logo

Genes within 1Mb (chr6:132614337:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 212862 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0774 0.141 0.103 B L1
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 5.27e-02 -0.103 0.0529 0.103 B L1
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 3.49e-01 0.0996 0.106 0.103 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 3.83e-01 0.0876 0.1 0.103 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0601 0.0606 0.103 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 6.88e-02 -0.232 0.127 0.103 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 482449 sc-eQTL 6.82e-01 0.0344 0.0838 0.103 B L1
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 1.86e-01 0.139 0.105 0.103 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0826 0.0832 0.103 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0487 0.0909 0.103 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0599 0.0617 0.103 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 1.15e-01 -0.197 0.124 0.103 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0098 0.104 0.103 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 2.77e-01 -0.112 0.102 0.103 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 7.25e-02 0.218 0.121 0.103 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0312 0.0416 0.103 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 1.11e-01 -0.2 0.125 0.103 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 2.84e-01 0.11 0.103 0.095 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -120428 sc-eQTL 8.15e-02 -0.222 0.127 0.095 DC L1
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 2.60e-01 -0.168 0.149 0.095 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -99718 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0939 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 2.35e-01 0.175 0.147 0.095 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 1.06e-01 -0.133 0.082 0.095 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 1.97e-01 -0.168 0.13 0.095 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -488791 sc-eQTL 8.49e-02 -0.204 0.118 0.095 DC L1
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 1.11e-01 -0.115 0.0716 0.103 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -120428 sc-eQTL 6.63e-01 0.054 0.124 0.103 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0966 0.117 0.103 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -99718 sc-eQTL 4.24e-01 0.106 0.133 0.103 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 4.38e-01 0.0729 0.0937 0.103 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00202 0.0562 0.103 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 2.73e-01 0.122 0.111 0.103 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 9.92e-01 0.00115 0.108 0.101 NK L1
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 9.26e-02 -0.166 0.0981 0.101 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 4.56e-01 -0.1 0.134 0.101 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 5.42e-01 -0.034 0.0556 0.101 NK L1
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00178 0.107 0.103 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 1.88e-01 -0.175 0.133 0.103 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 5.16e-01 -0.084 0.129 0.103 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 6.37e-01 0.0242 0.0512 0.103 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0374 0.14 0.103 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 212862 sc-eQTL 9.93e-01 0.00131 0.142 0.11 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0133 0.133 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 8.21e-01 0.0333 0.147 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 8.63e-01 0.0243 0.141 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 9.83e-01 0.00159 0.0757 0.11 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 1.24e-01 -0.204 0.132 0.11 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 482449 sc-eQTL 1.00e+00 -2.42e-05 0.126 0.11 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 212862 sc-eQTL 7.10e-01 0.0487 0.131 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 1.10e-01 -0.137 0.0853 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 2.76e-01 0.142 0.13 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00787 0.129 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 1.33e-01 -0.119 0.0787 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 6.46e-01 0.0656 0.142 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 482449 sc-eQTL 2.88e-01 0.129 0.121 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 212862 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0545 0.132 0.103 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 1.69e-02 -0.246 0.102 0.103 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 4.36e-01 -0.104 0.133 0.103 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 1.60e-01 0.191 0.135 0.103 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0813 0.0651 0.103 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 1.06e-02 -0.346 0.134 0.103 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 482449 sc-eQTL 3.62e-01 -0.116 0.127 0.103 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 212862 sc-eQTL 2.36e-01 -0.175 0.147 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 6.93e-02 -0.117 0.064 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 6.82e-01 0.0473 0.116 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 7.81e-01 0.0349 0.125 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0691 0.0712 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0965 0.138 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 482449 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0371 0.0912 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 212862 sc-eQTL 3.99e-01 -0.118 0.14 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0716 0.0761 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 2.61e-01 0.158 0.14 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 5.62e-01 0.0813 0.14 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0766 0.0739 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 2.26e-01 -0.171 0.141 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 482449 sc-eQTL 7.92e-01 0.0259 0.098 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 7.06e-01 0.0557 0.147 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 4.74e-01 -0.11 0.153 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 7.42e-01 0.049 0.148 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 9.82e-01 0.00155 0.0686 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 7.46e-01 0.0449 0.138 0.1 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 6.31e-01 0.0549 0.114 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 2.36e-01 -0.115 0.0971 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 