logo

Genes within 1Mb (chr6:138014838:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 2.10e-01 0.16 0.127 0.09 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 1.72e-01 0.17 0.124 0.09 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 4.37e-01 -0.076 0.0975 0.09 B L1
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0534 0.0974 0.09 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 4.77e-01 0.0558 0.0785 0.09 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 8.71e-01 0.0179 0.11 0.09 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 3.64e-01 0.112 0.123 0.09 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 2.54e-01 0.159 0.139 0.09 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 6.67e-01 0.0352 0.0816 0.09 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0221 0.0936 0.09 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 6.68e-01 0.0379 0.0883 0.09 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00467 0.0827 0.09 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0264 0.0914 0.09 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 8.46e-01 0.0202 0.104 0.09 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 5.98e-01 0.0786 0.149 0.09 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 7.92e-01 0.024 0.0912 0.09 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 4.04e-01 0.0815 0.0975 0.09 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00417 0.0994 0.09 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 8.06e-01 0.0189 0.0768 0.09 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 1.42e-02 -0.245 0.099 0.09 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 1.68e-02 0.268 0.111 0.09 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 4.06e-01 0.126 0.152 0.086 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 8.37e-01 0.0232 0.113 0.086 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0138 0.107 0.086 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 9.93e-01 0.00111 0.12 0.086 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -677733 sc-eQTL 4.53e-01 0.105 0.139 0.086 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 1.27e-01 -0.188 0.122 0.086 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -677710 sc-eQTL 9.12e-02 -0.245 0.145 0.086 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 5.99e-02 -0.23 0.122 0.086 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0211 0.109 0.09 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 3.67e-01 0.0838 0.0928 0.09 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0121 0.0754 0.09 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0116 0.0789 0.09 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -677733 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0355 0.142 0.09 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 2.05e-01 -0.106 0.0831 0.09 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -677710 sc-eQTL 3.66e-02 -0.309 0.147 0.09 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 6.22e-02 -0.182 0.0969 0.09 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 6.39e-01 0.0631 0.134 0.09 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 6.67e-01 0.0446 0.103 0.09 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 7.03e-01 0.0452 0.118 0.09 NK L1
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 2.53e-01 -0.115 0.1 0.09 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0595 0.086 0.09 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 8.38e-01 0.0226 0.111 0.09 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 4.32e-02 0.246 0.121 0.09 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 1.78e-02 0.373 0.156 0.09 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 9.52e-01 0.0058 0.0964 0.09 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 8.30e-01 0.022 0.102 0.09 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 2.40e-01 0.148 0.126 0.09 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0617 0.0598 0.09 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 2.78e-01 -0.134 0.123 0.09 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 7.52e-01 0.0377 0.119 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 2.56e-01 0.206 0.181 0.087 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 6.82e-02 0.295 0.161 0.087 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0716 0.159 0.087 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 8.11e-01 0.0197 0.0825 0.087 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 7.93e-01 0.0421 0.16 0.087 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0925 0.181 0.087 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0869 0.14 0.087 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 2.71e-01 0.169 0.153 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0733 0.142 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 6.92e-01 0.0421 0.106 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 9.39e-01 0.0104 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0709 0.106 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 4.18e-01 -0.116 0.143 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 1.94e-01 -0.195 0.15 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 3.47e-01 0.148 0.157 0.091 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 6.23e-01 0.0764 0.155 0.091 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 2.55e-01 -0.135 0.118 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0301 0.148 0.091 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 6.08e-01 0.0521 0.101 0.091 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 1.28e-01 -0.224 0.147 0.091 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 2.26e-01 0.183 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 2.58e-02 0.326 0.145 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 1.35e-01 0.181 0.121 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0245 0.103 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0992 0.14 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 4.68e-01 0.0589 0.0811 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 6.50e-01 0.0538 0.118 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 7.62e-01 0.0386 0.127 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 8.47e-01 0.0281 0.145 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 4.84e-02 0.294 0.148 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 1.38e-01 -0.147 0.0986 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 6.44e-01 -0.055 0.119 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0155 0.119 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 7.45e-02 0.232 0.129 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 4.25e-02 0.311 0.152 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 1.25e-01 -0.23 0.15 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 7.37e-01 0.0474 0.141 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 8.24e-01 0.0289 0.13 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 6.75e-01 0.0664 0.158 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0691 0.0922 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 6.53e-02 -0.271 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0722 0.144 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 4.24e-02 0.295 0.144 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 8.26e-01 -0.017 0.0771 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 9.34e-01 0.00752 0.0909 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 3.78e-01 0.106 0.12 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 9.47e-01 0.00565 0.0842 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0319 0.1 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 7.79e-01 0.0307 0.109 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 5.80e-01 0.0786 0.142 