Genes within 1Mb (chr6:136820748:T:TC):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 5.90e-01 0.0376 0.0696 0.513 B L1
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000444 0.031 0.513 B L1
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 1.29e-01 0.125 0.082 0.513 B L1
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 5.16e-02 0.126 0.0646 0.513 B L1
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 7.18e-01 0.0222 0.0613 0.513 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0498 0.0846 0.513 B L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 8.50e-01 0.0088 0.0466 0.513 CD4T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 8.96e-01 0.00461 0.0353 0.513 CD4T L1
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 5.32e-01 0.0469 0.075 0.513 CD4T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 1.38e-07 0.184 0.0337 0.513 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0402 0.0725 0.513 CD4T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 3.55e-01 0.0495 0.0534 0.513 CD8T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 4.33e-01 0.0284 0.0362 0.513 CD8T L1
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0719 0.0891 0.513 CD8T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 4.72e-16 0.358 0.0407 0.513 CD8T L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 6.53e-01 0.0294 0.0654 0.509 DC L1
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 2.95e-02 -0.128 0.0582 0.509 DC L1
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 4.95e-01 0.0629 0.092 0.509 DC L1
ENSG00000135525 MAP7 269929 sc-eQTL 9.82e-01 0.00171 0.0757 0.509 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 8.99e-01 0.0106 0.084 0.509 DC L1
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 8.15e-02 0.126 0.072 0.509 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0853 0.0785 0.509 DC L1
ENSG00000286646 AL121933.2 36703 sc-eQTL 6.86e-03 -0.254 0.093 0.509 DC L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 3.32e-01 0.0517 0.0532 0.513 Mono L1
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0669 0.0454 0.513 Mono L1
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 3.05e-01 0.0921 0.0895 0.513 Mono L1
ENSG00000135525 MAP7 269929 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0295 0.0791 0.513 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 1.81e-01 0.0861 0.0641 0.513 Mono L1
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 4.00e-02 0.108 0.0523 0.513 Mono L1
ENSG00000286646 AL121933.2 36703 sc-eQTL 1.66e-06 -0.299 0.0606 0.513 Mono L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 1.80e-01 0.0801 0.0596 0.511 NK L1
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 8.48e-01 0.0061 0.0318 0.511 NK L1
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 5.44e-01 0.0561 0.0923 0.511 NK L1
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 4.11e-19 0.582 0.059 0.511 NK L1
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 9.21e-01 0.00555 0.0557 0.513 Other_T L1
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0153 0.0467 0.513 Other_T L1
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 9.81e-02 0.15 0.0903 0.513 Other_T L1
ENSG00000146410 MTFR2 570413 sc-eQTL 8.04e-01 0.0131 0.0525 0.513 Other_T L1
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 2.47e-10 0.405 0.0609 0.513 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0157 0.0904 0.508 B_Activated L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 2.75e-02 0.161 0.0724 0.508 B_Activated L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 5.32e-01 0.0557 0.0888 0.508 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 9.30e-01 0.00784 0.0895 0.508 B_Activated L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 4.27e-01 0.0794 0.0998 0.508 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 6.68e-02 -0.133 0.0721 0.508 B_Activated L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 6.87e-02 0.149 0.0815 0.513 B_Intermediate L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 9.88e-02 -0.077 0.0464 0.513 B_Intermediate L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 7.71e-01 0.025 0.0859 0.513 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 7.26e-01 0.0281 0.0798 0.513 B_Intermediate L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 7.27e-02 0.133 0.0737 0.513 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0399 0.084 0.513 B_Intermediate L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 4.18e-01 0.0716 0.0883 0.515 B_Memory L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0764 0.0522 0.515 B_Memory L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 2.64e-01 0.0996 0.089 0.515 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 8.15e-01 0.0192 0.0816 0.515 B_Memory L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 3.95e-01 0.0672 0.0788 0.515 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0651 0.0754 0.515 B_Memory L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0155 0.0704 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00555 0.0402 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 