Genes within 1Mb (chr6:132725704:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 324229 sc-eQTL 4.09e-02 -0.243 0.118 0.16 B L1
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0251 0.045 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 9.23e-03 0.219 0.0833 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 6.78e-02 -0.0932 0.0508 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 9.05e-01 0.0128 0.108 0.16 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 593816 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0261 0.0707 0.16 B L1
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 3.49e-01 0.0816 0.0869 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 2.85e-01 0.0806 0.0752 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00661 0.0513 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 2.93e-01 0.109 0.103 0.16 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 4.92e-01 0.0596 0.0867 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 6.43e-02 0.187 0.101 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 6.89e-01 0.0139 0.0346 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0174 0.105 0.16 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 2.22e-01 0.1 0.082 0.155 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -9061 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0715 0.102 0.155 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 11649 sc-eQTL 5.50e-01 0.066 0.11 0.155 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 1.04e-02 0.3 0.116 0.155 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0026 0.0661 0.155 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 7.94e-01 0.0274 0.105 0.155 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -377424 sc-eQTL 2.65e-01 -0.106 0.0949 0.155 DC L1
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0231 0.0595 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -9061 sc-eQTL 1.60e-01 -0.144 0.102 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 11649 sc-eQTL 7.58e-01 0.034 0.11 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 1.35e-09 0.451 0.0711 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 4.14e-01 -0.038 0.0464 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 1.25e-02 0.228 0.0906 0.16 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0383 0.0897 0.159 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 5.91e-02 0.21 0.111 0.159 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 9.77e-01 0.00134 0.0462 0.159 NK L1
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0418 0.0922 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 1.20e-01 0.173 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 4.58e-01 0.0329 0.0442 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 8.37e-01 -0.025 0.121 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 324229 sc-eQTL 1.65e-01 -0.167 0.119 0.166 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 2.28e-01 -0.136 0.112 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 1.24e-02 0.297 0.118 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 4.92e-01 0.0442 0.0641 0.166 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 1.81e-01 0.15 0.112 0.166 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 593816 sc-eQTL 1.45e-02 -0.26 0.105 0.166 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 324229 sc-eQTL 9.39e-01 0.00826 0.109 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 4.73e-01 -0.051 0.071 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 2.29e-01 0.129 0.107 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 3.51e-02 -0.138 0.0648 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 5.87e-01 0.0642 0.118 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 593816 sc-eQTL 6.69e-01 0.043 0.1 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 324229 sc-eQTL 9.28e-01 0.0101 0.111 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 5.11e-01 0.0574 0.0873 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 6.76e-02 0.208 0.113 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 1.01e-01 -0.0903 0.0547 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 1.98e-01 -0.148 0.115 0.162 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 593816 sc-eQTL 6.25e-01 0.0523 0.107 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 324229 sc-eQTL 2.15e-01 -0.153 0.123 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0271 0.0539 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0315 0.105 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 2.08e-01 -0.075 0.0594 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0853 0.115 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 593816 sc-eQTL 8.44e-01 -0.015 0.0762 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 324229 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0758 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0818 0.0627 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 4.88e-01 0.0803 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 9.45e-01 0.00421 0.0612 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 8.13e-02 0.203 0.116 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 593816 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0912 0.0807 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 4.14e-02 0.257 0.125 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 8.14e-02 0.221 0.126 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 1.09e-01 0.0942 0.0585 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 2.51e-01 0.136 0.118 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 2.11e-01 0.117 0.0936 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 2.57e-01 0.0986 0.0867 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 6.91e-01 0.0225 0.0564 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 6.46e-01 0.05 0.109 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 