logo

Genes within 1Mb (chr6:138006169:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 2.10e-01 0.16 0.127 0.09 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 1.72e-01 0.17 0.124 0.09 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 4.37e-01 -0.076 0.0975 0.09 B L1
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0534 0.0974 0.09 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 4.77e-01 0.0558 0.0785 0.09 B L1
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 8.71e-01 0.0179 0.11 0.09 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 3.64e-01 0.112 0.123 0.09 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 2.54e-01 0.159 0.139 0.09 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 6.67e-01 0.0352 0.0816 0.09 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0221 0.0936 0.09 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 6.68e-01 0.0379 0.0883 0.09 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00467 0.0827 0.09 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0264 0.0914 0.09 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 8.46e-01 0.0202 0.104 0.09 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 5.98e-01 0.0786 0.149 0.09 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 7.92e-01 0.024 0.0912 0.09 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 4.04e-01 0.0815 0.0975 0.09 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00417 0.0994 0.09 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 8.06e-01 0.0189 0.0768 0.09 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 1.42e-02 -0.245 0.099 0.09 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 1.68e-02 0.268 0.111 0.09 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 4.06e-01 0.126 0.152 0.086 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 8.37e-01 0.0232 0.113 0.086 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0138 0.107 0.086 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 9.93e-01 0.00111 0.12 0.086 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 -686402 sc-eQTL 4.53e-01 0.105 0.139 0.086 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 1.27e-01 -0.188 0.122 0.086 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -686379 sc-eQTL 9.12e-02 -0.245 0.145 0.086 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 5.99e-02 -0.23 0.122 0.086 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0211 0.109 0.09 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 3.67e-01 0.0838 0.0928 0.09 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0121 0.0754 0.09 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0116 0.0789 0.09 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 -686402 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0355 0.142 0.09 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 2.05e-01 -0.106 0.0831 0.09 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 -686379 sc-eQTL 3.66e-02 -0.309 0.147 0.09 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 6.22e-02 -0.182 0.0969 0.09 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 6.39e-01 0.0631 0.134 0.09 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 6.67e-01 0.0446 0.103 0.09 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 7.03e-01 0.0452 0.118 0.09 NK L1
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 2.53e-01 -0.115 0.1 0.09 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0595 0.086 0.09 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 8.38e-01 0.0226 0.111 0.09 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 4.32e-02 0.246 0.121 0.09 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 1.78e-02 0.373 0.156 0.09 Other_T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 9.52e-01 0.0058 0.0964 0.09 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 8.30e-01 0.022 0.102 0.09 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 2.40e-01 0.148 0.126 0.09 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0617 0.0598 0.09 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 2.78e-01 -0.134 0.123 0.09 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 7.52e-01 0.0377 0.119 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 2.56e-01 0.206 0.181 0.087 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 6.82e-02 0.295 0.161 0.087 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0716 0.159 0.087 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 8.11e-01 0.0197 0.0825 0.087 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 7.93e-01 0.0421 0.16 0.087 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0925 0.181 0.087 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0869 0.14 0.087 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 2.71e-01 0.169 0.153 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0733 0.142 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 6.92e-01 0.0421 0.106 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 9.39e-01 0.0104 0.135 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0709 0.106 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 4.18e-01 -0.116 0.143 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 1.94e-01 -0.195 0.15 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 3.47e-01 0.148 0.157 0.091 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 6.23e-01 0.0764 0.155 0.091 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 2.55e-01 -0.135 0.118 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0301 0.148 0.091 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 6.08e-01 0.0521 0.101 0.091 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 1.28e-01 -0.224 0.147 0.091 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 2.26e-01 0.183 0.151 0.091 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 2.58e-02 0.326 0.145 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 1.35e-01 0.181 0.121 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0245 0.103 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0992 0.14 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 4.68e-01 0.0589 0.0811 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 6.50e-01 0.0538 0.118 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 7.62e-01 0.0386 0.127 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 8.47e-01 0.0281 0.145 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 4.84e-02 0.294 0.148 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 1.38e-01 -0.147 0.0986 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 6.44e-01 -0.055 0.119 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0155 0.119 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 7.45e-02 0.232 0.129 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 4.25e-02 0.311 0.152 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 1.25e-01 -0.23 0.15 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 7.37e-01 0.0474 0.141 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 8.24e-01 0.0289 0.13 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 6.75e-01 0.0664 0.158 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0691 0.0922 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 6.53e-02 -0.271 0.146 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0722 0.144 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 4.24e-02 0.295 0.144 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 8.26e-01 -0.017 0.0771 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 9.34e-01 0.00752 0.0909 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 3.78e-01 0.106 0.12 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 9.47e-01 0.00565 0.0842 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0319 0.1 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 7.79e-01 0.0307 0.109 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 5.80e-01 0.0786 0.142 