1.79e-01 0.125 0.0925 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 6.89e-02 0.142 0.0774 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 1.09e-01 -0.106 0.0658 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0798 0.0915 0.513 B_Naive1 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 2.42e-01 0.101 0.086 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 8.07e-01 0.0122 0.05 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 8.74e-01 -0.015 0.0944 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 1.95e-01 0.113 0.0865 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0722 0.073 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 9.20e-01 0.00897 0.0887 0.513 B_Naive2 L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 4.36e-01 0.062 0.0795 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 1.92e-01 0.0921 0.0703 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0117 0.0883 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 3.29e-04 0.295 0.0806 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 4.88e-01 0.0499 0.0718 0.514 CD4_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 7.41e-01 0.0146 0.0442 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 7.66e-01 0.0106 0.0355 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0103 0.0834 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 6.20e-04 0.12 0.0345 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0349 0.0786 0.513 CD4_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 3.19e-01 0.062 0.062 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 8.18e-01 -0.00902 0.0392 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 1.87e-01 0.12 0.0909 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 3.12e-05 0.208 0.049 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0146 0.0885 0.513 CD4_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0274 0.0697 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 2.67e-01 0.0548 0.0493 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 6.01e-01 0.0472 0.0899 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 4.94e-03 0.199 0.0702 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 1.19e-01 -0.13 0.0833 0.513 CD4_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 3.73e-01 0.0567 0.0635 0.513 CD8_CTL L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 9.87e-01 0.000695 0.0424 0.513 CD8_CTL L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 1.88e-01 0.115 0.0872 0.513 CD8_CTL L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 1.25e-13 0.526 0.0663 0.513 CD8_CTL L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 3.27e-01 0.0617 0.0628 0.513 CD8_Naive L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 3.24e-01 0.0433 0.0438 0.513 CD8_Naive L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 9.31e-01 0.00789 0.0912 0.513 CD8_Naive L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 9.47e-05 0.224 0.0563 0.513 CD8_Naive L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00243 0.0823 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 3.74e-01 0.0549 0.0616 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0501 0.0944 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 8.81e-03 0.207 0.0782 0.502 CD8_TCM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 8.47e-01 0.0157 0.0815 0.523 CD8_TEM L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 8.05e-01 -0.019 0.0769 0.523 CD8_TEM L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0428 0.0938 0.523 CD8_TEM L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 6.81e-06 0.408 0.0883 0.523 CD8_TEM L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 5.90e-01 0.0344 0.0637 0.515 MAIT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 2.06e-01 -0.067 0.0528 0.515 MAIT L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 4.59e-01 0.0641 0.0863 0.515 MAIT L2
ENSG00000146410 MTFR2 570413 sc-eQTL 6.67e-01 0.0308 0.0714 0.515 MAIT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 2.40e-09 0.428 0.0686 0.515 MAIT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 1.51e-01 0.104 0.0722 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 8.15e-01 0.0125 0.0536 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0771 0.0945 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 1.37e-06 0.386 0.0776 0.509 NK_CD56bright L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 3.26e-01 0.054 0.0549 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0169 0.0359 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 7.87e-01 0.0256 0.0948 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 1.04e-17 0.587 0.0625 0.513 NK_CD56dim L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 4.70e-01 0.0512 0.0707 0.518 NK_HLA L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 1.41e-01 0.0882 0.0596 0.518 NK_HLA L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00449 0.0899 0.518 NK_HLA L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 3.12e-08 0.476 0.0825 0.518 NK_HLA L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 3.77e-01 0.0518 0.0585 