logo

Genes within 1Mb (chr6:132543431:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 141956 sc-eQTL 3.39e-02 0.292 0.137 0.115 B L1
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0296 0.0521 0.115 B L1
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 1.08e-01 -0.167 0.103 0.115 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 8.69e-01 0.0162 0.098 0.115 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0161 0.0592 0.115 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 6.31e-02 0.231 0.124 0.115 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 411543 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0867 0.0816 0.115 B L1
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 5.33e-01 0.0625 0.1 0.115 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 9.81e-01 0.0019 0.0795 0.115 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0294 0.0868 0.115 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 5.26e-01 0.0375 0.059 0.115 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 3.76e-02 0.247 0.118 0.115 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 9.88e-01 0.0015 0.1 0.115 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0471 0.0988 0.115 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00625 0.117 0.115 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 3.97e-01 0.0339 0.04 0.115 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 2.22e-03 0.367 0.118 0.115 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0742 0.0914 0.117 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -191334 sc-eQTL 6.11e-01 0.0578 0.113 0.117 DC L1
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 7.18e-01 0.0481 0.133 0.117 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -170624 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0671 0.122 0.117 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 9.94e-01 0.000977 0.131 0.117 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 3.86e-01 0.0637 0.0733 0.117 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 1.29e-01 0.176 0.116 0.117 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -559697 sc-eQTL 8.29e-02 -0.183 0.105 0.117 DC L1
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 7.22e-02 -0.124 0.0684 0.115 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -191334 sc-eQTL 6.61e-01 -0.052 0.118 0.115 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 6.50e-01 0.0511 0.112 0.115 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -170624 sc-eQTL 8.51e-01 0.0239 0.127 0.115 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 4.45e-01 0.0686 0.0898 0.115 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00253 0.0539 0.115 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 4.65e-01 0.0778 0.106 0.115 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 8.99e-01 -0.013 0.102 0.116 NK L1
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0521 0.0933 0.116 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 7.02e-01 0.0487 0.127 0.116 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 4.30e-01 0.0415 0.0525 0.116 NK L1
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 7.61e-01 0.0308 0.101 0.115 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 5.39e-01 0.0776 0.126 0.115 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 4.11e-01 0.1 0.122 0.115 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0186 0.0484 0.115 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 2.88e-01 0.141 0.132 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 141956 sc-eQTL 2.04e-02 0.33 0.141 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 5.57e-01 0.0789 0.134 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 8.53e-01 0.0275 0.149 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 6.88e-01 0.0573 0.143 0.107 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 1.91e-01 0.0999 0.0761 0.107 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 7.15e-01 0.049 0.134 0.107 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 411543 sc-eQTL 7.99e-02 0.223 0.127 0.107 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 141956 sc-eQTL 1.66e-02 0.301 0.125 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0588 0.0826 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 1.82e-01 -0.168 0.125 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 4.00e-02 0.255 0.123 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0302 0.0763 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 3.87e-01 0.119 0.137 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 411543 sc-eQTL 1.79e-01 -0.157 0.116 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 141956 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0194 0.128 0.114 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 7.66e-01 0.0298 0.1 0.114 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 9.32e-01 -0.011 0.129 0.114 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0853 0.131 0.114 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 9.53e-01 0.00372 0.0631 0.114 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 1.38e-01 0.195 0.131 0.114 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 411543 sc-eQTL 7.20e-01 0.0441 0.123 0.114 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 141956 sc-eQTL 5.81e-01 0.0791 0.143 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0449 0.0625 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 2.69e-01 -0.124 0.112 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0496 0.122 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 9.44e-01 0.00489 0.0692 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 8.23e-02 0.232 0.133 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 411543 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0419 0.0884 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 141956 sc-eQTL 6.64e-01 0.0585 0.134 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0208 0.0732 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0562 0.135 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 5.10e-01 0.0885 0.134 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 8.46e-01 0.0138 0.0711 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0386 0.136 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 411543 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0732 0.094 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 4.09e-01 0.116 0.14 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 7.90e-01 -0.039 0.146 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0689 0.141 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0751 0.0652 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 4.61e-01 0.0972 0.132 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 9.34e-01 0.00899 0.108 