Genes within 1Mb (chr6:132555437:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 153962 sc-eQTL 2.46e-01 -0.15 0.128 0.135 B L1
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 1.24e-02 0.121 0.0479 0.135 B L1
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 4.75e-01 0.0693 0.0968 0.135 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 8.22e-01 0.0206 0.0914 0.135 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0617 0.0551 0.135 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 3.64e-01 0.106 0.116 0.135 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 423549 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0702 0.0762 0.135 B L1
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 1.02e-01 0.157 0.0955 0.135 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0677 0.0761 0.135 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0244 0.0832 0.135 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 5.11e-01 0.0373 0.0565 0.135 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 3.30e-01 0.112 0.114 0.135 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 2.24e-01 0.114 0.0934 0.135 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 6.71e-01 0.0393 0.0923 0.135 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 1.61e-01 0.153 0.109 0.135 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0611 0.0372 0.135 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 6.97e-01 0.0441 0.113 0.135 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 6.57e-01 0.0389 0.0873 0.128 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -179328 sc-eQTL 1.77e-01 0.146 0.108 0.128 DC L1
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 5.45e-01 0.0769 0.127 0.128 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -158618 sc-eQTL 2.32e-01 0.14 0.116 0.128 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 6.69e-01 0.0535 0.125 0.128 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0085 0.0701 0.128 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 1.80e-01 0.149 0.11 0.128 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -547691 sc-eQTL 7.97e-01 0.0261 0.101 0.128 DC L1
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 3.12e-01 0.0653 0.0644 0.135 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -179328 sc-eQTL 6.68e-01 0.0476 0.111 0.135 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 5.03e-01 0.0705 0.105 0.135 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -158618 sc-eQTL 1.18e-02 0.298 0.117 0.135 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 1.29e-02 0.208 0.0829 0.135 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00894 0.0504 0.135 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 3.29e-01 0.0973 0.0995 0.135 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 5.66e-02 0.185 0.0963 0.135 NK L1
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0402 0.0888 0.135 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 3.41e-01 0.115 0.121 0.135 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000619 0.05 0.135 NK L1
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 7.18e-01 0.0348 0.0963 0.135 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 4.41e-01 0.0928 0.12 0.135 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 3.83e-01 -0.102 0.116 0.135 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 9.06e-01 0.00545 0.0462 0.135 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 7.79e-01 0.0355 0.127 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 153962 sc-eQTL 9.99e-01 0.000104 0.132 0.133 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0462 0.124 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0678 0.138 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0613 0.132 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 3.82e-01 0.0619 0.0707 0.133 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 3.90e-01 0.107 0.124 0.133 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 423549 sc-eQTL 7.40e-01 0.0392 0.118 0.133 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 153962 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0215 0.119 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 5.73e-02 0.147 0.0772 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 2.29e-01 0.142 0.118 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0861 0.117 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0878 0.0715 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 2.38e-01 0.153 0.129 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 423549 sc-eQTL 5.88e-02 -0.207 0.109 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 153962 sc-eQTL 3.25e-01 0.117 0.119 0.136 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 3.25e-01 0.0921 0.0934 0.136 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0757 0.12 0.136 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 5.98e-01 0.0647 0.122 0.136 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 3.34e-02 -0.125 0.0584 0.136 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 1.65e-01 -0.171 0.123 0.136 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 423549 sc-eQTL 4.13e-01 -0.094 0.115 0.136 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 153962 sc-eQTL 9.59e-02 -0.224 0.134 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 1.74e-01 0.0802 0.0587 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 7.09e-01 0.0394 0.106 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 2.75e-02 -0.251 0.113 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0563 0.0651 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 1.33e-01 0.189 0.125 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 423549 sc-eQTL 1.52e-01 -0.119 0.0829 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 153962 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0542 0.128 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 9.25e-02 0.117 0.0694 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 3.39e-01 0.123 0.129 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00429 0.128 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 7.02e-01 -0.026 0.0678 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 8.72e-01 0.0208 0.129 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 423549 sc-eQTL 1.46e-01 -0.13 0.0893 0.135 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0943 0.131 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0203 0.136 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 3.91e-01 0.113 0.132 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 5.78e-01 -0.034 0.0611 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 1.12e-01 0.195 0.122 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 8.27e-02 0.178 0.102 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0657 0.0877 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 5.74e-01 0.0537 0.0952 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 