.0168 0.0 0.0 0.295
ENSG00000112406 HECA -112325 eQTL 0.0106 0.0257 0.01 0.0 0.0 0.295
ENSG00000135597 REPS1 34494 eQTL 3.57e-08 -0.0976 0.0176 0.00122 0.0 0.295
ENSG00000146386 ABRACL -5990 eQTL 9.41e-24 0.24 0.0233 0.291 0.0 0.295
ENSG00000226571 AL592429.2 -248607 eQTL 1.11e-02 0.0897 0.0353 0.00131 0.0 0.295

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A 249246 1.5e-06 1.38e-06 2.84e-07 1.28e-06 3.71e-07 6.12e-07 1.52e-06 3.99e-07 1.68e-06 6.65e-07 2.1e-06 9.26e-07 2.51e-06 3.61e-07 5.36e-07 1.01e-06 1.01e-06 1.09e-06 8.15e-07 4.58e-07 7.86e-07 1.91e-06 1.18e-06 5.47e-07 2.35e-06 7.53e-07 1.03e-06 8.66e-07 1.6e-06 1.23e-06 8.22e-07 2.71e-07 2.69e-07 6.67e-07 6.46e-07 5.06e-07 6.91e-07 3.23e-07 4.72e-07 3.15e-07 2.92e-07 2.11e-06 4.23e-07 8.1e-08 2.86e-07 2.31e-07 2.28e-07 9.26e-08 1.83e-07
ENSG00000135597 REPS1 34494 1.39e-05 1.33e-05 2.47e-06 7.29e-06 2.37e-06 5.82e-06 1.51e-05 2.41e-06 1.14e-05 6.09e-06 1.68e-05 6.87e-06 2.13e-05 5.16e-06 4.14e-06 8.18e-06 7.11e-06 1.08e-05 2.99e-06 3.29e-06 6.48e-06 1.27e-05 1.21e-05 3.52e-06 2.06e-05 4.58e-06 7.16e-06 5.32e-06 1.35e-05 1.19e-05 7.72e-06 9.95e-07 1.27e-06 3.55e-06 5.63e-06 2.8e-06 1.83e-06 2.09e-06 2.06e-06 1.11e-06 9.34e-07 1.8e-05 2.48e-06 1.65e-07 9.29e-07 1.89e-06 1.99e-06 6.86e-07 4.55e-07
ENSG00000146386 ABRACL -5990 3.12e-05 2.96e-05 5.66e-06 1.51e-05 5.42e-06 1.36e-05 4.07e-05 4.55e-06 2.6e-05 1.39e-05 3.55e-05 1.65e-05 4.46e-05 1.4e-05 7.03e-06 1.64e-05 1.61e-05 2.32e-05 7.02e-06 6.77e-06 1.4e-05 3.03e-05 2.92e-05 8.24e-06 3.91e-05 7.34e-06 1.26e-05 1.16e-05 2.89e-05 2.53e-05 1.74e-05 1.61e-06 2.61e-06 6.84e-06 1.11e-05 5.16e-06 2.85e-06 3.18e-06 4.54e-06 3.24e-06 1.74e-06 3.56e-05 3.74e-06 2.52e-07 2.25e-06 3.65e-06 4.05e-06 1.47e-06 1.43e-06