Genes within 1Mb (chr6:138624025:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 3.00e-01 0.156 0.15 0.051 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0642 0.115 0.051 B L1
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 5.31e-01 0.0721 0.115 0.051 B L1
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0905 0.146 0.051 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 4.09e-02 0.189 0.0916 0.051 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 5.55e-01 0.0765 0.129 0.051 B L1
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 3.38e-01 0.0729 0.0759 0.051 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -667973 sc-eQTL 5.79e-01 0.104 0.186 0.051 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 3.93e-01 -0.1 0.117 0.051 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -647337 sc-eQTL 3.49e-01 0.122 0.13 0.051 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 2.65e-01 -0.162 0.145 0.051 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0207 0.167 0.051 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0666 0.112 0.051 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0766 0.105 0.051 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 8.09e-02 -0.242 0.138 0.051 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 6.42e-02 0.182 0.098 0.051 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 8.30e-01 0.0235 0.109 0.051 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 3.53e-02 -0.168 0.0793 0.051 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 4.17e-01 -0.111 0.137 0.051 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -615628 sc-eQTL 9.80e-01 0.00341 0.135 0.051 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 7.12e-01 0.046 0.124 0.051 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 9.74e-01 0.00594 0.18 0.051 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 9.40e-01 0.00881 0.118 0.051 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0146 0.12 0.051 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 2.41e-01 -0.151 0.128 0.051 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 1.90e-01 0.121 0.0923 0.051 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 1.22e-01 -0.187 0.121 0.051 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 1.97e-01 -0.089 0.0687 0.051 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0758 0.131 0.051 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -615628 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00361 0.159 0.051 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 8.27e-01 0.0298 0.136 0.051 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 2.57e-01 0.15 0.131 0.051 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 2.62e-03 -0.272 0.0893 0.051 Mono L1
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0996 0.12 0.051 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 1.21e-01 -0.147 0.0949 0.051 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -68546 sc-eQTL 9.55e-01 0.00981 0.172 0.051 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 6.63e-01 0.044 0.101 0.051 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0918 0.131 0.051 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 6.56e-01 0.062 0.139 0.051 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -68523 sc-eQTL 4.19e-01 0.145 0.179 0.051 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0641 0.118 0.051 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 2.52e-02 0.423 0.188 0.051 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0937 0.122 0.051 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00449 0.151 0.051 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 2.21e-01 -0.168 0.137 0.051 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0597 0.0719 0.051 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 4.52e-01 0.111 0.148 0.051 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0962 0.0966 0.051 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 9.82e-01 0.00249 0.113 0.051 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 7.91e-02 0.25 0.142 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 6.07e-01 0.12 0.232 0.054 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 5.58e-01 0.119 0.204 0.054 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0444 0.106 0.054 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 5.22e-02 -0.428 0.219 0.054 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 1.12e-02 0.517 0.201 0.054 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 3.47e-01 -0.218 0.231 0.054 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0248 0.21 0.054 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -667973 sc-eQTL 2.21e-01 -0.22 0.179 0.054 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 2.90e-01 0.239 0.225 0.054 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -647337 sc-eQTL 4.82e-01 0.159 0.226 0.054 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 5.60e-02 -0.341 0.177 0.054 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 4.05e-01 0.154 0.185 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 5.26e-02 -0.247 0.127 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 4.60e-01 0.121 0.163 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0404 0.16 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 6.95e-01 0.0502 0.128 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 6.67e-02 -0.316 0.171 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 1.68e-01 -0.203 0.146 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -667973 sc-eQTL 3.74e-02 0.374 0.178 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0441 0.166 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -647337 sc-eQTL 8.35e-01 0.0375 0.18 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 8.35e-01 0.038 0.181 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 6.84e-01 0.0768 0.188 0.052 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 6.99e-01 0.0547 0.142 0.052 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 8.30e-01 0.0379 0.177 0.052 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 1.96e-01 -0.21 0.162 0.052 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 2.29e-01 0.146 0.121 0.052 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 3.46e-01 -0.166 0.176 0.052 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 2.81e-01 0.151 0.139 0.052 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -667973 sc-eQTL 4.36e-01 0.139 0.178 0.052 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00709 0.164 0.052 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -647337 sc-eQTL 3.44e-01 0.19 0.2 0.052 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 2.65e-03 -0.538 0.177 0.052 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0441 0.185 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 