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 1.55e-01 0.0622 0.0435 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 3.98e-01 0.0777 0.0918 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 6.08e-11 0.448 0.0649 0.513 NK_cytokine L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 4.37e-01 0.0917 0.118 0.526 PB L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 1.58e-01 0.143 0.101 0.526 PB L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 1.29e-01 0.183 0.12 0.526 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0143 0.0864 0.526 PB L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00657 0.104 0.526 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 5.75e-02 0.165 0.0859 0.526 PB L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0358 0.0724 0.504 Pro_T L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 2.06e-01 0.0948 0.0748 0.504 Pro_T L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 9.84e-01 0.00181 0.088 0.504 Pro_T L2
ENSG00000146410 MTFR2 570413 sc-eQTL 9.77e-01 0.00179 0.0611 0.504 Pro_T L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 9.14e-02 0.144 0.0848 0.504 Pro_T L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 4.43e-01 0.0639 0.0832 0.513 Treg L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 3.11e-01 0.0545 0.0537 0.513 Treg L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 2.11e-01 0.11 0.0877 0.513 Treg L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 3.36e-01 0.0553 0.0573 0.513 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0347 0.0807 0.513 Treg L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 6.46e-01 0.0336 0.0729 0.517 cDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 7.40e-01 0.0244 0.0734 0.517 cDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 4.82e-01 0.0663 0.0942 0.517 cDC L2
ENSG00000135525 MAP7 269929 sc-eQTL 4.10e-01 0.0693 0.0839 0.517 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 3.14e-01 0.0844 0.0835 0.517 cDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00815 0.0739 0.517 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0549 0.0758 0.517 cDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 36703 sc-eQTL 1.08e-01 -0.155 0.0956 0.517 cDC L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 3.12e-01 0.0507 0.05 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0526 0.0536 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00536 0.0902 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000135525 MAP7 269929 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0461 0.0776 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 4.25e-01 0.0609 0.0762 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 3.47e-01 0.0527 0.056 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000286646 AL121933.2 36703 sc-eQTL 8.34e-05 -0.279 0.0695 0.513 cMono_IL1B L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00395 0.0583 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 9.84e-01 0.0012 0.0599 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 7.61e-01 0.0284 0.0935 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000135525 MAP7 269929 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0174 0.0872 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 8.66e-01 0.0135 0.0799 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 1.99e-02 0.163 0.0695 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000286646 AL121933.2 36703 sc-eQTL 1.20e-03 -0.232 0.0708 0.513 cMono_S100A L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 5.00e-01 0.0559 0.0826 0.491 gdT L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 7.22e-01 0.0259 0.0728 0.491 gdT L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 3.95e-01 0.0892 0.105 0.491 gdT L2
ENSG00000146410 MTFR2 570413 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0467 0.0802 0.491 gdT L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 1.70e-04 0.395 0.102 0.491 gdT L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 5.86e-02 -0.118 0.0621 0.511 intMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0315 0.0828 0.511 intMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 1.50e-01 0.121 0.0841 0.511 intMono L2
ENSG00000135525 MAP7 269929 sc-eQTL 4.48e-01 0.0631 0.083 0.511 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 3.88e-01 0.0709 0.082 0.511 intMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 7.89e-01 0.0236 0.0881 0.511 intMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 36703 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0846 0.0928 0.511 intMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 7.90e-02 0.129 0.0732 0.507 ncMono L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0259 0.0573 0.507 ncMono L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 5.38e-01 0.0563 0.0913 0.507 ncMono L2
ENSG00000135525 MAP7 269929 sc-eQTL 6.63e-01 0.0352 0.0807 0.507 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 1.93e-01 0.0997 0.0763 0.507 ncMono L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 2.56e-01 0.0964 0.0846 0.507 ncMono L2
