Genes within 1Mb (chr6:132740783:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 339308 sc-eQTL 2.45e-02 -0.269 0.119 0.158 B L1
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0195 0.0453 0.158 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 1.28e-02 0.211 0.0839 0.158 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 4.20e-02 -0.104 0.051 0.158 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 7.43e-01 0.0355 0.108 0.158 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 608895 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0172 0.0711 0.158 B L1
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 3.79e-01 0.0771 0.0874 0.158 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 5.12e-01 0.0498 0.0758 0.158 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 7.87e-01 -0.014 0.0516 0.158 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 3.02e-01 0.108 0.104 0.158 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 4.91e-01 0.0602 0.0872 0.158 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 6.06e-02 0.191 0.101 0.158 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 6.55e-01 0.0156 0.0348 0.158 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 9.73e-01 0.00363 0.105 0.158 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 3.65e-01 0.0747 0.0823 0.153 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 6018 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0788 0.102 0.153 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 26728 sc-eQTL 5.45e-01 0.0669 0.11 0.153 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 7.77e-03 0.312 0.116 0.153 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00737 0.0662 0.153 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 7.26e-01 0.0367 0.105 0.153 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -362345 sc-eQTL 1.80e-01 -0.128 0.095 0.153 DC L1
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 8.77e-01 -0.00924 0.0598 0.158 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 6018 sc-eQTL 2.19e-01 -0.126 0.102 0.158 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 26728 sc-eQTL 7.69e-01 0.0325 0.11 0.158 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 1.04e-10 0.48 0.0706 0.158 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0496 0.0466 0.158 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 2.09e-02 0.212 0.0913 0.158 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0271 0.0906 0.157 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 5.89e-02 0.212 0.112 0.157 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00153 0.0466 0.157 NK L1
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0413 0.0927 0.158 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 7.55e-02 0.199 0.111 0.158 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 5.49e-01 0.0267 0.0445 0.158 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 9.38e-01 0.00948 0.122 0.158 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 339308 sc-eQTL 1.72e-01 -0.164 0.119 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 1.55e-01 -0.16 0.112 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 2.97e-02 0.259 0.118 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 4.57e-01 0.0478 0.0641 0.163 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 2.15e-01 0.139 0.112 0.163 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 608895 sc-eQTL 3.58e-02 -0.224 0.106 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 339308 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0388 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0398 0.0714 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 2.56e-01 0.122 0.107 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 2.97e-02 -0.143 0.0652 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 5.00e-01 0.0801 0.119 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 608895 sc-eQTL 7.32e-01 0.0345 0.101 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 339308 sc-eQTL 8.23e-01 0.0251 0.112 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 4.14e-01 0.0719 0.0879 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 9.47e-02 0.192 0.114 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 8.98e-02 -0.094 0.0551 0.159 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 1.51e-01 -0.166 0.115 0.159 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 608895 sc-eQTL 4.98e-01 0.0732 0.108 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 339308 sc-eQTL 2.37e-01 -0.147 0.124 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0282 0.0542 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0153 0.105 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 1.28e-01 -0.0912 0.0596 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0783 0.116 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 608895 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0182 0.0766 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 339308 sc-eQTL 3.75e-01 -0.103 0.116 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0709 0.0632 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 5.11e-01 0.0765 0.116 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0229 0.0616 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 2.86e-02 0.256 0.116 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 608895 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0883 0.0813 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 5.67e-02 0.243 0.127 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 1.03e-01 0.21 0.128 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 2.31e-01 0.0714 0.0594 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 3.93e-01 0.103 0.12 0.15 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 2.11e-01 0.118 0.0943 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 5.04e-01 0.0587 0.0876 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 7.41e-01 0.0188 0.0569 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 