logo

Genes within 1Mb (chr6:132752034:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 350559 sc-eQTL 5.82e-02 -0.233 0.123 0.145 B L1
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 5.63e-01 -0.027 0.0466 0.145 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 1.75e-02 0.207 0.0864 0.145 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 4.47e-02 -0.106 0.0525 0.145 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 7.18e-01 0.0403 0.111 0.145 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 620146 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0545 0.0731 0.145 B L1
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.60e-01 0.0829 0.0903 0.145 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 5.24e-01 0.0499 0.0782 0.145 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 5.86e-01 -0.029 0.0532 0.145 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 2.23e-01 0.131 0.107 0.145 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 5.97e-01 0.0476 0.0901 0.145 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 5.73e-02 0.199 0.104 0.145 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0113 0.036 0.145 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 8.53e-01 0.0201 0.109 0.145 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 1.78e-01 0.115 0.0852 0.142 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 17269 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00869 0.106 0.142 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 37979 sc-eQTL 4.75e-01 0.0819 0.114 0.142 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 1.37e-02 0.3 0.121 0.142 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0232 0.0687 0.142 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 5.73e-01 0.0613 0.109 0.142 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -351094 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0846 0.0988 0.142 DC L1
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0079 0.0623 0.145 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 17269 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0891 0.107 0.145 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 37979 sc-eQTL 4.23e-01 0.0923 0.115 0.145 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 6.38e-10 0.481 0.0742 0.145 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0438 0.0486 0.145 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 2.29e-02 0.218 0.0951 0.145 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 6.57e-01 -0.041 0.0922 0.144 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 6.23e-02 0.213 0.114 0.144 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0272 0.0475 0.144 NK L1
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00271 0.0948 0.145 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 5.38e-02 0.221 0.114 0.145 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 9.64e-01 0.00207 0.0455 0.145 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 9.71e-01 0.00461 0.125 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 350559 sc-eQTL 1.50e-01 -0.177 0.123 0.153 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.84e-01 -0.101 0.115 0.153 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 2.22e-02 0.28 0.121 0.153 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 4.93e-01 0.0453 0.0659 0.153 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 3.97e-01 0.0979 0.115 0.153 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 620146 sc-eQTL 4.07e-02 -0.225 0.109 0.153 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 350559 sc-eQTL 9.93e-01 0.001 0.112 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0641 0.0734 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 2.01e-01 0.141 0.11 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 2.44e-02 -0.152 0.067 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 5.63e-01 0.0706 0.122 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 620146 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00947 0.104 0.146 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 350559 sc-eQTL 3.93e-01 0.098 0.114 0.147 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 4.60e-01 0.0664 0.0898 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 9.81e-02 0.194 0.117 0.147 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 1.03e-01 -0.0922 0.0563 0.147 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 3.22e-01 -0.117 0.118 0.147 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 620146 sc-eQTL 5.52e-01 0.0656 0.11 0.147 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 350559 sc-eQTL 3.32e-01 -0.123 0.126 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0427 0.0553 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0433 0.107 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 8.53e-02 -0.105 0.0608 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0662 0.118 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 620146 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0703 0.0781 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 350559 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0455 0.12 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0761 0.0652 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 4.11e-01 0.0988 0.12 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0251 0.0636 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 2.22e-02 0.276 0.12 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 620146 sc-eQTL 2.33e-01 -0.1 0.0838 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.42e-02 0.28 0.131 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 1.21e-01 0.208 0.133 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 4.43e-01 0.0475 0.0619 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 2.47e-01 0.144 0.124 0.136 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 1.33e-01 0.147 0.0972 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 3.90e-01 0.0778 0.0904 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 8.36e-01 0.0122 