ENSG00000286646 AL121933.2 36703 sc-eQTL 3.96e-02 -0.176 0.0852 0.507 ncMono L2
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 7.82e-01 0.0236 0.0853 0.52 pDC L2
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 1.94e-01 -0.083 0.0636 0.52 pDC L2
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 5.19e-02 0.182 0.0928 0.52 pDC L2
ENSG00000135525 MAP7 269929 sc-eQTL 7.08e-01 0.0246 0.0656 0.52 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0457 0.089 0.52 pDC L2
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 1.43e-01 0.153 0.104 0.52 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0595 0.0862 0.52 pDC L2
ENSG00000286646 AL121933.2 36703 sc-eQTL 1.33e-01 -0.145 0.0961 0.52 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 1.01e-01 0.118 0.0715 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0372 0.0403 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 2.57e-01 0.0937 0.0825 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 9.09e-01 0.00849 0.0744 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 2.17e-02 0.153 0.0664 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 4.07e-01 -0.071 0.0853 0.513 B_Memory LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 9.42e-01 0.00545 0.0743 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 8.99e-01 -0.00433 0.0341 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 3.53e-01 0.084 0.0902 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 5.33e-02 0.145 0.0748 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 6.44e-02 -0.115 0.0618 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 939806 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0276 0.0918 0.513 B_Naive LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 5.18e-01 0.0327 0.0504 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0423 0.0469 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 6.89e-01 0.0363 0.0906 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 269929 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0273 0.081 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 3.42e-01 0.063 0.0662 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 3.80e-02 0.113 0.0542 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 36703 sc-eQTL 2.63e-06 -0.298 0.0618 0.513 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 6.03e-01 0.0309 0.0594 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0458 0.0536 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 1.40e-01 0.132 0.0892 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135525 MAP7 269929 sc-eQTL 7.71e-01 0.0253 0.0867 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B 969047 sc-eQTL 1.15e-01 0.117 0.0737 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 1.72e-01 0.0971 0.0709 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286646 AL121933.2 36703 sc-eQTL 5.87e-02 -0.159 0.0838 0.511 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 sc-eQTL 1.98e-01 0.0725 0.0562 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000029363 BCLAF1 530897 sc-eQTL 6.99e-01 0.0127 0.0327 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112357 PEX7 -1816 sc-eQTL 4.36e-01 0.0742 0.0951 0.513 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 sc-eQTL 2.65e-19 0.569 0.0573 0.513 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000027697 IFNGR1 -398701 pQTL 0.043 0.0306 0.0151 0.0 0.0 0.488
ENSG00000112357 PEX7 -1816 eQTL 4.230000000000001e-21 0.236 0.0245 0.00232 0.00208 0.483
ENSG00000182747 SLC35D3 -101553 eQTL 6.76e-16 -0.241 0.0293 0.0 0.0 0.483
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 eQTL 8.209999999999999e-23 0.115 0.0114 0.0 0.0 0.483


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112357 PEX7 -1816 0.000273 0.00035 4.73e-05 0.000117 6.79e-05 0.000104 0.000288 6.16e-05 0.00029 0.000163 0.000347 0.000163 0.000402 0.000113 6.6e-05 0.000216 0.000122 0.000223 8.18e-05 6e-05 0.000166 0.000346 0.000244 8.69e-05 0.000364 0.000108 0.000154 0.000121 0.000244 9.85e-05 0.000175 2.25e-05 2.53e-05 6.09e-05 6.84e-05 4.83e-05 2.71e-05 2.88e-05 4.04e-05 2.29e-05 1.78e-05 0.000337 2.89e-05 3.65e-06 2.58e-05 4.4e-05 4.68e-05 2.09e-05 1.76e-05
ENSG00000182747 SLC35D3 -101553 1.86e-05 1.84e-05 5.65e-06 7.87e-06 2.91e-06 5.81e-06 1.17e-05 2.62e-06 1.18e-05 5.48e-06 1.29e-05 5.73e-06 2.44e-05 4.49e-06 3.67e-06 1.51e-05 1.58e-05 1.64e-05 3.59e-06 3.09e-06 8.31e-06 1.67e-05 1.2e-05 4.37e-06 2.91e-05 5.25e-06 7.52e-06 6.54e-06 1.12e-05 8.58e-06 6.37e-06 1.65e-06 1.21e-06 3.54e-06 5.47e-06 2.87e-06 3.13e-06 1.93e-06 2.01e-06 2.1e-06 9.79e-07 1.57e-05 3.24e-06 5.28e-07 1.93e-06 2e-06 3.71e-06 8.16e-07 4.57e-07
ENSG00000197442 MAP3K5 28271 0.000162 0.000119 1.6e-05 3.76e-05 2.11e-05 4.03e-05 0.000104 1.85e-05 9.81e-05 5.52e-05 0.000127 4.98e-05 0.000162 4.02e-05 1.71e-05 9.35e-05 5.35e-05 9.19e-05 2.51e-05 1.65e-05 4.65e-05 0.000145 8.85e-05 2.97e-05 0.000196 3.27e-05 6.31e-05 3.62e-05 8.87e-05 4.74e-05 5.48e-05 5.38e-06 5.7e-06 1.78e-05 2.81e-05 1.24e-05 6.52e-06 9.43e-06 1.15e-05 6.13e-06 3.66e-06 0.000117 1.52e-05 2.23e-06 8.21e-06 1.29e-05 1.43e-05 6.17e-06 3.89e-06