Genes within 1Mb (chr6:132581926:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 180451 sc-eQTL 3.63e-05 -0.405 0.0959 0.259 B L1
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 7.26e-02 -0.0674 0.0374 0.259 B L1
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 4.19e-02 0.152 0.0743 0.259 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 1.93e-01 0.0921 0.0705 0.259 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0311 0.0427 0.259 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0656 0.09 0.259 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 450038 sc-eQTL 2.62e-01 0.0663 0.0589 0.259 B L1
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0347 0.0737 0.259 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0215 0.0585 0.259 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0174 0.0639 0.259 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00405 0.0434 0.259 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0459 0.0878 0.259 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0295 0.0722 0.259 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 3.04e-01 0.0732 0.071 0.259 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 2.05e-01 0.107 0.084 0.259 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 8.87e-01 0.00411 0.0288 0.259 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 6.75e-01 0.0366 0.0871 0.259 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 9.45e-02 0.114 0.0678 0.255 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -152839 sc-eQTL 5.99e-01 0.0446 0.0846 0.255 DC L1
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0703 0.0993 0.255 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -132129 sc-eQTL 4.17e-02 -0.185 0.0905 0.255 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0466 0.0978 0.255 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0269 0.0548 0.255 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0319 0.0868 0.255 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -521202 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0231 0.079 0.255 DC L1
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 1.75e-01 -0.067 0.0492 0.259 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -152839 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0581 0.0847 0.259 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 1.70e-01 -0.111 0.0802 0.259 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -132129 sc-eQTL 8.27e-01 -0.02 0.0912 0.259 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 1.28e-01 0.0977 0.064 0.259 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 6.22e-01 -0.019 0.0386 0.259 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0891 0.0761 0.259 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 4.60e-02 -0.149 0.0744 0.26 NK L1
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 1.59e-01 0.0967 0.0684 0.26 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 4.18e-01 0.0758 0.0934 0.26 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0363 0.0386 0.26 NK L1
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 3.37e-01 0.0724 0.0752 0.259 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 3.07e-01 0.096 0.0938 0.259 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0277 0.0911 0.259 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 6.02e-01 0.0188 0.0361 0.259 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 7.97e-01 0.0255 0.0989 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 180451 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0907 0.105 0.26 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 2.78e-01 -0.107 0.098 0.26 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0917 0.109 0.26 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 1.74e-02 0.247 0.103 0.26 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0167 0.056 0.26 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 5.93e-01 0.0525 0.0981 0.26 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 450038 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0758 0.0934 0.26 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 180451 sc-eQTL 2.45e-01 -0.107 0.092 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0909 0.0601 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 2.06e-01 0.116 0.0915 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 1.83e-01 -0.121 0.0906 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0117 0.0557 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0358 0.1 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 450038 sc-eQTL 3.71e-01 0.0763 0.0851 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 180451 sc-eQTL 1.53e-01 -0.133 0.0924 0.259 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0861 0.0726 0.259 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0641 0.0937 0.259 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 1.36e-01 0.142 0.0947 0.259 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0393 0.0458 0.259 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 7.41e-02 -0.171 0.095 0.259 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 450038 sc-eQTL 5.61e-01 0.0519 0.0892 0.259 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 180451 sc-eQTL 8.15e-04 -0.344 0.101 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0414 0.0454 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 1.96e-02 0.189 0.0804 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 8.65e-01 0.015 0.0883 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0611 0.0501 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 7.57e-01 0.0301 0.097 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 450038 sc-eQTL 3.11e-02 0.138 0.0635 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 180451 sc-eQTL 4.35e-02 -0.199 0.0981 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 2.67e-02 -0.119 0.0533 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 3.87e-01 0.0862 0.0995 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 4.07e-01 0.0822 0.0989 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 6.47e-01 -0.024 0.0524 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0878 0.0999 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 450038 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00982 0.0694 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 1.80e-01 -0.137 0.101 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0833 0.106 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 5.74e-01 0.0578 0.103 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 5.22e-01 0.0304 0.0474 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00579 0.0957 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 6.92e-01 0.0315 0.0793 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0833 0.0674 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0244 0.0734 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00226 0.0476 