logo

Genes within 1Mb (chr6:132105982:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -295493 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00378 0.157 0.092 B L1
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 2.25e-03 0.179 0.0578 0.092 B L1
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0961 0.118 0.092 B L1
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0121 0.111 0.092 B L1
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 2.10e-01 -0.084 0.0669 0.092 B L1
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 8.95e-01 0.0184 0.139 0.092 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 3.38e-01 -0.135 0.141 0.092 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 -25906 sc-eQTL 2.66e-01 0.103 0.0925 0.092 B L1
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 9.72e-04 0.369 0.11 0.092 CD4T L1
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 1.90e-01 0.118 0.0896 0.092 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 8.60e-01 0.0174 0.0981 0.092 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0875 0.0665 0.092 CD4T L1
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 3.91e-02 -0.248 0.119 0.092 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 2.97e-01 -0.141 0.135 0.092 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 5.46e-01 0.0683 0.113 0.092 CD8T L1
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 5.27e-01 0.0705 0.111 0.092 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 8.59e-01 0.0235 0.132 0.092 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 5.35e-01 -0.028 0.0451 0.092 CD8T L1
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 2.17e-01 -0.156 0.126 0.092 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 4.32e-02 -0.275 0.135 0.092 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 2.64e-01 0.119 0.106 0.09 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 -628783 sc-eQTL 3.41e-02 -0.279 0.131 0.09 DC L1
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 1.07e-01 -0.25 0.154 0.09 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 -608073 sc-eQTL 9.30e-02 -0.239 0.142 0.09 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000604 0.153 0.09 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0754 0.0855 0.09 DC L1
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 2.89e-01 0.162 0.152 0.09 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 2.67e-01 -0.151 0.135 0.09 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -997146 sc-eQTL 9.98e-01 0.00038 0.123 0.09 DC L1
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 3.32e-02 0.165 0.0769 0.092 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 -628783 sc-eQTL 3.84e-01 -0.116 0.133 0.092 Mono L1
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0165 0.127 0.092 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 -608073 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0103 0.144 0.092 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 4.29e-01 0.0802 0.101 0.092 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 5.79e-01 0.0337 0.0606 0.092 Mono L1
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0684 0.126 0.092 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0143 0.12 0.092 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 1.20e-04 0.454 0.116 0.092 NK L1
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0223 0.11 0.092 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 2.81e-01 -0.161 0.149 0.092 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0404 0.0617 0.092 NK L1
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 4.93e-01 -0.09 0.131 0.092 NK L1
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 4.78e-01 0.0839 0.118 0.092 Other_T L1
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 3.12e-01 -0.149 0.147 0.092 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 1.21e-01 -0.221 0.142 0.092 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 7.78e-01 -0.016 0.0567 0.092 Other_T L1
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00821 0.129 0.092 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 5.79e-01 0.0863 0.155 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -295493 sc-eQTL 1.78e-01 0.212 0.157 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 1.41e-01 0.217 0.147 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 2.90e-01 0.173 0.163 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 3.34e-02 -0.333 0.155 0.097 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0184 0.0843 0.097 B_Activated L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 8.01e-01 0.0412 0.163 0.097 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0819 0.148 0.097 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 -25906 sc-eQTL 4.35e-01 0.11 0.141 0.097 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 -295493 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0732 0.147 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 3.91e-02 0.198 0.0953 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 8.56e-01 0.0266 0.146 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 1.36e-01 -0.216 0.144 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 2.28e-01 -0.107 0.0885 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 8.31e-01 0.0317 0.149 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 1.24e-01 -0.245 0.159 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 -25906 sc-eQTL 1.49e-02 -0.329 0.134 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 -295493 sc-eQTL 5.15e-01 0.0937 0.144 0.093 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 2.80e-01 0.122 0.113 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0227 0.145 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0165 0.148 0.093 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 3.88e-02 -0.146 0.0704 0.093 B_Memory L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 