logo

Genes within 1Mb (chr6:138980040:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0256 0.0833 0.248 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0371 0.0635 0.248 B L1
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0406 0.0634 0.248 B L1
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 1.68e-01 -0.112 0.0807 0.248 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 6.56e-02 0.131 0.071 0.248 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 6.77e-02 0.0766 0.0417 0.248 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -311958 sc-eQTL 4.82e-02 0.203 0.102 0.248 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 4.18e-01 0.0526 0.0648 0.248 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -291322 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0266 0.0722 0.248 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 8.74e-01 0.015 0.0945 0.248 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 3.74e-01 0.0564 0.0633 0.248 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 5.05e-02 0.117 0.0592 0.248 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 3.56e-01 0.0727 0.0786 0.248 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0284 0.0619 0.248 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0424 0.0453 0.248 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0097 0.0775 0.248 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -259613 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0429 0.0764 0.248 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0322 0.102 0.248 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 3.12e-01 0.0675 0.0665 0.248 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 1.78e-01 0.0914 0.0676 0.248 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.04e-01 0.0278 0.0729 0.248 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0305 0.0685 0.248 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 3.10e-02 -0.0839 0.0386 0.248 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 7.60e-01 0.0226 0.0741 0.248 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -259613 sc-eQTL 6.70e-01 0.0384 0.09 0.248 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 2.13e-01 0.124 0.0994 0.252 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 4.06e-01 0.0583 0.0701 0.252 DC L1
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 2.20e-01 0.101 0.0819 0.252 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 287469 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0337 0.0915 0.252 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 5.71e-01 0.0459 0.0809 0.252 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 1.18e-01 -0.124 0.0788 0.252 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00545 0.0941 0.252 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 287492 sc-eQTL 8.19e-01 0.0219 0.0957 0.252 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0506 0.0715 0.248 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 8.58e-01 0.00889 0.0495 0.248 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 8.24e-01 0.0146 0.0653 0.248 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 287469 sc-eQTL 7.33e-01 -0.032 0.0935 0.248 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 4.80e-01 0.0387 0.0547 0.248 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 4.21e-04 -0.248 0.0692 0.248 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0563 0.0753 0.248 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 287492 sc-eQTL 4.71e-02 0.192 0.0964 0.248 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 5.76e-01 -0.049 0.0876 0.247 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00535 0.0772 0.247 NK L1
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 8.37e-01 0.0135 0.0656 0.247 NK L1
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 5.86e-01 0.0413 0.0757 0.247 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 7.24e-01 0.0255 0.0721 0.247 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 1.92e-02 -0.123 0.052 0.247 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 3.81e-01 0.0614 0.0699 0.247 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 8.98e-01 0.0136 0.106 0.248 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 1.01e-01 0.112 0.0681 0.248 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 2.56e-01 0.0959 0.0843 0.248 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0224 0.0768 0.248 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 7.98e-01 0.0211 0.0826 0.248 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 3.27e-01 -0.053 0.0539 0.248 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0388 0.0632 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 2.51e-01 -0.136 0.118 0.245 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 1.68e-01 -0.143 0.104 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0139 0.0541 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.79e-01 0.0318 0.113 0.245 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0331 0.118 0.245 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 4.21e-01 0.0864 0.107 0.245 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -311958 sc-eQTL 1.50e-01 0.132 0.0913 0.245 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 1.83e-01 0.154 0.115 0.245 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -291322 sc-eQTL 4.11e-01 -0.095 0.115 0.245 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 5.02e-01 0.0687 0.102 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 4.85e-01 0.0496 0.0708 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 6.26e-01 -0.044 0.0902 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0878 0.0884 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 9.00e-01 0.012 0.0956 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0315 0.0814 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -311958 sc-eQTL 8.92e-01 0.0135 0.0997 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0694 0.0916 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -291322 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0949 0.0992 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 5.94e-01 0.0553 0.104 0.246 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0314 0.078 0.246 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 3.85e-01 0.0845 0.0971 0.246 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.01e-01 0.0345 0.0897 0.246 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 7.78e-02 0.171 0.0965 0.246 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0745 0.0767 0.246 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -311958 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0255 0.0981 0.246 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0479 0.0901 0.246 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -291322 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0936 