logo

Genes within 1Mb (chr6:132550514:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 149039 sc-eQTL 9.56e-02 0.228 0.136 0.122 B L1
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0395 0.0515 0.122 B L1
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 1.62e-01 -0.144 0.102 0.122 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0428 0.097 0.122 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 9.08e-01 -0.00682 0.0587 0.122 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 2.65e-02 0.273 0.122 0.122 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 418626 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0983 0.0807 0.122 B L1
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 5.60e-01 0.0577 0.0989 0.122 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 8.11e-01 0.0188 0.0785 0.122 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0675 0.0856 0.122 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 4.25e-01 0.0465 0.0582 0.122 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 2.55e-02 0.262 0.117 0.122 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 7.91e-01 0.0264 0.0997 0.122 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0523 0.0982 0.122 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 8.35e-01 0.0243 0.116 0.122 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 2.15e-01 0.0493 0.0396 0.122 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 1.03e-03 0.39 0.117 0.122 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 2.05e-01 -0.114 0.0897 0.124 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -184251 sc-eQTL 9.41e-01 0.00834 0.112 0.124 DC L1
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 5.89e-01 0.0709 0.131 0.124 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -163541 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0914 0.12 0.124 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 9.85e-01 0.00248 0.129 0.124 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 4.23e-01 0.058 0.0722 0.124 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 1.94e-01 0.149 0.114 0.124 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -552614 sc-eQTL 2.85e-02 -0.227 0.103 0.124 DC L1
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 4.06e-02 -0.138 0.067 0.122 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -184251 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0991 0.116 0.122 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 4.27e-01 0.0877 0.11 0.122 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -163541 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000735 0.125 0.122 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 3.05e-01 0.0905 0.088 0.122 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 7.39e-01 0.0177 0.0529 0.122 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 6.79e-01 0.0433 0.105 0.122 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0141 0.102 0.122 NK L1
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0293 0.0931 0.122 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 6.32e-01 0.0607 0.127 0.122 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 3.83e-01 0.0457 0.0523 0.122 NK L1
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0125 0.1 0.122 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 6.48e-01 0.0572 0.125 0.122 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 3.26e-01 0.119 0.121 0.122 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0132 0.0481 0.122 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 3.53e-01 0.122 0.132 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 149039 sc-eQTL 4.67e-02 0.279 0.139 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0578 0.132 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0332 0.146 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 9.59e-01 0.0072 0.14 0.112 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 1.87e-01 0.0993 0.0749 0.112 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 6.42e-01 0.0614 0.132 0.112 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 418626 sc-eQTL 2.30e-01 0.151 0.125 0.112 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 149039 sc-eQTL 6.39e-02 0.231 0.124 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0939 0.0817 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 1.64e-01 -0.173 0.124 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 3.78e-02 0.255 0.122 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0323 0.0756 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 3.73e-01 0.121 0.136 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 418626 sc-eQTL 1.79e-01 -0.155 0.115 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 149039 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0609 0.126 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 7.58e-01 0.0306 0.0993 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 9.29e-01 0.0115 0.128 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 3.49e-01 -0.122 0.13 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00307 0.0626 0.121 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 1.04e-01 0.212 0.13 0.121 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 418626 sc-eQTL 7.90e-01 0.0325 0.122 0.121 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 149039 sc-eQTL 4.66e-01 0.103 0.141 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0567 0.0617 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0849 0.111 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0953 0.12 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 6.65e-01 0.0296 0.0684 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 1.07e-01 0.212 0.131 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 418626 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0225 0.0874 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 149039 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00507 0.133 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0261 0.0723 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0478 0.134 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00904 0.133 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 7.67e-01 0.0209 0.0703 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0294 0.134 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 418626 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0748 0.0929 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 2.87e-01 0.147 0.137 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0206 0.143 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0941 0.139 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0765 0.064 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 3.63e-01 0.118 0.129 0.12 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0194 0.106 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 