7.41e-01 0.0429 0.13 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 6.99e-01 0.0681 0.176 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 4.33e-01 -0.126 0.161 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 2.72e-02 0.225 0.101 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 1.63e-01 0.208 0.148 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 8.24e-01 0.0232 0.104 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -667973 sc-eQTL 3.27e-01 -0.191 0.195 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0805 0.142 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -647337 sc-eQTL 3.15e-01 0.187 0.186 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00851 0.16 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 3.03e-02 0.377 0.173 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0368 0.12 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 1.68e-01 -0.198 0.143 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0599 0.165 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 4.19e-01 0.116 0.143 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 2.05e-01 0.199 0.157 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 3.47e-02 0.243 0.114 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -667973 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0347 0.183 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0903 0.187 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -647337 sc-eQTL 1.22e-01 -0.265 0.171 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 8.45e-01 0.0364 0.186 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0734 0.179 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 5.37e-01 0.0954 0.154 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 6.91e-01 -0.075 0.188 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0833 0.18 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 2.77e-01 0.119 0.109 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 2.68e-01 -0.194 0.175 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0698 0.16 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 4.43e-01 -0.123 0.16 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -615628 sc-eQTL 2.67e-01 0.184 0.165 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 3.39e-01 0.163 0.17 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 9.73e-01 -0.006 0.176 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 7.71e-01 -0.032 0.11 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0392 0.145 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 5.09e-02 -0.266 0.135 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 1.69e-01 0.14 0.101 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 1.33e-01 0.182 0.121 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 1.04e-01 -0.132 0.0811 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0954 0.138 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -615628 sc-eQTL 4.30e-01 -0.111 0.14 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 9.71e-01 0.00471 0.132 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 7.49e-01 0.0546 0.171 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0668 0.127 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 5.30e-01 -0.1 0.159 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 4.73e-02 -0.27 0.135 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 1.20e-01 0.144 0.092 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 3.84e-02 -0.267 0.128 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 3.16e-02 -0.213 0.0984 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0946 0.148 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -615628 sc-eQTL 4.38e-01 0.124 0.16 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 5.74e-01 0.0729 0.13 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0664 0.191 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0446 0.13 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 1.20e-01 -0.235 0.151 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0636 0.149 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 2.98e-02 0.208 0.0952 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 1.39e-01 -0.24 0.161 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 2.04e-03 -0.353 0.113 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0291 0.152 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -615628 sc-eQTL 1.77e-01 0.214 0.158 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 4.33e-01 0.121 0.154 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 2.66e-01 0.22 0.197 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 4.54e-01 0.106 0.141 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 3.74e-01 -0.157 0.176 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0419 0.144 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 5.31e-01 0.0702 0.112 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 3.84e-01 -0.134 0.154 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 1.03e-01 -0.203 0.124 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0758 0.145 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -615628 sc-eQTL 3.84e-01 0.152 0.174 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00589 0.158 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0522 0.186 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0256 0.119 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 9.16e-01 0.0151 0.143 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0646 0.144 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 2.64e-02 0.225 0.101 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 2.65e-01 -0.161 0.144 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0218 0.0757 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0219 0.153 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -615628 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0334 0.175 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 2.22e-01 0.184 0.15 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 1.07e-01 -0.325 0.201 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0554 0.142 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 3.12e-01 0.19 0.187 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 3.64e-01 -0.134 0.148 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 1.18e-01 0.141 0.0899 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 2.27e-01 -0.186 0.153 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 8.19e-01 0.0351 0.153 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0452 0.157 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -615628 sc-eQTL 9.79e-01 0.00435 0.166 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 7.19e-01 0.0597 0.165 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 3.97e-01 0.161 0.19 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 