0.11 0.246 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00984 0.0968 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0629 0.0679 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0822 0.0921 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0932 0.0842 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 2.54e-01 0.089 0.0779 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 4.76e-02 0.108 0.0541 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -311958 sc-eQTL 8.12e-03 0.269 0.101 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 5.55e-01 0.044 0.0744 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -291322 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00975 0.0976 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 7.72e-01 0.0272 0.094 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0599 0.0642 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 1.39e-01 0.114 0.0769 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 5.96e-01 -0.047 0.0885 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00607 0.0845 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 3.00e-01 0.0644 0.062 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -311958 sc-eQTL 8.26e-01 0.0217 0.0984 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 2.65e-01 -0.112 0.1 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -291322 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0279 0.0922 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 2.69e-01 0.112 0.101 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0516 0.0874 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 7.20e-01 0.0382 0.106 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 4.23e-01 0.0819 0.102 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 2.86e-01 0.106 0.0989 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 8.18e-01 0.0208 0.0904 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 2.16e-01 0.112 0.0905 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -259613 sc-eQTL 1.09e-01 0.15 0.0931 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 3.94e-01 0.0841 0.0984 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 3.52e-01 0.0572 0.0614 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 3.34e-01 0.0785 0.081 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 5.89e-01 0.0414 0.0766 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0317 0.0679 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00281 0.0458 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 7.55e-01 0.0242 0.0777 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -259613 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0249 0.0786 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 1.96e-01 -0.125 0.0963 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 7.39e-01 0.024 0.0719 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 9.95e-01 0.00053 0.0902 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 5.13e-01 0.0507 0.0772 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0197 0.0733 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 2.68e-01 -0.0624 0.0562 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0649 0.0837 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -259613 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0907 0.0904 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 8.01e-01 0.0272 0.108 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0179 0.0737 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 4.24e-01 0.0685 0.0856 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0153 0.0842 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0191 0.0917 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0353 0.0653 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00422 0.0858 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -259613 sc-eQTL 2.57e-01 -0.102 0.0895 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00132 0.109 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 3.57e-01 0.0716 0.0775 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 2.35e-02 0.218 0.0958 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0255 0.0792 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 8.00e-01 0.0215 0.0848 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0831 0.0683 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0124 0.0799 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -259613 sc-eQTL 6.03e-02 0.179 0.095 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 6.56e-01 0.0473 0.106 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 1.04e-01 0.11 0.0673 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 6.84e-01 0.0331 0.0814 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 6.96e-01 0.032 0.0818 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 8.57e-01 0.0148 0.082 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0603 0.0428 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 5.26e-01 0.0551 0.0869 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -259613 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00245 0.0995 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 2.39e-01 0.136 0.115 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0428 0.081 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 1.66e-01 0.148 0.107 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 6.38e-01 0.0397 0.0843 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 9.72e-02 -0.145 0.0871 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 5.19e-02 0.169 0.0866 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0679 0.0897 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -259613 sc-eQTL 2.26e-01 -0.115 0.0945 0.243 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 9.82e-01 0.00241 0.109 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 5.03e-01 0.0666 0.0993 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 3.97e-01 0.096 0.113 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 5.46e-01 0.0618 0.102 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0824 0.106 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 1.54e-01 -0.117 0.0817 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 7.00e-01 0.0344 0.0892 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -259613 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0175 0.101 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 7.38e-01 0.0384 0.115 0.247 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 2.31e-01 0.0952 0.0792 0.247 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 1.61e-02 0.252 0.104 0.247 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0789 0.0869 0.247 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 4.75e-01 0.0671 0.0937 0.247 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0789 0.0688 0.247 