2.81e-01 -0.112 0.103 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 8.47e-01 0.0197 0.102 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0188 0.053 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 1.51e-01 0.176 0.122 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00342 0.121 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 7.18e-02 -0.208 0.115 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0241 0.0474 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 9.99e-01 0.000216 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 6.37e-01 0.0475 0.1 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 2.14e-02 0.261 0.113 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 1.46e-01 0.0887 0.0608 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 4.30e-01 0.0935 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 3.73e-01 -0.107 0.12 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0576 0.104 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00132 0.0595 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 5.78e-01 0.0664 0.119 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0288 0.123 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 6.49e-01 0.0557 0.122 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 8.02e-01 -0.015 0.0596 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00819 0.131 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 1.55e-01 -0.184 0.129 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 9.54e-02 0.214 0.128 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 1.02e-01 0.113 0.0687 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 4.12e-01 -0.107 0.131 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 9.78e-02 -0.201 0.121 0.149 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 1.54e-01 0.176 0.123 0.149 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 1.57e-01 0.0862 0.0607 0.149 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 2.31e-01 0.153 0.127 0.149 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 5.29e-01 0.0743 0.118 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 9.98e-02 0.196 0.119 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 6.39e-01 0.0313 0.0666 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0598 0.0955 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 3.95e-02 0.245 0.118 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 3.56e-01 0.0438 0.0474 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 8.99e-02 -0.197 0.116 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 2.19e-01 0.145 0.118 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 7.74e-01 0.0158 0.055 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0561 0.104 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 2.99e-01 0.121 0.116 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0192 0.0633 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 324229 sc-eQTL 2.25e-01 -0.15 0.123 0.17 PB L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 6.22e-01 -0.051 0.103 0.17 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 8.68e-01 0.0211 0.126 0.17 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 3.68e-01 0.0646 0.0714 0.17 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0913 0.134 0.17 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 593816 sc-eQTL 9.07e-01 0.0103 0.0883 0.17 PB L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 7.53e-02 0.19 0.106 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 3.89e-01 0.0988 0.114 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 2.45e-02 0.0971 0.0428 0.163 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0783 0.112 0.163 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0428 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 6.18e-01 0.0501 0.1 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 3.35e-01 0.0429 0.0443 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 3.70e-01 0.113 0.125 0.16 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 3.04e-01 0.108 0.104 0.151 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -9061 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0233 0.104 0.151 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 11649 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0317 0.122 0.151 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 3.06e-02 0.256 0.117 0.151 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0049 0.0587 0.151 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0257 0.116 0.151 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -377424 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0613 0.0929 0.151 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 4.34e-01 0.0591 0.0753 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -9061 sc-eQTL 1.27e-01 -0.162 0.106 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 11649 sc-eQTL 8.55e-01 0.0197 0.108 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 8.79e-09 0.477 0.0795 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0149 0.0478 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 3.11e-02 0.198 0.0912 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0828 0.0827 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -9061 sc-eQTL 8.34e-01 0.0218 0.104 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 11649 sc-eQTL 5.47e-01 0.0678 0.112 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 4.24e-11 0.462 0.0664 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0159 0.053 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 2.04e-01 0.125 0.0978 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0671 0.134 0.158 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 5.68e-01 0.0846 0.148 0.158 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 4.40e-01 0.0435 0.0562 0.158 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 4.77e-01 0.104 0.145 0.158 