Genes within 1Mb (chr6:138950991:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 8.23e-01 0.0217 0.0968 0.16 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0635 0.0738 0.16 B L1
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 9.27e-01 0.00678 0.0738 0.16 B L1
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 1.06e-01 -0.152 0.0936 0.16 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 2.61e-02 -0.184 0.0822 0.16 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 5.11e-02 -0.095 0.0484 0.16 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -341007 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0641 0.12 0.16 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 6.11e-01 0.0384 0.0754 0.16 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -320371 sc-eQTL 7.68e-01 0.0248 0.0839 0.16 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 6.12e-01 0.0545 0.107 0.16 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 9.06e-01 0.00854 0.072 0.16 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 4.40e-01 0.0525 0.0678 0.16 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 1.12e-01 -0.142 0.089 0.16 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 3.40e-01 0.0671 0.0702 0.16 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 1.03e-02 -0.132 0.0508 0.16 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 7.81e-01 0.0245 0.0881 0.16 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -288662 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0584 0.0868 0.16 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 1.82e-01 0.156 0.116 0.16 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0386 0.0766 0.16 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0369 0.078 0.16 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 1.90e-01 -0.11 0.0834 0.16 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 6.01e-01 0.0413 0.0787 0.16 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 6.67e-02 -0.082 0.0445 0.16 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 7.23e-01 0.0302 0.0851 0.16 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -288662 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0464 0.103 0.16 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 9.69e-01 0.00458 0.119 0.158 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 2.13e-01 -0.104 0.0834 0.158 DC L1
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 2.10e-01 -0.123 0.0977 0.158 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 258420 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0129 0.109 0.158 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 3.20e-01 0.096 0.0963 0.158 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 4.15e-01 0.0771 0.0944 0.158 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0433 0.112 0.158 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 258443 sc-eQTL 1.76e-01 -0.154 0.114 0.158 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 5.18e-01 0.0556 0.0859 0.16 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0581 0.0593 0.16 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 2.62e-01 -0.088 0.0782 0.16 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 258420 sc-eQTL 7.24e-02 0.201 0.111 0.16 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00816 0.0658 0.16 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0795 0.0854 0.16 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 8.70e-02 0.155 0.0899 0.16 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 258443 sc-eQTL 3.19e-01 -0.117 0.117 0.16 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 1.21e-01 0.164 0.105 0.161 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 6.17e-01 0.0467 0.0932 0.161 NK L1
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 2.73e-01 0.0867 0.0789 0.161 NK L1
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 2.53e-01 -0.105 0.0912 0.161 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0418 0.0871 0.161 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0689 0.0634 0.161 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 5.22e-01 0.0541 0.0845 0.161 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0674 0.124 0.16 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0919 0.0799 0.16 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 5.23e-01 0.0631 0.0988 0.16 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0534 0.0898 0.16 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0403 0.0966 0.16 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0221 0.0632 0.16 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 3.21e-01 0.0735 0.0739 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 5.77e-01 0.0784 0.14 0.166 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 3.44e-01 0.116 0.123 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0955 0.0635 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 6.50e-02 -0.246 0.132 0.166 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0393 0.14 0.166 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.32e-01 0.0434 0.127 0.166 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -341007 sc-eQTL 2.20e-01 -0.133 0.108 0.166 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0913 0.136 0.166 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -320371 sc-eQTL 2.11e-01 -0.171 0.136 0.166 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 4.61e-01 0.0883 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0915 0.0826 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 9.70e-01 -0.004 0.105 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 2.39e-01 -0.122 0.103 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 1.03e-02 -0.285 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.76e-01 0.0271 0.0952 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -341007 sc-eQTL 1.21e-01 0.18 0.116 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 9.47e-01 0.00719 0.107 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -320371 sc-eQTL 5.78e-01 0.0647 0.116 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0342 0.123 0.162 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 5.10e-01 0.0608 0.0922 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0268 0.115 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00342 0.106 0.162 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 4.44e-02 -0.23 0.114 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 9.32e-02 -0.152 0.0903 0.162 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -341007 sc-eQTL 2.19e-01 -0.142 0.116 0.162 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 7.23e-01 0.0378 0.107 0.162 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -320371 sc-eQTL 4.23e-01 