3.92e-02 -0.311 0.15 0.093 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 9.81e-01 0.00357 0.148 0.093 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 -25906 sc-eQTL 5.57e-02 0.264 0.137 0.093 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 -295493 sc-eQTL 3.19e-01 -0.162 0.162 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 6.52e-05 0.278 0.0683 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0868 0.127 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 5.03e-01 0.0925 0.138 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0697 0.0783 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 4.52e-01 0.12 0.159 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 8.29e-01 0.0327 0.151 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -25906 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0421 0.1 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 -295493 sc-eQTL 9.43e-01 0.011 0.153 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 2.04e-01 0.106 0.0832 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 6.88e-01 -0.062 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 7.32e-01 0.0525 0.153 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 1.47e-01 -0.118 0.0807 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 9.73e-01 0.00545 0.162 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 1.62e-01 -0.216 0.154 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 -25906 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0187 0.107 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 3.96e-01 0.138 0.163 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0162 0.169 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 8.06e-01 0.0404 0.164 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 2.92e-01 -0.08 0.0757 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 2.27e-01 -0.196 0.162 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 5.66e-01 0.0879 0.153 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 6.64e-03 0.329 0.12 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 2.78e-01 0.113 0.104 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0284 0.113 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0657 0.0733 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 8.12e-02 -0.237 0.135 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 5.88e-02 -0.266 0.14 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 5.65e-02 0.26 0.135 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 9.74e-01 0.00381 0.115 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0182 0.135 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 1.45e-01 -0.102 0.0694 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0187 0.133 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 5.83e-01 0.0888 0.161 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 2.26e-01 0.19 0.157 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0606 0.145 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 5.36e-01 0.0934 0.151 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 9.56e-01 0.00343 0.0618 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 7.18e-02 -0.285 0.158 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 4.38e-01 -0.119 0.153 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0308 0.131 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 2.96e-01 0.141 0.134 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 5.83e-01 0.0819 0.149 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 7.95e-01 0.0208 0.0798 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 4.57e-01 -0.112 0.15 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 4.07e-01 -0.128 0.154 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0697 0.157 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 4.16e-01 -0.103 0.126 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0105 0.136 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0106 0.0778 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 3.51e-01 -0.133 0.143 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 1.48e-01 -0.225 0.155 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0495 0.157 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0365 0.158 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 2.19e-01 -0.191 0.155 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 6.55e-01 0.034 0.0759 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 6.42e-01 0.0786 0.169 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 6.55e-03 -0.449 0.163 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 7.81e-01 0.0475 0.171 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 3.93e-01 0.14 0.164 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 1.55e-01 0.241 0.169 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 1.66e-01 0.126 0.0908 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 3.43e-01 -0.158 0.167 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0298 0.173 0.091 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 4.72e-01 0.111 0.154 0.093 MAIT L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0991 0.162 0.093 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 5.14e-01 -0.103 0.157 0.093 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0172 0.0773 0.093 MAIT L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 8.50e-01 0.0304 0.16 0.093 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 2.27e-01 0.196 0.162 0.093 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 6.05e-02 0.288 0.152 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0244 0.163 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0591 0.156 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 7.16e-01 0.0317 0.087 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 5.09e-01 -0.104 0.158 0.093 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 2.95e-02 