Genes within 1Mb (chr6:138889583:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 1.81e-01 -0.127 0.0944 0.154 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 1.49e-01 0.104 0.072 0.154 B L1
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0262 0.0722 0.154 B L1
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 8.04e-03 0.243 0.0907 0.154 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 3.97e-01 0.0691 0.0814 0.154 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 1.26e-01 -0.0732 0.0476 0.154 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -402415 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0528 0.117 0.154 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0245 0.0739 0.154 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -381779 sc-eQTL 1.29e-01 0.124 0.0817 0.154 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 1.95e-02 -0.245 0.104 0.154 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 4.22e-01 0.057 0.0708 0.154 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 4.96e-01 0.0455 0.0668 0.154 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 4.00e-01 0.0742 0.0879 0.154 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 8.88e-01 0.0098 0.0692 0.154 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 1.52e-01 0.0726 0.0506 0.154 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 8.48e-01 0.0167 0.0867 0.154 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -350070 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00833 0.0855 0.154 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 3.51e-01 -0.107 0.115 0.154 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 2.96e-01 0.0786 0.0751 0.154 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0982 0.0764 0.154 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 4.51e-01 0.062 0.0822 0.154 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 9.20e-01 0.00782 0.0774 0.154 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 1.51e-02 0.106 0.0434 0.154 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 6.88e-01 0.0336 0.0836 0.154 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -350070 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0534 0.102 0.154 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 1.37e-01 -0.169 0.113 0.158 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 9.97e-01 0.000273 0.0797 0.158 DC L1
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 8.75e-01 0.0147 0.0934 0.158 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 197012 sc-eQTL 7.17e-01 0.0378 0.104 0.158 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0463 0.0919 0.158 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0858 0.0898 0.158 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 7.09e-01 -0.04 0.107 0.158 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 197035 sc-eQTL 7.19e-01 0.0392 0.109 0.158 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 4.88e-02 -0.162 0.0819 0.154 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 5.12e-02 0.111 0.0567 0.154 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 7.70e-01 0.0221 0.0754 0.154 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 197012 sc-eQTL 4.02e-02 -0.221 0.107 0.154 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0217 0.0632 0.154 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 2.10e-01 0.103 0.082 0.154 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0688 0.087 0.154 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 197035 sc-eQTL 4.96e-01 0.0766 0.112 0.154 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 2.91e-01 -0.109 0.103 0.155 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 7.96e-01 0.0236 0.091 0.155 NK L1
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00501 0.0773 0.155 NK L1
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 4.63e-01 0.0656 0.0892 0.155 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0266 0.085 0.155 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 3.33e-03 0.181 0.0608 0.155 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0756 0.0824 0.155 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0803 0.121 0.154 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 4.91e-01 0.0541 0.0784 0.154 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0505 0.0967 0.154 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 1.41e-02 0.215 0.0867 0.154 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 1.96e-01 -0.122 0.0942 0.154 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 1.50e-01 0.0891 0.0616 0.154 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 9.34e-01 0.00604 0.0725 0.154 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 9.83e-01 0.00301 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00808 0.124 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0202 0.0643 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 1.69e-01 0.185 0.134 0.145 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 9.59e-01 0.0072 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 1.97e-01 -0.165 0.127 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -402415 sc-eQTL 4.37e-01 0.0849 0.109 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 3.04e-01 -0.141 0.137 0.145 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -381779 sc-eQTL 5.53e-02 0.262 0.136 0.145 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0714 0.118 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 5.11e-01 0.0536 0.0814 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0246 0.104 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 4.19e-01 0.0823 0.102 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 1.99e-01 0.141 0.11 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 3.71e-01 0.0838 0.0934 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -402415 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0522 0.115 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 9.53e-01 0.00626 0.105 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -381779 sc-eQTL 8.70e-01 0.0187 0.114 0.155 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 1.12e-01 -0.192 0.12 0.153 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 1.03e-01 0.148 0.0906 0.153 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 6.02e-01 0.0594 0.114 0.153 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 4.19e-01 0.0847 0.105 0.153 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0688 0.113 0.153 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 2.27e-01 -0.108 0.0895 0.153 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -402415 sc-eQTL 4.21e-01 0.0923 0.114 0.153 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 9.96e-01 0.000515 0.105 0.153 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -381779 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0221 0.129 0.153 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 