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0734 0.0916 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 1.80e-01 -0.118 0.0876 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0208 0.074 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0492 0.0867 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0205 0.0449 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000758 0.104 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0376 0.1 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 2.35e-01 0.11 0.0922 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 8.84e-01 -0.014 0.0964 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 6.31e-01 -0.019 0.0395 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 1.10e-01 -0.157 0.0976 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 5.25e-01 0.0523 0.0823 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 8.30e-02 0.146 0.0838 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 4.49e-01 0.0709 0.0934 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 6.67e-01 0.0216 0.0501 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 3.66e-01 0.0878 0.0968 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 1.21e-02 -0.251 0.0993 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0297 0.081 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 9.57e-01 0.00467 0.087 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0358 0.0497 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0515 0.0999 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 8.34e-01 0.0209 0.0996 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0469 0.0999 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 7.89e-02 -0.173 0.0981 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 5.22e-01 0.0308 0.0481 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0427 0.106 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 6.70e-01 0.0445 0.104 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 5.32e-01 0.0628 0.1 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 3.16e-02 0.222 0.103 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 5.92e-01 0.0299 0.0558 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 3.37e-01 0.101 0.105 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 9.86e-01 0.00173 0.0965 0.255 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 1.34e-01 0.151 0.1 0.255 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0264 0.0982 0.255 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 6.47e-02 0.089 0.0479 0.255 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0157 0.101 0.255 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0254 0.101 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 6.90e-01 0.0425 0.106 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 4.36e-01 0.0797 0.102 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0676 0.0567 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0665 0.0794 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 1.27e-01 0.124 0.0812 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 4.44e-02 0.199 0.0985 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 8.07e-01 -0.00967 0.0394 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00889 0.0992 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0888 0.1 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 3.64e-01 0.0912 0.1 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 9.97e-01 0.000182 0.0468 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 2.47e-02 -0.195 0.0861 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 6.12e-01 0.0458 0.0901 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 1.69e-01 -0.135 0.0975 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0156 0.0531 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 180451 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0885 0.0995 0.256 PB L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 5.67e-02 0.158 0.0821 0.256 PB L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0608 0.113 0.256 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0481 0.102 0.256 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 1.07e-01 0.0929 0.0572 0.256 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 2.20e-01 -0.133 0.108 0.256 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 450038 sc-eQTL 6.28e-01 0.0346 0.0712 0.256 PB L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 6.28e-01 0.0442 0.091 0.261 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 5.07e-01 0.068 0.102 0.261 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0252 0.0977 0.261 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 9.48e-01 0.0024 0.037 0.261 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 9.77e-01 0.00277 0.0957 0.261 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0199 0.097 0.259 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0489 0.0997 0.259 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 2.92e-01 -0.086 0.0814 0.259 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 8.85e-01 0.00523 0.0361 0.259 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 3.39e-01 0.0977 0.102 0.259 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 9.36e-02 0.148 0.0879 0.256 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -152839 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000821 0.0879 0.256 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 4.90e-01 0.079 0.114 0.256 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -132129 sc-eQTL 4.03e-03 -0.294 0.101 0.256 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00149 0.101 0.256 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0511 0.0496 0.256 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 9.17e-01 0.0102 0.0985 0.256 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -521202 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0476 0.0787 0.256 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0532 0.0639 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -152839 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0673 0.0903 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0994 0.0892 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -132129 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0176 0.0912 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 4.37e-02 0.147 0.0723 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 8.64e-01 -0.00697 0.0405 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 1.73e-01 -0.106 0.0778 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0929 0.0694 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -152839 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0106 0.0871 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 1.04e-01 -0.153 0.094 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -132129 sc-eQTL 8.76e-01 0.0148 0.0946 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 