0.273 0.124 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00566 0.129 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 5.15e-01 -0.102 0.157 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0428 0.0623 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 5.40e-01 -0.084 0.137 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 1.10e-01 0.248 0.154 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0923 0.157 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0437 0.157 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0833 0.073 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 9.59e-01 0.00847 0.163 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 3.23e-04 0.496 0.136 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 4.03e-01 0.121 0.144 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0591 0.157 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0719 0.0851 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00603 0.146 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 -295493 sc-eQTL 1.69e-01 -0.209 0.151 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0813 0.127 0.111 PB L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 3.68e-01 -0.156 0.172 0.111 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 9.74e-01 0.00505 0.155 0.111 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 5.31e-01 0.0553 0.0881 0.111 PB L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 7.10e-01 0.0627 0.168 0.111 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 5.05e-01 -0.11 0.165 0.111 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 -25906 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0398 0.109 0.111 PB L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 7.28e-01 0.0489 0.14 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0687 0.158 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0977 0.15 0.093 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 7.42e-01 0.0188 0.0569 0.093 Pro_T L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00445 0.135 0.093 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0913 0.147 0.093 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 2.61e-02 0.33 0.147 0.092 Treg L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0113 0.153 0.092 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 2.88e-01 0.133 0.125 0.092 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0338 0.0554 0.092 Treg L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 7.75e-03 -0.349 0.13 0.092 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 5.00e-01 -0.106 0.156 0.092 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 5.77e-01 0.0748 0.134 0.09 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -628783 sc-eQTL 3.38e-02 -0.281 0.132 0.09 cDC L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 3.11e-02 -0.371 0.171 0.09 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -608073 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0978 0.156 0.09 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0809 0.152 0.09 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00749 0.0753 0.09 cDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 5.15e-02 0.326 0.166 0.09 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 7.30e-03 -0.397 0.146 0.09 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -997146 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0508 0.119 0.09 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 1.76e-01 0.137 0.101 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 -628783 sc-eQTL 2.77e-01 -0.155 0.143 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 7.94e-01 0.0369 0.141 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 -608073 sc-eQTL 9.28e-01 -0.013 0.144 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 6.75e-01 0.0485 0.115 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 7.85e-01 0.0175 0.064 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 3.22e-01 -0.136 0.137 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0169 0.124 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 2.63e-01 0.123 0.11 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 -628783 sc-eQTL 6.91e-01 0.0548 0.137 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 4.87e-01 -0.104 0.149 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 -608073 sc-eQTL 8.96e-01 0.0195 0.149 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00774 0.0978 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0345 0.0704 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0489 0.146 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 8.56e-01 0.0236 0.13 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 6.44e-01 0.0842 0.182 0.091 gdT L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 6.76e-01 0.0819 0.195 0.091 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0443 0.202 0.091 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 8.14e-01 0.0181 0.0768 0.091 gdT L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 2.50e-01 0.235 0.203 0.091 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 4.40e-01 0.153 0.198 0.091 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 1.17e-01 0.232 0.147 0.091 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -628783 sc-eQTL 6.54e-01 -0.067 0.149 0.091 intMono L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0896 0.164 0.091 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -608073 sc-eQTL 7.28e-01 0.0515 0.148 0.091 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 3.56e-01 0.139 0.15 0.091 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0307 0.0653 0.091 intMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 2.22e-01 -0.196 0.16 0.091 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 2.45e-01 -0.185 0.159 0.091 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 2.56e-01 0.125 0.109 0.093 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 -628783 sc-eQTL 3.48e-02 -0.326 0.153 0.093 ncMono L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 3.39e-01 0.15 0.157 0.093 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 -608073 sc-eQTL 5.77e-01 0.0858 0.154 0.093 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 2.82e-01 0.159 0.147 0.093 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 5.37e-02 0.143 0.0735 0.093 ncMono L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 2.90e-02 0.331 0.15 0.093 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 9.42e-02 -0.219 0.13 0.093 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 8.58e-01 0.0221 0.123 0.096 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 -628783 sc-eQTL 1.85e-01 -0.164 0.123 0.096 pDC L2