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 4.95e-01 0.0628 0.0918 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0164 0.0997 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 5.21e-01 0.0416 0.0647 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 7.99e-02 0.218 0.124 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 1.22e-01 0.185 0.119 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0829 0.101 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 5.76e-01 0.0661 0.118 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 1.82e-01 0.0817 0.061 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 1.07e-01 0.228 0.141 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 3.53e-01 0.128 0.138 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 8.96e-01 0.0167 0.127 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 8.85e-01 0.0191 0.132 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 8.49e-01 0.0104 0.0543 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 1.49e-02 0.327 0.133 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0968 0.116 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0175 0.119 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 9.26e-01 0.0123 0.132 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 5.29e-01 0.0445 0.0706 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 3.86e-01 0.119 0.137 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 3.94e-02 0.282 0.136 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 1.76e-01 0.149 0.11 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0227 0.119 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 7.28e-01 0.0236 0.0678 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 5.71e-03 0.373 0.134 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 8.31e-01 0.0289 0.135 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 4.59e-02 -0.27 0.134 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 2.42e-01 -0.157 0.134 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 2.33e-01 0.078 0.0652 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 1.40e-02 0.35 0.141 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 3.05e-01 -0.149 0.145 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 2.70e-01 -0.154 0.139 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 6.89e-01 0.0579 0.144 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0947 0.0774 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 7.60e-01 -0.045 0.147 0.11 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 8.57e-01 0.0231 0.128 0.115 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 3.38e-02 0.284 0.133 0.115 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 7.15e-01 0.0477 0.13 0.115 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0475 0.0641 0.115 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00509 0.135 0.115 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00933 0.135 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 1.16e-01 -0.224 0.142 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 5.88e-01 0.0745 0.137 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 1.65e-01 0.106 0.0762 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0427 0.108 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0775 0.111 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 5.82e-01 0.0742 0.135 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 3.82e-01 0.0467 0.0534 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0481 0.129 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 7.39e-01 0.0434 0.13 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 9.67e-01 0.00536 0.13 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 3.88e-02 0.125 0.0601 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0665 0.119 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 1.57e-01 0.175 0.123 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0745 0.134 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 3.39e-01 0.0696 0.0727 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 141956 sc-eQTL 3.61e-01 0.136 0.148 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 8.69e-01 0.0205 0.124 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 9.27e-01 0.0155 0.168 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 2.05e-01 0.191 0.15 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0879 0.0855 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0345 0.161 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 411543 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0862 0.106 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0236 0.122 0.117 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 6.64e-01 0.0594 0.137 0.117 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 2.39e-01 0.154 0.13 0.117 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 4.96e-01 0.0337 0.0493 0.117 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 5.68e-01 0.0731 0.128 0.117 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 3.43e-01 0.125 0.131 0.115 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0541 0.135 0.115 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0496 0.111 0.115 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 4.33e-01 0.0384 0.0489 0.115 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 5.70e-01 0.0786 0.138 0.115 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0865 0.118 0.112 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -191334 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0197 0.118 0.112 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 1.40e-01 0.225 0.152 0.112 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -170624 sc-eQTL 4.31e-01 -0.109 0.138 0.112 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 7.98e-01 0.0345 0.135 0.112 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00363 0.0665 0.112 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 3.51e-01 0.123 0.131 0.112 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -559697 sc-eQTL 1.49e-01 -0.152 0.105 0.112 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 6.12e-03 -0.241 0.087 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -191334 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0225 0.125 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 7.94e-01 0.0324 0.124 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -170624 sc-eQTL 8.74e-01 0.0201 0.126 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 2.96e-01 0.105 0.101 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00788 0.0561 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 8.09e-01 0.0262 0.108 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0313 0.0962 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -191334 