logo

Genes within 1Mb (chr6:137643486:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0518 0.0827 0.226 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 5.81e-03 0.178 0.0638 0.226 B L1
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 6.91e-02 -0.178 0.0972 0.226 B L1
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0588 0.0647 0.226 B L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0466 0.0521 0.226 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 1.34e-01 0.109 0.0724 0.226 B L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0847 0.082 0.226 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0461 0.0554 0.226 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 2.12e-01 0.0793 0.0634 0.226 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0241 0.0894 0.226 CD4T L1
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 1.47e-01 0.0868 0.0597 0.226 CD4T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 7.31e-01 0.0193 0.0562 0.226 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0309 0.0428 0.226 CD4T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0237 0.0707 0.226 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 8.14e-01 0.0149 0.0632 0.226 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00284 0.0677 0.226 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 1.02e-01 -0.172 0.105 0.226 CD8T L1
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 3.02e-01 0.0711 0.0688 0.226 CD8T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00386 0.0532 0.226 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00518 0.0562 0.226 CD8T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 4.65e-01 0.0571 0.0781 0.226 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0295 0.0765 0.227 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 7.09e-01 -0.027 0.0725 0.227 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 1.62e-01 -0.15 0.107 0.227 DC L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 6.73e-01 0.0345 0.0817 0.227 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0641 0.0847 0.227 DC L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0597 0.0832 0.227 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 859441 sc-eQTL 5.12e-01 0.0727 0.111 0.227 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0559 0.0644 0.226 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 2.58e-01 0.0591 0.0522 0.226 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 5.96e-01 0.0576 0.108 0.226 Mono L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0346 0.0546 0.226 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0686 0.0637 0.226 Mono L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 6.37e-01 0.0321 0.0677 0.226 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 859441 sc-eQTL 5.93e-01 0.0414 0.0772 0.226 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00326 0.0709 0.227 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 4.03e-01 0.0679 0.081 0.227 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 6.14e-01 0.0552 0.109 0.227 NK L1
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 9.35e-01 0.00561 0.0689 0.227 NK L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0583 0.0588 0.227 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0291 0.0845 0.227 NK L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 7.74e-01 -0.024 0.0836 0.227 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0302 0.066 0.226 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 9.25e-01 0.00656 0.07 0.226 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 2.89e-01 0.114 0.107 0.226 Other_T L1
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 5.60e-01 0.0504 0.0864 0.226 Other_T L1
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 8.77e-01 -0.00636 0.0411 0.226 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000893 0.0794 0.226 Other_T L1
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 5.92e-01 0.0437 0.0815 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0207 0.114 0.219 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 9.35e-01 0.00914 0.111 0.219 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 6.16e-01 0.0561 0.112 0.219 B_Activated L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0194 0.0578 0.219 B_Activated L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00901 0.112 0.219 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0193 0.126 0.219 B_Activated L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00607 0.098 0.219 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 5.21e-01 0.0632 0.0982 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 5.49e-02 0.141 0.073 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 8.54e-01 -0.019 0.103 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 8.91e-01 0.0128 0.0937 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 5.16e-01 0.0478 0.0735 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00973 0.0889 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0946 0.104 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 1.12e-01 -0.169 0.106 0.226 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 7.83e-01 0.0223 0.0811 0.226 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 7.48e-02 -0.191 0.107 0.226 B_Memory L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0623 0.101 0.226 B_Memory L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0376 0.0696 0.226 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 2.58e-01 -0.108 0.0948 0.226 B_Memory L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0134 0.104 0.226 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0414 0.0838 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 9.57e-03 0.184 0.0703 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0743 0.111 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 6.16e-02 0.18 0.096 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0487 0.0561 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 2.97e-01 0.0822 0.0787 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 8.94e-02 -0.149 0.0874 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0116 0.106 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 5.16e-01 0.0456 0.0701 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 6.94e-01 0.0456 0.116 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 8.87e-02 0.143 0.0838 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 1.26e-01 0.129 0.0838 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0337 0.0897 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 4.92e-01 0.075 0.109 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 2.75e-01 0.106 0.0965 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 6.64e-01 0.0388 0.0892 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0448 0.107 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 2.98e-01 0.113 0.108 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 9.30e-01 0.00557 0.0634 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0761 0.101 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 1.40e-01 -0.146 0.0982 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 9.46e-02 -0.0876 0.0522 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 2.15e-01 0.0767 0.0617 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 1.58e-01 -0.14 0.0987 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 1.40e-01 0.12 0.0814 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 4.00e-01 0.0484 0.0573 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0288 0.0421 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 9.40e-01 0.00564 0.0744 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0106 0.073 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 