0.0587 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 6.29e-01 0.0547 0.113 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.13e-01 -0.109 0.108 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 8.96e-01 0.014 0.106 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0528 0.055 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 1.63e-01 0.178 0.127 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0273 0.125 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 1.97e-02 -0.278 0.118 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0332 0.0491 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 9.26e-01 0.0114 0.122 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0303 0.104 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 1.07e-02 0.3 0.117 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 3.91e-01 0.0543 0.0632 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 2.58e-01 0.139 0.122 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 6.61e-01 -0.055 0.125 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0312 0.108 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0467 0.0618 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 5.15e-01 0.081 0.124 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 9.44e-01 -0.009 0.128 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 6.95e-01 0.0498 0.127 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0536 0.0618 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 9.70e-01 0.00505 0.136 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 2.27e-01 -0.162 0.134 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 2.03e-01 0.17 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 1.99e-01 0.0923 0.0716 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0713 0.136 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 2.03e-01 -0.161 0.126 0.134 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 3.75e-02 0.267 0.127 0.134 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 2.52e-01 0.0726 0.0632 0.134 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 1.83e-01 0.177 0.132 0.134 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.55e-01 0.113 0.121 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 4.59e-02 0.246 0.122 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00259 0.0689 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0463 0.0983 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 5.06e-02 0.24 0.122 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 5.99e-01 0.0257 0.0488 0.144 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 1.24e-01 -0.186 0.12 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 3.60e-01 0.112 0.122 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00567 0.057 0.146 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0957 0.107 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 3.15e-01 0.121 0.12 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0494 0.0654 0.144 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 350559 sc-eQTL 3.63e-01 -0.114 0.125 0.152 PB L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 8.12e-01 -0.025 0.105 0.152 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 8.91e-01 0.0177 0.128 0.152 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 4.74e-01 0.0521 0.0725 0.152 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 5.53e-01 -0.081 0.136 0.152 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 620146 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0287 0.0896 0.152 PB L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 4.02e-02 0.226 0.11 0.148 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 4.42e-01 0.0914 0.119 0.148 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 1.31e-01 0.0677 0.0447 0.148 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0628 0.116 0.148 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.84e-01 -0.108 0.124 0.145 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 6.69e-01 0.0446 0.104 0.145 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 6.42e-01 0.0215 0.0461 0.145 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 3.76e-01 0.115 0.13 0.145 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.60e-01 0.099 0.108 0.141 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 17269 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0103 0.107 0.141 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 37979 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00887 0.126 0.141 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 4.15e-02 0.25 0.122 0.141 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00384 0.0607 0.141 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0376 0.12 0.141 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -351094 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0328 0.0961 0.141 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 5.71e-01 0.0444 0.0782 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 17269 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0713 0.11 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 37979 sc-eQTL 5.21e-01 0.0717 0.111 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 1.41e-09 0.518 0.0818 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0102 0.0495 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 2.09e-02 0.22 0.0944 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0335 0.0861 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 17269 sc-eQTL 7.83e-01 0.0297 0.108 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 37979 sc-eQTL 2.96e-01 0.122 0.117 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 3.19e-12 0.505 0.0682 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0223 0.0551 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 4.11e-01 0.0838 0.102 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0934 0.14 0.145 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 4.86e-01 0.108 0.155 0.145 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 6.55e-01 0.0264 