3.01e-01 -0.117 0.112 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 3.17e-01 0.0792 0.0789 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 3.56e-01 -0.099 0.107 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 8.12e-03 0.258 0.0965 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 3.50e-01 0.0848 0.0906 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0686 0.0634 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -402415 sc-eQTL 3.46e-01 -0.112 0.119 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 8.83e-01 0.0127 0.0865 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -381779 sc-eQTL 6.51e-02 0.209 0.113 0.154 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 8.77e-02 -0.188 0.109 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 7.99e-02 0.132 0.0748 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 3.99e-01 0.0764 0.0904 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 3.29e-02 0.22 0.103 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 5.48e-01 0.0595 0.0989 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0654 0.0727 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -402415 sc-eQTL 9.31e-01 0.01 0.115 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 9.32e-01 -0.01 0.118 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -381779 sc-eQTL 3.52e-01 0.1 0.108 0.152 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 1.23e-01 -0.181 0.117 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 4.26e-01 0.081 0.102 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 2.41e-01 0.145 0.124 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 8.23e-01 0.0266 0.119 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0726 0.115 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0528 0.105 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 5.03e-01 0.0709 0.106 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -350070 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0989 0.109 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 3.65e-03 -0.32 0.109 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 8.37e-01 0.0143 0.0693 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 1.70e-01 0.125 0.0911 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 1.92e-01 0.113 0.086 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 5.72e-01 0.0433 0.0765 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 5.66e-01 0.0296 0.0515 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 9.26e-01 0.00819 0.0875 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -350070 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0273 0.0885 0.154 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 8.59e-02 -0.186 0.108 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 5.17e-01 0.0525 0.0808 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 8.72e-01 0.0163 0.101 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 6.83e-01 0.0355 0.0869 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 8.51e-01 0.0155 0.0824 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 9.97e-02 0.104 0.063 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 4.91e-01 0.065 0.0941 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -350070 sc-eQTL 8.67e-01 0.0171 0.102 0.154 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0115 0.125 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 5.22e-01 0.0547 0.0853 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 7.55e-01 -0.031 0.0992 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 6.99e-01 0.0377 0.0974 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0951 0.106 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 1.50e-01 0.109 0.0754 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 4.85e-01 0.0695 0.0993 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -350070 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0451 0.104 0.154 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 1.13e-01 -0.201 0.127 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 8.41e-02 0.157 0.0903 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 8.74e-02 -0.193 0.113 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0183 0.0927 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0633 0.0992 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 1.44e-03 0.253 0.0784 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 9.63e-01 0.00429 0.0935 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -350070 sc-eQTL 1.04e-01 -0.182 0.111 0.154 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0539 0.12 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 4.42e-01 0.0588 0.0763 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 1.34e-01 -0.137 0.0914 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 6.71e-01 0.0392 0.0923 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0727 0.0924 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 7.52e-01 0.0154 0.0485 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0269 0.0981 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -350070 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0124 0.112 0.154 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0155 0.136 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 4.22e-01 0.0767 0.0954 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0859 0.126 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 3.65e-01 0.0902 0.0993 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 5.63e-02 0.197 0.102 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 8.85e-01 0.0149 0.103 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00787 0.106 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -350070 sc-eQTL 7.04e-01 0.0425 0.112 0.148 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 1.57e-01 -0.178 0.126 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 9.40e-01 0.00864 0.115 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 5.69e-02 -0.248 0.13 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 2.47e-01 -0.137 0.118 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 1.75e-01 -0.167 0.122 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 3.52e-02 0.199 0.0937 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 5.09e-01 0.068 0.103 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -350070 sc-eQTL 1.56e-01 -0.166 0.117 0.148 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 1.99e-01 -0.169 0.131 0.154 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0787 0.0912 0.154 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 9.38e-02 -0.202 0.12 0.154 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 2.14e-02 0.229 0.0989 0.154 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 1.82e-02 -0.253 0.106 0.154 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 5.33e-01 0.0495 0.0792 0.154 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 