logo

Genes within 1Mb (chr6:132609019:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 207544 sc-eQTL 2.21e-01 -0.134 0.109 0.199 B L1
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 1.46e-02 -0.1 0.0406 0.199 B L1
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 8.24e-01 0.0183 0.0821 0.199 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 2.66e-01 0.086 0.0772 0.199 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0717 0.0465 0.199 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 1.24e-01 -0.151 0.0979 0.199 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 477131 sc-eQTL 7.36e-01 0.0218 0.0646 0.199 B L1
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 5.69e-01 0.0457 0.0802 0.199 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 3.25e-01 0.0626 0.0635 0.199 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0316 0.0694 0.199 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0325 0.0472 0.199 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0384 0.0955 0.199 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 7.16e-01 0.0292 0.0803 0.199 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0319 0.0791 0.199 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 4.39e-01 0.0725 0.0936 0.199 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0161 0.032 0.199 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 1.67e-01 -0.134 0.0964 0.199 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 3.10e-03 0.219 0.0733 0.191 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -125746 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0122 0.0929 0.191 DC L1
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0371 0.109 0.191 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -105036 sc-eQTL 3.70e-01 -0.09 0.1 0.191 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 1.35e-01 0.16 0.107 0.191 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 1.08e-01 -0.0966 0.0598 0.191 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 1.91e-01 -0.124 0.0948 0.191 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -494109 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0536 0.0866 0.191 DC L1
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0158 0.0545 0.199 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -125746 sc-eQTL 2.44e-01 0.109 0.0933 0.199 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0445 0.0889 0.199 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -105036 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0883 0.101 0.199 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 3.61e-01 0.065 0.071 0.199 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 9.62e-01 0.00203 0.0426 0.199 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 3.33e-01 0.0816 0.0841 0.199 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0109 0.0829 0.197 NK L1
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0788 0.0756 0.197 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 6.24e-01 0.0506 0.103 0.197 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0105 0.0427 0.197 NK L1
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0533 0.0825 0.199 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 1.24e-01 -0.158 0.103 0.199 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0343 0.0999 0.199 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 3.09e-01 0.0403 0.0395 0.199 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 7.23e-01 0.0385 0.108 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 207544 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0261 0.116 0.196 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 6.73e-01 0.0459 0.109 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0262 0.12 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 1.73e-01 0.157 0.115 0.196 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 6.15e-01 0.0311 0.0619 0.196 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 2.10e-01 -0.136 0.108 0.196 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 477131 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000908 0.103 0.196 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 207544 sc-eQTL 6.46e-01 0.0464 0.101 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 1.09e-01 -0.106 0.0656 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00101 0.1 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 6.57e-01 0.0442 0.0994 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 9.70e-02 -0.101 0.0605 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 5.05e-01 0.0731 0.11 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 477131 sc-eQTL 8.02e-01 0.0234 0.0932 0.2 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 207544 sc-eQTL 1.17e-01 -0.163 0.103 0.2 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 9.04e-03 -0.211 0.0801 0.2 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 4.66e-01 0.0766 0.105 0.2 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 1.63e-01 0.149 0.106 0.2 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 8.47e-02 -0.0883 0.051 0.2 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 1.51e-01 -0.154 0.107 0.2 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 477131 sc-eQTL 1.14e-01 -0.158 0.0992 0.2 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 207544 sc-eQTL 1.78e-01 -0.153 0.113 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0556 0.0495 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 2.45e-01 0.103 0.0886 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0364 0.0964 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0752 0.0547 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 1.15e-01 -0.167 0.105 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 477131 sc-eQTL 9.33e-01 0.00594 0.0702 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 207544 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0826 0.107 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 2.82e-02 -0.128 0.0579 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 5.83e-01 0.0594 0.108 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 2.93e-01 0.113 0.107 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0346 0.0569 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0924 0.108 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 477131 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0415 0.0752 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 6.66e-01 0.0489 0.113 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 9.32e-01 0.0101 0.118 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 8.00e-01 0.029 0.114 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 5.82e-01 0.029 0.0527 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 9.23e-01 0.0103 0.106 0.193 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 7.09e-01 0.0326 0.0874 