6.68e-01 0.0453 0.106 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0642 0.0684 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 1.50e-01 -0.19 0.131 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 8.98e-02 0.211 0.124 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 7.20e-02 -0.188 0.104 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 1.01e-01 -0.201 0.122 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0839 0.0635 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 3.97e-01 -0.125 0.147 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 3.22e-01 0.144 0.145 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 5.62e-01 0.0775 0.133 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 9.48e-01 0.00915 0.139 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 6.09e-02 -0.107 0.0566 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0184 0.142 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0602 0.121 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 5.78e-01 0.0693 0.124 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 2.83e-01 0.148 0.138 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00916 0.0739 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 2.10e-01 -0.179 0.143 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 5.99e-01 -0.077 0.146 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 3.27e-01 -0.115 0.117 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 3.47e-01 0.119 0.126 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 8.46e-02 -0.124 0.0717 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 2.64e-01 -0.162 0.145 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 2.65e-01 0.17 0.152 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 3.98e-01 0.13 0.153 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 1.67e-01 -0.209 0.151 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 8.30e-01 0.0158 0.0738 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 9.97e-01 0.000578 0.162 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0318 0.15 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 4.30e-01 -0.114 0.144 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 4.08e-01 -0.123 0.149 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 1.57e-01 -0.114 0.0798 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 2.29e-01 0.183 0.151 0.105 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 2.64e-01 -0.159 0.142 0.1 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 4.63e-01 -0.109 0.148 0.1 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0402 0.145 0.1 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 7.38e-01 0.0238 0.0711 0.1 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 5.12e-01 0.0978 0.149 0.1 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0316 0.14 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 1.31e-01 -0.223 0.147 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 3.25e-01 -0.14 0.141 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0281 0.079 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 6.37e-01 0.0544 0.115 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0151 0.118 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0986 0.144 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00334 0.0571 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 9.76e-01 0.00426 0.139 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0735 0.141 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 7.27e-01 0.0493 0.141 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0195 0.0657 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0172 0.125 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 2.54e-02 -0.288 0.128 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 7.98e-01 -0.036 0.141 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0455 0.0763 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 212862 sc-eQTL 9.99e-01 0.000221 0.143 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 5.26e-01 0.0759 0.119 0.122 PB L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 3.75e-01 -0.144 0.162 0.122 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 4.66e-01 -0.107 0.146 0.122 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 9.68e-01 0.00338 0.083 0.122 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0881 0.155 0.122 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 482449 sc-eQTL 2.78e-01 -0.111 0.102 0.122 PB L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 3.44e-02 0.267 0.125 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0847 0.143 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0177 0.136 0.104 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 6.55e-01 0.023 0.0514 0.104 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00956 0.133 0.104 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 7.23e-01 0.0523 0.147 0.103 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 5.49e-01 0.091 0.151 0.103 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 6.33e-01 0.0593 0.124 0.103 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0278 0.0549 0.103 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 5.94e-02 -0.291 0.154 0.103 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 4.74e-01 0.0947 0.132 0.093 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -120428 sc-eQTL 4.16e-02 -0.266 0.13 0.093 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 9.27e-01 0.0157 0.171 0.093 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -99718 sc-eQTL 3.84e-01 -0.135 0.154 0.093 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 4.94e-01 0.103 0.15 0.093 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0605 0.0741 0.093 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 4.07e-01 0.122 0.147 0.093 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -488791 sc-eQTL 1.45e-01 -0.171 0.117 0.093 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0525 0.0921 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -120428 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0445 0.13 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 5.81e-01 -0.071 0.129 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -99718 sc-eQTL 3.40e-01 0.126 0.131 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 4.22e-01 0.0845 0.105 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 5.64e-01 0.0337 0.0583 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 5.99e-02 0.211 0.112 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 2.06e-02 -0.231 0.0989 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -120428 sc-eQTL 1.75e-01 0.17 0.125 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 4.43e-01 -0.104 0.136 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -99718 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0369 0.136 