Genes within 1Mb (chr6:132661269:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 259794 sc-eQTL 4.71e-01 0.101 0.139 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00586 0.0526 0.1 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 1.63e-01 0.138 0.0985 0.1 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 5.60e-01 0.0349 0.0598 0.1 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 3.10e-03 0.369 0.123 0.1 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 529381 sc-eQTL 5.10e-01 0.0545 0.0826 0.1 B L1
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 2.65e-01 -0.115 0.103 0.1 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 8.05e-01 -0.022 0.0891 0.1 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 8.78e-01 0.00927 0.0606 0.1 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 2.18e-01 0.151 0.122 0.1 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 1.02e-01 -0.165 0.101 0.1 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 6.56e-01 0.0528 0.118 0.1 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0202 0.0404 0.1 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 3.91e-02 0.251 0.121 0.1 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0804 0.0946 0.097 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -73496 sc-eQTL 7.73e-01 0.0339 0.118 0.097 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -52786 sc-eQTL 2.29e-02 0.287 0.125 0.097 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 3.20e-02 0.29 0.134 0.097 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 7.09e-01 0.0284 0.0761 0.097 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 2.87e-01 0.128 0.12 0.097 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -441859 sc-eQTL 4.12e-01 0.09 0.109 0.097 DC L1
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0986 0.0692 0.1 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -73496 sc-eQTL 2.26e-01 0.145 0.119 0.1 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -52786 sc-eQTL 4.88e-09 0.723 0.118 0.1 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 7.23e-02 0.162 0.09 0.1 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 8.45e-01 0.0106 0.0543 0.1 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 4.55e-01 0.0803 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 6.49e-01 0.0474 0.104 0.099 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 7.31e-06 0.568 0.123 0.099 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 1.98e-01 0.069 0.0534 0.099 NK L1
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0313 0.105 0.1 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 1.59e-02 0.304 0.125 0.1 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 6.47e-01 0.0231 0.0503 0.1 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 6.55e-02 0.253 0.137 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 259794 sc-eQTL 7.94e-01 0.0367 0.141 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 4.63e-02 -0.262 0.13 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 6.45e-02 0.259 0.139 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 7.43e-01 0.0247 0.0752 0.099 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 4.13e-01 0.108 0.132 0.099 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 529381 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0124 0.126 0.099 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 259794 sc-eQTL 8.59e-01 0.0231 0.13 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 9.35e-01 0.00701 0.0853 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 2.24e-01 0.156 0.128 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 6.33e-01 0.0376 0.0787 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 2.36e-02 0.319 0.14 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 529381 sc-eQTL 2.01e-01 0.154 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 259794 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0202 0.131 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 2.84e-01 -0.11 0.102 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0589 0.134 0.101 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 5.92e-01 0.0347 0.0647 0.101 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 6.85e-01 0.0548 0.135 0.101 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 529381 sc-eQTL 9.35e-01 0.0103 0.126 0.101 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 259794 sc-eQTL 1.73e-02 0.347 0.145 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00555 0.064 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 6.30e-01 0.0599 0.124 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 2.38e-01 0.0835 0.0706 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 2.25e-02 0.31 0.135 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 529381 sc-eQTL 2.46e-01 -0.105 0.0902 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 259794 sc-eQTL 8.91e-01 0.0191 0.139 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 6.65e-01 0.0327 0.0755 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 6.01e-01 0.0725 0.139 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 4.08e-01 0.0607 0.0733 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 2.21e-02 0.319 0.138 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 529381 sc-eQTL 7.14e-02 0.175 0.0963 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 9.70e-02 -0.236 0.142 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 4.72e-01 0.104 0.144 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 4.81e-01 0.0469 0.0664 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 6.72e-02 0.245 0.133 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 5.87e-01 0.0603 0.111 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 5.36e-01 0.0637 0.103 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00237 