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0737 0.12 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 5.61e-01 0.0759 0.13 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -170624 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0487 0.13 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 9.07e-01 -0.01 0.0854 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0105 0.0615 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 6.72e-01 0.0483 0.114 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0175 0.151 0.121 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0809 0.162 0.121 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 3.99e-01 0.141 0.167 0.121 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0438 0.0637 0.121 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 7.51e-02 0.292 0.163 0.121 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 7.65e-01 0.0377 0.126 0.116 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -191334 sc-eQTL 4.03e-01 0.107 0.127 0.116 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 1.72e-01 -0.191 0.139 0.116 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -170624 sc-eQTL 8.97e-02 0.213 0.125 0.116 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0976 0.128 0.116 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 4.46e-01 0.0425 0.0557 0.116 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 5.22e-01 0.0871 0.136 0.116 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0593 0.093 0.115 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -191334 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0867 0.131 0.115 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 7.97e-01 0.0343 0.133 0.115 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -170624 sc-eQTL 8.34e-01 0.0274 0.13 0.115 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0647 0.125 0.115 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 3.22e-01 0.0623 0.0628 0.115 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 2.40e-01 0.131 0.111 0.115 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0469 0.108 0.113 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -191334 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00139 0.109 0.113 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 4.00e-01 0.128 0.151 0.113 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -170624 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0981 0.11 0.113 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0703 0.132 0.113 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 8.19e-01 0.0208 0.0908 0.113 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 9.61e-02 0.223 0.133 0.113 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -559697 sc-eQTL 6.91e-02 -0.233 0.127 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 141956 sc-eQTL 2.59e-02 0.301 0.134 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000225 0.0768 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 2.18e-01 -0.145 0.117 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 4.89e-01 0.0842 0.121 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0519 0.0691 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 3.93e-01 0.108 0.127 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 411543 sc-eQTL 7.12e-01 0.0453 0.123 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 141956 sc-eQTL 3.53e-01 0.133 0.142 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0575 0.0585 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 1.74e-01 -0.15 0.11 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0181 0.114 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 9.75e-01 0.0022 0.0688 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 1.58e-01 0.183 0.129 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 411543 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0836 0.0823 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 1.10e-02 -0.186 0.0727 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -191334 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0295 0.12 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 6.14e-01 0.0584 0.116 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -170624 sc-eQTL 8.58e-01 0.0225 0.125 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 4.98e-01 0.0563 0.0829 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00419 0.0569 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 5.79e-01 0.0562 0.101 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 7.22e-01 0.0316 0.0889 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -191334 sc-eQTL 9.27e-01 -0.012 0.131 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0711 0.127 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -170624 sc-eQTL 8.01e-01 0.0328 0.13 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0835 0.122 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 2.78e-01 0.0562 0.0517 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -269908 sc-eQTL 2.02e-02 0.291 0.124 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 30233 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0181 0.102 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 915189 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0136 0.0993 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -220028 sc-eQTL 6.63e-01 0.0564 0.129 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -271138 sc-eQTL 4.16e-01 0.043 0.0528 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 30233 pQTL 7.42e-06 -0.161 0.0358 0.0 0.0 0.103
ENSG00000079950 STX7 30233 eQTL 6.38e-06 -0.112 0.0247 0.0 0.0 0.105
ENSG00000093134 VNN3 -191334 eQTL 0.00663 -0.0621 0.0228 0.0 0.0 0.105
ENSG00000112303 VNN2 -220028 pQTL 0.0134 -0.0992 0.0401 0.0 0.0 0.103
ENSG00000234484 AL032821.1 -209244 eQTL 0.00218 0.149 0.0486 0.0 0.0 0.105

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 30233 1.45e-05 1.48e-05 2.95e-06 9.25e-06 2.97e-06 7.28e-06 2.08e-05 3.01e-06 1.55e-05 7.65e-06 1.96e-05 7.33e-06 2.71e-05 5.77e-06 5.06e-06 9.29e-06 8.14e-06 1.35e-05 4.67e-06 4.2e-06 7.95e-06 1.45e-05 1.48e-05 5.15e-06 2.52e-05 5.29e-06 7.92e-06 6.83e-06 1.66e-05 1.58e-05 1.05e-05 1.25e-06 1.73e-06 4.8e-06 6.48e-06 3.89e-06 2.04e-06 2.73e-06 3.01e-06 2.42e-06 1.67e-06 1.89e-05 2.45e-06 3.57e-07 1.93e-06 2.63e-06 2.85e-06 1.23e-06 1.03e-06
ENSG00000093134 VNN3 -191334 2.48e-06 2.71e-06 2.7e-07 1.7e-06 4.59e-07 7.84e-07 1.61e-06 6.09e-07 1.79e-06 8.16e-07 2.11e-06 1.29e-06 3.5e-06 1.1e-06 8.08e-07 1.24e-06 1.07e-06 2.12e-06 7.68e-07 1.15e-06 9.18e-07 2.57e-06 2.1e-06 9.95e-07 3.16e-06 1.3e-06 1.27e-06 1.51e-06 1.8e-06 1.72e-06 1.45e-06 3.22e-07 5.72e-07 1.24e-06 9.17e-07 8.31e-07 8.1e-07 3.84e-07 8.54e-07 3.33e-07 2.1e-07 3e-06 4.11e-07 1.9e-07 2.88e-07 3.29e-07 6.08e-07 2.18e-07 2.01e-07