5.61e-01 0.036 0.0618 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 7.91e-01 0.0316 0.119 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 8.55e-03 0.296 0.112 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0526 0.0953 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 3.49e-01 -0.105 0.112 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00659 0.0579 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0589 0.134 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 7.06e-01 0.0493 0.131 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0959 0.12 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 6.34e-02 -0.232 0.124 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 6.69e-01 -0.022 0.0514 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 1.92e-01 0.167 0.127 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 2.34e-01 0.131 0.109 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 4.38e-01 0.0873 0.112 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 1.98e-02 0.289 0.123 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 5.05e-01 0.0445 0.0667 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 4.02e-01 0.108 0.129 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0693 0.132 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 1.34e-01 -0.159 0.106 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 6.76e-01 0.0478 0.114 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0282 0.0653 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 8.25e-01 -0.029 0.131 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0451 0.129 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 6.83e-01 0.0528 0.129 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 1.81e-01 -0.17 0.127 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 5.94e-01 0.0332 0.0621 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0545 0.136 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 2.43e-01 0.167 0.142 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 2.89e-01 0.146 0.137 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 4.76e-01 0.101 0.142 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0157 0.0764 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 9.44e-01 0.0102 0.144 0.126 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0102 0.122 0.132 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0212 0.128 0.132 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 2.88e-01 -0.132 0.124 0.132 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 6.41e-01 0.0286 0.0612 0.132 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 2.95e-01 0.135 0.128 0.132 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 2.72e-01 0.142 0.129 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 9.82e-01 0.00313 0.137 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 9.47e-02 0.219 0.13 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0245 0.073 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 1.07e-01 0.166 0.103 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0168 0.106 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 9.74e-01 0.00427 0.129 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 6.66e-01 0.0222 0.0513 0.136 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 3.73e-01 0.114 0.128 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0399 0.129 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 8.04e-01 0.0321 0.129 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0833 0.06 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 1.24e-01 0.172 0.111 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0404 0.115 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 1.14e-01 0.198 0.125 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0413 0.0681 0.136 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 153962 sc-eQTL 4.82e-01 -0.09 0.127 0.152 PB L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00352 0.107 0.152 PB L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0609 0.145 0.152 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 4.86e-02 0.255 0.128 0.152 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0194 0.074 0.152 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 8.57e-01 -0.025 0.139 0.152 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 423549 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0562 0.091 0.152 PB L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 1.15e-01 0.183 0.116 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 8.87e-01 0.0187 0.131 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0124 0.125 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 8.13e-01 0.0112 0.0473 0.137 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 4.87e-01 0.0852 0.122 0.137 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 3.13e-01 -0.126 0.124 0.135 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 1.77e-01 -0.173 0.127 0.135 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 8.48e-01 0.0201 0.105 0.135 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0271 0.0463 0.135 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 2.93e-01 0.138 0.131 0.135 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 1.39e-01 0.165 0.111 0.132 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -179328 sc-eQTL 4.45e-01 0.0846 0.111 0.132 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 3.34e-01 0.139 0.144 0.132 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -158618 sc-eQTL 3.01e-01 0.135 0.13 0.132 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 8.35e-01 0.0264 0.127 0.132 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 8.94e-01 -0.00836 0.0627 0.132 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 3.15e-01 0.125 0.124 0.132 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -547691 sc-eQTL 2.90e-01 -0.105 0.0989 0.132 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 1.71e-01 0.114 0.083 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -179328 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0692 0.118 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 9.51e-01 0.00711 0.117 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -158618 sc-eQTL 7.68e-02 0.21 0.118 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 6.78e-02 0.173 0.0944 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0286 0.0528 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 8.99e-01 0.013 0.102 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0497 0.09 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -179328 sc-eQTL 1.89e-01 0.148 0.112 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 9.24e-01 0.0116 0.122 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -158618 sc-eQTL 2.45e-02 0.273 0.121 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 8.43e-02 0.138 0.0794 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0419 0.0575 