Genes within 1Mb (chr6:132663273:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 261798 sc-eQTL 6.73e-02 -0.281 0.153 0.094 B L1
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 9.59e-01 0.00298 0.0581 0.094 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 3.51e-02 0.229 0.108 0.094 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 1.17e-01 -0.103 0.0657 0.094 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 5.21e-01 0.0892 0.139 0.094 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 531385 sc-eQTL 8.68e-01 0.0152 0.0913 0.094 B L1
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 1.73e-01 0.153 0.112 0.094 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 9.61e-01 0.00474 0.097 0.094 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0887 0.0657 0.094 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 5.36e-01 0.0827 0.133 0.094 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 6.88e-01 0.0444 0.11 0.094 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 3.35e-02 0.273 0.127 0.094 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0394 0.0439 0.094 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 3.35e-01 0.128 0.133 0.094 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 2.01e-01 0.129 0.101 0.092 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -71492 sc-eQTL 5.54e-01 0.0745 0.126 0.092 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -50782 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0923 0.135 0.092 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 6.99e-01 0.0561 0.145 0.092 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 8.84e-01 0.0119 0.0814 0.092 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 2.87e-01 0.137 0.128 0.092 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -439855 sc-eQTL 5.23e-01 -0.075 0.117 0.092 DC L1
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0775 0.0769 0.094 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -71492 sc-eQTL 5.71e-02 -0.251 0.131 0.094 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -50782 sc-eQTL 4.30e-05 0.571 0.137 0.094 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 2.38e-02 0.226 0.0992 0.094 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0555 0.0601 0.094 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 5.32e-01 0.0744 0.119 0.094 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00961 0.115 0.092 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 1.41e-02 -0.348 0.141 0.092 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0554 0.059 0.092 NK L1
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 8.05e-01 0.0289 0.117 0.094 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 7.63e-01 0.0427 0.142 0.094 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 3.92e-01 0.048 0.056 0.094 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 1.69e-01 0.211 0.153 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 261798 sc-eQTL 2.92e-02 0.334 0.152 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 5.96e-01 0.0767 0.144 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 2.19e-01 0.189 0.153 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 8.78e-01 0.0127 0.0823 0.097 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0709 0.144 0.097 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 531385 sc-eQTL 4.05e-01 0.115 0.137 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 261798 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0602 0.142 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 5.61e-01 0.0541 0.0928 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 8.56e-01 0.0254 0.14 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0982 0.0854 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 5.39e-01 0.0948 0.154 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 531385 sc-eQTL 8.68e-01 0.0218 0.131 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 261798 sc-eQTL 8.56e-01 0.0255 0.141 0.095 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0138 0.11 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0371 0.144 0.095 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 5.19e-01 -0.045 0.0695 0.095 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 5.29e-01 0.0915 0.145 0.095 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 531385 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00431 0.135 0.095 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 261798 sc-eQTL 6.35e-03 -0.427 0.155 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00209 0.0689 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 2.25e-01 0.162 0.133 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 1.02e-02 -0.195 0.075 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 2.42e-01 0.172 0.147 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 531385 sc-eQTL 6.89e-01 0.039 0.0973 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 261798 sc-eQTL 8.89e-01 -0.021 0.15 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0634 0.0815 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 1.52e-01 0.214 0.149 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 1.47e-01 -0.115 0.079 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0437 0.151 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 531385 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00802 0.105 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 9.32e-01 0.0128 0.151 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 1.26e-01 -0.232 0.151 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0928 0.07 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 2.11e-01 0.177 0.141 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 1.47e-01 0.173 0.119 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 7.86e-01 0.0301 0.11 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0708 0.0715 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 5.45e-01 0.0835 0.138 