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 2.69e-01 -0.121 0.109 0.16 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -9061 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00909 0.111 0.16 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 11649 sc-eQTL 2.15e-01 0.136 0.109 0.16 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 2.43e-01 0.13 0.111 0.16 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 5.63e-01 -0.028 0.0484 0.16 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 4.23e-01 0.0945 0.118 0.16 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0683 0.0818 0.158 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -9061 sc-eQTL 1.12e-01 0.184 0.115 0.158 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 11649 sc-eQTL 2.13e-02 0.263 0.113 0.158 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 4.59e-01 0.0818 0.11 0.158 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0377 0.0553 0.158 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 5.00e-01 0.066 0.0977 0.158 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0499 0.0939 0.155 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -9061 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0071 0.0946 0.155 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 11649 sc-eQTL 1.70e-03 0.298 0.0932 0.155 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 4.53e-02 0.228 0.113 0.155 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 4.08e-01 0.0654 0.0788 0.155 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 5.32e-01 0.0731 0.117 0.155 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -377424 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0923 0.112 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 324229 sc-eQTL 8.06e-01 0.0286 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0538 0.0657 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 1.09e-02 0.264 0.103 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 1.41e-02 -0.145 0.0585 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 9.57e-01 0.00593 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 593816 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0202 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 324229 sc-eQTL 1.96e-01 -0.16 0.123 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0421 0.0507 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 3.84e-01 0.086 0.0985 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 3.48e-01 -0.056 0.0596 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 5.76e-01 0.063 0.113 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 593816 sc-eQTL 6.15e-01 -0.036 0.0715 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 8.29e-01 0.0139 0.0642 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -9061 sc-eQTL 1.64e-01 -0.145 0.104 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 11649 sc-eQTL 8.98e-01 -0.014 0.109 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 1.86e-10 0.439 0.0655 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 6.00e-01 -0.026 0.0494 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 3.26e-02 0.187 0.087 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 8.33e-02 -0.136 0.0779 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -9061 sc-eQTL 6.73e-01 0.0488 0.115 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 11649 sc-eQTL 1.86e-02 0.268 0.113 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 2.58e-01 0.122 0.108 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0329 0.0457 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 sc-eQTL 1.29e-01 0.169 0.111 0.157 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 212506 sc-eQTL 3.75e-01 -0.08 0.0899 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -37755 sc-eQTL 4.69e-02 0.226 0.113 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -88865 sc-eQTL 7.04e-01 0.0177 0.0465 0.159 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 212506 eQTL 0.0192 -0.0568 0.0242 0.0 0.0 0.124
ENSG00000093134 VNN3 -9061 eQTL 9.29e-09 0.127 0.0219 0.0 0.0 0.124
ENSG00000112299 VNN1 11649 pQTL 0.000724 0.183 0.0541 0.0 0.0 0.123
ENSG00000112299 VNN1 11649 eQTL 0.0322 -0.0711 0.0331 0.0 0.0 0.124
ENSG00000112303 VNN2 -37755 pQTL 2e-19 0.347 0.0379 0.0108 0.00746 0.123
ENSG00000112303 VNN2 -37755 eQTL 3.73e-08 0.108 0.0195 0.0 0.0 0.124
ENSG00000146409 SLC18B1 -87635 eQTL 0.00763 0.0909 0.034 0.0 0.0 0.124
ENSG00000234484 AL032821.1 -26971 eQTL 2.86e-19 -0.418 0.0456 0.0 0.00609 0.124


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 -9061 0.000112 2.48e-05 5.92e-06 1.13e-05 3.33e-06 1.98e-05 3.55e-05 2.19e-06 2.19e-05 9.31e-06 2.28e-05 8.18e-06 3.69e-05 8.09e-06 5.24e-06 1.4e-05 1.01e-05 2.46e-05 6e-06 3.83e-06 1.09e-05 2.81e-05 2.57e-05 6.27e-06 2.94e-05 6.05e-06 8.26e-06 7.58e-06 2.69e-05 1.91e-05 1.29e-05 1.25e-06 1.57e-06 5.21e-06 6.37e-06 3.71e-06 1.68e-06 2.37e-06 2.84e-06 2.03e-06 1.05e-06 3.12e-05 4.52e-06 1.64e-07 2.07e-06 2.08e-06 3.42e-06 8.32e-07 5.35e-07
ENSG00000112303 VNN2 -37755 5.89e-05 1.06e-05 1.39e-06 4.71e-06 2.22e-06 7.78e-06 1.18e-05 1.22e-06 9.39e-06 4.89e-06 1.04e-05 4.64e-06 1.32e-05 4.05e-06 2.49e-06 6.54e-06 3.89e-06 1e-05 2.69e-06 1.92e-06 5.1e-06 1.1e-05 7.64e-06 2.84e-06 1.49e-05 3.55e-06 4.7e-06 3.05e-06 1.08e-05 7.87e-06 5.06e-06 9.81e-07 6.46e-07 2.91e-06 2.59e-06 1.09e-06 1.02e-06 5.41e-07 1.3e-06 8.05e-07 6.37e-07 1.25e-05 2.48e-06 1.6e-07 8.14e-07 1.1e-06 1.31e-06 7.36e-07 4.68e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -26971 7.37e-05 1.25e-05 2.57e-06 6.5e-06 2.3e-06 1.17e-05 1.69e-05 1.55e-06 1.14e-05 5.42e-06 1.24e-05 5.59e-06 1.81e-05 3.53e-06 3.5e-06 8.18e-06 5.49e-06 1.35e-05 3.07e-06 2.81e-06 6.66e-06 1.4e-05 1.11e-05 3.38e-06 2e-05 4.31e-06 6.35e-06 4.18e-06 1.42e-05 9.37e-06 7.11e-06 9.7e-07 1.24e-06 3.53e-06 3.88e-06 2.12e-06 1.19e-06 1.81e-06 2.11e-06 1e-06 8.13e-07 1.51e-05 2.68e-06 1.68e-07 9.29e-07 1.28e-06 1.8e-06 6.58e-07 6e-07