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00528 0.107 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 9.31e-01 0.00918 0.106 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 4.30e-01 -0.105 0.132 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 7.40e-01 0.0256 0.0769 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 2.53e-01 0.123 0.107 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0491 0.108 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 5.33e-02 0.305 0.157 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 7.38e-01 0.0402 0.12 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 9.44e-01 0.00754 0.108 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 7.84e-01 0.0344 0.125 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0253 0.0795 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 9.32e-02 -0.225 0.133 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 3.17e-01 0.128 0.127 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 1.50e-01 0.24 0.166 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 8.82e-01 0.0168 0.113 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 9.64e-02 0.198 0.119 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0753 0.149 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0381 0.0948 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0607 0.13 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 1.72e-02 0.316 0.132 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 6.18e-01 0.0768 0.154 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 4.67e-01 0.078 0.107 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0538 0.0982 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 9.75e-01 0.00377 0.118 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 4.14e-01 0.0685 0.0837 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 1.18e-01 -0.186 0.118 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 1.73e-01 0.169 0.123 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 3.63e-01 0.155 0.17 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 5.60e-02 0.268 0.139 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0334 0.12 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 1.23e-01 -0.244 0.157 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 6.76e-01 0.0319 0.0762 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 1.39e-01 -0.192 0.129 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 8.00e-02 0.244 0.138 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0795 0.166 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00798 0.144 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 6.74e-02 0.276 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 5.99e-01 -0.091 0.173 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 2.99e-01 0.11 0.106 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 2.37e-01 0.192 0.162 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 6.00e-01 0.0828 0.158 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 2.92e-01 0.179 0.169 0.091 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 4.27e-01 0.0874 0.11 0.091 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0411 0.118 0.091 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 4.45e-01 0.119 0.155 0.091 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0357 0.074 0.091 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 1.76e-01 -0.187 0.138 0.091 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 8.29e-01 0.0297 0.137 0.091 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 1.65e-01 0.218 0.156 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 3.99e-01 0.103 0.122 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 2.40e-01 -0.157 0.133 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0554 0.143 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 9.85e-01 0.00174 0.0913 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 5.53e-01 0.0788 0.133 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 2.62e-01 0.163 0.145 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 8.08e-01 0.0353 0.145 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 3.63e-01 0.0869 0.0952 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0316 0.129 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 5.64e-01 0.0667 0.115 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0268 0.0898 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 4.51e-01 0.0892 0.118 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 1.43e-01 0.197 0.134 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 2.14e-01 -0.218 0.175 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 8.89e-01 0.018 0.129 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 3.83e-01 0.131 0.15 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0839 0.133 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0141 0.102 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0328 0.162 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 1.56e-01 0.234 0.164 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 3.12e-01 -0.15 0.148 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00117 0.1 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 9.83e-01 0.0027 0.128 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 6.24e-02 -0.221 0.118 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 4.74e-01 -0.064 0.0891 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0533 0.132 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 3.87e-01 0.116 0.134 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0235 0.189 0.078 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 2.68e-01 -0.221 0.198 0.078 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 3.41e-01 0.16 0.167 0.078 PB L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0494 0.128 0.078 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0151 0.155 0.078 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 2.94e-01 -0.192 0.182 0.078 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 1.36e-01 -0.277 0.184 0.078 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 1.38e-01 0.247 0.166 0.091 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0901 0.127 0.091 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0918 0.133 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0312 0.123 0.091 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 5.53e-01 -0.046 0.0775 0.091 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0943 0.155 0.091 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 4.35e-01 0.117 0.15 0.091 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 2.81e-01 -0.165 0.153 0.09 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00703 0.144 0.09 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 8.79e-01 -0.016 0.105 0.09 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0346 0.165 0.09 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 8.44e-02 -0.158 0.091 0.09 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 9.39e-01 0.0101 0.132 0.09 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 4.27e-02 0.282 0.138 0.09 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0774 0.16 0.085 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 6.90e-01 0.0521 0.131 0.085 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00883 0.115 0.085 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0548 0.129 0.085 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -677733 sc-eQTL 8.76e-01 0.0233 0.149 0.085 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 4.31e-01 -0.136 0.172 0.085 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -677710 sc-eQTL 4.68e-01 -0.12 0.164 0.085 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 2.49e-02 -0.374 0.165 0.085 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 5.67e-01 0.0684 0.119 