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 3.76e-01 0.118 0.133 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 2.60e-01 -0.148 0.131 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00985 0.0679 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 4.53e-01 0.118 0.157 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 4.07e-02 0.312 0.152 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 7.45e-01 0.048 0.147 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0409 0.0602 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 5.02e-01 -0.101 0.15 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0257 0.128 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 3.11e-01 0.147 0.145 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0111 0.0776 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 1.87e-01 0.198 0.15 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0194 0.151 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 3.03e-02 0.28 0.129 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0403 0.0744 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 8.09e-01 0.0362 0.149 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 2.20e-01 -0.183 0.149 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 2.28e-01 -0.179 0.148 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 7.88e-01 0.0195 0.0724 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0965 0.158 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 9.64e-01 0.00728 0.163 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 4.84e-01 0.113 0.162 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0566 0.0871 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 6.82e-01 0.0677 0.165 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 9.54e-01 0.0085 0.146 0.093 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0703 0.149 0.093 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 2.92e-01 0.077 0.0729 0.093 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 4.37e-01 0.119 0.153 0.093 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 4.81e-01 0.109 0.154 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 2.31e-01 0.187 0.156 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0546 0.0869 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0201 0.123 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 6.32e-02 -0.284 0.152 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0269 0.0608 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0408 0.147 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 2.79e-02 -0.326 0.147 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0881 0.0691 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0708 0.135 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 8.84e-03 -0.396 0.15 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 1.75e-01 -0.112 0.0823 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 261798 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0425 0.168 0.093 PB L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0758 0.14 0.093 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0592 0.172 0.093 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 7.29e-01 0.0338 0.0975 0.093 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 1.98e-01 -0.235 0.181 0.093 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 531385 sc-eQTL 3.77e-01 0.106 0.12 0.093 PB L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 5.23e-01 0.0894 0.14 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0735 0.15 0.096 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 4.13e-01 0.0465 0.0567 0.096 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 8.58e-01 0.0264 0.147 0.096 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 2.97e-01 0.153 0.147 0.094 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 4.85e-01 0.0865 0.124 0.094 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 9.38e-01 0.00428 0.0547 0.094 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 5.16e-01 0.101 0.154 0.094 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 5.80e-01 0.0723 0.13 0.09 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -71492 sc-eQTL 4.81e-01 0.0914 0.129 0.09 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -50782 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0843 0.152 0.09 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 1.25e-01 0.227 0.147 0.09 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 8.12e-01 0.0175 0.0733 0.09 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00481 0.145 0.09 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -439855 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0771 0.116 0.09 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 6.46e-02 -0.183 0.0986 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -71492 sc-eQTL 1.88e-01 -0.185 0.14 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -50782 sc-eQTL 9.53e-05 0.544 0.137 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 5.81e-02 0.214 0.112 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0459 0.0629 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 2.49e-01 0.14 0.121 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 3.56e-01 0.0996 0.108 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -71492 sc-eQTL 8.11e-02 -0.235 0.134 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -50782 sc-eQTL 8.82e-04 0.481 0.143 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 1.27e-03 0.306 0.0935 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0583 0.0689 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0748 0.128 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 7.43e-01 0.053 0.162 0.1 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 1.13e-01 0.282 0.177 0.1 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 8.25e-01 0.0151 0.0681 0.1 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 6.10e-02 0.328 