7.09e-01 0.0409 0.109 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0938 0.104 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 6.44e-01 0.0474 0.103 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0209 0.0532 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 2.10e-01 0.154 0.123 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0182 0.121 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 8.48e-02 -0.2 0.116 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0196 0.0478 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 7.42e-01 0.0392 0.119 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 8.26e-01 0.0222 0.101 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 1.64e-02 0.274 0.113 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 9.70e-02 0.102 0.0612 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 4.17e-01 0.0969 0.119 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0725 0.121 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0379 0.105 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00457 0.0599 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 5.99e-01 0.0632 0.12 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 6.57e-01 -0.055 0.124 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 4.16e-01 0.0999 0.122 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0225 0.0598 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 7.37e-01 -0.044 0.131 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 1.37e-01 -0.194 0.13 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 1.60e-01 0.182 0.129 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 1.21e-01 0.108 0.0694 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0746 0.132 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 9.49e-02 -0.203 0.121 0.147 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 1.63e-01 0.173 0.123 0.147 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 1.84e-01 0.081 0.0608 0.147 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 2.73e-01 0.14 0.128 0.147 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 4.38e-01 0.0917 0.118 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 7.33e-02 0.215 0.119 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 6.69e-01 0.0287 0.0669 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 5.47e-01 -0.058 0.0962 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 4.34e-02 0.242 0.119 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 3.86e-01 0.0415 0.0477 0.157 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 2.76e-01 -0.128 0.117 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 3.32e-01 0.115 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 9.07e-01 0.00649 0.0554 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0483 0.104 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 2.44e-01 0.137 0.117 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0133 0.0638 0.157 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 339308 sc-eQTL 2.55e-01 -0.142 0.124 0.163 PB L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0515 0.104 0.163 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 9.14e-01 0.0137 0.127 0.163 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 3.71e-01 0.0646 0.0719 0.163 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0456 0.135 0.163 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 608895 sc-eQTL 7.69e-01 0.0262 0.0889 0.163 PB L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 4.88e-02 0.211 0.106 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 4.29e-01 0.0912 0.115 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 2.77e-02 0.0956 0.0431 0.161 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 5.41e-01 -0.069 0.113 0.161 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0549 0.12 0.158 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 8.12e-01 0.024 0.101 0.158 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 2.65e-01 0.0497 0.0445 0.158 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 3.37e-01 0.121 0.126 0.158 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 4.36e-01 0.0813 0.104 0.151 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 6018 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0409 0.103 0.151 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 26728 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0163 0.122 0.151 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 3.74e-02 0.246 0.117 0.151 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0053 0.0585 0.151 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 9.04e-01 -0.014 0.116 0.151 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -362345 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0534 0.0926 0.151 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 4.68e-01 0.0551 0.0757 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 6018 sc-eQTL 2.24e-01 -0.13 0.107 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 26728 sc-eQTL 9.37e-01 0.00853 0.108 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 1.03e-09 0.505 0.0791 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0227 0.0479 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 4.90e-02 0.182 0.0917 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0564 0.0832 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 6018 sc-eQTL 9.64e-01 0.00475 0.104 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 26728 sc-eQTL 5.52e-01 0.0673 0.113 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 1.29e-11 0.475 0.0663 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0203 0.0532 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 2.26e-01 0.119 0.0982 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 6.87e-01 -0.054 0.133 0.158 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 4.57e-01 0.11 0.147 0.158 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 4.42e-01 0.0433 