logo

Genes within 1Mb (chr6:133401410:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0153 0.11 0.19 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 999935 sc-eQTL 3.38e-01 0.111 0.116 0.19 B L1
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 6.64e-01 -0.019 0.0437 0.19 B L1
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 7.30e-01 0.0284 0.0821 0.19 B L1
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 5.45e-01 0.0301 0.0496 0.19 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 6.13e-02 -0.143 0.076 0.19 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 5.82e-03 -0.286 0.103 0.19 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 4.35e-01 0.063 0.0806 0.19 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 9.35e-01 0.0068 0.0839 0.19 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 5.76e-01 0.0406 0.0726 0.19 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0351 0.0493 0.19 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 2.52e-01 -0.076 0.0662 0.19 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 1.43e-03 -0.315 0.0975 0.19 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 9.21e-02 0.133 0.0786 0.19 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 1.46e-01 0.12 0.0822 0.19 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 9.34e-01 0.00802 0.0965 0.19 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 5.69e-01 0.0188 0.0329 0.19 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0259 0.0508 0.19 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 2.49e-03 -0.299 0.0975 0.19 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 2.86e-01 -0.132 0.124 0.189 DC L1
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 4.59e-01 0.0571 0.077 0.189 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 666645 sc-eQTL 5.86e-01 0.0521 0.0955 0.189 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 687355 sc-eQTL 8.17e-02 -0.179 0.102 0.189 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0437 0.11 0.189 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0359 0.0618 0.189 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0466 0.0718 0.189 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0605 0.0979 0.189 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 298282 sc-eQTL 7.28e-01 -0.031 0.0891 0.189 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -894891 sc-eQTL 2.99e-01 -0.115 0.111 0.189 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0456 0.0854 0.19 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 7.14e-01 -0.021 0.0571 0.19 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 666645 sc-eQTL 7.11e-02 0.177 0.0973 0.19 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 687355 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0314 0.106 0.19 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0676 0.0743 0.19 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 2.44e-01 -0.052 0.0445 0.19 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 7.83e-01 0.0174 0.063 0.19 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 8.13e-01 0.0209 0.0883 0.19 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -894891 sc-eQTL 2.35e-01 -0.103 0.0865 0.19 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00842 0.0929 0.191 NK L1
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 1.82e-01 0.114 0.0855 0.191 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 6.41e-01 0.0499 0.107 0.191 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0189 0.0442 0.191 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0729 0.0816 0.191 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0652 0.11 0.19 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0671 0.0866 0.19 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 1.48e-01 -0.151 0.104 0.19 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 9.74e-01 0.00137 0.0416 0.19 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 2.34e-01 -0.091 0.0763 0.19 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 2.79e-01 -0.123 0.114 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0937 0.13 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 999935 sc-eQTL 9.71e-01 0.00425 0.119 0.184 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 2.48e-01 0.128 0.111 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 3.06e-01 -0.121 0.118 0.184 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 1.42e-01 0.093 0.063 0.184 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 1.03e-01 -0.184 0.112 0.184 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 7.51e-01 0.0353 0.111 0.184 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0642 0.122 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 999935 sc-eQTL 2.87e-01 0.115 0.107 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 6.19e-01 0.035 0.0703 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 1.78e-01 0.143 0.105 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 2.09e-01 0.0815 0.0646 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0697 0.112 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 1.58e-02 -0.28 0.115 0.189 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 2.68e-01 0.131 0.118 0.19 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 999935 sc-eQTL 5.47e-02 -0.209 0.108 0.19 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 7.75e-02 0.151 0.0848 0.19 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 7.51e-01 0.0355 0.112 0.19 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 9.19e-01 0.0055 0.0539 0.19 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 2.77e-01 -0.107 0.0985 0.19 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0944 0.112 0.19 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0693 0.109 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 999935 sc-eQTL 3.16e-01 0.12 0.119 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00203 0.0523 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0241 0.102 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0292 0.0579 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0403 0.0905 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 1.57e-01 -0.158 0.111 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 4.34e-01 0.0916 0.117 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 999935 sc-eQTL 1.62e-01 0.159 0.113 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00589 0.0621 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 3.77e-01 0.101 0.114 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 4.74e-01 0.0433 0.0603 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0522 0.107 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 2.08e-01 -0.145 0.115 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 2.64e-02 -0.25 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 7.95e-01 0.0292 0.112 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 5.29e-01 0.0714 0.113 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00773 0.0523 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0528 0.0906 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0712 0.105 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 8.26e-01 0.0204 0.0924 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 1.40e-01 -0.133 0.0902 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 5.18e-01 0.0544 0.0839 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0417 0.0544 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 4.25e-02 -0.135 0.0661 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 1.31e-03 -0.333 0.102 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 1.21e-01 