7.19e-01 0.0337 0.0933 0.154 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 6.42e-01 0.055 0.118 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0472 0.101 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00569 0.108 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 8.24e-01 -0.024 0.107 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0872 0.0999 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0281 0.0922 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 4.87e-01 0.0688 0.0988 0.156 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0705 0.112 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 7.02e-01 0.0383 0.0998 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0315 0.0894 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 1.76e-01 0.131 0.0963 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0414 0.0916 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 2.20e-02 0.141 0.0613 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 2.09e-01 -0.104 0.0824 0.155 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0676 0.13 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 9.59e-01 0.00563 0.111 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 4.53e-02 0.196 0.0973 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 6.35e-01 0.0577 0.121 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 1.79e-01 -0.161 0.119 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 4.36e-01 0.0768 0.0984 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 2.84e-01 -0.113 0.105 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 2.99e-01 -0.119 0.115 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 7.30e-01 0.0342 0.099 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0678 0.0921 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 2.27e-01 0.119 0.0986 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 3.68e-01 0.092 0.102 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 2.49e-02 0.147 0.065 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0573 0.0858 0.155 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 1.80e-01 0.188 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 3.69e-01 0.113 0.125 0.144 PB L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0473 0.0952 0.144 PB L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 3.25e-02 0.325 0.15 0.144 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 1.66e-01 -0.188 0.135 0.144 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 2.84e-01 0.102 0.0948 0.144 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -402415 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0668 0.139 0.144 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 7.68e-01 0.0309 0.105 0.144 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -381779 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0746 0.14 0.144 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00712 0.123 0.154 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 6.05e-01 0.0507 0.0979 0.154 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 2.49e-01 0.104 0.0902 0.154 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 4.14e-03 0.275 0.0948 0.154 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 9.38e-03 0.294 0.112 0.154 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 2.32e-01 0.0878 0.0732 0.154 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 3.06e-01 0.0897 0.0873 0.154 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 2.79e-01 -0.126 0.116 0.154 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 1.23e-01 0.122 0.0791 0.154 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0316 0.125 0.154 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 8.33e-01 0.0204 0.0967 0.154 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 2.29e-01 -0.12 0.0998 0.154 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 9.91e-01 -0.001 0.0853 0.154 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 7.32e-01 0.0326 0.0951 0.154 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -350070 sc-eQTL 6.26e-01 0.0531 0.109 0.154 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 2.30e-02 -0.256 0.112 0.156 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 6.09e-01 0.0416 0.0811 0.156 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 6.98e-01 0.0418 0.108 0.156 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 197012 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0218 0.105 0.156 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0191 0.121 0.156 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0618 0.0992 0.156 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0681 0.105 0.156 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 197035 sc-eQTL 3.61e-01 0.106 0.116 0.156 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0856 0.0897 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 2.59e-01 0.0728 0.0644 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0169 0.0743 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 197012 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0504 0.108 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 7.92e-01 0.0255 0.0966 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 3.26e-01 0.0798 0.0811 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0447 0.0849 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 197035 sc-eQTL 6.01e-01 0.0593 0.113 0.154 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0512 0.104 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 7.51e-03 0.188 0.0698 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 3.54e-01 0.0813 0.0875 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 197012 sc-eQTL 4.27e-02 -0.224 0.11 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0214 0.105 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 7.35e-01 0.031 0.0914 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 4.48e-01 0.0687 0.0904 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 197035 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0777 0.122 0.154 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 5.97e-02 0.264 0.139 0.161 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 6.19e-02 0.25 0.133 0.161 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 5.61e-01 0.0728 0.125 0.161 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0471 0.134 0.161 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 1.65e-01 0.192 0.138 0.161 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0303 0.104 0.161 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 1.18e-01 -0.188 0.119 0.161 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 6.89e-03 -0.321 0.117 0.158 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 1.57e-01 0.114 0.0799 0.158 intMono L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0529 0.0981 0.158 