0.0589 0.145 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 6.36e-01 0.0722 0.152 0.145 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 2.45e-01 -0.132 0.113 0.147 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 17269 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0168 0.115 0.147 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 37979 sc-eQTL 4.10e-02 0.231 0.112 0.147 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 1.58e-01 0.163 0.115 0.147 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0231 0.0501 0.147 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 6.55e-01 0.0546 0.122 0.147 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0367 0.0851 0.145 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 17269 sc-eQTL 1.11e-01 0.191 0.119 0.145 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 37979 sc-eQTL 3.54e-03 0.345 0.117 0.145 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 5.65e-01 0.0661 0.115 0.145 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0658 0.0573 0.145 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 8.51e-01 0.019 0.102 0.145 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0241 0.0988 0.144 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 17269 sc-eQTL 8.25e-01 0.022 0.0994 0.144 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 37979 sc-eQTL 5.31e-03 0.279 0.0987 0.144 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 6.79e-02 0.219 0.119 0.144 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 1.88e-01 0.109 0.0825 0.144 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 3.67e-01 0.111 0.123 0.144 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -351094 sc-eQTL 3.81e-01 -0.103 0.117 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 350559 sc-eQTL 6.63e-01 0.0524 0.12 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0596 0.0679 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 1.33e-02 0.265 0.106 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 1.28e-02 -0.152 0.0604 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 8.88e-01 0.0159 0.113 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 620146 sc-eQTL 7.40e-01 -0.036 0.109 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 350559 sc-eQTL 3.14e-01 -0.128 0.127 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0495 0.0521 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 3.12e-01 0.102 0.101 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0852 0.061 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 3.49e-01 0.108 0.115 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 620146 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0737 0.0733 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 6.09e-01 0.0343 0.0671 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 17269 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0803 0.109 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 37979 sc-eQTL 7.73e-01 0.0329 0.114 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 4.03e-11 0.474 0.068 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0337 0.0517 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 3.55e-02 0.193 0.0911 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 1.94e-01 -0.106 0.0812 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 17269 sc-eQTL 7.28e-01 0.0418 0.12 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 37979 sc-eQTL 1.86e-03 0.366 0.116 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 3.07e-01 0.114 0.112 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0412 0.0475 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 sc-eQTL 2.91e-01 0.122 0.115 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 238836 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0882 0.0924 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -11425 sc-eQTL 5.75e-02 0.222 0.116 0.144 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -62535 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0104 0.0478 0.144 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 238836 eQTL 0.0142 -0.0608 0.0247 0.0 0.0 0.115
ENSG00000093134 VNN3 17269 eQTL 5.63e-09 0.132 0.0224 0.0 0.0 0.115
ENSG00000112299 VNN1 37979 pQTL 0.00499 0.156 0.0556 0.0 0.0 0.113
ENSG00000112299 VNN1 37979 eQTL 0.0452 -0.0679 0.0339 0.0 0.0 0.115
ENSG00000112303 VNN2 -11425 pQTL 1.15e-19 0.359 0.0389 0.0037 0.00242 0.113
ENSG00000112303 VNN2 -11425 eQTL 9.52e-08 0.107 0.02 0.0 0.0 0.115
ENSG00000146409 SLC18B1 -61305 eQTL 0.000751 0.117 0.0347 0.0 0.0 0.115
ENSG00000234484 AL032821.1 -641 eQTL 5.7e-18 -0.412 0.0468 0.0 0.0 0.115

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 17269 0.000151 1.24e-05 1.26e-06 7.82e-06 2.48e-06 1.82e-05 1.56e-05 1.96e-06 1e-05 5.61e-06 1.4e-05 5.73e-06 1.85e-05 3.67e-06 3.54e-06 9.02e-06 5.78e-06 1.68e-05 2.63e-06 2.93e-06 6.35e-06 1.34e-05 1.2e-05 3.17e-06 2.22e-05 4.45e-06 7.12e-06 3.57e-06 1.18e-05 1.06e-05 5.69e-06 7.64e-07 7.42e-07 3e-06 5.32e-06 1.53e-06 1.19e-06 1.74e-06 1.39e-06 1.04e-06 8.79e-07 1.89e-05 3.8e-06 1.95e-07 8.03e-07 1.01e-06 2.08e-06 5.52e-07 4.39e-07
ENSG00000112303 VNN2 -11425 0.000151 1.33e-05 2.38e-06 9.4e-06 2.4e-06 2.01e-05 2.04e-05 2.14e-06 1.14e-05 6.11e-06 1.67e-05 6.5e-06 2.3e-05 3.97e-06 4.33e-06 1.01e-05 7.29e-06 2.06e-05 2.58e-06 3.17e-06 6.85e-06 1.73e-05 1.49e-05 3.3e-06 2.42e-05 5.14e-06 7.58e-06 4.75e-06 1.45e-05 1.3e-05 7.63e-06 1.07e-06 1.27e-06 3.5e-06 6.09e-06 2.13e-06 1.73e-06 1.91e-06 2.11e-06 1.3e-06 9.4e-07 2.21e-05 4.52e-06 1.81e-07 9.9e-07 1.62e-06 2.74e-06 6.95e-07 6.21e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -641 0.00013 3.04e-05 5.99e-06 1.87e-05 7.19e-06 2.84e-05 4.74e-05 6.24e-06 3.72e-05 1.61e-05 4.6e-05 2.12e-05 5.42e-05 1.17e-05 6.69e-06 3.12e-05 1.98e-05 4.06e-05 6.32e-06 7.31e-06 1.59e-05 5.03e-05 3.58e-05 9.45e-06 5.3e-05 1.12e-05 1.98e-05 1.15e-05 3.36e-05 3.06e-05 2.41e-05 1.65e-06 2.95e-06 7.18e-06 1.52e-05 5.85e-06 3.82e-06 3.42e-06 5.18e-06 4.16e-06 1.96e-06 4.48e-05 5.66e-06 3.59e-07 2.77e-06 3.81e-06 6.21e-06 1.45e-06 1.57e-06