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 4.12e-01 0.0612 0.0746 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 8.96e-01 0.0106 0.081 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0199 0.0526 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0367 0.101 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0256 0.0965 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 1.95e-01 -0.105 0.0809 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 2.54e-01 -0.109 0.0949 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 1.18e-01 -0.0771 0.049 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 7.07e-01 -0.043 0.114 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 3.50e-01 0.104 0.111 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 1.01e-01 0.167 0.102 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0581 0.106 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 1.21e-01 -0.0676 0.0435 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 5.84e-01 0.0596 0.109 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 6.92e-01 0.0363 0.0916 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 3.43e-01 0.089 0.0937 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 6.45e-01 0.048 0.104 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 3.75e-01 0.0494 0.0556 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0264 0.108 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 3.97e-01 -0.095 0.112 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0122 0.0901 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0256 0.0966 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 4.06e-02 -0.113 0.0548 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 3.27e-01 -0.109 0.111 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 4.61e-01 0.0834 0.113 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 7.79e-02 0.2 0.113 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0516 0.112 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 7.62e-01 0.0166 0.0547 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00627 0.12 0.194 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0394 0.117 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 1.74e-01 -0.152 0.112 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 4.52e-01 0.0873 0.116 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0037 0.0624 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 1.25e-01 0.18 0.117 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 1.11e-01 -0.172 0.108 0.193 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 5.54e-01 -0.067 0.113 0.193 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 8.22e-01 0.0248 0.11 0.193 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 2.86e-01 0.0577 0.054 0.193 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 5.13e-01 0.0743 0.113 0.193 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0831 0.108 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00547 0.114 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0914 0.109 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0521 0.0609 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0125 0.0885 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 9.84e-01 0.00178 0.091 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 2.20e-01 0.136 0.11 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 9.61e-01 0.00215 0.044 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 4.34e-01 -0.084 0.107 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 3.47e-01 -0.102 0.108 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 1.69e-01 0.149 0.108 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 9.42e-01 0.00369 0.0506 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 9.31e-01 0.00835 0.0961 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 1.54e-01 -0.142 0.0989 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00462 0.108 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0608 0.0585 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 207544 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0949 0.112 0.211 PB L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 1.30e-01 0.142 0.093 0.211 PB L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 3.41e-01 -0.122 0.127 0.211 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 2.45e-01 -0.133 0.114 0.211 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 3.51e-01 0.0608 0.0649 0.211 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 3.12e-01 -0.124 0.122 0.211 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 477131 sc-eQTL 6.72e-02 -0.146 0.0791 0.211 PB L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 5.02e-01 0.0662 0.0984 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 1.60e-01 -0.156 0.11 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 9.88e-01 0.00164 0.106 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 2.67e-01 0.0444 0.0399 0.202 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 7.73e-01 0.0299 0.103 0.202 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 4.65e-01 0.0802 0.11 0.199 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 7.92e-01 0.0297 0.113 0.199 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 9.93e-01 0.000814 0.0923 0.199 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0191 0.0408 0.199 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0432 0.115 0.199 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 1.45e-01 0.138 0.0946 0.195 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -125746 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0325 0.0945 0.195 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 4.40e-01 0.0949 0.123 0.195 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -105036 sc-eQTL 1.98e-01 -0.143 0.111 0.195 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 3.05e-01 0.111 0.108 0.195 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 1.07e-01 -0.086 0.0531 0.195 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 8.21e-01 0.024 0.106 0.195 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -494109 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0784 0.0844 0.195 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0203 0.0703 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -125746 sc-eQTL 8.16e-01 0.0232 0.0994 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00803 0.0983 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -105036 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0384 0.1 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 2.14e-01 0.0996 0.0799 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 4.01e-01 0.0374 0.0445 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 3.63e-01 0.0781 0.0857 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 5.55e-02 -0.147 0.0765 