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 9.16e-01 0.0183 0.173 0.096 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 -608073 sc-eQTL 1.39e-03 -0.397 0.122 0.096 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 6.13e-01 0.0761 0.15 0.096 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0517 0.103 0.096 pDC L2
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 2.88e-01 -0.15 0.14 0.096 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 2.43e-01 0.179 0.152 0.096 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -997146 sc-eQTL 4.59e-01 -0.109 0.146 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 -295493 sc-eQTL 1.72e-01 0.207 0.151 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 5.91e-03 0.235 0.0845 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 2.24e-01 0.16 0.131 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 2.44e-01 -0.158 0.136 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 1.79e-01 -0.104 0.0772 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 3.42e-01 -0.127 0.134 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 3.76e-01 -0.126 0.142 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -25906 sc-eQTL 3.37e-01 0.132 0.137 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 -295493 sc-eQTL 4.14e-01 -0.132 0.162 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 6.47e-04 0.224 0.0647 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0584 0.125 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 5.67e-01 0.0739 0.129 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0843 0.0779 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 6.20e-01 0.078 0.157 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0961 0.147 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 -25906 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0269 0.0936 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 5.73e-02 0.161 0.0843 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -628783 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0928 0.138 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000127 0.133 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -608073 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0323 0.144 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 4.43e-01 0.0733 0.0954 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 8.12e-01 0.0156 0.0655 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0555 0.131 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 9.62e-01 0.0056 0.117 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 5.75e-02 0.196 0.103 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 -628783 sc-eQTL 1.04e-02 -0.388 0.15 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0778 0.148 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 -608073 sc-eQTL 8.29e-01 0.0326 0.151 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 2.05e-01 0.18 0.142 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 7.64e-01 0.0181 0.0603 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 7.33e-01 -0.052 0.152 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 -707357 sc-eQTL 8.43e-02 -0.252 0.145 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 -407216 sc-eQTL 1.84e-04 0.441 0.116 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112282 MED23 477740 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00255 0.116 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 -657477 sc-eQTL 2.26e-01 -0.184 0.151 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 -708587 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0333 0.0619 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118507 AKAP7 970515 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0672 0.128 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 -407216 eQTL 4.53e-08 0.146 0.0264 0.0 0.0 0.0947
ENSG00000112299 VNN1 -608073 eQTL 0.0273 0.081 0.0366 0.0 0.0 0.0947
ENSG00000112303 VNN2 -657477 pQTL 0.0417 -0.0891 0.0437 0.0 0.0 0.0928
ENSG00000118520 ARG1 532838 eQTL 0.00427 -0.0887 0.031 0.0 0.0 0.0947
ENSG00000118523 CCN2 154610 pQTL 1.68e-12 -0.255 0.0357 0.0 0.0 0.0928

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 -407216 1.05e-06 6.76e-07 1.63e-07 4.27e-07 1.11e-07 3.11e-07 6.19e-07 2.21e-07 6.92e-07 3.1e-07 9.73e-07 5.22e-07 9.97e-07 1.57e-07 3.35e-07 3.57e-07 5.56e-07 4.39e-07 2.88e-07 2.25e-07 2.42e-07 5.37e-07 3.99e-07 2.92e-07 1.14e-06 2.64e-07 4.37e-07 3.24e-07 5.41e-07 7.63e-07 3.68e-07 3.31e-08 5.95e-08 1.93e-07 3.63e-07 1.8e-07 1.22e-07 1.21e-07 8.35e-08 1.63e-08 1.36e-07 6.8e-07 5.84e-08 1.1e-08 1.96e-07 3.87e-08 1.49e-07 5.73e-08 5.26e-08
ENSG00000146409 \N -707357 3.14e-07 1.53e-07 6.55e-08 2.09e-07 1.05e-07 8.63e-08 2.1e-07 5.78e-08 1.71e-07 9.72e-08 1.61e-07 1.31e-07 2.13e-07 8e-08 5.62e-08 8.71e-08 4.25e-08 1.77e-07 7.16e-08 5.87e-08 1.18e-07 1.56e-07 1.58e-07 3.51e-08 2.02e-07 1.39e-07 1.22e-07 1.1e-07 1.32e-07 1.24e-07 1.14e-07 4.23e-08 3.56e-08 9.81e-08 4.04e-08 2.68e-08 4.62e-08 7.63e-08 6.5e-08 5.24e-08 6.14e-08 1.52e-07 3.55e-08 1.12e-08 3.55e-08 1.01e-08 7.97e-08 2.13e-09 4.98e-08