0.0562 0.158 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 3.91e-01 0.125 0.145 0.158 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0997 0.11 0.158 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 6018 sc-eQTL 9.86e-01 0.00191 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 26728 sc-eQTL 1.66e-01 0.152 0.109 0.158 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 2.32e-01 0.134 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0304 0.0486 0.158 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 6.23e-01 0.0582 0.118 0.158 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0464 0.0827 0.156 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 6018 sc-eQTL 1.10e-01 0.186 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 26728 sc-eQTL 1.61e-02 0.277 0.114 0.156 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 4.23e-01 0.0894 0.111 0.156 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0669 0.0557 0.156 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 5.24e-01 0.063 0.0986 0.156 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0575 0.0947 0.153 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 6018 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00087 0.0955 0.153 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 26728 sc-eQTL 2.88e-03 0.286 0.0944 0.153 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 3.59e-02 0.241 0.114 0.153 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 3.73e-01 0.071 0.0795 0.153 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 3.54e-01 0.109 0.118 0.153 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -362345 sc-eQTL 2.39e-01 -0.133 0.112 0.153 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 339308 sc-eQTL 9.93e-01 0.00104 0.117 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0457 0.0662 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 2.69e-02 0.231 0.104 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 1.01e-02 -0.153 0.0588 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 9.86e-01 0.00198 0.11 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 608895 sc-eQTL 9.57e-01 0.00568 0.106 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 339308 sc-eQTL 1.72e-01 -0.17 0.124 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0365 0.051 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 3.36e-01 0.0955 0.099 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0747 0.0598 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 3.99e-01 0.0956 0.113 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 608895 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0364 0.0719 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 7.06e-01 0.0243 0.0644 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 6018 sc-eQTL 2.30e-01 -0.126 0.105 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 26728 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0198 0.109 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 1.59e-11 0.463 0.0649 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0343 0.0495 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 4.64e-02 0.175 0.0874 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 1.51e-01 -0.113 0.0785 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 6018 sc-eQTL 5.68e-01 0.0663 0.116 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 26728 sc-eQTL 1.03e-02 0.293 0.113 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 2.17e-01 0.134 0.108 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0461 0.0459 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 sc-eQTL 1.81e-01 0.149 0.111 0.155 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 227585 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0721 0.0908 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -22676 sc-eQTL 4.85e-02 0.226 0.114 0.157 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -73786 sc-eQTL 7.67e-01 0.014 0.047 0.157 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 227585 eQTL 0.0103 -0.063 0.0245 0.0 0.0 0.123
ENSG00000093134 VNN3 6018 eQTL 4.41e-09 0.131 0.0222 0.0 0.0 0.123
ENSG00000112299 VNN1 26728 pQTL 0.000246 0.201 0.0547 0.0 0.0 0.122
ENSG00000112299 VNN1 26728 eQTL 0.0343 -0.0711 0.0336 0.0 0.0 0.123
ENSG00000112303 VNN2 -22676 pQTL 1.08e-20 0.363 0.0383 0.0198 0.0193 0.122
ENSG00000112303 VNN2 -22676 eQTL 5.67e-08 0.108 0.0198 0.0 0.0 0.123
ENSG00000146409 SLC18B1 -72556 eQTL 0.00143 0.11 0.0344 0.0 0.0 0.123
ENSG00000234484 AL032821.1 -11892 eQTL 2.19e-19 -0.425 0.0462 0.0 0.00662 0.123


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 6018 4.16e-05 2.96e-05 6.45e-06 1.55e-05 5.76e-06 1.67e-05 4.36e-05 4.07e-06 2.98e-05 1.45e-05 3.59e-05 1.56e-05 4.85e-05 1.3e-05 6.69e-06 1.86e-05 1.58e-05 2.56e-05 8.23e-06 6.97e-06 1.59e-05 3.22e-05 3.06e-05 1.02e-05 4.2e-05 7.92e-06 1.32e-05 1.17e-05 3.23e-05 3.14e-05 1.87e-05 1.63e-06 3.02e-06 7.79e-06 1.12e-05 5.99e-06 3.52e-06 3.21e-06 5.3e-06 3.6e-06 1.79e-06 3.65e-05 3.68e-06 4.29e-07 2.79e-06 3.72e-06 4.08e-06 1.64e-06 1.52e-06
ENSG00000112303 VNN2 -22676 1.63e-05 1.57e-05 3.02e-06 9.47e-06 2.98e-06 8.2e-06 2.18e-05 2.62e-06 1.64e-05 7.9e-06 1.99e-05 7.7e-06 2.87e-05 6.06e-06 5.06e-06 9.57e-06 8.12e-06 1.43e-05 4.65e-06 4.17e-06 8.04e-06 1.55e-05 1.64e-05 5.33e-06 2.61e-05 5.34e-06 7.82e-06 6.65e-06 1.77e-05 1.65e-05 1.09e-05 1.17e-06 1.68e-06 4.87e-06 6.48e-06 3.83e-06 1.86e-06 2.64e-06 3.25e-06 2.18e-06 1.48e-06 1.97e-05 2.52e-06 2.69e-07 1.84e-06 2.45e-06 2.93e-06 1.2e-06 1.01e-06
ENSG00000234484 AL032821.1 -11892 2.93e-05 2.41e-05 5.11e-06 1.31e-05 4.22e-06 1.31e-05 3.31e-05 3.69e-06 2.24e-05 1.13e-05 2.86e-05 1.07e-05 3.92e-05 9.68e-06 5.81e-06 1.35e-05 1.22e-05 2.06e-05 6.96e-06 5.45e-06 1.18e-05 2.46e-05 2.41e-05 8.06e-06 3.39e-05 6.27e-06 9.65e-06 9.09e-06 2.59e-05 2.41e-05 1.46e-05 1.57e-06 2.43e-06 6.71e-06 9.06e-06 4.91e-06 2.82e-06 2.96e-06 4.29e-06 3.17e-06 1.7e-06 2.92e-05 2.86e-06 3.55e-07 2.18e-06 2.97e-06 3.77e-06 1.48e-06 1.46e-06