5.46e-01 -0.105 0.173 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 8.74e-01 0.0313 0.197 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 6.71e-02 -0.325 0.177 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00159 0.122 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 3.22e-01 -0.184 0.185 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0975 0.143 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 3.96e-01 0.132 0.155 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -615628 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00301 0.177 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 2.17e-01 -0.223 0.18 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 1.90e-02 0.477 0.202 0.052 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0497 0.142 0.052 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0349 0.187 0.052 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 5.02e-01 -0.104 0.155 0.052 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 7.74e-01 0.0256 0.0892 0.052 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 4.76e-01 0.119 0.167 0.052 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 7.41e-02 -0.219 0.122 0.052 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 2.22e-01 -0.177 0.144 0.052 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 6.27e-01 0.0801 0.165 0.052 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0345 0.191 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 4.92e-01 0.112 0.163 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 9.13e-01 0.019 0.174 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 2.58e-01 -0.196 0.173 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 5.89e-01 -0.06 0.111 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 3.29e-01 -0.158 0.161 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0636 0.149 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 6.90e-01 0.0639 0.16 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 4.92e-01 0.122 0.177 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 5.37e-02 0.386 0.199 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 6.93e-01 0.0676 0.171 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0789 0.152 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 1.88e-01 -0.247 0.187 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 1.56e-01 0.165 0.116 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 3.36e-01 -0.178 0.185 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 3.61e-01 -0.139 0.152 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 3.26e-01 -0.16 0.162 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 2.12e-01 -0.235 0.188 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 3.62e-01 0.209 0.229 0.052 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 4.08e-01 -0.169 0.204 0.052 PB L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 3.05e-01 0.16 0.155 0.052 PB L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 2.03e-01 0.318 0.248 0.052 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00921 0.189 0.052 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 6.83e-01 -0.091 0.222 0.052 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 1.93e-01 -0.202 0.154 0.052 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -667973 sc-eQTL 3.78e-01 0.2 0.226 0.052 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 6.40e-01 0.08 0.171 0.052 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -647337 sc-eQTL 3.05e-01 0.235 0.228 0.052 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 5.30e-01 0.142 0.226 0.052 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 8.57e-01 0.038 0.21 0.052 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 9.47e-01 -0.011 0.167 0.052 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0381 0.155 0.052 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0482 0.165 0.052 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 7.55e-01 0.0304 0.0975 0.052 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 9.74e-01 0.00629 0.195 0.052 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0853 0.125 0.052 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 3.67e-01 0.135 0.149 0.052 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 5.60e-01 0.11 0.189 0.052 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0363 0.185 0.051 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 9.40e-01 0.00948 0.126 0.051 Treg L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0138 0.199 0.051 Treg L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0282 0.154 0.051 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 2.24e-01 0.135 0.11 0.051 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 7.73e-01 -0.046 0.159 0.051 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 4.51e-02 -0.271 0.134 0.051 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0587 0.151 0.051 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -615628 sc-eQTL 4.88e-01 0.12 0.173 0.051 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0566 0.169 0.051 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 4.87e-01 -0.126 0.181 0.054 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 5.94e-01 0.0695 0.13 0.054 cDC L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 2.38e-01 -0.204 0.172 0.054 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 8.16e-01 -0.034 0.146 0.054 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -68546 sc-eQTL 4.38e-01 -0.131 0.169 0.054 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 7.18e-01 0.0704 0.195 0.054 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 5.21e-01 -0.102 0.159 0.054 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 4.44e-01 -0.129 0.169 0.054 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -68523 sc-eQTL 5.92e-01 0.1 0.186 0.054 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 5.33e-01 -0.119 0.19 0.054 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 5.17e-02 0.285 0.146 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 7.89e-02 -0.185 0.105 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0792 0.122 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 2.00e-01 -0.148 0.115 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -68546 sc-eQTL 9.44e-01 0.0125 0.177 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 5.91e-01 0.0851 0.158 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 2.17e-01 -0.164 0.133 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0134 0.139 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -68523 sc-eQTL 2.25e-01 0.225 0.185 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0821 0.123 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 8.32e-01 0.0368 0.174 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 3.39e-02 -0.251 0.118 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0284 0.147 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 1.05e-01 -0.184 0.113 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -68546 sc-eQTL 3.93e-01 0.159 0.186 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 2.10e-01 -0.221 0.175 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 4.30e-01 -0.121 0.153 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 8.99e-01 0.0192 0.151 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -68523 sc-eQTL 2.35e-01 0.242 0.203 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 3.73e-01 0.145 0.162 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0709 0.22 0.058 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 4.76e-01 0.15 0.21 0.058 gdT L2