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 3.43e-01 0.101 0.106 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 3.63e-01 0.14 0.154 0.121 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 5.73e-01 0.0935 0.165 0.121 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 3.64e-01 -0.155 0.17 0.121 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0162 0.065 0.121 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 8.23e-01 0.0377 0.168 0.121 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 8.30e-01 0.0263 0.122 0.133 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -179328 sc-eQTL 3.29e-01 -0.12 0.123 0.133 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 2.05e-01 0.172 0.135 0.133 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -158618 sc-eQTL 3.67e-06 0.55 0.116 0.133 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 3.05e-02 0.267 0.122 0.133 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 6.17e-01 -0.027 0.0539 0.133 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00632 0.131 0.133 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 6.02e-01 0.048 0.0921 0.131 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -179328 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0321 0.13 0.131 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 6.68e-01 0.0566 0.132 0.131 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -158618 sc-eQTL 2.31e-03 0.389 0.126 0.131 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00441 0.124 0.131 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0332 0.0622 0.131 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 1.49e-01 -0.158 0.109 0.131 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0516 0.102 0.138 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -179328 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0823 0.102 0.138 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 4.00e-01 -0.12 0.143 0.138 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -158618 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0439 0.104 0.138 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 5.57e-01 0.0731 0.124 0.138 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00782 0.0856 0.138 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 7.14e-01 0.0466 0.127 0.138 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -547691 sc-eQTL 5.22e-01 0.0777 0.121 0.138 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 153962 sc-eQTL 1.40e-01 0.185 0.125 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 1.45e-01 0.103 0.0708 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 4.42e-01 0.0836 0.109 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 9.82e-01 0.00254 0.112 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0777 0.0639 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 4.98e-01 0.0797 0.118 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 423549 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0155 0.113 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 153962 sc-eQTL 1.96e-01 -0.174 0.134 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 8.18e-02 0.096 0.0549 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 3.65e-01 0.0941 0.104 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 2.33e-01 -0.128 0.107 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 4.51e-01 -0.049 0.0649 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 1.75e-01 0.166 0.122 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 423549 sc-eQTL 1.37e-01 -0.115 0.0774 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 3.11e-01 0.0709 0.0698 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -179328 sc-eQTL 7.45e-01 0.0371 0.114 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 7.44e-01 0.0358 0.109 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -158618 sc-eQTL 1.66e-02 0.283 0.117 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 7.68e-03 0.208 0.0773 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0193 0.0539 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 4.64e-01 0.0702 0.0958 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 5.71e-01 0.0491 0.0865 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -179328 sc-eQTL 2.23e-01 -0.155 0.127 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 1.62e-01 0.173 0.123 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -158618 sc-eQTL 7.62e-04 0.42 0.123 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 5.92e-01 0.0638 0.119 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0316 0.0504 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -257902 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0513 0.123 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 42239 sc-eQTL 9.00e-02 0.165 0.097 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 927195 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0492 0.0948 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -208022 sc-eQTL 4.03e-01 0.103 0.123 0.136 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -259132 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0019 0.0505 0.136 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 153962 eQTL 0.00444 -0.128 0.045 0.0025 0.0 0.122
ENSG00000079950 STX7 42239 pQTL 2.88e-05 0.141 0.0335 0.0 0.0 0.126
ENSG00000079950 STX7 42239 eQTL 2.99e-20 0.215 0.0228 0.0 0.0 0.122
ENSG00000112299 VNN1 -158618 pQTL 0.0239 0.118 0.0521 0.0 0.0 0.126
ENSG00000112303 VNN2 -208022 pQTL 0.016 0.0904 0.0375 0.0 0.0 0.126


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 153962 4e-06 3.29e-06 7.57e-07 1.94e-06 1.1e-06 8.02e-07 2.43e-06 9.27e-07 2.88e-06 1.67e-06 3.27e-06 2.39e-06 5.43e-06 1.2e-06 9.97e-07 2.3e-06 1.63e-06 2.26e-06 1.42e-06 9.53e-07 1.93e-06 3.58e-06 3.24e-06 1.71e-06 4.53e-06 1.29e-06 1.86e-06 1.41e-06 3.81e-06 3.06e-06 1.97e-06 6.09e-07 8.13e-07 1.76e-06 1.76e-06 9.44e-07 9.66e-07 4.71e-07 1.07e-06 3.8e-07 5.44e-07 3.87e-06 5.27e-07 1.74e-07 3.75e-07 3.54e-07 7.28e-07 2.72e-07 3.24e-07
ENSG00000079950 STX7 42239 1.03e-05 1.12e-05 2.41e-06 6.77e-06 2.48e-06 5.36e-06 1.32e-05 2.22e-06 1.06e-05 5.52e-06 1.41e-05 6.05e-06 1.91e-05 3.97e-06 3.67e-06 7.26e-06 6.44e-06 9.99e-06 3.56e-06 3.64e-06 6.47e-06 1.1e-05 1.1e-05 4.73e-06 1.85e-05 4.47e-06 6.66e-06 5.04e-06 1.37e-05 1.32e-05 6.75e-06 1.03e-06 1.53e-06 4.31e-06 5.39e-06 3.8e-06 1.91e-06 2.39e-06 2.99e-06 2.03e-06 1.67e-06 1.39e-05 1.6e-06 3.62e-07 1.76e-06 2.2e-06 2.15e-06 1.12e-06 9.67e-07
ENSG00000234484 \N -197238 2.22e-06 2.43e-06 3.23e-07 1.63e-06 5.96e-07 7.92e-07 1.53e-06 6.87e-07 1.8e-06 8.46e-07 2.11e-06 1.29e-06 3.5e-06 1.1e-06 8.32e-07 1.52e-06 1.06e-06 2.04e-06 9.61e-07 1.28e-06 1.12e-06 2.8e-06 2.14e-06 9.91e-07 2.95e-06 1.37e-06 1.29e-06 1.44e-06 1.94e-06 1.86e-06 1.23e-06 3.26e-07 5.43e-07 1.21e-06 1.07e-06 9.45e-07 7.91e-07 4.13e-07 1.14e-06 3.8e-07 2.23e-07 2.83e-06 4.81e-07 2.07e-07 3.04e-07 2.98e-07 8.41e-07 2.18e-07 1.53e-07