0.105 0.131 0.162 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0421 0.116 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 8.85e-01 0.0118 0.0817 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0389 0.111 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 4.89e-02 -0.199 0.1 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 7.08e-01 0.0352 0.0938 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 8.67e-01 -0.011 0.0656 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -341007 sc-eQTL 8.45e-01 0.0241 0.123 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 6.26e-01 0.0435 0.0893 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -320371 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0332 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 1.66e-01 0.158 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0488 0.0779 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0511 0.0936 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0362 0.107 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 6.35e-01 0.0487 0.102 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0566 0.0753 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -341007 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0569 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 9.38e-01 0.00946 0.122 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -320371 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0408 0.112 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 9.91e-01 0.00134 0.119 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 5.81e-01 0.0566 0.102 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 2.29e-01 0.15 0.124 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 4.83e-01 -0.084 0.12 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0187 0.116 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0416 0.106 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 7.78e-01 0.0301 0.106 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -288662 sc-eQTL 5.62e-01 0.0638 0.11 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 7.25e-01 0.0402 0.114 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 7.35e-01 0.0241 0.0711 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0585 0.0938 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 1.18e-01 -0.138 0.0881 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 3.96e-01 0.0667 0.0785 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 3.06e-02 -0.114 0.0523 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 8.24e-01 0.02 0.0898 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -288662 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0512 0.0908 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 2.19e-01 0.135 0.11 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 9.83e-01 0.00175 0.082 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00811 0.103 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 7.13e-02 -0.159 0.0875 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0229 0.0836 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0934 0.064 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 4.09e-01 0.0789 0.0954 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -288662 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0238 0.103 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00112 0.125 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 6.95e-01 0.0334 0.085 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00725 0.0989 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 6.08e-02 -0.182 0.0963 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 1.50e-01 0.152 0.105 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 4.44e-02 -0.151 0.0747 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 7.81e-01 0.0276 0.099 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -288662 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00543 0.104 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 2.91e-01 0.136 0.129 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0281 0.092 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 2.88e-01 -0.122 0.115 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 2.07e-01 -0.118 0.0935 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0947 0.1 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.07e-02 -0.147 0.0806 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 9.71e-01 0.00349 0.0946 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -288662 sc-eQTL 1.51e-01 -0.163 0.113 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 6.90e-01 0.0493 0.123 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0214 0.0788 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 1.10e-01 -0.151 0.0941 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 3.28e-01 -0.093 0.0949 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 3.36e-01 0.0918 0.0952 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0364 0.05 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 5.51e-01 0.0604 0.101 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -288662 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0788 0.116 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 2.97e-01 0.145 0.139 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 7.51e-01 0.0311 0.0978 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 1.47e-01 0.187 0.128 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 2.00e-01 -0.13 0.101 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0294 0.106 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.90e-03 -0.278 0.104 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0535 0.108 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -288662 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0581 0.114 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 6.57e-01 0.0558 0.126 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 3.33e-01 0.111 0.114 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0192 0.13 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 8.90e-01 0.0163 0.118 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0331 0.123 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.66e-02 -0.167 0.0937 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 4.59e-01 0.0761 0.102 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -288662 sc-eQTL 6.87e-01 -0.047 0.117 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 3.49e-01 -0.124 0.133 0.16 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0333 0.0922 0.16 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 2.67e-01 0.135 0.122 0.16 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 9.76e-01 0.00306 0.101 0.16 