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00528 0.107 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 9.31e-01 0.00918 0.106 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 4.30e-01 -0.105 0.132 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 7.40e-01 0.0256 0.0769 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 2.53e-01 0.123 0.107 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0491 0.108 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 5.33e-02 0.305 0.157 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 7.38e-01 0.0402 0.12 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 9.44e-01 0.00754 0.108 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 7.84e-01 0.0344 0.125 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0253 0.0795 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 9.32e-02 -0.225 0.133 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 3.17e-01 0.128 0.127 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 1.50e-01 0.24 0.166 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 8.82e-01 0.0168 0.113 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 9.64e-02 0.198 0.119 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0753 0.149 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0381 0.0948 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0607 0.13 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 1.72e-02 0.316 0.132 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 6.18e-01 0.0768 0.154 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 4.67e-01 0.078 0.107 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0538 0.0982 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 9.75e-01 0.00377 0.118 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 4.14e-01 0.0685 0.0837 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 1.18e-01 -0.186 0.118 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 1.73e-01 0.169 0.123 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 3.63e-01 0.155 0.17 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 5.60e-02 0.268 0.139 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0334 0.12 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 1.23e-01 -0.244 0.157 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 6.76e-01 0.0319 0.0762 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 1.39e-01 -0.192 0.129 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 8.00e-02 0.244 0.138 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0795 0.166 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00798 0.144 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 6.74e-02 0.276 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 5.99e-01 -0.091 0.173 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 2.99e-01 0.11 0.106 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 2.37e-01 0.192 0.162 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 6.00e-01 0.0828 0.158 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 2.92e-01 0.179 0.169 0.091 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 4.27e-01 0.0874 0.11 0.091 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0411 0.118 0.091 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 4.45e-01 0.119 0.155 0.091 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0357 0.074 0.091 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 1.76e-01 -0.187 0.138 0.091 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 8.29e-01 0.0297 0.137 0.091 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 1.65e-01 0.218 0.156 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 3.99e-01 0.103 0.122 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 2.40e-01 -0.157 0.133 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0554 0.143 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 9.85e-01 0.00174 0.0913 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 5.53e-01 0.0788 0.133 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 2.62e-01 0.163 0.145 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 8.08e-01 0.0353 0.145 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 3.63e-01 0.0869 0.0952 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0316 0.129 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 5.64e-01 0.0667 0.115 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0268 0.0898 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 4.51e-01 0.0892 0.118 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 1.43e-01 0.197 0.134 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 2.14e-01 -0.218 0.175 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 8.89e-01 0.018 0.129 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 3.83e-01 0.131 0.15 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0839 0.133 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0141 0.102 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0328 0.162 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 1.56e-01 0.234 0.164 0.087 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 3.12e-01 -0.15 0.148 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00117 0.1 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 9.83e-01 0.0027 0.128 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 6.24e-02 -0.221 0.118 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 4.74e-01 -0.064 0.0891 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0533 0.132 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 3.87e-01 0.116 0.134 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0235 0.189 0.078 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 2.68e-01 -0.221 0.198 0.078 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 3.41e-01 0.16 0.167 0.078 PB L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0494 0.128 0.078 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0151 0.155 0.078 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 2.94e-01 -0.192 0.182 0.078 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 1.36e-01 -0.277 0.184 0.078 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 1.38e-01 0.247 0.166 0.091 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0901 0.127 0.091 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0918 0.133 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0312 0.123 0.091 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 5.53e-01 -0.046 0.0775 0.091 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0943 0.155 0.091 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 4.35e-01 0.117 0.15 0.091 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 2.81e-01 -0.165 0.153 0.09 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00703 0.144 0.09 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 8.79e-01 -0.016 0.105 0.09 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0346 0.165 0.09 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 8.44e-02 -0.158 0.091 0.09 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 9.39e-01 0.0101 0.132 0.09 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 4.27e-02 0.282 0.138 0.09 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0774 0.16 0.085 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 6.90e-01 0.0521 0.131 0.085 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00883 0.115 0.085 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0548 0.129 0.085 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -686402 sc-eQTL 8.76e-01 0.0233 0.149 0.085 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 4.31e-01 -0.136 0.172 0.085 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -686379 sc-eQTL 4.68e-01 -0.12 0.164 0.085 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 2.49e-02 -0.374 0.165 0.085 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 5.67e-01 0.0684 0.119 