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -125746 sc-eQTL 1.43e-02 0.235 0.095 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0816 0.104 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -105036 sc-eQTL 9.70e-02 -0.173 0.104 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 1.72e-01 0.0934 0.0682 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 8.71e-01 -0.00804 0.0493 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 3.60e-01 0.0837 0.0911 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0897 0.124 0.197 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 5.09e-02 -0.258 0.131 0.197 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0766 0.137 0.197 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0108 0.0522 0.197 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0632 0.135 0.197 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 1.09e-01 0.163 0.101 0.198 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -125746 sc-eQTL 9.09e-01 0.0117 0.102 0.198 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 4.66e-02 0.223 0.111 0.198 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -105036 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0156 0.101 0.198 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0466 0.103 0.198 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 1.19e-01 -0.0698 0.0445 0.198 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 3.22e-01 -0.108 0.109 0.198 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 9.98e-01 0.000177 0.0756 0.195 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -125746 sc-eQTL 6.92e-01 0.0423 0.107 0.195 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 2.03e-01 -0.138 0.108 0.195 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -105036 sc-eQTL 1.11e-02 -0.267 0.104 0.195 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0417 0.102 0.195 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0588 0.0509 0.195 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0349 0.0902 0.195 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 1.54e-01 0.122 0.0854 0.206 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -125746 sc-eQTL 4.77e-01 0.0616 0.0864 0.206 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 2.22e-01 -0.147 0.12 0.206 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -105036 sc-eQTL 8.26e-01 0.0194 0.088 0.206 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 9.87e-02 0.173 0.104 0.206 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 5.24e-01 -0.046 0.0721 0.206 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 7.48e-02 -0.19 0.106 0.206 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -494109 sc-eQTL 6.83e-01 0.0418 0.102 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 207544 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00136 0.108 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 8.97e-03 -0.159 0.0602 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 9.36e-01 0.00758 0.0937 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 1.05e-01 0.157 0.0962 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 4.03e-02 -0.113 0.0546 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0797 0.101 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 477131 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0228 0.0976 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 207544 sc-eQTL 1.06e-01 -0.182 0.112 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 8.45e-02 -0.0799 0.0461 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 3.99e-01 0.0736 0.087 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 7.12e-01 0.0334 0.0901 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0628 0.0544 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 1.55e-01 -0.146 0.102 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 477131 sc-eQTL 7.46e-01 0.0212 0.0654 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0457 0.0588 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -125746 sc-eQTL 3.41e-01 0.0913 0.0958 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0714 0.0922 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -105036 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0696 0.1 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 1.85e-01 0.0876 0.0659 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 8.42e-01 0.00908 0.0454 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 1.96e-01 0.105 0.0805 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 2.33e-01 0.0851 0.0711 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -125746 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00283 0.105 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 4.81e-01 0.0721 0.102 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -105036 sc-eQTL 5.14e-02 -0.202 0.103 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0588 0.098 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 5.01e-02 -0.0813 0.0412 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -204320 sc-eQTL 2.50e-01 -0.116 0.101 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 95821 sc-eQTL 8.70e-01 0.0136 0.0833 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 980777 sc-eQTL 2.77e-01 -0.088 0.0807 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -154440 sc-eQTL 5.53e-01 0.0626 0.105 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -205550 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00647 0.043 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112282 MED23 980777 eQTL 0.012 0.0544 0.0216 0.0 0.0 0.177
ENSG00000112299 VNN1 -105036 pQTL 0.00254 0.134 0.0445 0.0 0.0 0.182
ENSG00000112299 VNN1 -105036 eQTL 1.05e-05 -0.124 0.028 0.0 0.0 0.177
ENSG00000112303 VNN2 -154440 pQTL 0.000638 0.109 0.032 0.0 0.0 0.182
ENSG00000118523 CCN2 657647 pQTL 0.0294 0.0581 0.0267 0.0 0.0 0.182
ENSG00000234484 AL032821.1 -143656 eQTL 0.00762 -0.108 0.0403 0.0 0.0 0.177

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 -105036 1.5e-05 2.13e-05 5.11e-06 1.29e-05 2.75e-06 7.4e-06 2.38e-05 2.9e-06 1.87e-05 8.91e-06 2.26e-05 9.35e-06 3.35e-05 8.94e-06 5.14e-06 1.09e-05 9.72e-06 1.51e-05 4.98e-06 4.47e-06 8.63e-06 1.91e-05 1.77e-05 5.03e-06 3.23e-05 5.33e-06 8.01e-06 7.85e-06 1.9e-05 1.58e-05 1.2e-05 1.23e-06 1.55e-06 4.9e-06 8.71e-06 4.46e-06 2.29e-06 2.7e-06 3.25e-06 2.44e-06 1.59e-06 2.92e-05 2.6e-06 3.05e-07 1.44e-06 2.75e-06 3.21e-06 1.26e-06 1.01e-06
ENSG00000112306 \N -205550 8.08e-06 9.91e-06 3.89e-06 7.03e-06 1.9e-06 3.93e-06 1e-05 1.24e-06 9.39e-06 4.78e-06 1.05e-05 5.31e-06 1.62e-05 3.78e-06 2.42e-06 6.38e-06 4.55e-06 5.52e-06 2.61e-06 2.77e-06 5.02e-06 9.58e-06 6.94e-06 2.42e-06 1.75e-05 2.92e-06 4.55e-06 3.24e-06 9.09e-06 7.94e-06 4.69e-06 5.67e-07 1.1e-06 3.26e-06 4.87e-06 2.67e-06 1.79e-06 1.85e-06 1.57e-06 1.01e-06 9.92e-07 1.65e-05 1.45e-06 2.71e-07 6.81e-07 1.74e-06 1.42e-06 7.51e-07 5.05e-07