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00394 0.109 0.16 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 9.58e-01 0.00422 0.08 0.16 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0347 0.0942 0.16 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 3.07e-01 -0.128 0.125 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 8.41e-01 0.0214 0.107 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 8.17e-01 0.0265 0.114 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0426 0.114 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00378 0.106 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 6.66e-03 -0.263 0.096 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 7.39e-01 0.035 0.105 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 1.08e-01 0.183 0.113 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 9.38e-01 0.00787 0.101 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 1.35e-01 0.136 0.0903 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 8.10e-02 -0.171 0.0974 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 9.50e-01 0.0058 0.093 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0499 0.0629 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 4.43e-01 0.0645 0.0839 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 4.52e-01 0.0985 0.131 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 5.80e-01 0.0617 0.111 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 4.72e-01 0.0713 0.099 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 3.26e-01 0.12 0.122 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0614 0.121 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 2.12e-01 -0.124 0.0989 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 1.90e-01 0.139 0.106 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 6.86e-02 0.215 0.117 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 8.16e-01 0.0237 0.102 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 4.22e-01 0.0764 0.0948 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 2.12e-01 -0.127 0.102 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0423 0.105 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0491 0.0677 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 8.48e-01 0.017 0.0885 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0796 0.144 0.174 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0436 0.128 0.174 PB L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 4.99e-01 0.066 0.0972 0.174 PB L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 4.07e-01 0.13 0.156 0.174 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 2.66e-01 -0.155 0.138 0.174 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 2.05e-01 0.123 0.0967 0.174 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -341007 sc-eQTL 3.11e-01 0.144 0.142 0.174 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 7.46e-02 -0.19 0.106 0.174 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -320371 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0287 0.144 0.174 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 2.33e-01 -0.153 0.128 0.161 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 2.26e-01 -0.124 0.102 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 1.11e-01 -0.151 0.0941 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0773 0.101 0.161 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 2.94e-01 -0.125 0.119 0.161 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0232 0.0769 0.161 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 1.26e-01 0.14 0.0911 0.161 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 7.19e-01 0.0432 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00951 0.0819 0.16 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 9.86e-01 0.00227 0.129 0.16 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 5.82e-01 0.0549 0.0995 0.16 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 4.87e-01 0.0718 0.103 0.16 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000502 0.0878 0.16 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 6.79e-01 0.0406 0.098 0.16 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -288662 sc-eQTL 5.43e-01 0.0683 0.112 0.16 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 7.64e-01 0.0366 0.121 0.159 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 1.10e-01 -0.139 0.0865 0.159 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 1.33e-01 -0.173 0.115 0.159 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 258420 sc-eQTL 6.24e-01 0.0554 0.113 0.159 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0202 0.13 0.159 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 4.02e-01 0.0893 0.106 0.159 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 9.28e-01 0.0102 0.113 0.159 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 258443 sc-eQTL 1.48e-01 -0.18 0.124 0.159 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 9.31e-01 0.00812 0.0932 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0673 0.0668 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0667 0.0769 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 258420 sc-eQTL 4.70e-02 0.222 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 2.99e-02 0.216 0.099 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0221 0.0842 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 3.21e-01 0.0873 0.0879 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 258443 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0205 0.117 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 7.04e-01 0.0414 0.109 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 8.32e-01 0.0158 0.0743 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 2.31e-01 -0.11 0.0915 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 258420 sc-eQTL 9.80e-01 0.00296 0.116 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 4.26e-02 -0.222 0.109 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0756 0.0955 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 5.02e-01 0.0637 0.0946 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 258443 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0884 0.127 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 1.82e-01 0.192 0.144 0.145 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 1.05e-01 0.222 0.136 0.145 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 3.11e-01 0.13 0.128 0.145 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0161 0.137 0.145 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0991 0.142 0.145 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0407 0.107 0.145 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 1.69e-01 0.169 0.122 0.145 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 