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0515 0.195 0.058 gdT L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 2.22e-01 -0.255 0.208 0.058 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 2.87e-01 0.115 0.108 0.058 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 4.87e-01 0.151 0.216 0.058 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 6.38e-01 0.0767 0.163 0.058 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 6.33e-01 0.0897 0.188 0.058 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 1.02e-02 0.5 0.192 0.058 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 6.09e-01 -0.111 0.217 0.051 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 9.15e-01 -0.018 0.169 0.051 pDC L2
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 3.82e-01 0.16 0.183 0.051 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 3.90e-01 0.147 0.17 0.051 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -68546 sc-eQTL 4.72e-01 -0.121 0.168 0.051 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 2.81e-01 -0.183 0.169 0.051 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 6.08e-02 -0.347 0.184 0.051 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 5.88e-01 0.119 0.218 0.051 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -68523 sc-eQTL 5.61e-01 0.0982 0.168 0.051 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 2.76e-01 -0.188 0.172 0.051 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 3.65e-01 0.161 0.177 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 2.77e-01 -0.134 0.123 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 8.44e-01 0.032 0.162 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 1.45e-01 -0.23 0.157 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 4.39e-01 0.0829 0.107 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 5.19e-02 -0.318 0.162 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0319 0.114 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -667973 sc-eQTL 6.36e-02 0.348 0.187 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0895 0.159 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -647337 sc-eQTL 4.03e-01 0.155 0.185 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 9.89e-02 -0.298 0.18 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 2.30e-01 0.199 0.166 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0163 0.115 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP 516606 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0364 0.169 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 3.35e-01 -0.15 0.155 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 2.01e-02 0.206 0.0878 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 2.63e-01 0.148 0.132 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 1.15e-01 0.146 0.0924 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -667973 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0843 0.194 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 3.36e-01 -0.136 0.141 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -647337 sc-eQTL 8.72e-01 0.0267 0.166 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00308 0.158 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -149484 sc-eQTL 1.96e-01 0.174 0.134 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 220494 sc-eQTL 1.22e-02 -0.25 0.0987 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA -511055 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0675 0.121 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 756811 sc-eQTL 1.28e-01 -0.151 0.0985 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -68546 sc-eQTL 4.08e-01 0.146 0.176 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -364236 sc-eQTL 3.62e-01 -0.132 0.145 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL -404720 sc-eQTL 2.35e-01 -0.153 0.129 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -750623 sc-eQTL 7.06e-01 0.0534 0.141 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -68523 sc-eQTL 9.72e-02 0.313 0.188 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 755792 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0181 0.119 0.051 CD14_Mono LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000135540 NHSL1 -68546 eQTL 0.0319 -0.16 0.0746 0.0 0.0 0.0265
ENSG00000135597 REPS1 -364236 eQTL 0.0267 -0.114 0.0513 0.0 0.0 0.0265
ENSG00000146386 ABRACL -404720 eQTL 0.000143 -0.268 0.0702 0.0 0.0 0.0265
ENSG00000225177 AL590617.2 -68523 eQTL 0.0191 -0.216 0.0922 0.0 0.0 0.0265
ENSG00000226571 AL592429.2 -647337 eQTL 3.19e-02 -0.219 0.102 0.0 0.0 0.0265
ENSG00000237499 AL357060.1 755792 eQTL 0.00878 0.101 0.0386 0.00184 0.0 0.0265


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146386 ABRACL -404720 1.28e-06 8.72e-07 1.63e-07 3.68e-07 9.16e-08 3.22e-07 7.54e-07 1.45e-07 8.08e-07 2.98e-07 1.25e-06 5.28e-07 1.49e-06 2.1e-07 4.3e-07 3.4e-07 4.54e-07 4.4e-07 2.57e-07 1.32e-07 2.09e-07 7.21e-07 4.66e-07 1.61e-07 1.69e-06 2.4e-07 4.25e-07 3.62e-07 6.19e-07 7.36e-07 4.53e-07 5.99e-08 5.51e-08 1.57e-07 3.32e-07 1.19e-07 1.15e-07 5.8e-08 6.01e-08 3.05e-08 5.23e-08 1.53e-06 4.65e-08 1.81e-08 1.17e-07 1.55e-08 7.36e-08 1.18e-08 5.61e-08
ENSG00000225177 AL590617.2 -68523 1.09e-05 1.06e-05 1.37e-06 5.09e-06 1.92e-06 4.19e-06 1.07e-05 1.45e-06 8.98e-06 5.06e-06 1.24e-05 4.84e-06 1.58e-05 3.96e-06 2.45e-06 6.37e-06 3.7e-06 6.51e-06 2.63e-06 2.41e-06 4.67e-06 9.68e-06 7.17e-06 2.56e-06 1.34e-05 2.84e-06 4.81e-06 3.24e-06 8.87e-06 7.8e-06 5.1e-06 7.78e-07 8.38e-07 2.74e-06 3.58e-06 2.09e-06 1.38e-06 1.14e-06 1.59e-06 9.09e-07 7.59e-07 1.36e-05 1.39e-06 1.61e-07 7.74e-07 1.02e-06 9.03e-07 6.4e-07 6.14e-07
ENSG00000226571 AL592429.2 -647337 5.14e-07 1.92e-07 6.57e-08 2.28e-07 1.03e-07 8.85e-08 2.74e-07 5.85e-08 1.86e-07 1.11e-07 2.68e-07 1.48e-07 3.77e-07 8.66e-08 7.98e-08 9.11e-08 4.31e-08 2.04e-07 7.09e-08 4.89e-08 1.27e-07 2.09e-07 1.69e-07 3.17e-08 3.14e-07 1.23e-07 1.23e-07 1.26e-07 1.37e-07 1.17e-07 1.52e-07 3.03e-08 3.73e-08 8.89e-08 5.65e-08 3.07e-08 5.61e-08 9.23e-08 6.71e-08 3.67e-08 5.34e-08 3.55e-07 5.27e-08 1.2e-08 3.41e-08 8.31e-09 1.2e-07 1.91e-09 5.02e-08