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 5.22e-01 0.093 0.145 0.091 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -71492 sc-eQTL 3.53e-01 0.136 0.146 0.091 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -50782 sc-eQTL 9.66e-02 0.24 0.144 0.091 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 2.18e-02 0.336 0.145 0.091 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 4.72e-01 0.0461 0.064 0.091 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 9.07e-01 0.0183 0.156 0.091 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 8.56e-01 0.0196 0.108 0.088 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -71492 sc-eQTL 3.34e-01 0.148 0.152 0.088 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -50782 sc-eQTL 3.66e-04 0.533 0.147 0.088 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0447 0.146 0.088 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0826 0.0729 0.088 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 4.28e-01 -0.102 0.129 0.088 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 7.76e-01 0.0338 0.118 0.099 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -71492 sc-eQTL 2.57e-01 -0.135 0.119 0.099 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -50782 sc-eQTL 1.58e-01 -0.171 0.12 0.099 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 2.55e-02 -0.32 0.142 0.099 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 3.76e-01 -0.088 0.0991 0.099 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 6.32e-01 0.0704 0.147 0.099 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -439855 sc-eQTL 1.88e-01 -0.185 0.14 0.099 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 261798 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0273 0.151 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 4.85e-01 0.0597 0.0855 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 7.62e-01 0.041 0.135 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 1.09e-01 -0.123 0.0766 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 4.27e-01 0.112 0.141 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 531385 sc-eQTL 2.66e-01 0.152 0.136 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 261798 sc-eQTL 5.29e-02 -0.304 0.156 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0503 0.0646 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 4.17e-02 0.255 0.124 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 2.33e-02 -0.171 0.075 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 5.47e-01 0.0863 0.143 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 531385 sc-eQTL 8.91e-01 0.0125 0.091 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 2.61e-01 -0.093 0.0826 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -71492 sc-eQTL 6.27e-02 -0.25 0.134 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -50782 sc-eQTL 3.49e-05 0.571 0.135 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 1.95e-02 0.216 0.0919 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0573 0.0637 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 6.27e-01 0.0552 0.113 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 6.65e-01 0.0437 0.101 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -71492 sc-eQTL 7.30e-01 0.0512 0.148 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -50782 sc-eQTL 1.88e-03 0.452 0.144 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 3.85e-01 0.12 0.138 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 9.61e-01 0.0029 0.0588 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -150066 sc-eQTL 2.60e-01 0.161 0.142 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 150075 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0326 0.115 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -100186 sc-eQTL 1.13e-02 -0.368 0.144 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -151296 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0485 0.0595 0.093 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 150075 pQTL 0.0379 -0.0757 0.0364 0.0 0.0 0.101
ENSG00000079950 STX7 150075 eQTL 1.65e-05 -0.105 0.0242 0.00129 0.0 0.107
ENSG00000093134 VNN3 -71492 eQTL 0.0111 0.0569 0.0224 0.0 0.0 0.107
ENSG00000112299 VNN1 -50782 pQTL 8.13e-20 0.506 0.0547 0.0 0.0 0.101
ENSG00000112299 VNN1 -50782 eQTL 3.61e-06 0.154 0.033 0.0 0.0 0.107
ENSG00000112303 VNN2 -100186 pQTL 0.0484 0.0801 0.0406 0.0 0.0 0.101
ENSG00000118523 CCN2 711901 pQTL 0.00773 -0.0899 0.0337 0.00141 0.0 0.101
ENSG00000234484 AL032821.1 -89402 eQTL 3.05e-05 -0.199 0.0474 0.0 0.0 0.107


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 150075 4.04e-06 4.24e-06 7.63e-07 1.82e-06 1.2e-06 1.07e-06 2.93e-06 9.91e-07 3.49e-06 1.94e-06 4.22e-06 3.04e-06 6.49e-06 1.39e-06 1.3e-06 2.49e-06 1.81e-06 2.87e-06 1.39e-06 9.52e-07 2.12e-06 4.07e-06 3.5e-06 1.63e-06 4.62e-06 1.36e-06 2.15e-06 1.44e-06 4.17e-06 3.53e-06 1.95e-06 5.76e-07 8.13e-07 1.73e-06 2.01e-06 9.97e-07 9.31e-07 4.75e-07 1.23e-06 3.81e-07 4.41e-07 4.85e-06 4.65e-07 1.8e-07 3.43e-07 3.23e-07 7.28e-07 3.19e-07 3.53e-07
ENSG00000112299 VNN1 -50782 9.82e-06 1.09e-05 1.89e-06 6.2e-06 2.34e-06 4.92e-06 1.18e-05 2.14e-06 9.81e-06 5.32e-06 1.35e-05 5.88e-06 1.74e-05 3.54e-06 3.26e-06 6.69e-06 5.17e-06 8.43e-06 3.07e-06 2.89e-06 6.18e-06 1.04e-05 9.7e-06 3.54e-06 1.67e-05 4.45e-06 5.79e-06 4.61e-06 1.2e-05 1.03e-05 6.33e-06 9.91e-07 1.19e-06 3.58e-06 4.81e-06 2.84e-06 1.79e-06 2.02e-06 2.06e-06 1.08e-06 1.1e-06 1.3e-05 1.4e-06 2.5e-07 9.39e-07 1.78e-06 1.74e-06 6.27e-07 4.51e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -89402 5.83e-06 7.21e-06 9.56e-07 3.67e-06 1.84e-06 2.2e-06 8.7e-06 1.34e-06 4.96e-06 3.49e-06 8.62e-06 3.63e-06 1.07e-05 2.68e-06 1.29e-06 4.67e-06 3.34e-06 3.81e-06 1.94e-06 2.07e-06 3.13e-06 7.3e-06 5.5e-06 2.22e-06 9.63e-06 2.37e-06 3.53e-06 2.09e-06 6.73e-06 7.35e-06 3.43e-06 5.84e-07 6.76e-07 2.69e-06 2.38e-06 2.03e-06 1.31e-06 9.68e-07 1.35e-06 7.31e-07 8.79e-07 8.25e-06 7.85e-07 1.64e-07 6.81e-07 8.05e-07 9.55e-07 6.45e-07 6e-07