3.25e-01 0.089 0.0903 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0571 0.0982 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 4.81e-01 0.045 0.0637 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 6.31e-02 0.227 0.122 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 1.00e-01 0.195 0.118 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0653 0.0997 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 4.92e-01 0.0805 0.117 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 1.74e-01 0.0824 0.0604 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 6.60e-02 0.257 0.139 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 3.95e-01 0.116 0.136 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 8.87e-01 0.0179 0.126 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 8.51e-01 0.0246 0.131 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 6.37e-01 0.0254 0.0537 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 1.28e-02 0.33 0.132 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0696 0.115 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00497 0.118 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 6.11e-01 0.0664 0.13 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 4.93e-01 0.0479 0.0697 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 3.66e-01 0.122 0.135 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 3.89e-02 0.279 0.134 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 1.73e-01 0.148 0.109 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 9.66e-01 0.00498 0.117 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 6.35e-01 0.0319 0.067 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 4.15e-03 0.382 0.132 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 9.73e-01 0.00455 0.133 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 4.78e-02 -0.263 0.132 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 2.96e-01 -0.138 0.132 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 1.31e-01 0.0971 0.064 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 2.06e-02 0.325 0.139 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 4.28e-01 -0.114 0.144 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 1.88e-01 -0.183 0.138 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 5.71e-01 0.0813 0.143 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0724 0.0769 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 8.22e-01 0.0328 0.146 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 8.71e-01 0.0207 0.127 0.121 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 4.11e-02 0.27 0.132 0.121 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 7.89e-01 0.0345 0.129 0.121 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0556 0.0634 0.121 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00897 0.133 0.121 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 7.11e-01 0.0495 0.134 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 2.75e-01 -0.154 0.141 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 2.65e-01 0.151 0.135 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 2.04e-01 0.0959 0.0753 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0627 0.107 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0304 0.11 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 6.05e-01 0.0694 0.134 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 2.82e-01 0.0572 0.0531 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0379 0.127 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 8.52e-01 0.024 0.129 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 6.87e-01 0.052 0.129 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 4.79e-02 0.118 0.0594 0.128 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0187 0.118 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 2.28e-01 0.148 0.122 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0468 0.133 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 4.80e-01 0.051 0.0721 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 149039 sc-eQTL 4.37e-01 0.111 0.142 0.119 PB L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00105 0.119 0.119 PB L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 7.58e-01 0.0499 0.162 0.119 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 2.66e-01 0.162 0.145 0.119 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 1.68e-01 -0.114 0.0819 0.119 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 9.26e-01 0.0144 0.155 0.119 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 418626 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0557 0.102 0.119 PB L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 6.45e-01 -0.056 0.121 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 4.75e-01 0.0974 0.136 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 2.67e-01 0.144 0.13 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 4.08e-01 0.0407 0.0491 0.124 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 9.43e-01 0.00918 0.127 0.124 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 3.48e-01 0.122 0.13 0.122 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0345 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0709 0.11 0.122 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 4.84e-01 0.034 0.0485 0.122 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 3.05e-01 0.14 0.137 0.122 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 2.91e-01 -0.123 0.116 0.12 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -184251 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0299 0.115 0.12 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 1.36e-01 0.223 0.149 0.12 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -163541 sc-eQTL 2.70e-01 -0.15 0.135 0.12 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 9.15e-01 0.0142 0.132 0.12 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00817 0.0653 0.12 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 4.99e-01 0.0875 0.129 0.12 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -552614 sc-eQTL 7.45e-02 -0.184 0.103 0.12 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 4.22e-03 -0.247 0.0853 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -184251 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0726 0.123 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 4.60e-01 0.0898 0.121 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -163541 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0294 0.124 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 1.98e-01 0.127 0.0988 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 8.80e-01 0.00835 0.0551 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 9.87e-01 0.00168 0.106 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0554 0.0945 