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 3.74e-01 0.079 0.0888 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0269 0.064 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 9.73e-01 0.00399 0.119 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0192 0.161 0.094 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 3.94e-02 -0.355 0.171 0.094 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 9.07e-02 -0.301 0.177 0.094 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 1.37e-01 -0.101 0.0675 0.094 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0194 0.176 0.094 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 3.82e-01 0.116 0.132 0.104 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -120428 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0916 0.134 0.104 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 4.89e-01 0.102 0.147 0.104 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -99718 sc-eQTL 3.01e-01 0.137 0.132 0.104 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0159 0.135 0.104 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 9.15e-02 -0.0986 0.0582 0.104 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 1.02e-01 -0.233 0.142 0.104 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0704 0.103 0.1 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -120428 sc-eQTL 4.30e-01 -0.115 0.146 0.1 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00623 0.148 0.1 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -99718 sc-eQTL 4.09e-01 -0.12 0.145 0.1 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 9.64e-01 0.00638 0.139 0.1 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0196 0.0699 0.1 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0874 0.123 0.1 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0799 0.12 0.096 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -120428 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0743 0.121 0.096 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 1.55e-01 -0.239 0.167 0.096 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -99718 sc-eQTL 8.15e-01 0.0287 0.123 0.096 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 3.18e-02 0.312 0.144 0.096 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 2.70e-01 -0.111 0.1 0.096 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 8.25e-03 -0.39 0.146 0.096 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -488791 sc-eQTL 2.44e-01 -0.166 0.142 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 212862 sc-eQTL 7.25e-01 0.0492 0.139 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 2.38e-02 -0.178 0.0781 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 3.61e-01 0.111 0.121 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 1.74e-01 0.17 0.124 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 4.99e-02 -0.139 0.0706 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 8.66e-02 -0.224 0.13 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 482449 sc-eQTL 7.60e-01 0.0385 0.126 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 212862 sc-eQTL 1.26e-01 -0.226 0.147 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 6.94e-02 -0.11 0.0601 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 2.92e-01 0.12 0.113 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 6.13e-01 0.0596 0.118 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0816 0.071 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 3.51e-01 -0.125 0.134 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 482449 sc-eQTL 8.21e-01 0.0193 0.0853 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 1.46e-01 -0.112 0.077 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -120428 sc-eQTL 7.09e-01 0.0471 0.126 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 2.30e-01 -0.145 0.121 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -99718 sc-eQTL 4.70e-01 0.0951 0.131 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 2.93e-01 0.0913 0.0867 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 9.61e-01 0.0029 0.0596 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 1.33e-01 0.159 0.106 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 7.03e-01 0.0361 0.0944 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -120428 sc-eQTL 2.56e-01 -0.158 0.139 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 5.91e-01 0.0727 0.135 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -99718 sc-eQTL 9.15e-01 0.0148 0.138 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 9.53e-01 0.00764 0.13 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 1.41e-01 -0.081 0.0548 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -199002 sc-eQTL 5.81e-02 -0.253 0.133 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 101139 sc-eQTL 7.33e-01 0.0369 0.108 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 986095 sc-eQTL 1.33e-01 -0.158 0.104 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -149122 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0991 0.137 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -200232 sc-eQTL 4.75e-01 -0.04 0.0558 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 101139 pQTL 0.0217 -0.0843 0.0367 0.0 0.0 0.106
ENSG00000112282 MED23 986095 eQTL 0.00649 0.0747 0.0274 0.0 0.0 0.103
ENSG00000112299 VNN1 -99718 pQTL 0.000117 0.218 0.0565 0.0 0.0 0.106

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112282 MED23 986095 2.69e-07 1.27e-07 4.98e-08 1.81e-07 9.25e-08 9.76e-08 1.53e-07 5.33e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.57e-07 8.59e-08 1.47e-07 7.13e-08 6.12e-08 7.37e-08 4.17e-08 1.26e-07 5.82e-08 4.21e-08 1.05e-07 1.27e-07 1.44e-07 3.79e-08 1.55e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.61e-08 1.16e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.59e-08 3.43e-08 8.34e-08 5.64e-08 3.49e-08 5.42e-08 9.36e-08 6.55e-08 4.47e-08 4.94e-08 1.4e-07 4.52e-08 1.11e-08 4.7e-08 1.84e-08 1.22e-07 1.98e-09 5.02e-08
ENSG00000112306 \N -200232 4.34e-06 5.12e-06 8.35e-07 2.42e-06 8.3e-07 1.05e-06 4.07e-06 6.3e-07 3.4e-06 1.47e-06 4.29e-06 2.56e-06 7.47e-06 2.08e-06 1.43e-06 2.43e-06 1.78e-06 2.79e-06 1.32e-06 9.17e-07 1.39e-06 4.27e-06 3.89e-06 1.54e-06 6.39e-06 1.14e-06 1.79e-06 1.51e-06 4.58e-06 4.23e-06 2.32e-06 5.06e-07 6.12e-07 1.44e-06 1.94e-06 9.44e-07 9.66e-07 4.37e-07 1.05e-06 3.8e-07 2.25e-07 5.47e-06 5.88e-07 1.96e-07 3.5e-07 3.96e-07 6.43e-07 2.26e-07 1.59e-07
ENSG00000154269 \N 985895 2.69e-07 1.34e-07 4.98e-08 1.81e-07 9.25e-08 9.76e-08 1.53e-07 5.33e-08 1.44e-07 4.57e-08 1.57e-07 8.59e-08 1.47e-07 7.13e-08 6.12e-08 7.37e-08 4.17e-08 1.26e-07 5.82e-08 4.21e-08 1.05e-07 1.27e-07 1.44e-07 3.79e-08 1.55e-07 1.14e-07 1.06e-07 9.61e-08 1.16e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.59e-08 3.43e-08 8.34e-08 5.64e-08 3.49e-08 5.42e-08 9.36e-08 6.55e-08 4.47e-08 4.94e-08 1.4e-07 4.52e-08 1.11e-08 4.7e-08 1.84e-08 1.22e-07 1.98e-09 5.02e-08