0.155 0.0996 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 5.20e-02 0.195 0.1 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 9.64e-01 0.00445 0.0994 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 9.51e-01 0.00314 0.0515 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00711 0.0721 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 1.37e-01 -0.177 0.119 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 2.72e-01 0.128 0.116 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 9.16e-01 0.0123 0.117 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 8.46e-01 0.0218 0.112 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0216 0.0459 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0167 0.0789 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0445 0.114 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 2.81e-01 0.109 0.101 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 8.87e-03 0.245 0.0927 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 7.65e-01 -0.032 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0458 0.0572 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0474 0.0967 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 1.87e-01 -0.146 0.111 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00506 0.107 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 6.11e-01 0.0581 0.114 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 6.04e-01 0.0511 0.0984 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 6.07e-01 -0.029 0.0563 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0199 0.0707 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 2.59e-02 -0.251 0.112 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0823 0.12 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 2.53e-01 0.127 0.111 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0205 0.11 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 7.70e-01 0.0158 0.0537 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 6.32e-02 -0.165 0.0882 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 6.97e-01 0.046 0.118 0.197 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0207 0.111 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 4.72e-01 -0.087 0.121 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00394 0.12 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0702 0.0645 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 3.69e-01 0.0954 0.106 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 1.93e-01 -0.159 0.122 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 4.84e-02 -0.224 0.113 0.19 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0988 0.108 0.19 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 1.48e-01 -0.159 0.109 0.19 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 1.62e-01 0.0755 0.0538 0.19 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0977 0.0758 0.19 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0375 0.113 0.19 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 6.52e-01 0.0554 0.123 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 3.17e-01 0.114 0.114 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0196 0.116 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0739 0.0642 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 7.73e-01 0.0278 0.0963 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0969 0.0997 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 5.17e-01 0.0593 0.0914 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 5.39e-01 0.0703 0.114 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0389 0.0453 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 3.11e-01 -0.102 0.1 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 9.35e-01 0.0102 0.125 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 9.92e-01 0.00111 0.114 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0968 0.115 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 6.32e-01 0.0257 0.0536 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0474 0.106 0.185 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 3.79e-01 0.0895 0.101 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 6.43e-01 0.0456 0.0984 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 3.81e-01 0.097 0.11 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0392 0.06 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 5.44e-02 -0.192 0.0991 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 4.51e-02 -0.297 0.146 0.193 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 999935 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0336 0.127 0.193 PB L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 2.36e-02 0.238 0.104 0.193 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 2.17e-01 0.16 0.129 0.193 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 2.88e-01 0.0782 0.0733 0.193 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 2.52e-02 -0.264 0.116 0.193 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 1.57e-01 0.195 0.137 0.193 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 6.97e-01 -0.045 0.115 0.189 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 8.39e-01 0.021 0.103 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0717 0.11 0.189 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0427 0.0417 0.189 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 7.49e-01 0.0269 0.0838 0.189 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 4.38e-01 0.0839 0.108 0.189 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 2.97e-01 0.123 0.118 0.19 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 2.39e-01 -0.131 0.111 0.19 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0687 0.0937 0.19 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 8.29e-01 0.00897 0.0415 0.19 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 4.34e-01 0.0685 0.0873 0.19 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 4.48e-04 -0.406 0.114 0.19 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 1.13e-01 -0.202 0.127 0.183 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 3.18e-01 0.1 0.0999 0.183 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 666645 sc-eQTL 1.85e-01 0.132 0.099 0.183 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 687355 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0652 0.117 0.183 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 6.91e-01 0.0454 0.114 0.183 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0124 0.0563 0.183 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 8.52e-02 -0.163 0.0941 0.183 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0331 0.111 0.183 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 298282 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0401 0.0891 0.183 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894891 sc-eQTL 6.61e-02 -0.201 0.109 0.183 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0635 0.0965 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 8.11e-01 0.0175 0.0733 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 666645 sc-eQTL 4.40e-01 0.08 0.103 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 687355 sc-eQTL 7.51e-01 0.0332 0.104 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0294 0.0835 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0611 0.0462 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0156 0.0692 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0287 0.0895 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894891 sc-eQTL 1.75e-01 -0.126 0.0928 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0467 0.11 