7.16e-01 0.0263 0.0722 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 5.43e-01 0.0653 0.107 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 5.46e-01 0.0547 0.0906 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0413 0.0526 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0447 0.0599 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 8.73e-01 0.0118 0.0738 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 3.22e-01 0.0829 0.0836 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 7.41e-02 0.134 0.0748 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 9.77e-01 0.00314 0.108 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0395 0.0876 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00416 0.0556 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0652 0.0858 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0813 0.089 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 5.84e-01 0.0419 0.0765 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 5.54e-01 -0.048 0.081 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0754 0.105 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 7.98e-01 0.0259 0.101 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 1.08e-01 -0.103 0.064 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 7.80e-01 0.0254 0.0908 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0625 0.0904 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 1.70e-01 -0.104 0.0751 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0137 0.0692 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0581 0.109 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 4.27e-01 0.066 0.083 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 4.39e-01 0.0457 0.0589 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 7.79e-01 0.0196 0.0699 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 8.87e-01 0.0124 0.0873 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 4.94e-01 0.0681 0.0993 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0481 0.0845 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0611 0.114 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 6.86e-01 0.0452 0.112 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 5.42e-01 0.0329 0.0538 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0455 0.0961 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 2.45e-01 0.114 0.0982 0.227 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 1.85e-01 0.128 0.0961 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 7.32e-02 0.181 0.1 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 2.42e-01 -0.13 0.111 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 7.02e-01 0.0442 0.115 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0886 0.0709 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 8.60e-01 0.0194 0.11 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 3.68e-01 0.0952 0.105 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0296 0.0774 0.225 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 7.16e-01 0.0301 0.0828 0.225 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0602 0.105 0.225 MAIT L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 2.17e-01 0.135 0.109 0.225 MAIT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0125 0.0521 0.225 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 4.94e-01 0.0621 0.0907 0.225 MAIT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 1.61e-01 0.135 0.0959 0.225 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 1.46e-01 0.124 0.0848 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 7.52e-01 0.0294 0.093 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0543 0.111 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 3.72e-02 -0.207 0.0985 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0782 0.0632 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 1.26e-01 0.147 0.096 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 5.53e-01 -0.06 0.101 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 9.15e-01 0.007 0.0656 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 5.49e-01 0.0531 0.0885 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 3.74e-01 0.1 0.113 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 6.01e-02 -0.149 0.0787 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 6.89e-01 0.0248 0.0617 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 5.53e-01 0.0528 0.0888 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 9.33e-01 0.00782 0.0925 0.228 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 9.49e-01 0.00549 0.0859 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 3.93e-01 0.085 0.0994 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 2.07e-01 0.138 0.109 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 7.09e-01 0.033 0.0885 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00515 0.0681 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 2.57e-01 -0.123 0.108 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0862 0.11 0.221 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 9.51e-01 0.00433 0.0699 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 5.29e-01 0.0563 0.0892 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 5.06e-01 -0.073 0.11 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 6.04e-01 0.0431 0.0832 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0502 0.0623 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 1.97e-01 -0.111 0.0854 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0462 0.094 0.228 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 4.96e-02 -0.257 0.129 0.241 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 7.37e-02 0.197 0.109 0.241 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 5.60e-01 0.0788 0.135 0.241 PB L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0129 0.0843 0.241 PB L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0165 0.102 0.241 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0329 0.116 0.241 PB L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0926 0.122 0.241 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 6.81e-01 0.0355 0.0864 0.228 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0325 0.0903 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0538 0.105 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 7.19e-01 0.03 0.0835 0.228 Pro_T L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0377 0.0526 0.228 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0604 0.102 0.228 Pro_T L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 4.45e-01 -0.078 0.102 0.228 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 5.84e-02 -0.186 0.0979 0.226 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00317 0.0717 0.226 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 5.03e-01 0.07 0.104 0.226 Treg L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 3.33e-01 0.109 0.113 0.226 Treg L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 5.06e-01 0.0418 0.0627 0.226 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00685 0.068 0.226 Treg L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0225 0.0958 0.226 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 3.42e-01 -0.08 0.0839 0.227 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0157 0.0741 0.227 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 2.54e-01 -0.124 0.108 0.227 cDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 6.66e-02 0.152 0.0822 0.227 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0809 0.0851 0.227 cDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 8.71e-01 0.0176 0.108 0.227 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859441 sc-eQTL 5.05e-01 0.0742 0.111 0.227 