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 4.61e-01 0.0641 0.0868 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0026 0.0857 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0453 0.0935 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 -686402 sc-eQTL 8.90e-01 0.0199 0.144 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 2.18e-01 -0.158 0.128 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -686379 sc-eQTL 1.41e-01 -0.221 0.15 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 1.83e-01 -0.133 0.0995 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 2.35e-01 -0.161 0.135 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0608 0.0998 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 6.59e-01 0.0411 0.093 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 9.13e-01 0.00973 0.0887 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 -686402 sc-eQTL 4.91e-01 -0.1 0.145 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 4.62e-01 0.101 0.138 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -686379 sc-eQTL 3.69e-02 -0.331 0.158 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 7.51e-02 -0.226 0.126 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 8.02e-02 0.315 0.179 0.097 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 7.16e-01 0.0528 0.145 0.097 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0273 0.172 0.097 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 4.13e-02 0.325 0.158 0.097 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 2.59e-01 -0.1 0.0886 0.097 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 7.96e-01 -0.046 0.178 0.097 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 1.41e-01 0.237 0.16 0.097 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 2.07e-01 0.2 0.158 0.091 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 4.18e-01 0.0863 0.106 0.091 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 7.22e-01 0.0378 0.106 0.091 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0485 0.0919 0.091 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -686402 sc-eQTL 9.08e-01 0.0166 0.143 0.091 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0356 0.148 0.091 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -686379 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0992 0.16 0.091 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 8.77e-01 0.0213 0.137 0.091 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 6.07e-01 0.0791 0.153 0.088 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 6.30e-01 0.0629 0.131 0.088 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00902 0.0915 0.088 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0479 0.116 0.088 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 -686402 sc-eQTL 3.48e-01 -0.138 0.147 0.088 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 1.49e-01 -0.16 0.11 0.088 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -686379 sc-eQTL 5.06e-01 -0.109 0.163 0.088 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0739 0.144 0.088 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 6.84e-01 0.0743 0.182 0.079 pDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 1.54e-01 0.22 0.153 0.079 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 4.66e-01 -0.103 0.141 0.079 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00272 0.143 0.079 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 -686402 sc-eQTL 3.56e-01 0.13 0.14 0.079 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0401 0.143 0.079 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 -686379 sc-eQTL 3.92e-01 0.121 0.141 0.079 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 2.75e-01 -0.158 0.145 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 1.72e-01 0.202 0.147 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0288 0.126 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 9.31e-01 0.00884 0.103 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0302 0.135 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0338 0.0891 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 2.24e-01 -0.166 0.136 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 4.66e-01 -0.11 0.151 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 2.24e-02 0.311 0.135 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 2.70e-02 0.281 0.126 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0451 0.0947 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 2.14e-01 -0.173 0.139 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 2.99e-01 0.076 0.073 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 5.20e-01 0.0702 0.109 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 2.98e-01 0.136 0.13 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0682 0.11 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 5.43e-01 0.0534 0.0877 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 7.61e-01 -0.025 0.0822 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 9.60e-01 0.00406 0.0812 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -686402 sc-eQTL 8.66e-01 0.0245 0.145 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0912 0.119 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -686379 sc-eQTL 4.14e-02 -0.315 0.154 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 8.35e-02 -0.168 0.0966 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 6.13e-01 0.0752 0.148 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 2.37e-01 0.123 0.104 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0244 0.0792 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0814 0.0969 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 -686402 sc-eQTL 4.37e-01 -0.11 0.141 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0957 0.0875 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 -686379 sc-eQTL 2.31e-01 -0.187 0.155 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0861 0.13 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0109 0.14 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 786720 sc-eQTL 4.94e-01 0.067 0.0979 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 sc-eQTL 5.16e-01 0.0789 0.121 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -101250 sc-eQTL 2.54e-01 -0.117 0.102 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 138955 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0785 0.0891 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 -982092 sc-eQTL 9.48e-01 0.00769 0.117 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 137936 sc-eQTL 5.42e-02 0.24 0.124 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 eQTL 0.0455 0.0503 0.0251 0.0 0.0 0.109
ENSG00000051620 HEBP2 -397362 eQTL 0.0013 0.099 0.0307 0.0 0.0 0.109
ENSG00000135597 REPS1 -982092 pQTL 0.0141 0.104 0.0422 0.00167 0.0 0.106
ENSG00000237499 AL357060.1 137936 eQTL 0.0404 -0.041 0.02 0.0 0.0 0.109

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000024862 CCDC28A -767340 7.3e-07 1.33e-07 5.82e-08 3.96e-07 1.07e-07 1.44e-07 3.33e-07 5.85e-08 1.71e-07 7.6e-08 1.86e-07 1.19e-07 3.04e-07 7.64e-08 6.04e-08 7.74e-08 4.25e-08 1.77e-07 7.29e-08 4.3e-08 1.24e-07 1.47e-07 1.58e-07 3.49e-08 1.98e-07 1.31e-07 1.12e-07 1.12e-07 1.31e-07 2.52e-07 1.14e-07 3.98e-08 3.73e-08 1.36e-07 3.22e-07 1.16e-07 1e-07 7.92e-08 6.71e-08 5.56e-08 5.87e-08 2.5e-07 1.65e-08 1.74e-07 5.19e-08 6.98e-09 9.96e-08 1.88e-09 4.77e-08
ENSG00000135597 REPS1 -982092 3.53e-07 1.19e-07 3.88e-08 2.44e-07 9.79e-08 8.33e-08 1.9e-07 5.37e-08 1.45e-07 4.74e-08 1.55e-07 8.59e-08 1.69e-07 6.38e-08 5.55e-08 7.37e-08 3.93e-08 1.26e-07 5.75e-08 4.21e-08 1.21e-07 1.28e-07 1.39e-07 4.54e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.65e-08 1.08e-07 1.06e-07 9.64e-08 3.84e-08 3.28e-08 1.02e-07 3.04e-07 4.68e-08 4.47e-08 8.71e-08 7.23e-08 3.76e-08 5.13e-08 1.46e-07 3.99e-08 6.51e-08 7.79e-08 1.87e-08 1.19e-07 3.95e-09 4.74e-08