2.16e-01 0.0766 0.0617 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0282 0.0446 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0872 0.0823 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 5.05e-02 0.214 0.108 0.264 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0461 0.118 0.264 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0497 0.121 0.264 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 9.37e-01 0.00368 0.0463 0.264 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 9.94e-01 0.000911 0.12 0.264 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 5.14e-01 0.0616 0.0942 0.26 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -152839 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0769 0.095 0.26 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 6.52e-01 0.0472 0.105 0.26 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -132129 sc-eQTL 2.01e-01 -0.12 0.0937 0.26 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 1.13e-01 0.151 0.0951 0.26 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00044 0.0416 0.26 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0409 0.101 0.26 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 9.84e-01 0.0014 0.0702 0.251 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -152839 sc-eQTL 3.01e-02 0.214 0.098 0.251 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 5.75e-01 0.0564 0.1 0.251 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -132129 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0481 0.0983 0.251 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0421 0.0946 0.251 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 8.64e-01 -0.00811 0.0474 0.251 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 6.53e-01 0.0377 0.0838 0.251 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 3.98e-01 0.0692 0.0815 0.266 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -152839 sc-eQTL 3.96e-01 0.0699 0.0821 0.266 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 1.58e-01 -0.162 0.114 0.266 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -132129 sc-eQTL 6.32e-01 0.0402 0.0837 0.266 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 1.29e-01 -0.151 0.0989 0.266 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0147 0.0686 0.266 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0538 0.102 0.266 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -521202 sc-eQTL 9.34e-01 0.00809 0.0972 0.266 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 180451 sc-eQTL 1.82e-02 -0.229 0.0962 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 2.92e-02 -0.12 0.0546 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 8.06e-01 0.0207 0.0845 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 2.26e-01 0.106 0.087 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0422 0.0497 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0709 0.0912 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 450038 sc-eQTL 1.24e-01 0.135 0.0876 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 180451 sc-eQTL 1.05e-03 -0.337 0.101 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 5.21e-02 -0.0826 0.0423 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 1.59e-02 0.192 0.079 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 4.14e-01 0.0677 0.0827 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 4.03e-01 -0.042 0.05 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00411 0.0945 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 450038 sc-eQTL 1.78e-01 0.0808 0.0598 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0635 0.0536 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -152839 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0749 0.0874 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 4.99e-02 -0.164 0.0834 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -132129 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0333 0.0913 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 9.66e-02 0.1 0.06 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0205 0.0414 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 1.13e-01 -0.117 0.0732 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00879 0.0661 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -152839 sc-eQTL 8.86e-01 0.014 0.0972 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 2.59e-01 0.107 0.0944 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -132129 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0688 0.0962 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 3.52e-01 0.0846 0.0907 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0356 0.0385 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 sc-eQTL 9.44e-01 0.00655 0.0936 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 68728 sc-eQTL 3.07e-02 -0.163 0.0748 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 953684 sc-eQTL 1.42e-01 0.108 0.0731 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -181533 sc-eQTL 6.03e-01 0.0498 0.0957 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -232643 sc-eQTL 4.90e-01 -0.027 0.039 0.261 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 180451 eQTL 2.66e-05 -0.143 0.0339 0.0 0.0 0.248
ENSG00000079950 STX7 68728 eQTL 0.00198 -0.0557 0.0179 0.0 0.0 0.248
ENSG00000112299 VNN1 -132129 pQTL 0.00356 0.117 0.04 0.0 0.0 0.25
ENSG00000112303 VNN2 -181533 pQTL 0.0488 0.0569 0.0288 0.0 0.0 0.25
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 eQTL 9.06e-11 -0.162 0.0248 0.0 0.0 0.248


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 180451 2.77e-06 2.49e-06 2.74e-07 1.86e-06 4.37e-07 7.84e-07 1.61e-06 4.42e-07 1.69e-06 8.08e-07 2.11e-06 1.44e-06 3.49e-06 1.21e-06 5.46e-07 1.15e-06 9.55e-07 1.79e-06 6.65e-07 1.09e-06 7.69e-07 2.26e-06 2.12e-06 1.03e-06 3.48e-06 1.22e-06 1.16e-06 1.34e-06 1.93e-06 1.81e-06 1.65e-06 2.62e-07 3.95e-07 1.22e-06 9.93e-07 8.31e-07 7.89e-07 3.9e-07 1.11e-06 3.78e-07 2.44e-07 3.33e-06 3.74e-07 1.41e-07 3.98e-07 3.63e-07 4.02e-07 2.52e-07 2.32e-07
ENSG00000112299 VNN1 -132129 4.27e-06 4.24e-06 5.8e-07 2.24e-06 8.74e-07 1.03e-06 2.93e-06 8.98e-07 2.98e-06 1.67e-06 3.7e-06 2.05e-06 7.22e-06 1.47e-06 1.07e-06 2.06e-06 1.85e-06 2.38e-06 1.42e-06 8.79e-07 1.8e-06 3.5e-06 3.53e-06 1.71e-06 4.9e-06 1.17e-06 1.56e-06 1.63e-06 3.85e-06 3.95e-06 1.95e-06 4.72e-07 5.69e-07 1.8e-06 1.98e-06 8.88e-07 9.13e-07 4.68e-07 1.06e-06 3.42e-07 3.2e-07 4.67e-06 4.6e-07 1.81e-07 3.35e-07 3.54e-07 8.67e-07 2.33e-07 1.9e-07
ENSG00000146409 SLC18B1 -231413 1.4e-06 1.42e-06 2.28e-07 1.25e-06 3.96e-07 6.3e-07 1.43e-06 3.68e-07 1.77e-06 6.36e-07 2e-06 8.56e-07 2.58e-06 3.58e-07 4.89e-07 9.51e-07 9.77e-07 1.06e-06 7.2e-07 4.77e-07 8.13e-07 1.93e-06 1.21e-06 5.79e-07 2.36e-06 7.54e-07 9.45e-07 9.31e-07 1.6e-06 1.31e-06 8.43e-07 2.98e-07 2.53e-07 5.66e-07 5.91e-07 4.9e-07 7.4e-07 2.92e-07 5.12e-07 2.04e-07 2.72e-07 2.07e-06 1.66e-07 6.49e-08 3.07e-07 2.31e-07 2.18e-07 3.73e-08 1.07e-07