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0227 0.0812 0.247 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0168 0.102 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 5.85e-01 0.0477 0.0871 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0288 0.0933 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0278 0.0928 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 8.86e-01 0.0124 0.0866 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 8.50e-01 0.0151 0.0798 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0637 0.0854 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0459 0.0947 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0172 0.0841 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0583 0.0753 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 3.34e-01 0.0787 0.0813 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 5.12e-01 0.0507 0.0772 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 2.15e-02 -0.12 0.0517 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 1.57e-01 0.0986 0.0694 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 4.61e-01 0.0799 0.108 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 9.16e-01 0.00979 0.0924 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0788 0.0819 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 8.29e-01 0.0219 0.101 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 6.12e-01 0.0508 0.1 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0404 0.0823 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 3.63e-02 0.183 0.0869 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 2.60e-01 -0.11 0.0972 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 9.45e-01 0.00584 0.084 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 7.16e-01 0.0286 0.0783 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0324 0.084 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0678 0.0866 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0729 0.0556 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 8.89e-01 0.0102 0.0729 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 6.08e-02 -0.227 0.12 0.274 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 2.94e-01 -0.113 0.108 0.274 PB L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 7.43e-01 0.027 0.0823 0.274 PB L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0446 0.132 0.274 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 2.64e-02 0.259 0.115 0.274 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0703 0.0821 0.274 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -311958 sc-eQTL 9.36e-01 0.0096 0.12 0.274 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 4.54e-01 0.0679 0.0903 0.274 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -291322 sc-eQTL 1.24e-01 0.186 0.12 0.274 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0162 0.11 0.248 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 8.24e-01 0.0196 0.0879 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0307 0.0812 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0456 0.0868 0.248 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0233 0.102 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 7.47e-01 0.0213 0.066 0.248 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 1.73e-01 -0.107 0.0783 0.248 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 4.02e-01 0.0859 0.102 0.248 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 6.87e-01 0.0282 0.0699 0.248 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 1.84e-04 0.406 0.107 0.248 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.77e-01 0.0241 0.0851 0.248 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 1.84e-01 0.117 0.0877 0.248 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0387 0.075 0.248 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 9.76e-01 0.00254 0.0837 0.248 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -259613 sc-eQTL 3.11e-01 -0.097 0.0955 0.248 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 1.88e-01 0.131 0.0992 0.254 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 5.29e-01 0.045 0.0714 0.254 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 3.37e-01 0.0911 0.0946 0.254 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 287469 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0178 0.0928 0.254 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 5.08e-01 0.0708 0.107 0.254 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 8.20e-02 -0.152 0.0867 0.254 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 9.48e-01 -0.006 0.0927 0.254 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 287492 sc-eQTL 8.59e-01 0.0182 0.102 0.254 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0241 0.0779 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 7.81e-01 0.0156 0.0559 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.89e-01 0.0172 0.0643 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 287469 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0637 0.0936 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 9.39e-01 0.00643 0.0837 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 2.64e-04 -0.253 0.0682 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0355 0.0736 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 287492 sc-eQTL 2.90e-02 0.213 0.097 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 8.70e-01 0.0146 0.0892 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0646 0.0609 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 9.19e-01 0.00767 0.0754 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 287469 sc-eQTL 1.45e-01 0.139 0.0951 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0255 0.0904 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 9.48e-03 -0.203 0.0774 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0699 0.0777 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 287492 sc-eQTL 4.17e-01 0.0851 0.105 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 7.43e-01 0.0421 0.128 0.221 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0581 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 2.46e-01 0.132 0.113 0.221 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0364 0.122 0.221 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 2.99e-01 -0.131 0.126 0.221 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 1.78e-01 0.128 0.0944 0.221 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 2.13e-01 0.136 0.109 0.221 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 6.53e-01 -0.048 0.107 0.247 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0486 0.0715 0.247 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 7.05e-01 0.0332 0.0875 0.247 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 287469 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0565 0.0964 0.247 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 