0.0667 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 4.90e-01 0.0887 0.128 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 5.12e-02 -0.235 0.12 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0514 0.119 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 9.71e-01 0.00223 0.0617 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 2.74e-01 0.156 0.143 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 2.06e-01 -0.179 0.141 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 4.54e-01 -0.101 0.135 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0149 0.0556 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 8.66e-03 0.36 0.136 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 4.54e-02 -0.232 0.115 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 7.27e-02 0.237 0.131 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 3.21e-01 0.0704 0.0707 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 1.04e-01 0.223 0.136 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0283 0.142 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 2.84e-01 -0.132 0.122 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00772 0.0703 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 1.32e-01 0.212 0.14 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0632 0.141 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 5.29e-01 -0.088 0.139 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0314 0.068 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 5.82e-02 0.282 0.148 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 9.40e-01 0.0115 0.152 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 5.78e-01 0.0842 0.151 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 1.89e-01 0.107 0.0809 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 2.30e-01 -0.184 0.153 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 5.42e-02 -0.259 0.134 0.1 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 5.18e-01 0.0887 0.137 0.1 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 4.39e-01 0.0522 0.0673 0.1 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 2.60e-01 0.159 0.141 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 4.34e-01 0.111 0.141 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 4.16e-01 0.117 0.143 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 3.43e-01 0.0757 0.0797 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0628 0.111 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 4.72e-05 0.552 0.133 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 9.82e-02 0.0906 0.0545 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 6.54e-02 0.251 0.135 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 9.56e-04 0.451 0.134 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 1.80e-01 0.0861 0.064 0.098 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 8.54e-01 0.0225 0.122 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 1.69e-04 0.508 0.133 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 2.79e-01 0.0806 0.0743 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 259794 sc-eQTL 9.20e-01 0.0152 0.152 0.104 PB L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0575 0.127 0.104 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 5.28e-01 0.0978 0.155 0.104 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 9.24e-01 0.00841 0.0879 0.104 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 3.43e-01 -0.156 0.164 0.104 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 529381 sc-eQTL 6.21e-01 0.0537 0.108 0.104 PB L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 9.47e-01 0.00839 0.126 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 2.35e-01 0.161 0.135 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 8.34e-01 0.0107 0.0512 0.1 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0997 0.132 0.1 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 4.36e-01 -0.107 0.137 0.1 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 7.22e-01 -0.041 0.115 0.1 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 3.34e-01 0.0492 0.0508 0.1 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 5.83e-01 0.079 0.144 0.1 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 2.61e-01 -0.132 0.117 0.098 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -73496 sc-eQTL 2.94e-01 0.122 0.116 0.098 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -52786 sc-eQTL 1.76e-01 0.185 0.137 0.098 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 1.46e-01 0.194 0.133 0.098 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 6.37e-01 0.0312 0.066 0.098 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 7.34e-02 0.233 0.13 0.098 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -441859 sc-eQTL 5.67e-01 0.0599 0.104 0.098 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0577 0.0889 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -73496 sc-eQTL 3.96e-01 0.107 0.126 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -52786 sc-eQTL 6.85e-09 0.708 0.117 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 5.29e-02 0.196 0.101 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 7.53e-01 0.0177 0.0563 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 2.14e-01 0.135 0.108 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 2.72e-01 -0.105 0.0957 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -73496 sc-eQTL 8.73e-02 0.204 0.119 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -52786 sc-eQTL 7.87e-06 0.569 0.124 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 1.54e-01 0.121 0.0848 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 3.53e-01 0.057 0.0613 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0681 0.114 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 8.59e-01 0.0273 0.153 