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0139 0.0606 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 9.48e-01 0.00388 0.0597 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 2.28e-01 0.131 0.109 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 7.83e-01 -0.018 0.0652 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0678 0.0677 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 5.37e-01 0.0431 0.0696 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859441 sc-eQTL 7.24e-01 0.0309 0.0872 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0922 0.0693 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 7.44e-01 0.0212 0.0648 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 6.34e-01 0.0533 0.112 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 7.81e-01 0.0172 0.0618 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 7.50e-01 0.0268 0.0841 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 1.83e-01 0.118 0.0884 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859441 sc-eQTL 4.53e-01 0.065 0.0866 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0375 0.104 0.203 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 9.79e-01 0.00329 0.124 0.203 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 3.29e-02 0.28 0.13 0.203 gdT L2
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0167 0.115 0.203 gdT L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 6.02e-02 0.12 0.0633 0.203 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 6.12e-02 -0.253 0.134 0.203 gdT L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0439 0.116 0.203 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0122 0.075 0.22 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0437 0.0747 0.22 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 8.18e-01 0.0233 0.101 0.22 intMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 5.87e-01 0.0352 0.0647 0.22 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 2.23e-01 0.128 0.105 0.22 intMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 5.35e-01 0.0599 0.0965 0.22 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859441 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0911 0.111 0.22 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 5.26e-01 0.0555 0.0874 0.224 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 6.77e-01 0.0256 0.0613 0.224 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0498 0.108 0.224 ncMono L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 8.45e-01 0.0152 0.0774 0.224 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0503 0.101 0.224 ncMono L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0666 0.0967 0.224 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859441 sc-eQTL 4.78e-01 0.0725 0.102 0.224 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0372 0.0986 0.223 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0784 0.0902 0.223 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0419 0.108 0.223 pDC L2
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 1.21e-01 -0.141 0.0907 0.223 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 1.90e-01 -0.159 0.121 0.223 pDC L2
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0825 0.0925 0.223 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 859441 sc-eQTL 4.57e-01 0.0832 0.112 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0388 0.0858 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 5.36e-02 0.134 0.069 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 4.13e-02 -0.201 0.0977 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0253 0.0917 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 8.79e-01 0.00926 0.0605 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0461 0.0801 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0535 0.102 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0163 0.0881 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 5.24e-03 0.181 0.0642 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0709 0.107 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 7.74e-02 0.169 0.0953 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0593 0.0503 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 4.82e-01 0.052 0.0739 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0793 0.0897 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0463 0.0608 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 5.27e-01 0.0361 0.0569 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 4.82e-01 0.0768 0.109 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 8.03e-01 -0.014 0.0563 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0587 0.0658 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 3.28e-01 0.066 0.0673 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 859441 sc-eQTL 6.10e-01 0.0401 0.0784 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0307 0.0718 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 9.40e-01 0.00414 0.0548 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0352 0.108 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 5.18e-01 0.0434 0.067 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 8.77e-01 0.0134 0.086 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00525 0.0899 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 859441 sc-eQTL 8.25e-01 0.0226 0.102 0.226 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 424037 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00798 0.0668 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 sc-eQTL 4.49e-01 0.0628 0.0828 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 820922 sc-eQTL 5.95e-01 0.06 0.113 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112378 PERP -463933 sc-eQTL 7.50e-01 0.0223 0.0699 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118503 TNFAIP3 -223728 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0494 0.0608 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0385 0.0822 0.228 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000237499 WAKMAR2 -224747 sc-eQTL 7.34e-01 -0.029 0.0852 0.228 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 eQTL 0.000579 0.0732 0.0212 0.0077 0.0 0.282
ENSG00000197442 MAP3K5 851009 eQTL 0.0149 0.0332 0.0136 0.0 0.0 0.282

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 HEBP2 -760045 2.67e-07 1.27e-07 5.03e-08 1.9e-07 9.24e-08 9.91e-08 1.6e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.55e-07 9.19e-08 1.53e-07 7.13e-08 6.04e-08 7.49e-08 4.09e-08 1.33e-07 6.07e-08 4.31e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.64e-08 1.55e-07 1.25e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.2e-07 1.05e-07 9.92e-08 3.06e-08 3.96e-08 8.23e-08 4.84e-08 3.28e-08 5.22e-08 8.71e-08 6.86e-08 3.92e-08 5.39e-08 1.4e-07 5.21e-08 1.28e-08 3.83e-08 1.84e-08 1.21e-07 1.88e-09 5.01e-08
ENSG00000220412 \N -63715 5.49e-06 7.73e-06 1.05e-06 3.75e-06 1.9e-06 2.58e-06 9.17e-06 1.28e-06 5.32e-06 3.49e-06 8.76e-06 3.63e-06 1.12e-05 3.14e-06 1.02e-06 4.66e-06 3.67e-06 3.97e-06 2.15e-06 2.27e-06 3.37e-06 7.38e-06 5.54e-06 2.56e-06 9.83e-06 2.49e-06 3.41e-06 2.36e-06 7.01e-06 7.77e-06 3.67e-06 6.3e-07 8.97e-07 2.79e-06 2.6e-06 2.1e-06 1.55e-06 1.42e-06 1.39e-06 9.09e-07 1.04e-06 8.21e-06 7.85e-07 1.88e-07 6.99e-07 8.35e-07 9.16e-07 7.13e-07 5.39e-07
ENSG00000226004 \N -302316 1.26e-06 9.36e-07 3.03e-07 4.19e-07 1.78e-07 4.06e-07 9.92e-07 2.88e-07 9.89e-07 3.11e-07 1.16e-06 5.62e-07 1.46e-06 2.4e-07 4.05e-07 5.75e-07 7.78e-07 5.67e-07 3.95e-07 4.25e-07 2.93e-07 7.73e-07 6.93e-07 4.87e-07 1.69e-06 2.8e-07 5.76e-07 4.92e-07 8.81e-07 9.93e-07 4.59e-07 3.85e-08 1.73e-07 3.91e-07 3.93e-07 3.98e-07 3.64e-07 1.55e-07 1.5e-07 4.07e-08 3.02e-07 1.22e-06 6.87e-08 3.38e-08 1.73e-07 5.38e-08 1.9e-07 8.51e-08 8.28e-08