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -184251 sc-eQTL 3.43e-01 -0.112 0.118 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 6.42e-01 0.0597 0.128 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -163541 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0437 0.128 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 8.80e-01 0.0127 0.084 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 8.77e-01 0.00935 0.0605 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 8.04e-01 0.0278 0.112 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0194 0.15 0.13 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0591 0.16 0.13 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 2.04e-01 0.21 0.165 0.13 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0336 0.0629 0.13 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 7.56e-02 0.288 0.161 0.13 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 8.34e-01 0.0261 0.124 0.122 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -184251 sc-eQTL 4.87e-01 0.087 0.125 0.122 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 1.87e-01 -0.181 0.137 0.122 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -163541 sc-eQTL 1.47e-01 0.179 0.123 0.122 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 3.19e-01 -0.125 0.125 0.122 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 2.86e-01 0.0584 0.0546 0.122 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 5.65e-01 0.0768 0.133 0.122 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0611 0.0917 0.122 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -184251 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0707 0.129 0.122 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 8.72e-01 0.0211 0.131 0.122 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -163541 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00837 0.129 0.122 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0436 0.124 0.122 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 1.80e-01 0.0831 0.0617 0.122 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 1.63e-01 0.153 0.109 0.122 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0995 0.11 0.119 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -184251 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0576 0.111 0.119 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 2.70e-01 0.171 0.154 0.119 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -163541 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0718 0.113 0.119 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0266 0.134 0.119 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 6.22e-01 0.0457 0.0925 0.119 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 1.22e-01 0.212 0.136 0.119 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -552614 sc-eQTL 3.28e-02 -0.278 0.129 0.119 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 149039 sc-eQTL 1.15e-01 0.212 0.134 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0411 0.0764 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 3.09e-01 -0.119 0.117 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 6.57e-01 0.0537 0.121 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0497 0.0688 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 2.80e-01 0.136 0.126 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 418626 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00421 0.122 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 149039 sc-eQTL 4.68e-01 0.102 0.141 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0627 0.0577 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 2.61e-01 -0.122 0.108 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 3.30e-01 -0.11 0.112 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 7.69e-01 0.02 0.068 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 1.62e-01 0.179 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 418626 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0846 0.0813 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 6.25e-03 -0.197 0.0712 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -184251 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0795 0.118 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 3.83e-01 0.0991 0.113 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -163541 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00522 0.123 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 3.24e-01 0.0804 0.0813 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 8.28e-01 0.0122 0.0559 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 8.04e-01 0.0247 0.0994 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 7.57e-01 0.0271 0.0874 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -184251 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00534 0.129 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0723 0.125 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -163541 sc-eQTL 9.94e-01 0.000903 0.127 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0802 0.12 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 1.46e-01 0.074 0.0507 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -262825 sc-eQTL 2.08e-02 0.285 0.122 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 37316 sc-eQTL 8.29e-01 -0.022 0.102 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 922272 sc-eQTL 1.00e+00 3.37e-05 0.099 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -212945 sc-eQTL 6.41e-01 0.0602 0.129 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -264055 sc-eQTL 3.68e-01 0.0474 0.0526 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 37316 pQTL 0.00014 -0.129 0.0337 0.0 0.0 0.117
ENSG00000079950 STX7 37316 eQTL 5.12e-05 -0.095 0.0233 0.0 0.0 0.12
ENSG00000093134 VNN3 -184251 eQTL 0.0152 -0.0525 0.0216 0.0 0.0 0.12
ENSG00000234484 AL032821.1 -202161 eQTL 0.0213 0.106 0.046 0.0 0.0 0.12

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 37316 1.04e-05 1.24e-05 2.05e-06 6.69e-06 2.32e-06 5.45e-06 1.41e-05 2.2e-06 1.07e-05 6.14e-06 1.54e-05 6.45e-06 2.02e-05 4.25e-06 3.71e-06 6.92e-06 6.42e-06 9.66e-06 3.53e-06 3.14e-06 6.79e-06 1.12e-05 1.08e-05 3.85e-06 1.98e-05 4.49e-06 6.4e-06 5.22e-06 1.37e-05 1.2e-05 7.63e-06 9.67e-07 1.33e-06 3.69e-06 5.21e-06 2.87e-06 1.72e-06 1.99e-06 2.2e-06 1.34e-06 1.12e-06 1.45e-05 1.61e-06 2.66e-07 9.99e-07 2e-06 1.82e-06 7.41e-07 4.51e-07
ENSG00000093134 VNN3 -184251 1.92e-06 2.39e-06 2.31e-07 1.43e-06 4.74e-07 6.96e-07 1.33e-06 5.96e-07 1.63e-06 8.05e-07 1.99e-06 1.45e-06 3.04e-06 9.31e-07 4.99e-07 1.18e-06 9.71e-07 1.44e-06 6.58e-07 9.54e-07 8.29e-07 2.18e-06 1.81e-06 9.76e-07 2.68e-06 1.21e-06 1.13e-06 1.44e-06 1.81e-06 1.63e-06 9.62e-07 2.5e-07 4.47e-07 8.95e-07 9.62e-07 7.09e-07 7.56e-07 3.86e-07 7.27e-07 2.76e-07 2.44e-07 2.77e-06 4.33e-07 1.99e-07 3.62e-07 3.62e-07 4.32e-07 2.42e-07 2.9e-07