5.46e-01 0.0602 0.0996 0.247 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 4.17e-02 -0.184 0.09 0.247 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0955 0.0881 0.247 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 287492 sc-eQTL 6.93e-01 0.0428 0.108 0.247 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0221 0.0971 0.249 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 5.25e-01 0.0369 0.0579 0.249 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0401 0.0887 0.249 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 287469 sc-eQTL 2.19e-01 -0.115 0.0929 0.249 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 6.87e-02 0.128 0.0697 0.249 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 3.08e-03 -0.248 0.0828 0.249 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0595 0.0718 0.249 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 287492 sc-eQTL 1.26e-01 0.158 0.103 0.249 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 7.99e-01 0.0283 0.111 0.249 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00797 0.0861 0.249 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 4.78e-01 0.0666 0.0936 0.249 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 287469 sc-eQTL 7.73e-01 0.0248 0.0857 0.249 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 1.46e-01 0.126 0.0863 0.249 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0231 0.0949 0.249 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 6.18e-01 0.0558 0.112 0.249 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 287492 sc-eQTL 7.20e-01 0.0309 0.0861 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 8.65e-01 0.0168 0.0989 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 9.57e-01 0.00371 0.0685 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 6.25e-01 0.0442 0.0902 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0523 0.0879 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 6.28e-01 0.0443 0.0912 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0156 0.0632 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -311958 sc-eQTL 6.51e-01 0.0474 0.105 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0585 0.0887 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -291322 sc-eQTL 2.85e-01 -0.111 0.103 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0356 0.0909 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0811 0.0628 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0593 0.0925 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0909 0.0848 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 5.63e-01 0.042 0.0724 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 6.10e-02 0.095 0.0504 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -311958 sc-eQTL 3.58e-02 0.223 0.105 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 4.18e-01 0.0627 0.0772 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -291322 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0132 0.0909 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0166 0.0718 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 8.32e-01 0.0114 0.0536 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 6.62e-01 0.0282 0.0644 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 287469 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0202 0.0942 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0166 0.0775 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 1.98e-04 -0.253 0.0667 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0667 0.0753 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 287492 sc-eQTL 7.80e-02 0.178 0.1 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0512 0.0981 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 5.77e-01 0.0293 0.0524 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0067 0.0838 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 287469 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0578 0.0931 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 7.58e-02 0.103 0.0576 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 7.74e-03 -0.225 0.0835 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0882 0.0729 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 287492 sc-eQTL 2.12e-01 0.128 0.103 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 206531 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0472 0.0908 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 576509 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00478 0.0788 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 872621 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00676 0.0665 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -155040 sc-eQTL 5.55e-01 0.0458 0.0775 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -8221 sc-eQTL 9.08e-01 0.00877 0.0757 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -48705 sc-eQTL 2.17e-02 -0.112 0.0483 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -394608 sc-eQTL 2.88e-01 0.075 0.0705 0.248 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 287469 eQTL 0.0227 -0.0635 0.0278 0.0 0.0 0.24
ENSG00000135597 REPS1 -8221 pQTL 0.0285 0.0639 0.0292 0.0011 0.0 0.249
ENSG00000135597 REPS1 -8221 eQTL 2.42e-08 0.106 0.0189 0.00704 0.00498 0.24
ENSG00000146386 ABRACL -48705 eQTL 5.6e-14 -0.195 0.0256 0.0 0.0 0.24
ENSG00000226571 AL592429.2 -291322 eQTL 9.39e-03 -0.0987 0.0379 0.00158 0.0 0.24

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000135597 REPS1 -8221 2.99e-05 3.04e-05 5.11e-06 1.41e-05 4.43e-06 1.17e-05 3.81e-05 3.8e-06 2.5e-05 1.23e-05 3.3e-05 1.23e-05 4.29e-05 1.17e-05 6.11e-06 1.53e-05 1.38e-05 2.1e-05 6.91e-06 5.36e-06 1.18e-05 2.74e-05 2.66e-05 7.43e-06 3.79e-05 6.4e-06 1.13e-05 1.08e-05 2.85e-05 2.17e-05 1.69e-05 1.63e-06 2.22e-06 6.16e-06 9.74e-06 4.59e-06 2.56e-06 2.89e-06 3.81e-06 2.85e-06 1.62e-06 3.54e-05 2.88e-06 2.85e-07 2.11e-06 3.29e-06 3.46e-06 1.5e-06 1.41e-06
ENSG00000146386 ABRACL -48705 9.27e-06 1.15e-05 1.32e-06 5.14e-06 2.1e-06 3.7e-06 1.01e-05 1.69e-06 7.74e-06 4.73e-06 1.13e-05 4.64e-06 1.36e-05 3.87e-06 1.69e-06 6.35e-06 3.84e-06 5.52e-06 2.26e-06 2.26e-06 3.6e-06 8.24e-06 6.98e-06 1.95e-06 1.39e-05 2.84e-06 4.85e-06 3.15e-06 9.05e-06 7.86e-06 4.97e-06 4.97e-07 7.24e-07 2.78e-06 3.09e-06 1.56e-06 1.03e-06 5.57e-07 1.38e-06 7.21e-07 4.41e-07 1.29e-05 1.23e-06 1.46e-07 7.55e-07 1.32e-06 9.61e-07 6.82e-07 5.74e-07
ENSG00000226571 AL592429.2 -291322 1.28e-06 9.29e-07 2.52e-07 5.11e-07 1.64e-07 4.39e-07 9.97e-07 2.71e-07 9.42e-07 2.67e-07 1.26e-06 5.69e-07 1.48e-06 2.57e-07 4.03e-07 5.02e-07 7.22e-07 5.16e-07 3.98e-07 3.09e-07 2.49e-07 7.21e-07 6.26e-07 2.95e-07 1.92e-06 2.47e-07 6.75e-07 3.95e-07 8.81e-07 9.93e-07 4.61e-07 4.75e-08 4.92e-08 2.19e-07 3.22e-07 1.94e-07 1.44e-07 1.24e-07 7.63e-08 1.79e-08 6.31e-08 1.43e-06 1.22e-07 6.51e-08 1.96e-07 7.09e-08 1.3e-07 4.41e-08 6.46e-08