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0458 0.0798 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 666645 sc-eQTL 2.13e-02 0.228 0.0985 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 687355 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0336 0.108 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0594 0.0708 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 1.11e-01 -0.0812 0.0508 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0504 0.0583 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 8.34e-01 0.0199 0.0945 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894891 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0928 0.0922 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 4.19e-01 -0.12 0.148 0.188 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 4.08e-01 -0.106 0.128 0.188 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 1.46e-01 -0.205 0.14 0.188 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 2.91e-02 -0.117 0.053 0.188 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0314 0.102 0.188 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 2.26e-01 -0.169 0.139 0.188 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 6.72e-01 0.0484 0.114 0.187 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 4.40e-02 0.219 0.108 0.187 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 666645 sc-eQTL 1.45e-03 0.347 0.107 0.187 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 687355 sc-eQTL 9.19e-01 0.0111 0.109 0.187 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0332 0.111 0.187 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0492 0.048 0.187 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 4.99e-01 0.0546 0.0808 0.187 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 1.75e-02 -0.277 0.116 0.187 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894891 sc-eQTL 9.63e-01 0.00526 0.112 0.187 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 4.99e-01 0.082 0.121 0.183 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0595 0.0817 0.183 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 666645 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0289 0.115 0.183 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 687355 sc-eQTL 1.23e-01 -0.177 0.114 0.183 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 2.72e-01 -0.121 0.11 0.183 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 4.75e-01 0.0395 0.0552 0.183 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0341 0.0782 0.183 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 1.74e-02 0.231 0.0963 0.183 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894891 sc-eQTL 3.21e-01 -0.102 0.103 0.183 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 9.89e-01 0.00201 0.143 0.186 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 2.01e-01 0.122 0.0949 0.186 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 666645 sc-eQTL 6.62e-01 -0.042 0.096 0.186 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 687355 sc-eQTL 2.02e-02 -0.225 0.096 0.186 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0186 0.116 0.186 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 8.56e-02 -0.137 0.0794 0.186 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0145 0.0814 0.186 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0741 0.118 0.186 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 298282 sc-eQTL 4.25e-01 0.0906 0.113 0.186 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -894891 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0639 0.101 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 9.28e-01 0.0108 0.119 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 999935 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0118 0.116 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 9.16e-02 0.111 0.0652 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 4.60e-01 0.0768 0.104 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 8.25e-01 0.0131 0.0592 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 1.81e-01 -0.124 0.0921 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 1.08e-02 -0.275 0.107 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0496 0.109 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 999935 sc-eQTL 8.10e-02 0.207 0.118 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 8.22e-01 -0.011 0.0489 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 6.96e-01 0.0372 0.0949 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 9.90e-01 0.000732 0.0575 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0628 0.0888 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 3.21e-02 -0.231 0.107 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 3.98e-01 -0.075 0.0885 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0251 0.0616 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 666645 sc-eQTL 1.55e-01 0.143 0.1 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 687355 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00828 0.105 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0582 0.0692 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0769 0.0472 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0139 0.0647 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0187 0.0845 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -894891 sc-eQTL 2.29e-01 -0.107 0.0884 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 3.82e-01 0.0998 0.114 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 4.60e-01 0.0558 0.0753 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 666645 sc-eQTL 2.14e-02 0.254 0.109 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 687355 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0908 0.11 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0951 0.103 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 8.72e-01 0.00707 0.0439 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 9.89e-01 0.000937 0.0665 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 sc-eQTL 2.68e-01 -0.118 0.106 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -894891 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0669 0.0964 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -550760 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0195 0.092 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 888212 sc-eQTL 2.36e-01 0.102 0.0861 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 637951 sc-eQTL 3.85e-01 0.095 0.109 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 586841 sc-eQTL 6.38e-01 -0.021 0.0446 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -916702 sc-eQTL 7.65e-02 -0.163 0.0915 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 666645 eQTL 0.000413 -0.0651 0.0184 0.0 0.0 0.189
ENSG00000112299 VNN1 687355 pQTL 0.00375 0.131 0.0452 0.0 0.0 0.188
ENSG00000112299 VNN1 687355 eQTL 0.0117 0.0692 0.0274 0.0 0.0 0.189
ENSG00000112303 VNN2 637951 pQTL 0.00397 -0.094 0.0326 0.0 0.0 0.188
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 eQTL 0.000523 -0.0977 0.0281 0.0 0.0 0.189
ENSG00000234484 AL032821.1 648735 eQTL 0.0234 0.0893 0.0393 0.0 0.0 0.189

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 588071 3.62e-07 1.83e-07 7.72e-08 2.41e-07 1.05e-07 1.19e-07 2.86e-07 7.12e-08 1.98e-07 1.15e-07 2.07e-07 1.62e-07 3.04e-07 8.66e-08 7.79e-08 1.1e-07 6.81e-08 2.33e-07 8.93e-08 8.87e-08 1.39e-07 2.06e-07 1.86e-07 4.91e-08 2.74e-07 1.76e-07 1.39e-07 1.44e-07 1.47e-07 1.89e-07 1.27e-07 6.58e-08 5.2e-08 9.09e-08 1.22e-07 5.05e-08 5.76e-08 6.1e-08 4.9e-08 8.16e-08 3.27e-08 2e-07 3.2e-08 1.98e-08 8.06e-08 8.07e-09 9.12e-08 2.85e-09 5.49e-08