5.83e-01 0.0699 0.127 0.158 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 5.78e-01 0.0475 0.0853 0.158 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 9.34e-02 0.175 0.104 0.158 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 258420 sc-eQTL 4.96e-01 0.0783 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 2.23e-01 -0.145 0.118 0.158 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.63e-01 0.0327 0.108 0.158 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 2.17e-01 0.13 0.105 0.158 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 258443 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0962 0.129 0.158 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 5.00e-01 0.0793 0.117 0.154 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0991 0.0697 0.154 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 6.19e-01 0.0534 0.107 0.154 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 258420 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0176 0.113 0.154 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0138 0.0851 0.154 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 5.11e-03 -0.285 0.1 0.154 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 1.24e-01 0.134 0.0865 0.154 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 258443 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0957 0.125 0.154 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0709 0.132 0.167 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 9.35e-01 0.00837 0.102 0.167 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 3.99e-01 -0.094 0.111 0.167 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 258420 sc-eQTL 3.03e-01 -0.105 0.102 0.167 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 8.50e-01 0.0195 0.103 0.167 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 2.48e-01 0.13 0.112 0.167 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 1.58e-01 0.187 0.132 0.167 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 258443 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0847 0.102 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 5.60e-01 0.0672 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0168 0.0798 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000429 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 1.43e-01 -0.15 0.102 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 6.60e-04 -0.357 0.103 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0718 0.0735 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -341007 sc-eQTL 8.54e-01 0.0224 0.122 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0418 0.103 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -320371 sc-eQTL 8.83e-01 0.0177 0.12 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 5.14e-01 0.0709 0.108 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00668 0.0753 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0652 0.11 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 5.72e-02 -0.192 0.101 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00349 0.0865 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0389 0.0606 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -341007 sc-eQTL 4.04e-01 -0.106 0.127 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 6.98e-01 0.0359 0.0923 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -320371 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0779 0.108 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 8.62e-01 0.0151 0.0866 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0652 0.0644 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 1.57e-01 -0.11 0.0773 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 258420 sc-eQTL 1.67e-01 0.157 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 5.62e-01 0.0542 0.0933 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0296 0.083 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 4.11e-01 0.0748 0.0908 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 258443 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0567 0.122 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 5.08e-01 0.0789 0.119 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 2.08e-01 -0.08 0.0634 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 2.98e-01 0.106 0.101 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 258420 sc-eQTL 6.43e-01 0.0525 0.113 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0123 0.0704 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 7.58e-02 -0.183 0.102 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 1.46e-01 0.129 0.0883 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 258443 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0364 0.125 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 177482 sc-eQTL 3.09e-02 0.236 0.109 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 547460 sc-eQTL 7.51e-01 0.0302 0.0952 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 843572 sc-eQTL 1.60e-01 0.113 0.0799 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -184089 sc-eQTL 1.90e-01 -0.123 0.0933 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -37270 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00959 0.0915 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -77754 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0642 0.0589 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -423657 sc-eQTL 5.64e-01 0.0493 0.0853 0.162 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112378 PERP 843572 eQTL 0.00579 -0.0977 0.0353 0.00342 0.00101 0.156
ENSG00000135597 REPS1 -37270 eQTL 8.01e-19 -0.194 0.0214 0.0 0.0 0.156
ENSG00000146386 ABRACL -77754 eQTL 0.0388 0.0634 0.0306 0.0 0.0 0.156


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112378 PERP 843572 2.67e-07 1.1e-07 3.69e-08 1.82e-07 9.65e-08 9.71e-08 1.38e-07 5.35e-08 1.41e-07 4.38e-08 1.6e-07 7.78e-08 1.3e-07 6.21e-08 5.53e-08 7.89e-08 4.63e-08 1.14e-07 5.19e-08 4.21e-08 1.05e-07 1.28e-07 1.26e-07 4.54e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.12e-07 8.71e-08 1.02e-07 1.12e-07 9.58e-08 3.68e-08 3.26e-08 8.82e-08 8.98e-08 4.02e-08 4.89e-08 9.61e-08 6.56e-08 3.37e-08 5.43e-08 1.36e-07 3.99e-08 2.33e-08 5.87e-08 1.83e-08 1.25e-07 4.09e-09 4.91e-08
ENSG00000135597 REPS1 -37270 1.21e-05 1.56e-05 1.85e-06 7.65e-06 2.32e-06 5.89e-06 1.81e-05 2.12e-06 1.17e-05 5.52e-06 1.59e-05 6.6e-06 2.33e-05 5.19e-06 3.64e-06 6.61e-06 7.66e-06 9.52e-06 3.49e-06 2.95e-06 5.84e-06 1.14e-05 1.17e-05 3.36e-06 2.18e-05 4.34e-06 5.85e-06 4.89e-06 1.45e-05 1.2e-05 8.36e-06 1.01e-06 1.17e-06 3.24e-06 5.39e-06 2.83e-06 1.83e-06 1.82e-06 2.15e-06 9.8e-07 8.81e-07 1.68e-05 1.4e-06 1.95e-07 7.98e-07 1.67e-06 1.4e-06 7.83e-07 5.09e-07