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 4.61e-01 0.0641 0.0868 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0026 0.0857 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0453 0.0935 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -677733 sc-eQTL 8.90e-01 0.0199 0.144 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 2.18e-01 -0.158 0.128 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -677710 sc-eQTL 1.41e-01 -0.221 0.15 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 1.83e-01 -0.133 0.0995 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 2.35e-01 -0.161 0.135 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0608 0.0998 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 6.59e-01 0.0411 0.093 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 9.13e-01 0.00973 0.0887 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -677733 sc-eQTL 4.91e-01 -0.1 0.145 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 4.62e-01 0.101 0.138 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -677710 sc-eQTL 3.69e-02 -0.331 0.158 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 7.51e-02 -0.226 0.126 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 8.02e-02 0.315 0.179 0.097 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 7.16e-01 0.0528 0.145 0.097 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0273 0.172 0.097 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 4.13e-02 0.325 0.158 0.097 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 2.59e-01 -0.1 0.0886 0.097 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 7.96e-01 -0.046 0.178 0.097 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 1.41e-01 0.237 0.16 0.097 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 2.07e-01 0.2 0.158 0.091 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 4.18e-01 0.0863 0.106 0.091 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 7.22e-01 0.0378 0.106 0.091 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0485 0.0919 0.091 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -677733 sc-eQTL 9.08e-01 0.0166 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0356 0.148 0.091 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -677710 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0992 0.16 0.091 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 8.77e-01 0.0213 0.137 0.091 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 6.07e-01 0.0791 0.153 0.088 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 6.30e-01 0.0629 0.131 0.088 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00902 0.0915 0.088 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0479 0.116 0.088 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -677733 sc-eQTL 3.48e-01 -0.138 0.147 0.088 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 1.49e-01 -0.16 0.11 0.088 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -677710 sc-eQTL 5.06e-01 -0.109 0.163 0.088 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0739 0.144 0.088 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 6.84e-01 0.0743 0.182 0.079 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 1.54e-01 0.22 0.153 0.079 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 4.66e-01 -0.103 0.141 0.079 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00272 0.143 0.079 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -677733 sc-eQTL 3.56e-01 0.13 0.14 0.079 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0401 0.143 0.079 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -677710 sc-eQTL 3.92e-01 0.121 0.141 0.079 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 2.75e-01 -0.158 0.145 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 1.72e-01 0.202 0.147 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0288 0.126 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 9.31e-01 0.00884 0.103 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0302 0.135 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0338 0.0891 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 2.24e-01 -0.166 0.136 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 4.66e-01 -0.11 0.151 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 2.24e-02 0.311 0.135 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 2.70e-02 0.281 0.126 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0451 0.0947 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 2.14e-01 -0.173 0.139 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 2.99e-01 0.076 0.073 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 5.20e-01 0.0702 0.109 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 2.98e-01 0.136 0.13 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0682 0.11 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 5.43e-01 0.0534 0.0877 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 7.61e-01 -0.025 0.0822 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 9.60e-01 0.00406 0.0812 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -677733 sc-eQTL 8.66e-01 0.0245 0.145 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0912 0.119 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -677710 sc-eQTL 4.14e-02 -0.315 0.154 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 8.35e-02 -0.168 0.0966 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 6.13e-01 0.0752 0.148 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 2.37e-01 0.123 0.104 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0244 0.0792 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0814 0.0969 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -677733 sc-eQTL 4.37e-01 -0.11 0.141 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0957 0.0875 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -677710 sc-eQTL 2.31e-01 -0.187 0.155 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0861 0.13 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -758671 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0109 0.14 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 795389 sc-eQTL 4.94e-01 0.067 0.0979 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 sc-eQTL 5.16e-01 0.0789 0.121 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -92581 sc-eQTL 2.54e-01 -0.117 0.102 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 147624 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0785 0.0891 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -973423 sc-eQTL 9.48e-01 0.00769 0.117 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 146605 sc-eQTL 5.42e-02 0.24 0.124 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -388693 eQTL 0.00162 0.0992 0.0314 0.0 0.0 0.108
ENSG00000135597 REPS1 -973423 pQTL 0.0216 0.0983 0.0428 0.00133 0.0 0.104
ENSG00000237499 AL357060.1 146605 eQTL 0.032 -0.0438 0.0204 0.0 0.0 0.108

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 \N -758671 2.77e-07 1.36e-07 5.93e-08 2.05e-07 1.03e-07 8.33e-08 1.73e-07 5.62e-08 1.5e-07 6.75e-08 1.73e-07 1.08e-07 1.79e-07 7.64e-08 5.72e-08 7.89e-08 4.31e-08 1.56e-07 7.12e-08 4.95e-08 1.22e-07 1.31e-07 1.58e-07 3.22e-08 1.68e-07 1.26e-07 1.17e-07 1.06e-07 1.31e-07 1.05e-07 1.07e-07 3.93e-08 3.29e-08 9.3e-08 3.02e-08 2.74e-08 5.42e-08 8.51e-08 6.67e-08 5.13e-08 5.65e-08 1.48e-07 5.39e-08 1.1e-08 3.32e-08 1.68e-08 9.96e-08 1.93e-09 4.85e-08
ENSG00000135597 REPS1 -973423 2.69e-07 1.25e-07 4.48e-08 1.82e-07 9.25e-08 1e-07 1.44e-07 5.4e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.62e-07 8.59e-08 1.41e-07 6.56e-08 6.17e-08 7.53e-08 3.87e-08 1.26e-07 5.82e-08 4.04e-08 1.19e-07 1.28e-07 1.39e-07 3.23e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.09e-07 1.07e-07 9.64e-08 3.64e-08 3.66e-08 8.34e-08 7.51e-08 3.49e-08 5.11e-08 9.36e-08 6.54e-08 3.8e-08 5.14e-08 1.35e-07 5.27e-08 1.09e-08 4.67e-08 1.83e-08 1.19e-07 3.81e-09 4.88e-08