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 197012 sc-eQTL 2.05e-01 -0.137 0.108 0.158 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 2.41e-01 0.131 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 6.60e-01 0.0449 0.102 0.158 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 5.92e-01 0.0531 0.099 0.158 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 197035 sc-eQTL 7.61e-01 0.037 0.121 0.158 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.113 0.156 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 7.20e-01 0.0242 0.0674 0.156 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0442 0.103 0.156 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 197012 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0403 0.109 0.156 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 7.53e-02 -0.145 0.0812 0.156 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 3.95e-03 0.282 0.0966 0.156 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 2.37e-01 -0.099 0.0834 0.156 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 197035 sc-eQTL 1.56e-01 0.171 0.12 0.156 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 3.60e-01 -0.12 0.131 0.147 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 2.02e-01 -0.13 0.101 0.147 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 5.23e-01 0.0709 0.111 0.147 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 197012 sc-eQTL 2.50e-01 0.117 0.101 0.147 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0637 0.103 0.147 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0256 0.112 0.147 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 8.17e-01 0.0306 0.132 0.147 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 197035 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0338 0.102 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0864 0.112 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 5.05e-01 0.0517 0.0775 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 4.99e-01 0.0692 0.102 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 3.36e-01 0.096 0.0994 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 6.49e-01 0.0471 0.103 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0663 0.0715 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -402415 sc-eQTL 7.12e-01 0.0438 0.119 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00693 0.101 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -381779 sc-eQTL 1.70e-01 0.161 0.116 0.154 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 7.90e-02 -0.184 0.104 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 2.11e-01 0.091 0.0726 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0375 0.107 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 1.35e-03 0.312 0.0959 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 7.74e-02 0.148 0.0832 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0775 0.0585 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -402415 sc-eQTL 2.63e-01 -0.138 0.123 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00319 0.0894 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -381779 sc-eQTL 7.70e-02 0.185 0.104 0.154 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0978 0.0827 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 6.13e-02 0.115 0.0613 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 8.17e-01 0.0173 0.0744 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 197012 sc-eQTL 1.97e-01 -0.14 0.108 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00771 0.0895 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 4.12e-01 0.0653 0.0795 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00999 0.0872 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 197035 sc-eQTL 8.83e-01 0.0171 0.117 0.154 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 1.42e-03 -0.357 0.11 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 4.91e-01 0.0416 0.0603 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0459 0.0965 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 197012 sc-eQTL 5.88e-02 -0.202 0.106 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0516 0.0667 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 2.54e-02 0.218 0.0967 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0207 0.0843 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 197035 sc-eQTL 1.29e-01 0.18 0.118 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 sc-eQTL 3.17e-01 -0.108 0.108 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 486052 sc-eQTL 8.86e-01 0.0135 0.0938 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 782164 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0159 0.0791 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -245497 sc-eQTL 1.89e-01 0.121 0.0919 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -98678 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0268 0.0901 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -139162 sc-eQTL 7.65e-04 0.193 0.0566 0.155 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -485065 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0852 0.0839 0.155 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 eQTL 1.74e-07 -0.107 0.0203 0.0 0.0 0.167
ENSG00000112406 HECA -245497 eQTL 0.00272 0.0367 0.0122 0.0 0.0 0.167
ENSG00000135597 REPS1 -98678 eQTL 0.00569 0.0601 0.0217 0.0 0.0 0.167
ENSG00000146386 ABRACL -139162 eQTL 2.37e-08 0.166 0.0294 0.0 0.0 0.167
ENSG00000226571 AL592429.2 -381779 eQTL 2.69e-02 0.0954 0.043 0.0 0.0 0.167


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A 116074 5.13e-06 5.58e-06 7.72e-07 3.47e-06 2.21e-06 1.55e-06 8.05e-06 1.64e-06 4.86e-06 3.25e-06 7.41e-06 2.91e-06 9.86e-06 2.02e-06 1.45e-06 5.39e-06 2.72e-06 3.77e-06 2.23e-06 2.52e-06 3.46e-06 6.89e-06 4.86e-06 2.56e-06 9.02e-06 2.84e-06 3.82e-06 2.3e-06 6.73e-06 5.83e-06 2.72e-06 7.91e-07 9.22e-07 2.83e-06 2.16e-06 2.07e-06 1.71e-06 6.96e-07 1.46e-06 1e-06 1.16e-06 7.35e-06 6.31e-07 1.9e-07 6.99e-07 9.83e-07 9.05e-07 6.09e-07 4.77e-07
ENSG00000112406 HECA -245497 1.96e-06 2.4e-06 3e-07 1.56e-06 6.82e-07 7.12e-07 1.31e-06 8.67e-07 1.86e-06 8.25e-07 1.99e-06 1.29e-06 3.3e-06 9.24e-07 8.59e-07 1.7e-06 1.01e-06 1.99e-06 7.85e-07 1.29e-06 1.14e-06 2.76e-06 1.87e-06 1.03e-06 2.88e-06 1.05e-06 1.31e-06 1.65e-06 2.02e-06 1.59e-06 1.08e-06 3.4e-07 5.52e-07 1.21e-06 9.46e-07 9.92e-07 7.47e-07 3.86e-07 1.07e-06 4.17e-07 2.92e-07 2.79e-06 4.07e-07 1.99e-07 2.97e-07 3.21e-07 6.27e-07 2.65e-07 1.59e-07
ENSG00000146386 ABRACL -139162 4.74e-06 4.89e-06 6.65e-07 3.18e-06 1.76e-06 1.63e-06 5.25e-06 1.29e-06 5.03e-06 2.95e-06 5.38e-06 3.18e-06 7.69e-06 2.15e-06 1.02e-06 3.9e-06 1.91e-06 3.98e-06 1.47e-06 1.64e-06 2.82e-06 4.98e-06 4.49e-06 1.91e-06 7.48e-06 2.29e-06 2.75e-06 1.78e-06 4.94e-06 4.34e-06 2.87e-06 4.84e-07 8.03e-07 2.34e-06 1.98e-06 1.46e-06 1.27e-06 4.21e-07 1.05e-06 8.19e-07 9.4e-07 5.71e-06 3.83e-07 1.58e-07 7.73e-07 1.14e-06 1.06e-06 7.35e-07 5.27e-07