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 5.87e-02 0.319 0.167 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 9.51e-01 0.00396 0.0645 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 3.49e-01 0.156 0.166 0.109 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0249 0.129 0.102 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -73496 sc-eQTL 2.71e-01 -0.143 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -52786 sc-eQTL 3.75e-04 0.45 0.124 0.102 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 1.35e-01 0.195 0.13 0.102 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00299 0.0568 0.102 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 2.53e-01 0.158 0.138 0.102 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 8.33e-03 -0.256 0.096 0.102 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -73496 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0303 0.138 0.102 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -52786 sc-eQTL 3.94e-07 0.673 0.128 0.102 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 3.54e-01 0.122 0.131 0.102 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00754 0.066 0.102 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 3.75e-01 -0.103 0.116 0.102 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 8.44e-02 -0.201 0.116 0.09 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -73496 sc-eQTL 5.14e-01 0.0768 0.117 0.09 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -52786 sc-eQTL 1.85e-01 0.158 0.119 0.09 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 1.69e-02 0.338 0.14 0.09 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 3.35e-02 -0.207 0.0967 0.09 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0694 0.145 0.09 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -441859 sc-eQTL 4.58e-01 0.103 0.139 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 259794 sc-eQTL 8.29e-01 0.03 0.139 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 1.95e-01 -0.102 0.0782 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 2.39e-01 0.146 0.124 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 5.16e-01 0.046 0.0707 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 7.08e-02 0.234 0.129 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 529381 sc-eQTL 5.64e-01 0.0724 0.125 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 259794 sc-eQTL 1.07e-01 0.235 0.145 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 7.19e-01 0.0215 0.0599 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 3.02e-01 0.12 0.116 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 4.02e-01 0.059 0.0702 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 2.81e-03 0.393 0.13 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 529381 sc-eQTL 8.67e-01 0.0142 0.0843 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0736 0.0743 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -73496 sc-eQTL 1.73e-01 0.165 0.121 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -52786 sc-eQTL 1.44e-08 0.692 0.117 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 1.08e-01 0.134 0.0832 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 4.37e-01 0.0446 0.0573 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 4.80e-01 0.0722 0.102 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 9.46e-02 -0.154 0.0917 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -73496 sc-eQTL 4.48e-01 -0.103 0.136 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -52786 sc-eQTL 1.62e-06 0.629 0.127 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 2.02e-01 0.162 0.126 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0346 0.0538 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -152070 sc-eQTL 3.07e-01 0.134 0.13 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 148071 sc-eQTL 6.44e-01 0.0483 0.104 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -102190 sc-eQTL 1.19e-06 0.626 0.125 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -153300 sc-eQTL 1.75e-01 0.0731 0.0537 0.099 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 -52786 pQTL 1.21e-18 0.509 0.0568 0.0 0.0 0.0914
ENSG00000112299 VNN1 -52786 eQTL 7.65e-14 0.268 0.0353 0.0 0.0 0.0883
ENSG00000112306 RPS12 -153300 eQTL 0.0434 0.0204 0.0101 0.0 0.0 0.0883
ENSG00000234484 AL032821.1 -91406 eQTL 0.0211 -0.12 0.052 0.0 0.0 0.0883


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 \N -73496 6.16e-06 5.22e-06 6.82e-07 3.2e-06 1.49e-06 1.91e-06 7.52e-06 1.15e-06 5.03e-06 2.82e-06 6.6e-06 3.25e-06 8.41e-06 1.71e-06 1.02e-06 4.04e-06 2e-06 3.84e-06 1.44e-06 1.4e-06 2.75e-06 5.45e-06 4.72e-06 1.89e-06 8.48e-06 2.07e-06 2.22e-06 1.55e-06 5.21e-06 6.39e-06 2.58e-06 4.15e-07 7.9e-07 2.34e-06 2.03e-06 1.22e-06 1.07e-06 5.45e-07 9.08e-07 7.28e-07 8.4e-07 7.12e-06 6.31e-07 1.64e-07 8.27e-07 1.19e-06 1.16e-06 7.35e-07 4.68e-07
ENSG00000112299 VNN1 -52786 8.18e-06 7.92e-06 1.35e-06 3.98e-06 2.18e-06 3.93e-06 9.61e-06 1.5e-06 5.94e-06 4.12e-06 8.95e-06 3.89e-06 1.14e-05 3.23e-06 1.73e-06 5.49e-06 3.64e-06 5.37e-06 2.3e-06 2.56e-06 4.18e-06 7.46e-06 6.67e-06 2.8e-06 1.11e-05 2.92e-06 3.73e-06 2.38e-06 7.21e-06 7.87e-06 4.13e-06 8.07e-07 1.14e-06 2.93e-06 2.59e-06 2.12e-06 1.55e-06 1.85e-06 1.63e-06 1.03e-06 1.04e-06 8.83e-06 1.14e-06 1.52e-07 6.8e-07 1.13e-06 1.06e-06 7.23e-07 5.79e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 -91406 4.89e-06 4.79e-06 8.95e-07 2.52e-06 1.64e-06 1.62e-06 4.58e-06 9.98e-07 4.96e-06 2.44e-06 4.85e-06 3.56e-06 7.1e-06 2.3e-06 1.35e-06 3.3e-06 2.07e-06 3.49e-06 1.45e-06 1.09e-06 2.89e-06 4.79e-06 4.24e-06 1.41e-06 6.41e-06 1.95e-06 2.68e-06 1.72e-06 4.53e-06 4.45e-06 2.7e-06 5.08e-07 4.67e-07 1.66e-06 2.07e-06 9.71e-07 9.63e-07 4.58e-07 9.23e-07 4.89e-07 6.91e-07 5.64e-06 4.01e-07 1.83e-07 5.92e-07 6.92e-07 1.03e-06 4.11e-07 3.41e-07